More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_5529 on replicon NC_007950
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008545  Bcen2424_6864  phage integrase family protein  63.93 
 
 		 563 aa  696    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.728791  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7054  integrase family protein  61.89 
 
 		 578 aa  651    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01673  putative integrase/recombinase protein  65.76 
 
 		 566 aa  692    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6605  phage integrase family protein  62.77 
 
 		 559 aa  656    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0412955 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0376  phage integrase family protein  63.75 
 
 		 565 aa  692    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.128426  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1051  phage integrase family protein  63.75 
 
 		 565 aa  692    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.930281  n/a   
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6456  phage integrase  62.94 
 
 		 563 aa  666    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5389  integrase family protein  63.55 
 
 		 575 aa  650    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.028287  normal  0.0149159 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2103  phage integrase family protein  64.4 
 
 		 559 aa  695    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4706  integrase family protein  63.32 
 
 		 563 aa  667    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6948  Phage integrase  61.31 
 
 		 578 aa  650    Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00529901  normal  0.395305 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5567  phage integrase family protein  62.84 
 
 		 565 aa  686    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6458  integrase family protein  62.23 
 
 		 580 aa  660    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.446342 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1882  phage integrase family protein  64.4 
 
 		 566 aa  717    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.496854  normal  0.778139 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6390  phage integrase family protein  61.2 
 
 		 578 aa  654    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.82741  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5529  phage integrase  100 
 
 		 557 aa  1103    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.95616 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0038  phage integrase family protein  63.75 
 
 		 565 aa  692    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4514  Tyrosine-based site-specific recombinase  61.97 
 
 		 559 aa  656    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.197712  normal  0.108767 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1438  phage integrase  61.02 
 
 		 578 aa  652    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1825  integrase family protein  65.21 
 
 		 566 aa  664    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0271537 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5291  phage integrase  62.66 
 
 		 565 aa  684    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1740  integrase family protein  65.59 
 
 		 559 aa  687    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.407368 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5705  phage integrase family protein  61.84 
 
 		 578 aa  659    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.782513  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1208  phage integrase family protein  63.75 
 
 		 565 aa  692    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1337  phage integrase family protein  65.5 
 
 		 565 aa  711    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.515892  normal  0.256556 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1227  phage integrase  64.29 
 
 		 507 aa  618  1e-175  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1746  integrase family protein  70 
 
 		 442 aa  597  1e-169  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.526139 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6926  integrase family protein  53.09 
 
 		 580 aa  549  1e-155  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4983  Phage integrase  53.26 
 
 		 588 aa  546  1e-154  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.850292 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6086  tyrosine-based site-specific recombinase  34.29 
 
 		 716 aa  246  8e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0503413  normal  1 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6262  integrase family protein  39.09 
 
 		 770 aa  246  9.999999999999999e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.755623  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1507  integrase family protein  32.79 
 
 		 704 aa  236  6e-61  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.879594  normal  0.107383 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5172  integrase family protein  32.79 
 
 		 704 aa  236  6e-61  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.301594  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4613  integrase domain-containing protein  58.16 
 
 		 222 aa  236  1.0000000000000001e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.754834 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6112  integrase family protein  35.37 
 
 		 630 aa  221  3e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1625  Phage integrase:Phage integrase, N-terminal SAM-like  38.3 
 
 		 411 aa  216  5.9999999999999996e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7607  phage integrase family protein  52.83 
 
 		 248 aa  216  7e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.484677  normal  1 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_5076  integrase family protein  33.6 
 
 		 733 aa  204  3e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.821689  normal  0.0349063 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2034  integrase family protein  35.45 
 
 		 422 aa  204  3e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.108116  hitchhiker  0.0000000170998 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1886  phage integrase family protein  36.62 
 
 		 417 aa  201  1.9999999999999998e-50  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.455882 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6577  integrase family protein  32.13 
 
 		 710 aa  198  3e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.00328143  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1405  Phage integrase  35.98 
 
 		 420 aa  197  4.0000000000000005e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5789  integrase family protein  36.36 
 
 		 399 aa  196  7e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5830  integrase family protein  35.98 
 
 		 398 aa  196  8.000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00308669  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3895  phage integrase  35.98 
 
 		 398 aa  196  9e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.211604  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4473  phage integrase family protein  35.98 
 
 		 398 aa  196  9e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0169641  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4335  integrase family protein  36.34 
 
 		 397 aa  193  7e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.199412 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_5048  integrase family protein  36.34 
 
 		 397 aa  193  7e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.414068  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4445  integrase family protein  36.34 
 
 		 397 aa  193  7e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0199847  normal  0.157682 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1733  integrase family protein  36.34 
 
 		 397 aa  193  7e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.461971 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7324  integrase family protein  34.42 
 
 		 421 aa  192  2e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0511421 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2135  integrase family protein  34.12 
 
 		 394 aa  190  5.999999999999999e-47  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.182439  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4162  integrase family protein  35.19 
 
 		 428 aa  186  9e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.424445 
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_4952  integrase family protein  29.91 
 
 		 577 aa  177  4e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1886  phage integrase  36.1 
 
 		 397 aa  177  4e-43  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.031072  n/a   
 
 
-
 
NC_012851  Rpic12D_5448  integrase family protein  29.74 
 
 		 577 aa  175  1.9999999999999998e-42  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6892  phage integrase family protein  32.94 
 
 		 618 aa  173  5.999999999999999e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4614  phage integrase  53.61 
 
 		 185 aa  160  8e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4251  phage integrase family protein  29.31 
 
 		 624 aa  157  4e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4691  phage integrase family protein  29.88 
 
 		 609 aa  157  5.0000000000000005e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.298565  normal  0.0454355 
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2777  integrase family protein  31.86 
 
 		 420 aa  150  5e-35  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0260202  normal  1 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4473  phage integrase family protein  28.62 
 
 		 609 aa  148  3e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00130209  decreased coverage  4.4515899999999994e-20 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6164  Phage integrase:Phage integrase, N-terminal SAM-like  30.32 
 
 		 616 aa  147  5e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5516  phage integrase  28.28 
 
 		 734 aa  146  1e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0248661  normal  1 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4932  phage integrase family protein  29.13 
 
 		 618 aa  140  7.999999999999999e-32  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.356622 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5040  phage integrase  28.54 
 
 		 732 aa  129  1.0000000000000001e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.346055  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5821  tyrosine-based site-specific recombinase XerD  28.96 
 
 		 526 aa  120  4.9999999999999996e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009705  YpsIP31758_B0092  putative integrase family protein  27.79 
 
 		 376 aa  120  9.999999999999999e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.967916  n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4175  phage integrase family protein  28.57 
 
 		 436 aa  115  2.0000000000000002e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5664  integrase family protein  32.28 
 
 		 490 aa  114  3e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.375823  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7315  integrase family protein  31.05 
 
 		 508 aa  114  5e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.968074  normal  0.0692077 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2857  site-specific recombinase, phage integrase family  27.14 
 
 		 444 aa  113  7.000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0775939  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0076  hypothetical protein  30.1 
 
 		 797 aa  109  1e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.701551  hitchhiker  0.00833618 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5345  putative integrase/recombinase protein  31.66 
 
 		 527 aa  109  2e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2856  site-specific recombinase, phage integrase family  25.39 
 
 		 434 aa  104  5e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0175495  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5988  tyrosine-based site-specific recombinase BimA  30.64 
 
 		 495 aa  103  1e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.239926  normal  0.0876373 
 
 
-
 
NC_010115  COXBURSA331_0002  phage integrase family site specific recombinase  25.79 
 
 		 406 aa  98.6  2e-19  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.952684  n/a   
 
 
-
 
NC_009726  CBUD_A0040  phage integrase family protein  24.51 
 
 		 417 aa  99.4  2e-19  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1968  phage integrase family site specific recombinase  25.75 
 
 		 415 aa  96.7  1e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.172186  normal  1 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6320  tyrosine-based site-specific recombinase activity site-specific DNA integration  30.08 
 
 		 398 aa  92.8  1e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25680  Phage integrase  27.05 
 
 		 430 aa  93.2  1e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1732  integrase/recombinase XerD  31.17 
 
 		 308 aa  92.8  2e-17  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5548  phage integrase  29.06 
 
 		 527 aa  92.4  2e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.174978  normal  0.321363 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6193  phage integrase-like SAM-like  28.61 
 
 		 495 aa  92.4  2e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.126905  hitchhiker  0.000249234 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1829  hypothetical protein  27.68 
 
 		 408 aa  90.5  8e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1832  hypothetical protein  27.68 
 
 		 408 aa  89.7  1e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2788  site-specific tyrosine recombinase XerD  27.51 
 
 		 296 aa  89.4  1e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000777667  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1622  tyrosine recombinase XerD  25 
 
 		 310 aa  89.4  2e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4012  tyrosine recombinase XerC  30.99 
 
 		 294 aa  89  2e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00152232  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0907  site-specific tyrosine recombinase XerD  34.55 
 
 		 307 aa  88.6  3e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2797  tyrosine recombinase XerD  28.74 
 
 		 298 aa  87.8  5e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.650693  normal  0.205647 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0507  tyrosine recombinase XerD  32.14 
 
 		 339 aa  87  8e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1427  tyrosine recombinase XerD subunit  28.24 
 
 		 295 aa  86.7  0.000000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2629  phage integrase family site specific recombinase  23.72 
 
 		 418 aa  86.3  0.000000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.953118  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3920  site-specific tyrosine recombinase XerD  26.54 
 
 		 296 aa  84.3  0.000000000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000317777  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3999  site-specific tyrosine recombinase XerD  26.54 
 
 		 296 aa  84  0.000000000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.189801  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3830  site-specific tyrosine recombinase XerD  26.54 
 
 		 296 aa  84  0.000000000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4311  site-specific tyrosine recombinase XerD  26.54 
 
 		 296 aa  84  0.000000000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.789664  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4113  site-specific tyrosine recombinase XerD  26.54 
 
 		 296 aa  84  0.000000000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.00015e-24 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2378  tyrosine recombinase XerD  30.16 
 
 		 296 aa  83.6  0.000000000000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.336575 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>