More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_2212 on replicon NC_010508
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009080  BMA10247_0659  Rhs element Vgr protein  69.84 
 
 		 935 aa  1261    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1606  Rhs element Vgr protein  69.73 
 
 		 935 aa  1260    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0855  Rhs element Vgr protein  69.62 
 
 		 935 aa  1254    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1580  Rhs element Vgr protein  69.73 
 
 		 935 aa  1261    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1766  Rhs element Vgr protein  69.73 
 
 		 935 aa  1279    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1377  Rhs element Vgr protein  69.84 
 
 		 935 aa  1261    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.369821  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04700  Rhs element Vgr protein  45.71 
 
 		 979 aa  697    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7615  Rhs element Vgr protein  66.4 
 
 		 984 aa  1327    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.874813 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0498  Rhs element Vgr protein  69.84 
 
 		 935 aa  1261    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02029  Rhs element Vgr protein  46.4 
 
 		 928 aa  684    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2705  Rhs element Vgr protein  70.3 
 
 		 932 aa  1283    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2212  type VI secretion system Vgr family protein  100 
 
 		 981 aa  1981    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0391  Rhs element Vgr protein  38.03 
 
 		 1094 aa  588  1e-166  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.437245 
 
 
-
 
NC_003296  RS01940  putative VGR-related protein  38.68 
 
 		 1006 aa  583  1.0000000000000001e-165  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS04687  putative VGR-related protein  39.01 
 
 		 962 aa  553  1e-156  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0394  Rhs element Vgr protein  39.41 
 
 		 811 aa  442  9.999999999999999e-123  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.787309 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04713  Rhs element Vgr protein  43.64 
 
 		 564 aa  313  1e-83  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0204  Rhs element Vgr protein  29.34 
 
 		 869 aa  278  4e-73  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2274  Rhs element Vgr protein  30.76 
 
 		 871 aa  276  2.0000000000000002e-72  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04712  Rhs element Vgr protein  50.48 
 
 		 336 aa  272  2.9999999999999997e-71  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2254  Rhs element Vgr protein  29.26 
 
 		 875 aa  271  4e-71  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2182  Rhs element Vgr protein  27.82 
 
 		 911 aa  268  5e-70  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.368954  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2169  Rhs element Vgr protein  30.68 
 
 		 933 aa  262  3e-68  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4974  Rhs element Vgr protein  27.1 
 
 		 958 aa  255  3e-66  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2744  type VI secretion system Vgr family protein  28.62 
 
 		 851 aa  255  4.0000000000000004e-66  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4080  Rhs element Vgr protein  28.62 
 
 		 853 aa  253  1e-65  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03644  Rhs element Vgr protein  29.93 
 
 		 906 aa  244  7.999999999999999e-63  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02464  Rhs element Vgr protein  29.76 
 
 		 906 aa  243  1e-62  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01958  putative VGR-related protein  30.74 
 
 		 918 aa  240  9e-62  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.917398  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2668  type VI secretion system Vgr family protein  25.31 
 
 		 895 aa  238  3e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2559  type VI secretion system Vgr family protein  25.61 
 
 		 895 aa  237  1.0000000000000001e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2686  Rhs element Vgr protein  25.73 
 
 		 891 aa  234  8.000000000000001e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.308688  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2639  Rhs element Vgr protein  24.79 
 
 		 895 aa  231  6e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2028  Rhs element Vgr protein  24.69 
 
 		 895 aa  227  8e-58  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.14177  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7609  Rhs element Vgr protein  29.03 
 
 		 947 aa  219  1e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.823228 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02040  Rhs element Vgr protein  27.81 
 
 		 847 aa  217  9.999999999999999e-55  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.406402  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2209  type VI secretion system Vgr family protein  25.95 
 
 		 895 aa  215  2.9999999999999995e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2206  type VI secretion system Vgr family protein  28.5 
 
 		 927 aa  214  4.9999999999999996e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3327  type VI secretion system Vgr family protein  25.46 
 
 		 850 aa  211  4e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.702291 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00502  Rhs element Vgr protein  28.02 
 
 		 920 aa  207  7e-52  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00270  Rhs element Vgr protein  28.05 
 
 		 920 aa  206  2e-51  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5730  type VI secretion system Vgr family protein  24.74 
 
 		 868 aa  206  2e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0627617  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0410  type VI secretion system Vgr family protein  24.97 
 
 		 853 aa  203  9.999999999999999e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0383  type VI secretion system Vgr family protein  25.21 
 
 		 1057 aa  202  1.9999999999999998e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0352  type VI secretion system Vgr family protein  24.87 
 
 		 1059 aa  201  6e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2693  Rhs element Vgr protein, putative  27.8 
 
 		 942 aa  200  1.0000000000000001e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3549  Rhs element Vgr protein  25.03 
 
 		 1074 aa  197  8.000000000000001e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.321828 
 
 
-
 
NC_003296  RS01970  putative VGR-related protein  26.88 
 
 		 898 aa  196  1e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.298061 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1769  hypothetical protein  26.17 
 
 		 1111 aa  196  1e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3567  Rhs element Vgr protein  25.51 
 
 		 892 aa  196  2e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4023  Rhs element Vgr protein  25.36 
 
 		 923 aa  196  3e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.78403 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1615  Rhs element Vgr protein  27.19 
 
 		 946 aa  194  6e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1771  Rhs element Vgr protein  27.37 
 
 		 946 aa  194  7e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.156841  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2648  Rhs element Vgr protein  24.77 
 
 		 1063 aa  194  8e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0459  Rhs element Vgr protein  24.77 
 
 		 1063 aa  194  9e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.139035  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0434  type VI secretion system Vgr family protein  24.97 
 
 		 1063 aa  193  1e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000011014 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1590  Rhs element Vgr protein  27.37 
 
 		 946 aa  193  1e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0367  Rhs element Vgr protein  25.1 
 
 		 1057 aa  193  1e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2922  type VI secretion system Vgr family protein  26 
 
 		 853 aa  191  5e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.228171  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0475  Rhs element Vgr protein  25.97 
 
 		 853 aa  189  3e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.494661  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02054  Rhs element Vgr protein  27.89 
 
 		 849 aa  187  8e-46  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3777  type VI secretion system Vgr family protein  25.3 
 
 		 850 aa  186  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.028091 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4617  Rhs element Vgr protein  25.41 
 
 		 850 aa  186  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.761294  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3746  Rhs element Vgr protein  25.41 
 
 		 850 aa  186  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0271118 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2517  type VI secretion system Vgr family protein  29.5 
 
 		 616 aa  186  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2329  Rhs element Vgr protein  23.91 
 
 		 968 aa  184  7e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2568  Rhs element Vgr protein  29.07 
 
 		 661 aa  184  8.000000000000001e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0240  Rhs element Vgr protein  29.07 
 
 		 661 aa  184  9.000000000000001e-45  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0511  Rhs element Vgr protein  29.07 
 
 		 661 aa  184  9.000000000000001e-45  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1269  Rhs element Vgr protein  29.07 
 
 		 661 aa  184  9.000000000000001e-45  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0412192  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1057  Rhs element Vgr protein  29.07 
 
 		 661 aa  184  9.000000000000001e-45  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.517121  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1320  Rhs element Vgr protein  28.88 
 
 		 661 aa  183  1e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.249702  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1401  Rhs element Vgr protein  29.07 
 
 		 661 aa  184  1e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.764688  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1436  Rhs element Vgr protein  29.07 
 
 		 661 aa  183  2e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.064161  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2697  Rhs element Vgr protein, putative  28.41 
 
 		 1111 aa  182  4e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7612  Rhs element Vgr protein  26.59 
 
 		 1114 aa  181  4.999999999999999e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1610  Rhs element Vgr protein  28.39 
 
 		 1111 aa  181  4.999999999999999e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03738  putative VGR-related protein  25 
 
 		 957 aa  181  7e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.198638 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0006  type VI secretion system Vgr family protein  22.98 
 
 		 852 aa  179  2e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0359048  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1585  Rhs element Vgr protein  28.1 
 
 		 1111 aa  176  1.9999999999999998e-42  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.163096  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6440  type VI secretion system Vgr family protein  23.96 
 
 		 843 aa  171  8e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.720009  normal  0.358804 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4983  Rhs element Vgr protein  27.95 
 
 		 614 aa  171  9e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1281  type VI secretion system Vgr family protein  23.93 
 
 		 843 aa  170  1e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.435024  normal  0.300855 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2760  type VI secretion system Vgr family protein  27.45 
 
 		 613 aa  170  1e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.68949 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2618  Rhs element Vgr protein  28.65 
 
 		 618 aa  170  1e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.576781 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5512  Rhs element Vgr protein  24.82 
 
 		 902 aa  169  2e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0019  type VI secretion system Vgr family protein  25.53 
 
 		 730 aa  167  8e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3106  hypothetical protein  28.37 
 
 		 618 aa  164  1e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.166384  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0894  type VI secretion system Vgr family protein  25.16 
 
 		 886 aa  164  1e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1191  Rhs element Vgr protein  26.96 
 
 		 703 aa  161  4e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5680  type VI secretion system Vgr family protein  24.71 
 
 		 975 aa  154  5e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.555449  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2999  Rhs element Vgr protein  23.82 
 
 		 910 aa  154  8e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.228485 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3859  type VI secretion system Vgr family protein  25.78 
 
 		 901 aa  154  1e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03220  hypothetical protein  25.92 
 
 		 1019 aa  153  2e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000195826 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01531  Rhs element Vgr protein  27.52 
 
 		 892 aa  152  4e-35  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3371  type VI secretion system Vgr family protein  26.91 
 
 		 922 aa  149  2.0000000000000003e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS00397  putative VGR-related protein  24.87 
 
 		 908 aa  148  5e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.873856 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2630  Rhs element Vgr protein  26.42 
 
 		 847 aa  146  2e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.690564  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0207  Rhs element Vgr protein  23.31 
 
 		 855 aa  144  6e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.118716  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69550  hypothetical protein  29.64 
 
 		 680 aa  143  9.999999999999999e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.256731  normal  0.401785 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>