160 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_04712 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010717  PXO_04712  Rhs element Vgr protein  100 
 
 		 336 aa  666    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04700  Rhs element Vgr protein  98.68 
 
 		 979 aa  579  1e-164  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02029  Rhs element Vgr protein  90.77 
 
 		 928 aa  561  1.0000000000000001e-159  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7615  Rhs element Vgr protein  49.84 
 
 		 984 aa  276  4e-73  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.874813 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2212  type VI secretion system Vgr family protein  50.16 
 
 		 981 aa  273  4.0000000000000004e-72  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0855  Rhs element Vgr protein  46.11 
 
 		 935 aa  270  2e-71  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1766  Rhs element Vgr protein  46.41 
 
 		 935 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1377  Rhs element Vgr protein  45.81 
 
 		 935 aa  267  2e-70  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.369821  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0498  Rhs element Vgr protein  45.81 
 
 		 935 aa  267  2e-70  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1606  Rhs element Vgr protein  45.81 
 
 		 935 aa  267  2e-70  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0659  Rhs element Vgr protein  45.81 
 
 		 935 aa  267  2e-70  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1580  Rhs element Vgr protein  45.51 
 
 		 935 aa  266  2.9999999999999995e-70  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0391  Rhs element Vgr protein  47.55 
 
 		 1094 aa  266  4e-70  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.437245 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2705  Rhs element Vgr protein  46.41 
 
 		 932 aa  266  4e-70  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0394  Rhs element Vgr protein  46.91 
 
 		 811 aa  265  8e-70  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.787309 
 
 
-
 
NC_003296  RS01940  putative VGR-related protein  43.71 
 
 		 1006 aa  223  3e-57  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS04687  putative VGR-related protein  43.45 
 
 		 962 aa  216  5e-55  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02035  Rhs element Vgr protein  74.38 
 
 		 129 aa  174  2.9999999999999996e-42  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.807362  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0204  Rhs element Vgr protein  30.03 
 
 		 869 aa  139  8.999999999999999e-32  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4974  Rhs element Vgr protein  33.64 
 
 		 958 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2254  Rhs element Vgr protein  31 
 
 		 875 aa  133  3.9999999999999996e-30  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2274  Rhs element Vgr protein  30.57 
 
 		 871 aa  127  3e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2668  type VI secretion system Vgr family protein  30.89 
 
 		 895 aa  124  3e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2028  Rhs element Vgr protein  29.97 
 
 		 895 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.14177  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2639  Rhs element Vgr protein  29.97 
 
 		 895 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3567  Rhs element Vgr protein  29.71 
 
 		 892 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0367  Rhs element Vgr protein  28.48 
 
 		 1057 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0383  type VI secretion system Vgr family protein  28.48 
 
 		 1057 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2182  Rhs element Vgr protein  33.02 
 
 		 911 aa  112  1.0000000000000001e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.368954  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4023  Rhs element Vgr protein  27.94 
 
 		 923 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.78403 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3549  Rhs element Vgr protein  28.48 
 
 		 1074 aa  108  9.000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.321828 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5512  Rhs element Vgr protein  27.36 
 
 		 902 aa  108  1e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2559  type VI secretion system Vgr family protein  29.05 
 
 		 895 aa  108  1e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5730  type VI secretion system Vgr family protein  28.62 
 
 		 868 aa  107  3e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0627617  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2686  Rhs element Vgr protein  27.44 
 
 		 891 aa  105  8e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.308688  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44900  hypothetical protein  29.27 
 
 		 842 aa  104  2e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0151345  normal  0.422437 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0475  Rhs element Vgr protein  26.16 
 
 		 853 aa  103  3e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.494661  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0410  type VI secretion system Vgr family protein  25.8 
 
 		 853 aa  104  3e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3327  type VI secretion system Vgr family protein  25.97 
 
 		 850 aa  103  5e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.702291 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0434  type VI secretion system Vgr family protein  27.18 
 
 		 1063 aa  103  5e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000011014 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3371  type VI secretion system Vgr family protein  27.66 
 
 		 922 aa  102  7e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0352  type VI secretion system Vgr family protein  27.51 
 
 		 1059 aa  102  1e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2922  type VI secretion system Vgr family protein  28.03 
 
 		 853 aa  102  1e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.228171  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2648  Rhs element Vgr protein  27.18 
 
 		 1063 aa  101  2e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0459  Rhs element Vgr protein  26.54 
 
 		 1063 aa  101  2e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.139035  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3777  type VI secretion system Vgr family protein  27.57 
 
 		 850 aa  100  3e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.028091 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2169  Rhs element Vgr protein  27.22 
 
 		 933 aa  100  5e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03738  putative VGR-related protein  27.62 
 
 		 957 aa  98.2  2e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.198638 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4617  Rhs element Vgr protein  27.57 
 
 		 850 aa  98.2  2e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.761294  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3746  Rhs element Vgr protein  27.57 
 
 		 850 aa  98.2  2e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0271118 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02040  Rhs element Vgr protein  28.21 
 
 		 847 aa  95.1  1e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.406402  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02038  Rhs element Vgr protein  29.26 
 
 		 477 aa  94.4  2e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.307189  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03220  hypothetical protein  29.41 
 
 		 1019 aa  93.2  6e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000195826 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1248  hypothetical protein  29.08 
 
 		 1019 aa  92  1e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.60494  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5209  Rhs element Vgr protein  27.79 
 
 		 922 aa  89.4  8e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3479  Rhs element Vgr protein  28.43 
 
 		 897 aa  87.8  2e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.477057 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0013  Rhs element Vgr protein  26.54 
 
 		 771 aa  86.7  5e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0785  Rhs element Vgr protein  25 
 
 		 832 aa  84.7  0.000000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4796  Rhs element Vgr protein  27.21 
 
 		 911 aa  84.3  0.000000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2225  Rhs element Vgr protein  30.79 
 
 		 835 aa  83.2  0.000000000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03644  Rhs element Vgr protein  28.34 
 
 		 906 aa  80.9  0.00000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02464  Rhs element Vgr protein  28.34 
 
 		 906 aa  80.9  0.00000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2504  Rhs element Vgr protein  25.18 
 
 		 782 aa  80.5  0.00000000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0788  Rhs element Vgr protein  24.34 
 
 		 900 aa  80.1  0.00000000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2744  type VI secretion system Vgr family protein  29.26 
 
 		 851 aa  79.7  0.00000000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2983  Rhs element Vgr protein  25.18 
 
 		 782 aa  79.7  0.00000000000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.389792  hitchhiker  0.000144528 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0169  hypothetical protein  25.53 
 
 		 782 aa  78.6  0.0000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000232253 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3130  type VI secretion system Vgr family protein  22.49 
 
 		 835 aa  79  0.0000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3640  type VI secretion system Vgr family protein  25.94 
 
 		 941 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4080  Rhs element Vgr protein  27.22 
 
 		 853 aa  78.2  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2329  Rhs element Vgr protein  29.19 
 
 		 968 aa  77.8  0.0000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5469  type VI secretion system Vgr family protein  29 
 
 		 1284 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.387829  normal  0.0913862 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0733  type VI secretion system family protein  25.53 
 
 		 782 aa  77.8  0.0000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0805  type VI secretion system Vgr family protein  24.54 
 
 		 782 aa  77  0.0000000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.637165  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5366  Rhs element Vgr protein  27.67 
 
 		 1284 aa  76.3  0.0000000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.317319  normal  0.534977 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6440  type VI secretion system Vgr family protein  24.83 
 
 		 843 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.720009  normal  0.358804 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1790  Rhs element Vgr protein  25.93 
 
 		 792 aa  75.9  0.000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4492  type VI secretion system Vgr family protein  29.94 
 
 		 834 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5128  Rhs element Vgr protein  29.94 
 
 		 834 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5731  Rhs element Vgr protein  29.94 
 
 		 834 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.611211 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0933  Rhs element Vgr protein, putative  24.07 
 
 		 780 aa  74.3  0.000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.218046  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1531  Rhs element Vgr protein, putative  24.38 
 
 		 780 aa  74.3  0.000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.398232  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0006  type VI secretion system Vgr family protein  22.22 
 
 		 852 aa  73.6  0.000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0359048  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7022  type VI secretion system Vgr family protein  25.79 
 
 		 846 aa  73.6  0.000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2142  Rhs element Vgr protein  26.96 
 
 		 961 aa  73.9  0.000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3220  putative VGR-related protein  23.87 
 
 		 509 aa  73.2  0.000000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00376065 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00270  Rhs element Vgr protein  29.39 
 
 		 920 aa  73.2  0.000000000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0100  Rhs element Vgr protein  29.52 
 
 		 926 aa  72.8  0.000000000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01531  Rhs element Vgr protein  31.05 
 
 		 892 aa  72.8  0.000000000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01970  putative VGR-related protein  27.12 
 
 		 898 aa  72.4  0.00000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.298061 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00502  Rhs element Vgr protein  29.38 
 
 		 920 aa  72.4  0.00000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04253  Rhs element Vgr protein  27.3 
 
 		 612 aa  72.4  0.00000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7612  Rhs element Vgr protein  25.48 
 
 		 1114 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0089  Rhs element Vgr protein, putative  29.07 
 
 		 926 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3225  Rhs element Vgr protein, putative  29.07 
 
 		 926 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6429  type VI secretion system Vgr family protein  23.95 
 
 		 955 aa  69.7  0.00000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.727988 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4520  type VI secretion system Vgr family protein  29.91 
 
 		 927 aa  69.7  0.00000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1615  putative Rhs element Vgr protein  29.84 
 
 		 928 aa  69.7  0.00000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.491638  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0179  Rhs element Vgr protein  23.1 
 
 		 783 aa  69.7  0.00000000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.109522  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02054  Rhs element Vgr protein  28.57 
 
 		 849 aa  69.3  0.00000000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>