More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_1785 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_3302  alpha amylase catalytic region  62.5 
 
 		 566 aa  669    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.15105  normal  0.0149256 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08990  glycosidase  61.66 
 
 		 570 aa  652    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.134217  normal  0.0194138 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2164  alpha amylase catalytic region  65.34 
 
 		 571 aa  704    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.126804  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2176  alpha amylase catalytic region  67.88 
 
 		 567 aa  743    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.374326  normal  0.160369 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13840  glycosidase  62.14 
 
 		 605 aa  710    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0384787  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1785  alpha amylase catalytic region  100 
 
 		 599 aa  1190    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.326803 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1529  alpha amylase catalytic region  61.37 
 
 		 593 aa  699    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.331611  normal  0.956497 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02470  Alpha-glucosidase  58.49 
 
 		 576 aa  625  1e-178  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.914818  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0622  alpha amylase catalytic region  56.76 
 
 		 609 aa  624  1e-177  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.653551 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01920  glycosidase  58.19 
 
 		 607 aa  612  9.999999999999999e-175  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0412  alpha amylase, catalytic region  58.63 
 
 		 640 aa  605  9.999999999999999e-173  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51470  Alpha-glucosidase  59.89 
 
 		 565 aa  608  9.999999999999999e-173  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3538  alpha amylase catalytic region  61.21 
 
 		 546 aa  601  1e-170  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.489113  normal  0.592754 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12260  glycosidase  55.99 
 
 		 563 aa  589  1e-167  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.203639  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0695  alpha amylase catalytic region  55.04 
 
 		 533 aa  565  1e-160  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.497083 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0743  alpha amylase, catalytic region  56.17 
 
 		 573 aa  555  1e-157  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.802881  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5893  alpha amylase catalytic region  54.35 
 
 		 507 aa  552  1e-156  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.186774 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0833  alpha-glucosidase  55.12 
 
 		 544 aa  529  1e-149  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3342  conserved hypothetical protein; K01187 alpha- glucosidase  53.25 
 
 		 538 aa  529  1e-149  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.292623  normal  0.0532512 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1739  alpha amylase catalytic region  54.09 
 
 		 550 aa  527  1e-148  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000285446  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3038  alpha amylase, catalytic region  50.17 
 
 		 568 aa  525  1e-148  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11590  glycosidase  53.9 
 
 		 522 aa  523  1e-147  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1883  alpha amylase catalytic region  54.28 
 
 		 538 aa  516  1.0000000000000001e-145  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.681572 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2981  alpha amylase catalytic region  52.3 
 
 		 540 aa  516  1.0000000000000001e-145  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000000947876  normal  0.0148383 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8467  alpha amylase catalytic region  50.43 
 
 		 544 aa  513  1e-144  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0947398 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6925  conserved hypothetical protein; K01187 alpha- glucosidase  51.49 
 
 		 545 aa  513  1e-144  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.179369  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22590  glycosidase  54.69 
 
 		 555 aa  511  1e-143  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.144788  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0775  alpha amylase, catalytic region  52.61 
 
 		 534 aa  511  1e-143  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0745  alpha amylase catalytic region  51.37 
 
 		 543 aa  505  9.999999999999999e-143  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.215044  hitchhiker  0.000627206 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3700  alpha amylase catalytic region  50.44 
 
 		 560 aa  508  9.999999999999999e-143  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.715458  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0801  alpha amylase, catalytic region  51.72 
 
 		 543 aa  504  1e-141  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.235668  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2111  alpha amylase catalytic region  54.09 
 
 		 555 aa  501  1e-140  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2546  alpha amylase, catalytic region  52.36 
 
 		 561 aa  499  1e-140  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24650  glycosidase  50.08 
 
 		 567 aa  495  1e-139  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1134  alpha amylase catalytic region  51.07 
 
 		 531 aa  492  9.999999999999999e-139  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.746257  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5859  alpha amylase catalytic region  49.91 
 
 		 558 aa  489  1e-137  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.63248 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3357  alpha amylase catalytic region  51.77 
 
 		 539 aa  487  1e-136  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.925027  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3300  alpha amylase catalytic region  51.1 
 
 		 560 aa  483  1e-135  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.522775  normal  0.208807 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2746  alpha amylase catalytic region  48.65 
 
 		 570 aa  484  1e-135  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00507625 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3849  alpha amylase, catalytic region  51.06 
 
 		 554 aa  484  1e-135  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0257835 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2030  alpha amylase catalytic region  48.72 
 
 		 587 aa  479  1e-134  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.31853  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3695  alpha amylase catalytic region  50.44 
 
 		 524 aa  482  1e-134  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.660519  normal  0.194739 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0062  alpha amylase catalytic region  48.81 
 
 		 553 aa  481  1e-134  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.3547  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF00610  alpha-glucosidase, putative  44.77 
 
 		 563 aa  476  1e-133  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.260556  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27360  glycosidase  51.41 
 
 		 554 aa  478  1e-133  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.155559  normal  0.548604 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7356  conserved hypothetical protein; K01187 alpha- glucosidase  51.15 
 
 		 511 aa  475  1e-132  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1390  alpha amylase catalytic region  47.26 
 
 		 533 aa  467  9.999999999999999e-131  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.794681  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2798  alpha amylase catalytic region  53.04 
 
 		 548 aa  467  9.999999999999999e-131  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3603  alpha amylase catalytic region  47.5 
 
 		 572 aa  465  1e-129  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3708  alpha amylase catalytic region  49.18 
 
 		 549 aa  463  1e-129  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0503251  hitchhiker  0.00685051 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12496  alpha-glucosidase aglA (maltase)  49.47 
 
 		 546 aa  457  1e-127  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.447411  normal  0.123805 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2158  alpha amylase catalytic region  49.12 
 
 		 542 aa  452  1.0000000000000001e-126  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2119  alpha amylase catalytic region  50.26 
 
 		 560 aa  454  1.0000000000000001e-126  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1495  glycosidase  45.31 
 
 		 556 aa  446  1.0000000000000001e-124  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3611  alpha amylase, catalytic region  48.78 
 
 		 539 aa  442  1e-123  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.275383  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6968  alpha amylase catalytic region  47.18 
 
 		 561 aa  443  1e-123  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.144872  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3684  alpha amylase, catalytic region  48.78 
 
 		 539 aa  442  1e-123  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.942466  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3616  alpha amylase, catalytic region  48.78 
 
 		 539 aa  442  1e-123  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.381116 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5406  conserved hypothetical protein; K01187 alpha- glucosidase  46.91 
 
 		 512 aa  440  9.999999999999999e-123  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1532  alpha amylase catalytic region  50.54 
 
 		 532 aa  441  9.999999999999999e-123  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1150  alpha amylase, catalytic region  48.98 
 
 		 634 aa  434  1e-120  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4692  alpha amylase catalytic region  47.74 
 
 		 580 aa  426  1e-118  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.375992  normal  0.284886 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4117  alpha amylase catalytic region  50.88 
 
 		 548 aa  424  1e-117  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.357071  normal  0.208807 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1323  alpha-amylase  42.56 
 
 		 604 aa  423  1e-117  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5316  alpha amylase catalytic region  53.55 
 
 		 594 aa  424  1e-117  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0561676  normal  0.278605 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1017  alpha amylase catalytic region  45.47 
 
 		 544 aa  416  9.999999999999999e-116  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.503917 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1794  alpha amylase catalytic region  45.03 
 
 		 543 aa  397  1e-109  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.209676  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2320  alpha amylase catalytic region  42.19 
 
 		 547 aa  342  2e-92  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.80263 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3687  alpha amylase, catalytic region  41.19 
 
 		 540 aa  340  4e-92  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1475  alpha amylase catalytic region  40.59 
 
 		 553 aa  333  7.000000000000001e-90  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0777  alpha amylase catalytic region  40.88 
 
 		 532 aa  332  1e-89  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.876516  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0307  alpha amylase catalytic subunit  39.79 
 
 		 525 aa  328  1.0000000000000001e-88  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4891  alpha amylase, catalytic region  39.78 
 
 		 538 aa  320  3.9999999999999996e-86  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3102  alpha amylase catalytic region  39.25 
 
 		 548 aa  318  1e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.355967  normal  0.289712 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2833  alpha amylase catalytic region  39.25 
 
 		 548 aa  318  2e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.518671  normal  0.538121 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4274  alpha amylase catalytic region  43.61 
 
 		 529 aa  317  3e-85  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3169  alpha amylase, catalytic region  41.3 
 
 		 530 aa  317  4e-85  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5769  alpha amylase catalytic region  40.08 
 
 		 535 aa  314  2.9999999999999996e-84  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2736  alpha amylase, catalytic region  39.71 
 
 		 543 aa  314  2.9999999999999996e-84  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.70509  normal  0.436177 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0942  oligo-1,6-glucosidase, putative  41.41 
 
 		 539 aa  310  4e-83  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3300  alpha-glucosidase  39.4 
 
 		 555 aa  310  4e-83  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2303  alpha amylase catalytic region  43.61 
 
 		 448 aa  310  5e-83  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.190789 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5268  alpha amylase catalytic region  43.89 
 
 		 540 aa  309  9e-83  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1017  alpha amylase catalytic region  40.15 
 
 		 537 aa  309  1.0000000000000001e-82  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.487933  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0416  alpha amylase catalytic region  43.59 
 
 		 557 aa  308  3e-82  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3307  HAD-superfamily hydrolase subfamily IA, variant 3  42.51 
 
 		 735 aa  306  7e-82  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.081208  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0672  alpha amylase, catalytic region  40.07 
 
 		 533 aa  305  2.0000000000000002e-81  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.227468 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1969  alpha amylase catalytic region  40.2 
 
 		 536 aa  305  2.0000000000000002e-81  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.786718  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3863  alpha amylase catalytic region  42.24 
 
 		 541 aa  304  3.0000000000000004e-81  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00249861  normal  0.684332 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1931  alpha amylase, catalytic region  42.03 
 
 		 541 aa  303  4.0000000000000003e-81  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.126366  normal  0.0171494 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5528  alpha amylase catalytic region  39.64 
 
 		 545 aa  304  4.0000000000000003e-81  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.283745  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3104  trehalose-6-phosphate hydrolase  43.74 
 
 		 515 aa  303  7.000000000000001e-81  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0986221  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1662  alpha amylase, catalytic region  38.15 
 
 		 544 aa  302  1e-80  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.723863  normal  0.697753 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3077  alpha amylase catalytic region  43.67 
 
 		 535 aa  301  2e-80  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0346516 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0021  alpha amylase catalytic region  39.63 
 
 		 530 aa  301  3e-80  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.193993  normal  0.266827 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3325  alpha amylase catalytic region  37.26 
 
 		 556 aa  299  9e-80  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0029  alpha amylase, catalytic region  41.22 
 
 		 536 aa  299  1e-79  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5242  alpha amylase catalytic region  40.63 
 
 		 538 aa  296  5e-79  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0039  alpha amylase, catalytic region  40.82 
 
 		 536 aa  296  8e-79  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2294  Alpha amylase, catalytic region  40.56 
 
 		 542 aa  296  1e-78  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.960991  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>