More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_1726 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_1726  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 		 144 aa  289  9e-78  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.108071  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3205  transcriptional regulator, MarR family  38.79 
 
 		 147 aa  84.7  4e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000109713  hitchhiker  0.00541794 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6524  transcriptional regulator, MarR family  37.93 
 
 		 146 aa  79  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00893581  normal  0.0928109 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3890  MarR family transcriptional regulator  48.98 
 
 		 144 aa  77.4  0.00000000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3964  MarR family transcriptional regulator  48.98 
 
 		 144 aa  77.4  0.00000000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.528609  normal  0.520443 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3876  MarR family transcriptional regulator  48.98 
 
 		 144 aa  77.4  0.00000000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.156722 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1596  transcriptional regulator, MarR family  38.52 
 
 		 148 aa  75.9  0.0000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.665279  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6596  transcriptional regulator, MarR family  37.86 
 
 		 140 aa  74.7  0.0000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000155903 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4344  MarR family transcriptional regulator  44.21 
 
 		 144 aa  74.3  0.0000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.747818  normal  0.0412659 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2607  transcriptional regulator, MarR family  36.7 
 
 		 158 aa  70.5  0.000000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.116422 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0825  transcriptional regulator, MarR family  36.36 
 
 		 156 aa  68.6  0.00000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0733  MarR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 156 aa  68.2  0.00000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0770  MarR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 156 aa  68.2  0.00000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2239  transcriptional regulator, MarR family  40.86 
 
 		 146 aa  67.8  0.00000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.222685  normal  0.0457312 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0682  MarR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 157 aa  67.8  0.00000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2302  MarR family transcriptional regulator  44.79 
 
 		 139 aa  67.4  0.00000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2388  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 168 aa  67.4  0.00000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0862  MarR family transcriptional regulator  35.35 
 
 		 156 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4686  MarR family transcriptional regulator  41.05 
 
 		 168 aa  65.9  0.0000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00000388035  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4123  MarR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 175 aa  63.5  0.0000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00388815  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3957  MarR family transcriptional regulator  40 
 
 		 165 aa  62  0.000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.432771  normal  0.0893513 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8206  MarR family  35.14 
 
 		 156 aa  60.5  0.000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3949  transcriptional regulatory protein  39.36 
 
 		 179 aa  60.1  0.00000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5248  MarR family transcriptional regulator  39.36 
 
 		 151 aa  59.7  0.00000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.282441  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5336  MarR family transcriptional regulator  39.36 
 
 		 151 aa  59.7  0.00000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.293186 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5627  MarR family transcriptional regulator  39.36 
 
 		 151 aa  59.7  0.00000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.281141  normal  0.686349 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5196  transcriptional regulator, MarR family  47.69 
 
 		 161 aa  60.1  0.00000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.416383  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5487  Transcriptional regulators-like protein  44.44 
 
 		 169 aa  58.5  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.303163  normal  0.0138039 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1500  transcriptional regulator, MarR family  26.06 
 
 		 157 aa  58.5  0.00000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7503  transcriptional regulator, MarR family  34.11 
 
 		 156 aa  57.8  0.00000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3350  transcriptional regulator, MarR family  42.03 
 
 		 164 aa  57.8  0.00000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0764351  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1342  transcriptional regulator, MarR family  38.2 
 
 		 156 aa  57  0.00000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000398816 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4631  transcriptional regulator, MarR family  30.15 
 
 		 162 aa  56.6  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0697845 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4000  MarR family transcriptional regulator  40.58 
 
 		 188 aa  55.8  0.0000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.869888 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5060  MarR family transcriptional regulator  28.36 
 
 		 149 aa  55.5  0.0000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.391119  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7275  MarR family transcriptional regulator  39.53 
 
 		 151 aa  55.1  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.430156  normal  0.0802572 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2288  transcriptional regulator, MarR family  36.67 
 
 		 140 aa  54.3  0.0000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.068173 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0875  MarR family transcriptional regulator  36.14 
 
 		 166 aa  53.5  0.0000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.445474 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1589  MarR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 169 aa  53.9  0.0000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0850023  normal  0.119457 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1379  transcriptional regulator, MarR family  34.88 
 
 		 149 aa  53.5  0.0000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.92932 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1634  transcriptional regulator, MarR family  34.34 
 
 		 140 aa  52.8  0.000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0355019  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5097  transcriptional regulator, MarR family  38.64 
 
 		 151 aa  53.1  0.000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4639  MarR family transcriptional regulator  40.58 
 
 		 186 aa  53.1  0.000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0356  MarR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 193 aa  52.8  0.000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.36145 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1312  transcriptional regulator, MarR family  30.53 
 
 		 164 aa  52  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.230395  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1519  transcriptional regulator, MarR family  39.08 
 
 		 144 aa  52  0.000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.513004  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1154  MarR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 164 aa  51.2  0.000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.246648  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2120  MarR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 164 aa  51.2  0.000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.401109  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1595  MarR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 164 aa  51.2  0.000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000929046  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0255  MarR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 164 aa  51.2  0.000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1958  MarR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 164 aa  51.2  0.000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1975  MarR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 164 aa  51.2  0.000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0792948  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0906  MarR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 164 aa  51.2  0.000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.670814  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2725  putative transcription regulator protein  55.36 
 
 		 157 aa  51.2  0.000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.612085  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0282  MarR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 157 aa  50.8  0.000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.486948  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1740  MarR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 136 aa  50.4  0.000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.140466  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7239  transcriptional regulator, MarR family  36 
 
 		 147 aa  50.1  0.000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7677  hypothetical protein  36.11 
 
 		 162 aa  50.1  0.00001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  hitchhiker  0.00437604  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2070  transcriptional regulator, MarR family  40.54 
 
 		 163 aa  49.7  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3234  transcriptional regulator, MarR family  27.34 
 
 		 151 aa  50.1  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0823  transcriptional regulator, MarR family  27.34 
 
 		 150 aa  50.1  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2129  MarR family transcriptional regulator  29.09 
 
 		 148 aa  50.1  0.00001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0697643  normal  0.94503 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6003  MarR family transcriptional regulator  35.79 
 
 		 244 aa  50.1  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.14161 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4409  transcriptional regulator, MarR family  27.78 
 
 		 161 aa  50.1  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2632  MarR family transcriptional regulator  39.08 
 
 		 161 aa  49.7  0.00001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.256033  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3234  transcriptional regulator, MarR family  50.98 
 
 		 154 aa  49.7  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.255403  hitchhiker  0.00212329 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0565  MarR family transcriptional regulator  31.68 
 
 		 193 aa  48.9  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2651  transcriptional regulator, MarR family  40.91 
 
 		 160 aa  48.9  0.00002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6016  MarR family transcriptional regulator  30.66 
 
 		 226 aa  48.9  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0276025 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2889  MarR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 167 aa  49.3  0.00002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000416849 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4510  MarR family transcriptional regulator  28.46 
 
 		 150 aa  49.3  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.88228  normal  0.825822 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2317  MarR family transcriptional regulator  30.48 
 
 		 150 aa  48.5  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1964  MarR family transcriptional regulator  42.31 
 
 		 150 aa  48.5  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000642572  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0762  MarR family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 149 aa  48.5  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.967077  normal  0.4484 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2118  transcriptional regulator, MarR family  28.16 
 
 		 151 aa  48.9  0.00003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3221  MarR family transcriptional regulator  31.67 
 
 		 153 aa  48.5  0.00003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4072  MarR family transcriptional regulator  41.79 
 
 		 147 aa  48.5  0.00003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1559  MarR family transcriptional regulator  40.32 
 
 		 142 aa  48.5  0.00003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.184935 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0962  MarR family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 165 aa  48.5  0.00003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.100112  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3184  transcriptional regulator, MarR family  37.11 
 
 		 162 aa  48.5  0.00003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.824605 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1653  MarR family transcriptional regulator  30.09 
 
 		 177 aa  48.1  0.00004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.959419  normal  0.745484 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0630  MarR family transcriptional regulator  35.24 
 
 		 194 aa  48.1  0.00004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3538  regulatory protein MarR  46.3 
 
 		 153 aa  48.1  0.00004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.671328  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1059  transcriptional regulator, TrmB  36.36 
 
 		 153 aa  48.1  0.00004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0495893  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0218  MarR family transcriptional regulator  31.37 
 
 		 143 aa  48.1  0.00004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02870  transcriptional regulator  40 
 
 		 157 aa  48.1  0.00004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6384  MarR family transcriptional regulator  39.73 
 
 		 143 aa  48.1  0.00004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0220  MarR family transcriptional regulator  31.37 
 
 		 143 aa  48.1  0.00004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0877  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 159 aa  48.1  0.00004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.600163  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3834  transcriptional regulator, MarR family  36.84 
 
 		 175 aa  47.8  0.00005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4218  transcriptional regulator, MarR family  29.89 
 
 		 128 aa  47.8  0.00005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.440858  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3566  MarR family transcriptional regulator  28.08 
 
 		 164 aa  47.8  0.00005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1639  transcriptional regulator, MarR family  27.08 
 
 		 149 aa  47.8  0.00005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0131  transcriptional regulator, MarR family  39.44 
 
 		 138 aa  47.8  0.00006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3524  transcriptional regulator, MarR family  28.87 
 
 		 158 aa  47.4  0.00006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000157721  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15420  transcriptional regulator  36.26 
 
 		 158 aa  47.4  0.00006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.481321  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3714  MarR family transcriptional regulator  30.88 
 
 		 150 aa  47.8  0.00006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0613  MarR family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 150 aa  47.8  0.00006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.31364  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3727  MarR family transcriptional regulator  30.88 
 
 		 150 aa  47.8  0.00006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4463  MarR family transcriptional regulator  41.79 
 
 		 151 aa  47.4  0.00006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0490827  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>