More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1710b_2104 on replicon NC_007434
Organism: Burkholderia pseudomallei 1710b



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010717  PXO_05538  RHS Repeat family  39.98 
 
 		 1579 aa  734    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0425564  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2806  YD repeat-/RHS repeat-containing protein  62.71 
 
 		 1552 aa  1806    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0766  YD repeat-containing protein  41.85 
 
 		 1466 aa  1068    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.668703  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2104  rhsD protein  100 
 
 		 1593 aa  3271    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0967057  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1171  rhsD protein  62.71 
 
 		 1543 aa  1808    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0267  rhsD protein  56.62 
 
 		 1539 aa  1593    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0248  YD repeat protein  35.89 
 
 		 1434 aa  779    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.116954  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00285  RhsD protein  39.9 
 
 		 1428 aa  733    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0673678  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0698  YD repeat-/RHS repeat-containing protein  42.2 
 
 		 1492 aa  1070    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.632091  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2951  RhsD protein  56.14 
 
 		 1539 aa  1575    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00283  RhsD protein  44.85 
 
 		 613 aa  451  1e-125  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.333499  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1792  YD repeat-containing protein  62.76 
 
 		 348 aa  434  1e-120  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.227953  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1609  YD repeat-containing protein  62.76 
 
 		 348 aa  434  1e-120  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0462  YD repeat-containing protein  62.76 
 
 		 352 aa  433  1e-119  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.756225  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0412  YD repeat-containing protein  62.57 
 
 		 342 aa  426  1e-117  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0858889  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0353  YD repeat-containing protein  28.12 
 
 		 1547 aa  353  2e-95  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0435  YD repeat-containing protein  28.68 
 
 		 1527 aa  345  4e-93  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00763231 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3481  YD repeat-containing protein  28.21 
 
 		 1586 aa  343  1e-92  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.130925  normal  0.269624 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3550  Rhs family protein  27.02 
 
 		 1560 aa  342  5e-92  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.955949 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0460  YD repeat-containing protein  28.28 
 
 		 1551 aa  340  1.9999999999999998e-91  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.61036  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0368  YD repeat-containing protein  28.25 
 
 		 1520 aa  337  1e-90  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.268176  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6418  YD repeat-containing protein  25.3 
 
 		 1368 aa  337  1e-90  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0100911  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0770  YD repeat-containing protein  34.56 
 
 		 693 aa  333  1e-89  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.163533  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5681  RHS protein  27.22 
 
 		 1609 aa  332  5.0000000000000004e-89  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0384  YD repeat-containing protein  27.99 
 
 		 1550 aa  331  7e-89  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.223676  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1422  YD repeat-containing protein  27.75 
 
 		 1197 aa  330  1.0000000000000001e-88  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.645858  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8640  YD repeat protein  28.07 
 
 		 1518 aa  321  7.999999999999999e-86  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.357358  normal  0.924086 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4580  YD repeat protein  26.02 
 
 		 1401 aa  320  2e-85  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.315308  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4797  rhs-related transmembrane protein, YD repeat protein  27.42 
 
 		 1626 aa  318  6e-85  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2081  YD repeat protein  26.31 
 
 		 1528 aa  318  8e-85  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.359432  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32860  Rhs family protein  28.08 
 
 		 1259 aa  308  6e-82  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.390343  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3519  YD repeat protein  27.01 
 
 		 1508 aa  306  2.0000000000000002e-81  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0534715  normal  0.146276 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3480  YD repeat-containing protein  29.01 
 
 		 1620 aa  304  9e-81  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.219558 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08820  Rhs family protein  27.27 
 
 		 1485 aa  303  1e-80  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0271193  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2563  YD repeat-containing protein  25.93 
 
 		 1611 aa  302  4e-80  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2330  RHS protein  26.83 
 
 		 1573 aa  295  7e-78  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.361613 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5438  Rhs family protein  27.9 
 
 		 1572 aa  293  2e-77  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.196818  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3788  YD repeat-containing protein  27.89 
 
 		 1554 aa  290  1e-76  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0253716  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1676  Rhs family protein  28.68 
 
 		 1586 aa  286  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.143254 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1751  Rhs family protein  28.68 
 
 		 1595 aa  286  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3345  YD repeat-containing protein  26.33 
 
 		 1583 aa  284  9e-75  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.370886  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8635  YD repeat protein  25.26 
 
 		 1489 aa  280  1e-73  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.128218  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1191  YD repeat-containing protein  64.59 
 
 		 425 aa  273  1e-71  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.270395  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43100  putative Rhs family protein  26.16 
 
 		 1614 aa  271  8e-71  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0535223  normal  0.616257 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4986  YD repeat-containing protein  26.17 
 
 		 1409 aa  268  5.999999999999999e-70  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2826  substrate-binding repeat-containing protein  64.36 
 
 		 419 aa  268  5.999999999999999e-70  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4426  Rhs family protein  27.2 
 
 		 1362 aa  267  1e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.479042 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3178  type VI secretion system Vgr family protein  26.42 
 
 		 1981 aa  266  4e-69  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.568675 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0572  YD repeat protein  27.7 
 
 		 1509 aa  265  4.999999999999999e-69  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.442069  n/a   
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6210  RHS protein  28.77 
 
 		 1421 aa  263  2e-68  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0158165  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4544  YD repeat protein  30.77 
 
 		 1488 aa  262  3e-68  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0377133  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2508  YD repeat-containing protein  24.7 
 
 		 1699 aa  261  5.0000000000000005e-68  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0105853  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1826  Rhs family protein  26.23 
 
 		 1429 aa  259  2e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.831768  normal  0.546607 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0648  Rhs family protein  28.1 
 
 		 1446 aa  258  4e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.000723582  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6958  YD repeat protein  27.88 
 
 		 1495 aa  257  1.0000000000000001e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0165328  normal  0.66981 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8624  YD repeat protein  25.86 
 
 		 1528 aa  257  1.0000000000000001e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.165231  normal  0.776649 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0331  Rhs family protein  27.11 
 
 		 1568 aa  254  7e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0499  YD repeat-containing protein  25.54 
 
 		 1604 aa  252  3e-65  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3399  hypothetical protein  26.42 
 
 		 2096 aa  252  5e-65  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.664853  normal  0.744074 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2813  YD repeat protein  25.73 
 
 		 1673 aa  249  2e-64  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2042  Rhs family protein  26.17 
 
 		 1576 aa  249  2e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.901099  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2870  YD repeat protein  26.7 
 
 		 2144 aa  247  1.9999999999999999e-63  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0317  Rhs family protein  28.25 
 
 		 924 aa  245  5e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.325486  normal  0.374096 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0299  YD repeat-containing protein  26 
 
 		 1525 aa  238  5.0000000000000005e-61  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0346  YD repeat-containing protein  23.11 
 
 		 2035 aa  236  3e-60  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2818  YD repeat protein  25.49 
 
 		 1679 aa  234  1e-59  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0012  YD repeat protein  22.87 
 
 		 3027 aa  232  4e-59  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2740  YD repeat-containing protein  26.14 
 
 		 1602 aa  232  4e-59  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3881  YD repeat-containing protein  24.96 
 
 		 1386 aa  229  4e-58  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2521  YD repeat-containing protein  25.57 
 
 		 1509 aa  228  5.0000000000000005e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29400  hypothetical protein  26.74 
 
 		 1317 aa  226  4e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3692  RHS/YD repeat-containing protein  25.22 
 
 		 1419 aa  225  6e-57  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.333413  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0650  YD repeat protein  24.9 
 
 		 1422 aa  222  3.9999999999999997e-56  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.614814  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1504  YD repeat protein  25.1 
 
 		 1457 aa  222  5e-56  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3576  YD repeat protein  28.97 
 
 		 2149 aa  221  8.999999999999998e-56  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.971607  hitchhiker  0.00854554 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2570  YD repeat-containing protein  26.2 
 
 		 1565 aa  221  8.999999999999998e-56  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.332337  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2577  YD repeat-containing protein  26.2 
 
 		 1565 aa  221  8.999999999999998e-56  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.328115  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2838  YD repeat-containing protein  25.23 
 
 		 1654 aa  221  8.999999999999998e-56  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0573188  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4482  YD repeat-containing protein  25.92 
 
 		 1528 aa  220  2e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1403  substrate-binding repeat-containing protein  25.2 
 
 		 1541 aa  219  2.9999999999999998e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2570  YD repeat-containing protein  25.35 
 
 		 1541 aa  218  7e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0238  YD repeat-containing protein  25.14 
 
 		 1541 aa  218  9.999999999999999e-55  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.691901  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0509  YD repeat-containing protein  25.14 
 
 		 1541 aa  218  9.999999999999999e-55  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0575036  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1059  YD repeat-containing protein  25.14 
 
 		 1541 aa  218  9.999999999999999e-55  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1266  YD repeat-containing protein  25.2 
 
 		 1381 aa  215  4.9999999999999996e-54  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1322  substrate-binding repeat-containing protein  25.27 
 
 		 1541 aa  215  5.999999999999999e-54  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2434  RHS protein  24.92 
 
 		 1348 aa  214  7.999999999999999e-54  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3233  YD repeat protein  25 
 
 		 1639 aa  214  9e-54  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.471244  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18610  YD repeat protein  27.19 
 
 		 2277 aa  210  1e-52  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3959  hypothetical protein  28.04 
 
 		 1319 aa  208  6e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1283  YD repeat-containing protein  28.55 
 
 		 1531 aa  208  6e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.950777 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4951  YD repeat-containing protein  25.87 
 
 		 1495 aa  206  3e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.746977 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4805  YD repeat-containing protein  25.08 
 
 		 1229 aa  205  7e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.739306  normal  0.809733 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5261  YD repeat-containing protein  26.28 
 
 		 1487 aa  204  8e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.792751 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4990  YD repeat-containing protein  27.19 
 
 		 867 aa  204  9e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0647  RHS Repeat family protein  25.21 
 
 		 1616 aa  204  9.999999999999999e-51  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0115  YD repeat protein  26.71 
 
 		 1377 aa  202  3e-50  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2936  YD repeat protein  26.4 
 
 		 1397 aa  202  6e-50  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1235  hypothetical protein  25.64 
 
 		 1405 aa  201  1.0000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.617923 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4085  RHS family protein, putative  25.38 
 
 		 1530 aa  200  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.572678  normal  0.0133781 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>