168 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_7842 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_7842  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 182 aa  356  9.999999999999999e-98  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.341573  normal  0.515425 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0676  TetR family transcriptional regulator  72.97 
 
 		 191 aa  258  3e-68  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.49013  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1060  transcriptional regulator, TetR family  67.4 
 
 		 186 aa  249  2e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0130577  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0913  transcriptional regulator, TetR family  65.75 
 
 		 186 aa  243  9e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.457382 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2134  transcriptional regulator, TetR family  59.67 
 
 		 186 aa  204  5e-52  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1146  TetR family transcriptional regulator  65.19 
 
 		 194 aa  204  5e-52  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3422  transcriptional regulator, TetR family  63.33 
 
 		 187 aa  202  2e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.296256  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1297  transcriptional regulator, TetR family  62.22 
 
 		 182 aa  202  3e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4264  TetR family transcriptional regulator  58.1 
 
 		 181 aa  194  7e-49  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3295  transcriptional regulator, TetR family  58.99 
 
 		 185 aa  192  2e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.457543 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3102  regulatory protein TetR  61.67 
 
 		 187 aa  186  1e-46  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.44802  normal  0.6435 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0043  transcriptional regulator, TetR family  48.62 
 
 		 188 aa  138  4.999999999999999e-32  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3948  transcriptional regulator, TetR family  39.2 
 
 		 180 aa  130  9e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2270  TetR family transcriptional regulator  34.43 
 
 		 189 aa  89  3e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1649  TetR family transcriptional regulator  29.94 
 
 		 192 aa  80.5  0.00000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.279043 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3052  TetR family transcriptional regulator  32.37 
 
 		 183 aa  77.8  0.00000000000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.186092 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2114  transcriptional regulator, TetR family  32.63 
 
 		 193 aa  70.5  0.00000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4071  putative transcriptional regulator, TetR family  31.75 
 
 		 193 aa  65.5  0.0000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0294777  normal  0.94431 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3452  transcriptional regulator, TetR family  30.06 
 
 		 205 aa  62  0.000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0294937  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0268  TetR family transcriptional regulator  28.14 
 
 		 202 aa  59.7  0.00000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.329049 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2948  transcriptional regulator, TetR family  29.94 
 
 		 193 aa  59.3  0.00000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000720602  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3353  TetR family transcriptional regulator  29.69 
 
 		 195 aa  58.5  0.00000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5016  transcriptional regulator, TetR family  30.77 
 
 		 191 aa  58.2  0.00000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.000793722  normal  0.491919 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2559  transcriptional regulator, TetR family  31.28 
 
 		 191 aa  57.8  0.00000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.927467  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2645  TetR family transcriptional regulator  25.54 
 
 		 194 aa  56.6  0.0000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.154552  normal  0.491764 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3185  transcriptional regulator, TetR family  23.08 
 
 		 192 aa  57  0.0000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2638  TetR family transcriptional regulator  27.92 
 
 		 210 aa  55.8  0.0000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0064  TetR family transcriptional regulator  34.1 
 
 		 210 aa  55.8  0.0000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1648  hypothetical protein  24.43 
 
 		 211 aa  55.5  0.0000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.273732 
 
 
-
 
NC_003296  RS01911  putative transcription regulator protein  32.2 
 
 		 191 aa  55.1  0.0000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0303213 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2580  TetR family transcriptional regulator  31.21 
 
 		 211 aa  55.1  0.0000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.257801 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1963  TetR family transcriptional regulator  43.48 
 
 		 190 aa  55.1  0.0000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.264679 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48190  putative transcriptional regulator  26.84 
 
 		 186 aa  54.3  0.000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0114913  normal  0.0538885 
 
 
-
 
NC_008505  LACR_C37  transcriptional regulator  24.61 
 
 		 191 aa  53.5  0.000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1740  transcriptional regulator, TetR family  31.18 
 
 		 188 aa  54.3  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.976934  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28390  transcriptional regulator  28.22 
 
 		 195 aa  53.1  0.000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7118  putative transcriptional regulator, TetR family  31.21 
 
 		 186 aa  53.1  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0105564  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2924  regulatory protein TetR  28.57 
 
 		 204 aa  53.5  0.000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5860  TetR family transcriptional regulator  26.22 
 
 		 194 aa  53.5  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1699  transcriptional regulator, TetR family  27.53 
 
 		 205 aa  52.8  0.000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.502572  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4749  TetR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 207 aa  52  0.000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.590058  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0127  transcriptional regulator, TetR family  25.57 
 
 		 193 aa  52.4  0.000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5683  transcriptional regulator, TetR family  32.28 
 
 		 189 aa  51.6  0.000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4358  regulatory protein, TetR  27.07 
 
 		 220 aa  51.6  0.000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10198  transcriptional regulator  30.67 
 
 		 194 aa  50.4  0.00001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2209  transcriptional regulator, TetR family  29.83 
 
 		 204 aa  49.7  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1146  TetR family transcriptional regulator  31.55 
 
 		 216 aa  49.3  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.390773  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0795  TetR family transcriptional regulator  29.23 
 
 		 199 aa  48.9  0.00004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00985009  normal  0.205797 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5463  transcriptional regulator, TetR family  30.46 
 
 		 212 aa  48.9  0.00004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0798  transcriptional regulator, TetR family  29.28 
 
 		 194 aa  48.5  0.00005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01892  transcription regulator protein  35.06 
 
 		 207 aa  48.1  0.00007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00576188  normal  0.449964 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6284  regulatory protein, TetR  28.93 
 
 		 195 aa  47.8  0.00008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3520  TetR family transcriptional regulator  29.27 
 
 		 236 aa  48.1  0.00008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0735  TetR family transcriptional regulator  28.27 
 
 		 212 aa  47.8  0.00008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.177644  normal  0.315987 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3489  transcriptional regulator, TetR family  32.06 
 
 		 200 aa  47.8  0.00008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3237  TetR family transcriptional regulator  26.28 
 
 		 193 aa  48.1  0.00008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0582489  normal  0.651915 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0122  transcriptional regulator, TetR family  30.53 
 
 		 204 aa  47.8  0.00008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.288839  decreased coverage  0.00195597 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1410  TetR family transcriptional regulator  25.27 
 
 		 194 aa  47.4  0.0001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3545  transcriptional regulator, TetR family  25 
 
 		 192 aa  47  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2110  transcriptional regulator, TetR family  30 
 
 		 200 aa  47  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0942807  normal  0.362877 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4482  TetR family transcriptional regulator  29.56 
 
 		 197 aa  47  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.14402  normal  0.0182705 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0275  TetR family transcriptional regulator  28.9 
 
 		 193 aa  47  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.280469  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4594  TetR family transcriptional regulator  30.97 
 
 		 199 aa  47.8  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0206  TetR family transcriptional regulator  25.73 
 
 		 205 aa  47.4  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.611612 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0949  transcriptional regulator, TetR family  29.76 
 
 		 286 aa  47  0.0001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4813  TetR family transcriptional regulator  27.22 
 
 		 223 aa  47  0.0001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3836  transcriptional regulator, TetR family  27.96 
 
 		 192 aa  47.4  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.410307  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2720  TetR family transcriptional regulator  29.19 
 
 		 194 aa  46.6  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.532546  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5306  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 193 aa  46.2  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.635344  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2215  TetR family transcriptional regulator  24.58 
 
 		 215 aa  46.6  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2764  TetR family transcriptional regulator  29.19 
 
 		 194 aa  46.6  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5395  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 193 aa  46.2  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.488916  normal  0.171159 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1864  transcriptional regulator, TetR family  31.85 
 
 		 204 aa  47  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0665556  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2194  transcriptional regulator, TetR family  28.31 
 
 		 203 aa  46.2  0.0002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.285199  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1242  TetR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 212 aa  46.6  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000053734  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1874  putative regulatory protein  39.85 
 
 		 198 aa  46.6  0.0002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.885441  normal  0.710734 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0114  transcriptional regulator, TetR family  25.61 
 
 		 197 aa  46.2  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.13405  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7134  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 204 aa  45.8  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0109323  normal  0.572193 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2304  transcriptional regulator, TetR family  27.22 
 
 		 201 aa  45.8  0.0004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5685  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 193 aa  45.4  0.0004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2750  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 194 aa  45.4  0.0005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.209675  normal  0.0475693 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1940  TetR family transcriptional regulator  28.26 
 
 		 198 aa  45.4  0.0005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.688335  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3845  transcriptional regulator, TetR family  25.62 
 
 		 209 aa  45.4  0.0005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00359694  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2272  TetR family transcriptional regulator  22.37 
 
 		 194 aa  45.4  0.0005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0259  transcriptional regulator, TetR family  41.07 
 
 		 195 aa  45.1  0.0006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3341  TetR family transcriptional regulator  41.07 
 
 		 196 aa  45.1  0.0006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0882  transcriptional regulator, TetR family  40.82 
 
 		 233 aa  44.7  0.0007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3212  TetR family transcriptional regulator  43.14 
 
 		 193 aa  44.7  0.0007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0659  transcriptional regulator TetR family  28.11 
 
 		 196 aa  44.7  0.0007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2754  regulatory protein, TetR  35.42 
 
 		 219 aa  44.7  0.0008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.396057  normal  0.0231562 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1255  TetR family transcriptional regulator  24.59 
 
 		 200 aa  44.7  0.0008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5542  transcriptional regulator, TetR family  37.11 
 
 		 194 aa  44.7  0.0008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.789571  normal  0.111085 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0581  putative transcriptional regulator  38.6 
 
 		 189 aa  44.7  0.0008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2629  transcriptional regulator, TetR family  33.86 
 
 		 212 aa  43.9  0.001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4004  TetR family transcriptional regulator  23.81 
 
 		 196 aa  44.3  0.001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.638592  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4306  TetR family transcriptional regulator  30.85 
 
 		 202 aa  44.3  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.651969  normal  0.688785 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6080  transcriptional regulator, TetR family  25.44 
 
 		 199 aa  43.9  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2582  TetR family transcriptional regulator  33.86 
 
 		 212 aa  43.9  0.001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.120721 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2112  transcriptional regulator RutR  33.86 
 
 		 212 aa  43.9  0.001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3845  TetR family transcriptional regulator  21.31 
 
 		 193 aa  44.3  0.001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>