182 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_0336 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008541  Arth_0336  LmbE family protein  100 
 
 		 471 aa  940    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0556  LmbE family protein  59.65 
 
 		 464 aa  528  1e-149  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20100  uncharacterized LmbE-like protein  43.32 
 
 		 502 aa  328  1.0000000000000001e-88  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.153307  normal  0.245779 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0511  LmbE family protein  42.92 
 
 		 464 aa  302  8.000000000000001e-81  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.211712  decreased coverage  0.000000388452 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01090  uncharacterized LmbE-like protein  42.55 
 
 		 708 aa  283  5.000000000000001e-75  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3271  LmbE family protein  38.67 
 
 		 462 aa  279  7e-74  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000861736  hitchhiker  0.0000637715 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5977  LmbE family protein  35.05 
 
 		 447 aa  195  2e-48  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2568  LmbE family protein  34.89 
 
 		 427 aa  176  9.999999999999999e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.219184  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3000  methyltransferase, putative  41.03 
 
 		 208 aa  155  1e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3133  methyltransferase, putative  40.82 
 
 		 208 aa  155  2e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0805315  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2541  NodS  41.11 
 
 		 199 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.43061 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2028  putative methyltransferase protein  47.13 
 
 		 201 aa  147  4.0000000000000006e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2654  methyltransferase type 12  42.78 
 
 		 199 aa  146  8.000000000000001e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.268056  normal  0.772066 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1799  methyltransferase type 12  33.33 
 
 		 265 aa  142  9.999999999999999e-33  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.399656  normal  0.0767519 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2638  NodS family protein  40.45 
 
 		 199 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.589636 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5417  methyltransferase type 12  42.37 
 
 		 199 aa  142  1.9999999999999998e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.791352 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1345  methyltransferase type 12  41.11 
 
 		 191 aa  141  3e-32  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0930798  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3257  methyltransferase, putative  41.01 
 
 		 199 aa  140  4.999999999999999e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.509429  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2504  methyltransferase type 12  41.01 
 
 		 199 aa  140  4.999999999999999e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2239  Methyltransferase type 12  41.34 
 
 		 201 aa  139  1e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4938  NodS  40.31 
 
 		 203 aa  139  2e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2920  Methyltransferase type 12  45.1 
 
 		 195 aa  136  9.999999999999999e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.338698  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0200  Methyltransferase type 12  39.62 
 
 		 240 aa  133  6.999999999999999e-30  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4156  Methyltransferase type 12  45.7 
 
 		 198 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0265563  normal  0.868511 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3847  methyltransferase type 12  45.03 
 
 		 198 aa  128  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3595  Methyltransferase type 12  40.54 
 
 		 192 aa  122  9.999999999999999e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0201  LmbE family protein  36.11 
 
 		 277 aa  121  1.9999999999999998e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.910977  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4100  NodS  36.26 
 
 		 192 aa  118  3e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.246696  normal  0.139963 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4304  Methyltransferase type 12  45.7 
 
 		 197 aa  117  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0637573  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4069  LmbE-like protein  34.39 
 
 		 260 aa  115  2.0000000000000002e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.64995  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3661  methyltransferase type 12  39.07 
 
 		 197 aa  113  9e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0983592  normal  0.117601 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5873  methyltransferase type 12  39.47 
 
 		 197 aa  112  2.0000000000000002e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.444387 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1800  LmbE-like protein  29.48 
 
 		 286 aa  108  2e-22  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.14671 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0019  NodS family protein  35.29 
 
 		 207 aa  103  5e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.136752  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0800  Methyltransferase type 12  38.62 
 
 		 202 aa  98.2  3e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.721847 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2542  LmbE-like protein  33.33 
 
 		 252 aa  96.7  9e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.439463 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0577  methyltransferase type 12  34.41 
 
 		 192 aa  94.4  4e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2653  LmbE family protein  36.94 
 
 		 251 aa  93.6  6e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.327123  normal  0.817849 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5872  LmbE family protein  37.27 
 
 		 252 aa  92.4  1e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.359965 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3258  LmbE family protein  36.04 
 
 		 251 aa  91.7  2e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2503  LmbE family protein  36.04 
 
 		 251 aa  90.9  4e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3132  hypothetical protein  31.74 
 
 		 257 aa  90.5  6e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.226704  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2999  LmbE-like protein  32.62 
 
 		 257 aa  90.5  6e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10890  uncharacterized LmbE-like protein  40.12 
 
 		 234 aa  87.4  5e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0375606  normal  0.400819 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2637  LmbE family protein  32.89 
 
 		 250 aa  85.1  0.000000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.338459  normal  0.600261 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2160  LmbE family protein  32.17 
 
 		 292 aa  84.3  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3594  LmbE family protein  32.66 
 
 		 246 aa  84.3  0.000000000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0020  LmbE family protein  34.17 
 
 		 255 aa  81.3  0.00000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.128438  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2921  LmbE family protein  29.22 
 
 		 264 aa  77.8  0.0000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0797  LmbE family protein  33.18 
 
 		 244 aa  77.8  0.0000000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.34049  normal  0.5646 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1304  LmbE family protein  27.8 
 
 		 207 aa  77.4  0.0000000000005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.528408  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4346  LmbE-like protein  37.82 
 
 		 302 aa  76.3  0.000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4099  LmbE-like protein  31.34 
 
 		 246 aa  74.7  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.149754  normal  0.14336 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2062  LmbE family protein  31.56 
 
 		 288 aa  72.8  0.00000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3660  LmbE family protein  32.88 
 
 		 245 aa  73.2  0.00000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.364651  normal  0.122228 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0576  LmbE-like protein  32.86 
 
 		 261 aa  70.5  0.00000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.627816  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0216  hypothetical protein  26.2 
 
 		 277 aa  69.3  0.0000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1286  LmbE family protein  27.48 
 
 		 264 aa  69.3  0.0000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.636367  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1388  LmbE family protein  31.5 
 
 		 245 aa  68.2  0.0000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0664971  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0957  methyltransferase type 12  33.86 
 
 		 190 aa  67.8  0.0000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0352326 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1227  LmbE family protein  30.28 
 
 		 245 aa  67  0.0000000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.986351 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3114  LmbE family protein  25.52 
 
 		 260 aa  66.2  0.000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3198  glycosyl transferase family 2  32.89 
 
 		 1015 aa  66.2  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0137  LmbE family protein  28.37 
 
 		 265 aa  64.7  0.000000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.295286  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7716  NodS family protein  29.69 
 
 		 209 aa  63.9  0.000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0210387  normal  0.935412 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2950  glycosyl transferase family 2  36.92 
 
 		 1001 aa  63.5  0.000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.611527 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1164  LmbE family protein  31.94 
 
 		 245 aa  62.4  0.00000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.147674  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1028  LmbE family protein  25.93 
 
 		 300 aa  58.5  0.0000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.912842  normal  0.457472 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10900  hypothetical protein  30.37 
 
 		 235 aa  57.8  0.0000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.028052  normal  0.399666 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_193  LmbE  26.99 
 
 		 265 aa  57.4  0.0000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.599254  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0697  LmbE family protein  23.15 
 
 		 193 aa  55.5  0.000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1264  LmbE-like protein protein  28.4 
 
 		 322 aa  55.8  0.000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0430129 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0794  Methyltransferase type 12  28.8 
 
 		 404 aa  55.1  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1010  LmbE family protein  25.69 
 
 		 469 aa  55.1  0.000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2445  hypothetical protein  28.26 
 
 		 236 aa  55.1  0.000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.122432  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1330  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 252 aa  54.3  0.000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0651  LmbE family protein  26.89 
 
 		 239 aa  53.9  0.000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.481432 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2539  LmbE-like protein  29.03 
 
 		 253 aa  53.5  0.000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.448814 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3570  LmbE-like protein  27.14 
 
 		 265 aa  52.8  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.839683  decreased coverage  0.00474608 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0339  hypothetical protein  37.5 
 
 		 189 aa  53.1  0.00001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.255644  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1983  methyltransferase type 12  37.5 
 
 		 189 aa  53.1  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.377104  normal  0.388188 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3896  Methyltransferase type 11  28.26 
 
 		 175 aa  52.8  0.00001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2970  hypothetical protein  31 
 
 		 226 aa  51.6  0.00003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9641  peptide synthetase  27.59 
 
 		 3761 aa  52  0.00003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0374  LmbE family protein  31.73 
 
 		 243 aa  51.2  0.00004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2590  methyltransferase type 11  28.78 
 
 		 260 aa  51.2  0.00004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.205764  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2463  LmbE family protein  28.26 
 
 		 259 aa  51.2  0.00004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000204581 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1152  LmbE family protein  32.59 
 
 		 298 aa  51.2  0.00004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.370679  normal  0.107811 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0368  LmbE-like protein protein  30.25 
 
 		 218 aa  50.4  0.00006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2740  LmbE family protein  26.42 
 
 		 258 aa  50.4  0.00007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.384192  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3561  conserved hypothetical protein LmbE  35.23 
 
 		 276 aa  50.4  0.00007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.532852  normal  0.20928 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1118  hypothetical protein  37.5 
 
 		 225 aa  49.7  0.0001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1251  methyltransferase, putative  28.16 
 
 		 229 aa  49.7  0.0001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2387  Methyltransferase type 11  26.04 
 
 		 253 aa  49.7  0.0001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2080  LmbE family protein  37.37 
 
 		 281 aa  49.7  0.0001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0263313  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2430  LmbE family protein  29.96 
 
 		 274 aa  48.5  0.0002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4580  LmbE family protein  27.23 
 
 		 228 aa  48.9  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0453  LmbE family protein  28.93 
 
 		 238 aa  48.9  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1084  1D-myo-inosityl-2-acetamido-2-deoxy-alpha-D- glucopyranoside deacetylase  38.16 
 
 		 294 aa  48.5  0.0003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2036  putative methyltransferase  33.66 
 
 		 243 aa  48.1  0.0003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>