More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeh_3289 on replicon NC_007760
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011145  AnaeK_3364  transcriptional activator domain  95.71 
 
 
1118 aa  1876    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3289  SARP family transcriptional regulator  100 
 
 
1116 aa  2097    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.16943  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3408  transcriptional activator domain protein  94.9 
 
 
1118 aa  1842    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3347  transcriptional activator domain-containing protein  65.36 
 
 
1109 aa  1130    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0338  transcriptional regulator  30.14 
 
 
1193 aa  180  1e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.497277  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4424  transcriptional activator domain-containing protein  30.92 
 
 
1055 aa  179  2e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.518741  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1406  transcriptional activator domain-containing protein  30.64 
 
 
1067 aa  169  4e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4928  transcriptional activator domain-containing protein  31.55 
 
 
1075 aa  168  5.9999999999999996e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.66885  normal  0.971064 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0063  transcriptional regulator  28.32 
 
 
1190 aa  162  4e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.82825  normal  0.766346 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4327  transcriptional activator domain-containing protein  30.63 
 
 
1029 aa  161  6e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.425746 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3683  transcriptional activator domain-containing protein  26.97 
 
 
1034 aa  132  5.0000000000000004e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00198659  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0848  transcriptional regulator, LuxR family  31.25 
 
 
954 aa  129  4.0000000000000003e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2859  transcriptional activator domain protein  34.28 
 
 
999 aa  125  4e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0795  transcriptional regulator, LuxR family  35.14 
 
 
983 aa  120  9.999999999999999e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2581  transcriptional activator domain-containing protein  28.16 
 
 
1183 aa  120  9.999999999999999e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.808302  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0361  LuxR family transcriptional regulator  30.09 
 
 
973 aa  120  1.9999999999999998e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2962  transcriptional activator domain protein  29.15 
 
 
1013 aa  117  1.0000000000000001e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000192637 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1636  TPR repeat transcriptional activator domain-containing protein  27.49 
 
 
1126 aa  116  2.0000000000000002e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2227  XRE family transcriptional regulator  27.75 
 
 
1015 aa  116  2.0000000000000002e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5333  transcriptional regulator, LuxR family  30.93 
 
 
992 aa  117  2.0000000000000002e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1630  SARP family transcriptional regulator  28.95 
 
 
1089 aa  113  2.0000000000000002e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0348  LuxR family transcriptional regulator  30.37 
 
 
975 aa  112  3e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0210125 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2653  response regulator receiver/SARP domain-containing protein  33.08 
 
 
572 aa  112  3e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2428  transcriptional regulator, SARP family  29.38 
 
 
494 aa  112  4.0000000000000004e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3549  transcriptional regulator, LuxR family  29.18 
 
 
1022 aa  110  1e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.642921  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1015  SARP family transcriptional regulator  26.61 
 
 
1216 aa  110  1e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4935  tetratricopeptide TPR_4  30.69 
 
 
1029 aa  110  2e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.179334 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4892  transcriptional activator domain-containing protein  35.81 
 
 
597 aa  109  2e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  normal  0.123982 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4724  transcriptional activator domain-containing protein  25.29 
 
 
713 aa  108  4e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0744  ATPase-like protein  32.12 
 
 
1054 aa  108  7e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0403  transcriptional regulator, LuxR family  34.39 
 
 
981 aa  107  9e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.106797 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4382  regulatory protein, LuxR  29.98 
 
 
1006 aa  107  1e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.172901  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2154  transcriptional activator domain protein  26.91 
 
 
1139 aa  107  2e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0522112 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4653  transcriptional regulator  29.02 
 
 
1148 aa  106  2e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.346184  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2785  transcriptional regulator, LuxR family  30.48 
 
 
1013 aa  106  3e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5023  transcriptional regulator, LuxR family  30.11 
 
 
982 aa  105  5e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3701  SARP family transcriptional regulator  34.59 
 
 
1064 aa  105  6e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000000037794 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1046  transcriptional activator domain protein  28.97 
 
 
1143 aa  104  1e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.203225 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7885  ATPase-like protein  28.12 
 
 
1121 aa  103  2e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.811946  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0773  transcriptional regulator, LuxR family  28.95 
 
 
967 aa  102  4e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3586  adenylate/guanylate cyclase  25.42 
 
 
1123 aa  100  1e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0258664  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1757  transcriptional regulator, LuxR family  30.04 
 
 
993 aa  100  1e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.790916  normal  0.333807 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2863  transcriptional activator domain-containing protein  30.28 
 
 
1132 aa  99.8  3e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1815  transcriptional regulator  27.89 
 
 
1141 aa  99.8  3e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0114746 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3193  LuxR family transcriptional regulator  29.54 
 
 
895 aa  99.4  4e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3322  transcriptional activator domain-containing protein  32.71 
 
 
1204 aa  98.6  7e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.11039  normal  0.190141 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5676  transcriptional regulator, LuxR family  33.42 
 
 
953 aa  97.8  1e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.228112  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7187  transcriptional regulator  32.09 
 
 
1198 aa  97.8  1e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4593  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  26.44 
 
 
1141 aa  97.1  2e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1559  ATPase-like protein  29.28 
 
 
916 aa  96.7  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0078  transcriptional activator domain-containing protein  32.58 
 
 
914 aa  96.7  2e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.323405  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1470  SARP family transcriptional regulator  27.42 
 
 
1141 aa  96.3  3e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6794  transcriptional regulator  26.85 
 
 
723 aa  96.3  3e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6796  transcriptional regulator  32.68 
 
 
1118 aa  96.3  3e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5436  transcriptional regulator, LuxR family  27.51 
 
 
959 aa  95.5  5e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00800009 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4345  transcriptional activator domain-containing protein  31.2 
 
 
1095 aa  95.5  5e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00663384 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5315  transcriptional regulator, LuxR family  30.66 
 
 
965 aa  95.1  6e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00819594  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0699  transcriptional activator domain-containing protein  32 
 
 
1094 aa  95.1  6e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00060152 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0366  transcriptional activator domain protein  31.74 
 
 
1097 aa  94.7  9e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.37715 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1512  response regulator receiver/SARP domain-containing protein  30.52 
 
 
561 aa  94  1e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0226395 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6954  transcriptional regulator, LuxR family  27.25 
 
 
1005 aa  94  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0590  transcriptional activator domain protein  32.6 
 
 
1163 aa  93.6  2e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.422877 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2513  regulatory protein, LuxR  29.89 
 
 
964 aa  92.8  3e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0733559  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1430  adenylate/guanylate cyclase  26.53 
 
 
1160 aa  92.4  4e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0380252  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2600  transcriptional activator domain protein  29.91 
 
 
1108 aa  92.8  4e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1683  sterile alpha motif-containing protein  30.43 
 
 
1122 aa  92.4  4e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.122095  normal  0.480972 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2669  winged helix family transcriptional regulator ATPase  29.72 
 
 
1123 aa  91.7  7e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.940937  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3287  transcriptional activator domain protein  34.38 
 
 
1044 aa  91.7  7e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0920226  hitchhiker  0.00000903469 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8304  transcriptional regulator, LuxR family  31.3 
 
 
1084 aa  91.7  7e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7631  ATPase-like protein  27.43 
 
 
1123 aa  91.3  8e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.289533  normal  0.197233 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4285  ATPase-like protein  27.4 
 
 
1114 aa  91.7  8e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.660299  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0060  transcriptional activator domain-containing protein  33.73 
 
 
1145 aa  90.9  1e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1600  ATPase-like protein  26.75 
 
 
1071 aa  90.5  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3277  transcriptional regulator, LuxR family  30.3 
 
 
970 aa  90.1  2e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.737282  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6308  serine/threonine protein kinase  29.03 
 
 
1235 aa  88.6  6e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4160  transcriptional regulator, LuxR family  34.39 
 
 
872 aa  87.8  0.000000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3460  transcriptional activator domain-containing protein  30.99 
 
 
1061 aa  87.8  0.000000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0253  response regulator receiver and SARP domain protein  30.08 
 
 
661 aa  87.8  0.000000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.52601  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1020  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  25.38 
 
 
1441 aa  86.3  0.000000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5691  sterile alpha motif-containing protein  26.33 
 
 
1055 aa  85.9  0.000000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3612  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  28.76 
 
 
1089 aa  85.5  0.000000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.758157  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1110  transcriptional activator domain-containing protein  27.31 
 
 
1082 aa  85.1  0.000000000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0173  ATP-dependent transcriptional regulator-like protein  25.9 
 
 
1111 aa  84.3  0.00000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0281  transcriptional regulator, LuxR family  30.22 
 
 
947 aa  84  0.00000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1953  transcriptional activator domain protein  29.69 
 
 
1083 aa  84  0.00000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00247822 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4524  adenylate/guanylate cyclase  28.03 
 
 
1105 aa  83.6  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0405  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  28.1 
 
 
1291 aa  83.6  0.00000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5181  adenylate/guanylate cyclase  27.8 
 
 
1227 aa  84  0.00000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.454407  normal  0.397726 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0761  LuxR family transcriptional regulator  23.76 
 
 
881 aa  83.2  0.00000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2409  transcriptional activator domain protein  40 
 
 
1119 aa  82.8  0.00000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00237404 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3945  serine/threonine protein kinase  26.29 
 
 
1402 aa  82.8  0.00000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0258209  decreased coverage  0.00379805 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5465  SARP family transcriptional regulator  31.18 
 
 
775 aa  82  0.00000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4834  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  25.87 
 
 
1149 aa  81.3  0.00000000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.519309  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3733  transcriptional regulator, LuxR family  28.34 
 
 
1007 aa  81.3  0.00000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6475  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  28.28 
 
 
1175 aa  81.3  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.928071  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2662  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  26.49 
 
 
1422 aa  80.9  0.0000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7064  adenylate/guanylate cyclase  25.34 
 
 
1046 aa  80.1  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.48236  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1771  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  27.6 
 
 
1403 aa  79.3  0.0000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00900617  normal  0.173635 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5916  transcriptional regulator, LuxR family  29.07 
 
 
864 aa  79.3  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3318  serine/threonine protein kinase  26.72 
 
 
1403 aa  79.3  0.0000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0363788 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>