More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_4822 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_1907  extracellular ligand-binding receptor  82.49 
 
 		 395 aa  690    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.780883 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4822  extracellular ligand-binding receptor  100 
 
 		 395 aa  808    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.623024  normal  0.429541 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2984  twin-arginine translocation pathway signal  82.78 
 
 		 395 aa  697    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.808904  normal  0.464937 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1329  extracellular ligand-binding receptor  60.15 
 
 		 395 aa  498  1e-140  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1226  extracellular ligand-binding receptor  59.64 
 
 		 397 aa  493  9.999999999999999e-139  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.15047  normal  0.127165 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1622  extracellular ligand-binding receptor  62.77 
 
 		 389 aa  488  1e-137  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.810291 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3653  extracellular ligand-binding receptor  63.39 
 
 		 390 aa  488  1e-137  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0214  extracellular ligand-binding receptor  59.03 
 
 		 393 aa  483  1e-135  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.486026  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2950  extracellular ligand-binding receptor  61.77 
 
 		 387 aa  475  1e-133  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.967573  normal  0.434807 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1779  extracellular ligand-binding receptor  59.28 
 
 		 392 aa  457  1e-127  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000205301 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0087  Extracellular ligand-binding receptor  59.39 
 
 		 394 aa  449  1e-125  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4744  extracellular ligand-binding receptor  54.29 
 
 		 390 aa  445  1.0000000000000001e-124  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2772  extracellular ligand-binding receptor  57.34 
 
 		 390 aa  441  1e-123  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000645997  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0077  extracellular ligand-binding receptor  57.3 
 
 		 387 aa  439  9.999999999999999e-123  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3135  Extracellular ligand-binding receptor  57.62 
 
 		 395 aa  439  9.999999999999999e-123  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3089  Extracellular ligand-binding receptor  55.12 
 
 		 390 aa  426  1e-118  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4035  plasmid encoded RepA protein  53.71 
 
 		 406 aa  424  1e-117  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4371  twin-arginine translocation pathway signal  53.7 
 
 		 402 aa  407  1.0000000000000001e-112  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.392335  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4662  twin-arginine translocation pathway signal  52.33 
 
 		 402 aa  404  1e-111  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.841519 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1017  twin-arginine translocation pathway signal  50.76 
 
 		 392 aa  394  1e-108  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0735  Extracellular ligand-binding receptor  53.7 
 
 		 392 aa  388  1e-107  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2689  Extracellular ligand-binding receptor  35.16 
 
 		 395 aa  209  7e-53  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.00000331787  normal  0.185218 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3174  extracellular ligand-binding receptor  33.7 
 
 		 399 aa  206  6e-52  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0541097  normal  0.740982 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2686  putative ABC transporter substrate binding protein  33.33 
 
 		 390 aa  206  7e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.192979  normal  0.314956 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3998  extracellular ligand-binding receptor  33.7 
 
 		 389 aa  201  1.9999999999999998e-50  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0350284  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1212  Extracellular ligand-binding receptor  34.86 
 
 		 398 aa  194  2e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.787629  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4043  extracellular ligand-binding receptor  30.71 
 
 		 388 aa  193  5e-48  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3643  response regulator receiver protein  34.81 
 
 		 396 aa  192  8e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0163627 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4181  Extracellular ligand-binding receptor  31.35 
 
 		 412 aa  188  1e-46  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2302  Extracellular ligand-binding receptor  32.34 
 
 		 410 aa  185  1.0000000000000001e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4610  extracellular ligand-binding receptor  31.64 
 
 		 389 aa  179  8e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0366  Extracellular ligand-binding receptor  31.58 
 
 		 401 aa  176  9e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2846  Extracellular ligand-binding receptor  33.42 
 
 		 400 aa  175  9.999999999999999e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.743504  normal  0.530964 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5126  extracellular ligand-binding receptor  29.43 
 
 		 388 aa  174  1.9999999999999998e-42  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.189049 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4488  extracellular ligand-binding receptor  31.82 
 
 		 391 aa  174  2.9999999999999996e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0631  Extracellular ligand-binding receptor  29.14 
 
 		 390 aa  169  1e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.276028  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0862  extracellular ligand-binding receptor  31.88 
 
 		 379 aa  168  2e-40  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.284446  normal  0.223955 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5379  Extracellular ligand-binding receptor  31.11 
 
 		 395 aa  167  2.9999999999999998e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.115103  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1987  extracellular ligand-binding receptor  27.7 
 
 		 389 aa  166  5e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.378551  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2120  Extracellular ligand-binding receptor  30.06 
 
 		 389 aa  166  8e-40  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.671824 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0994  extracellular ligand-binding receptor  28.57 
 
 		 391 aa  165  1.0000000000000001e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000312387 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0732  hypothetical protein  29.86 
 
 		 390 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.479144  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1579  extracellular ligand-binding receptor  30.95 
 
 		 392 aa  164  3e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.409097 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0159  extracellular ligand-binding receptor  32.56 
 
 		 395 aa  162  6e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1586  twin-arginine translocation pathway signal  30.81 
 
 		 392 aa  162  1e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.764817 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3268  hypothetical protein  36.01 
 
 		 387 aa  161  2e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.781038 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4211  extracellular ligand-binding receptor  29.7 
 
 		 379 aa  160  4e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0456551  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5707  branched-chain amino acid ABC transporter  30.09 
 
 		 392 aa  160  4e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4559  Extracellular ligand-binding receptor  30.26 
 
 		 392 aa  160  5e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.61677  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6211  extracellular ligand-binding receptor  30.53 
 
 		 413 aa  159  6e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3830  Extracellular ligand-binding receptor  29.11 
 
 		 390 aa  159  1e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3384  extracellular ligand-binding receptor  28.77 
 
 		 390 aa  154  2.9999999999999998e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0249016 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0193  extracellular ligand-binding receptor  30.65 
 
 		 414 aa  152  1e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.271143  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0641  Extracellular ligand-binding receptor  26.56 
 
 		 389 aa  152  1e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.474288  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0794  extracellular ligand-binding receptor  30.34 
 
 		 386 aa  150  3e-35  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5095  ABC transporter substrate binding protei  30.6 
 
 		 381 aa  150  4e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.263393  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2730  extracellular ligand-binding receptor  30.23 
 
 		 390 aa  149  9e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0102883  hitchhiker  0.00729362 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5150  extracellular ligand-binding receptor  29.05 
 
 		 397 aa  148  2.0000000000000003e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.156171 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0288  extracellular ligand-binding receptor  29.89 
 
 		 390 aa  147  3e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3317  Extracellular ligand-binding receptor  30.93 
 
 		 401 aa  147  3e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1747  Extracellular ligand-binding receptor  28.9 
 
 		 391 aa  147  3e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.877738  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2460  extracellular ligand-binding receptor  30.59 
 
 		 390 aa  146  5e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.343297  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2056  Extracellular ligand-binding receptor  30.36 
 
 		 388 aa  146  7.0000000000000006e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2449  Extracellular ligand-binding receptor  30.36 
 
 		 388 aa  146  7.0000000000000006e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4395  extracellular ligand-binding receptor  29.13 
 
 		 395 aa  146  8.000000000000001e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1365  extracellular ligand-binding receptor  28.46 
 
 		 392 aa  145  9e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.780713  normal  0.67049 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2244  substrate-binding periplasmic ABC transporter protein  30.4 
 
 		 392 aa  144  2e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.219706  normal  1 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3724  extracellular ligand-binding receptor  30.05 
 
 		 384 aa  142  8e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.159594  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4136  Extracellular ligand-binding receptor  30.35 
 
 		 399 aa  141  1.9999999999999998e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.831108  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0175  putative ABC transporter binding protein  29.26 
 
 		 393 aa  140  3e-32  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.673441  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2237  extracellular ligand-binding receptor  27.25 
 
 		 376 aa  140  4.999999999999999e-32  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.246635  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0759  extracellular ligand-binding receptor  29.22 
 
 		 426 aa  139  1e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.561575  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4401  extracellular ligand-binding receptor  28.86 
 
 		 407 aa  137  2e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.933784  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0836  extracellular ligand-binding receptor  27.95 
 
 		 390 aa  136  8e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0783302 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0701  extracellular ligand-binding receptor  29.81 
 
 		 423 aa  135  9.999999999999999e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.161591  normal  0.175564 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3688  ABC-type branched-chain amino acid transport systems periplasmic component-like protein  28.72 
 
 		 399 aa  131  2.0000000000000002e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00171007  normal  0.751271 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4775  putative ABC transporter substrate binding protein  30.45 
 
 		 393 aa  131  2.0000000000000002e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00131883  normal  0.383486 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3183  Extracellular ligand-binding receptor  28.87 
 
 		 390 aa  125  9e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.84663  normal  0.596586 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4528  extracellular ligand-binding receptor  30.23 
 
 		 413 aa  125  1e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.521193 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1177  Extracellular ligand-binding receptor  28.01 
 
 		 390 aa  124  3e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2270  extracellular ligand-binding receptor  27.49 
 
 		 391 aa  122  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.733577  normal  0.60166 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4017  extracellular ligand-binding receptor  28.77 
 
 		 391 aa  121  3e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4217  extracellular ligand-binding receptor  29.5 
 
 		 390 aa  120  3e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3730  extracellular ligand-binding receptor  27.14 
 
 		 390 aa  120  6e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4821  putative ABC transport system, periplasmic substrate-binding protein  28.65 
 
 		 416 aa  119  7e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.675554 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3475  Extracellular ligand-binding receptor  28.26 
 
 		 390 aa  119  9.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.361368 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5038  extracellular ligand-binding receptor  28.33 
 
 		 398 aa  117  3e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00742101 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0610  amino acid ABC transporter, periplasmic amino-acid binding protein  27.3 
 
 		 390 aa  117  3e-25  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.110277  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0851  extracellular ligand-binding receptor  28.09 
 
 		 396 aa  117  5e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.532444  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5186  Extracellular ligand-binding receptor  28.85 
 
 		 425 aa  115  1.0000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0648  amino acid ABC transporter, periplasmic amino-acid binding protein  27.02 
 
 		 390 aa  115  2.0000000000000002e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5444  ABC transporter substrate binding protein (branched amino acid)  29.64 
 
 		 406 aa  114  3e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0986  extracellular ligand-binding receptor  29.1 
 
 		 399 aa  110  5e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.763691  unclonable  0.00000240352 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0821  Extracellular ligand-binding receptor  27.2 
 
 		 368 aa  109  7.000000000000001e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1208  extracellular ligand-binding receptor  27.79 
 
 		 396 aa  109  8.000000000000001e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0219  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  29.14 
 
 		 376 aa  109  8.000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00187981  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2240  extracellular ligand-binding receptor  28.49 
 
 		 394 aa  108  2e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2717  extracellular ligand-binding receptor  26.75 
 
 		 396 aa  106  5e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0418912  normal  0.429406 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1392  extracellular ligand-binding receptor  25.32 
 
 		 386 aa  106  7e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2316  extracellular ligand-binding receptor  26.08 
 
 		 437 aa  104  3e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.147685  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>