260 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tter_1874 on replicon NC_013525
Organism: Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013525  Tter_1874  SMC domain protein  100 
 
 		 1021 aa  2061    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2343  SMC domain protein  29.62 
 
 		 912 aa  152  3e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0748  SMC domain-containing protein  24.23 
 
 		 935 aa  147  1e-33  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.874201  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2009  hypothetical protein  36.45 
 
 		 922 aa  132  4.0000000000000003e-29  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1725  nuclease SbcCD, C subunit, putative  24.07 
 
 		 813 aa  127  9e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.536729  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1922  SMC domain protein  36.07 
 
 		 987 aa  123  1.9999999999999998e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.664102 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2301  SMC domain protein  29.39 
 
 		 987 aa  122  3.9999999999999996e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0237  SMC domain-containing protein  23.49 
 
 		 993 aa  114  1.0000000000000001e-23  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0769992  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1375  DNA repair ATPase  29.26 
 
 		 814 aa  112  3e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.000000000366162  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2789  SMC domain protein  23.49 
 
 		 926 aa  106  2e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0068  Rad50 zinc hook domain protein  22.55 
 
 		 864 aa  105  6e-21  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.191393  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1484  SMC domain-containing protein  23.57 
 
 		 1061 aa  103  2e-20  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0728646  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2570  SMC domain-containing protein  33.1 
 
 		 984 aa  89.7  2e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0855  SMC domain protein  32.98 
 
 		 802 aa  86.7  0.000000000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.128097  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1081  SMC domain-containing protein  25 
 
 		 804 aa  85.9  0.000000000000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.000660429  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1332  SMC domain-containing protein  24.51 
 
 		 993 aa  85.5  0.000000000000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0586  SMC domain-containing protein  24.8 
 
 		 993 aa  81.6  0.00000000000007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.594919  normal  0.0182683 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0652  SMC domain-containing protein  26.8 
 
 		 1019 aa  80.1  0.0000000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.105285  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0711  SMC domain-containing protein  28.64 
 
 		 994 aa  79  0.0000000000005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  decreased coverage  0.00173757  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0762  SMC domain-containing protein  22.98 
 
 		 858 aa  78.2  0.0000000000007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0108669  decreased coverage  0.00239369 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0018  SMC domain protein  31.52 
 
 		 862 aa  77.8  0.000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0623828 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1495  SMC domain protein  28.78 
 
 		 895 aa  77.4  0.000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2951  SMC domain protein  21.3 
 
 		 1031 aa  77  0.000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00128287  unclonable  0.000000102622 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0371  chromosome segregation protein  28.35 
 
 		 890 aa  75.1  0.000000000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2437  SMC domain protein  28.98 
 
 		 924 aa  74.3  0.00000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0181  chromosome segregation protein  25.59 
 
 		 902 aa  73.9  0.00000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2898  chromosome segregation protein  28.77 
 
 		 891 aa  72  0.00000000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1245  SMC domain-containing protein  27.12 
 
 		 693 aa  70.9  0.0000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0961  SMC domain protein  22.96 
 
 		 891 aa  70.1  0.0000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000356641  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1617  SMC domain-containing protein  22.46 
 
 		 1057 aa  70.1  0.0000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1709  exonuclease SbcC  28 
 
 		 1008 aa  67  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0985  SMC domain-containing protein  27.34 
 
 		 702 aa  67  0.000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000497741 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1819  SMC domain-containing protein  26.51 
 
 		 702 aa  65.9  0.000000004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  decreased coverage  0.000524613  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1213  SMC domain-containing protein  27.37 
 
 		 806 aa  65.5  0.000000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3877  exonuclease SbcC  28.8 
 
 		 1016 aa  64.7  0.000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.371142  normal  0.0827458 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0948  SMC domain protein  27.84 
 
 		 789 aa  64.3  0.00000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.217826  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0302  SMC domain-containing protein  22.8 
 
 		 702 aa  63.2  0.00000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0205  SMC domain-containing protein  27.96 
 
 		 1180 aa  62.8  0.00000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3541  exonuclease SbcC  27.78 
 
 		 1003 aa  63.2  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.757761  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04030  Exodeoxyribonuclease I subunit C  24.12 
 
 		 1108 aa  62  0.00000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0894457  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1155  SMC domain-containing protein  31.13 
 
 		 852 aa  61.6  0.00000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1300  SMC domain-containing protein  31.13 
 
 		 852 aa  61.6  0.00000008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.975813  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3179  SMC domain-containing protein  22.69 
 
 		 1023 aa  60.8  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0019664  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1488  SMC domain protein  26.67 
 
 		 1114 aa  58.5  0.0000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0673  SMC domain protein  28.11 
 
 		 1116 aa  58.5  0.0000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00700495  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1257  SMC domain protein  24.82 
 
 		 1019 aa  58.2  0.0000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.861215  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7212  DNA repair ATPase-like protein  24.39 
 
 		 648 aa  58.2  0.0000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.236988  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0772  SMC domain protein  30.19 
 
 		 961 aa  57.8  0.000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00238509  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0356  SMC domain-containing protein  33.33 
 
 		 700 aa  57.4  0.000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4561  exonuclease SbcC  25.4 
 
 		 1007 aa  57.8  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1303  SMC domain-containing protein  26.1 
 
 		 1234 aa  57  0.000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1882  SMC domain-containing protein  22.41 
 
 		 805 aa  56.2  0.000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0300452  normal  0.0368515 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1142  SMC domain protein  23.53 
 
 		 857 aa  56.6  0.000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0448  SMC protein-like protein  28.14 
 
 		 955 aa  56.2  0.000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.507994  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4849  nuclease sbcCD subunit C  33.62 
 
 		 1211 aa  56.2  0.000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0713621  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6131  SMC domain protein  37.76 
 
 		 851 aa  55.8  0.000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.983245 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1501  SMC-like protein  21.67 
 
 		 888 aa  55.8  0.000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0905  SMC domain-containing protein  21.88 
 
 		 1022 aa  55.8  0.000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.995306  hitchhiker  0.000299578 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1158  condensin subunit Smc  50 
 
 		 1187 aa  55.8  0.000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00321236  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0696  exonuclease SbcC  29.31 
 
 		 1007 aa  55.8  0.000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1418  chromosome segregation protein SMC  25.15 
 
 		 1181 aa  55.5  0.000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1556  SMC domain-containing protein  33.94 
 
 		 1214 aa  55.5  0.000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.291963 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1882  SMC domain protein  25.97 
 
 		 904 aa  55.1  0.000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.600097  normal  0.549876 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0005  recombination protein F  35.71 
 
 		 377 aa  54.7  0.000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.000288317  hitchhiker  0.00404548 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1540  SMC domain protein  31.9 
 
 		 1182 aa  54.3  0.00001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0360  chromosome segregation protein  36.84 
 
 		 1074 aa  54.3  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55650  putative exonuclease  33.62 
 
 		 1211 aa  54.3  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.49463  normal  0.712595 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0927  condensin subunit Smc  22.73 
 
 		 1190 aa  53.9  0.00002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.177469  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0003  DNA replication and repair protein RecF  48.89 
 
 		 415 aa  53.1  0.00002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.000000951254  normal  0.107465 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1626  SMC domain protein  53.06 
 
 		 978 aa  52.8  0.00003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2750  DNA replication and repair protein RecF  35.79 
 
 		 387 aa  52.8  0.00003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.433504  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1584  SMC domain-containing protein  25.35 
 
 		 1214 aa  53.1  0.00003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.999097  hitchhiker  0.00383377 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0651  SMC domain-containing protein  27.11 
 
 		 1174 aa  53.1  0.00003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.721251 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3718  SMC domain-containing protein  26.03 
 
 		 1214 aa  52.8  0.00003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0549  exonuclease SbcC, putative  24.94 
 
 		 859 aa  52.8  0.00004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2024  SMC domain protein  26.03 
 
 		 1214 aa  52.8  0.00004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3217  exonuclease SbcC  33.03 
 
 		 1213 aa  52.8  0.00004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0454  condensin subunit Smc  45.83 
 
 		 1184 aa  52.8  0.00004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1130  chromosome segregation SMC protein, putative  30.77 
 
 		 1175 aa  52.4  0.00005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1391  SMC domain protein  41.43 
 
 		 526 aa  52.4  0.00005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.156144 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1216  SMC domain protein  38.03 
 
 		 531 aa  52.4  0.00005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05654  DNA repair exonuclease  24.04 
 
 		 1018 aa  52  0.00006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1564  condensin subunit Smc  24.65 
 
 		 1185 aa  52  0.00006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0004  recombination protein F  35.71 
 
 		 371 aa  51.6  0.00007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00656338  n/a   
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_3009  SMC domain protein  41.56 
 
 		 514 aa  51.6  0.00007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2800  recombination protein F  51.16 
 
 		 356 aa  51.6  0.00007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.127366 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2270  chromosome segregation protein SMC  41.82 
 
 		 1147 aa  51.6  0.00008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0859  exonuclease SbcC  28.34 
 
 		 950 aa  51.2  0.00009  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0939  SMC domain-containing protein  25.58 
 
 		 812 aa  51.2  0.00009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0924914  normal  0.567341 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1551  SMC domain-containing protein  43.75 
 
 		 1074 aa  50.8  0.0001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00625316 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1084  chromosome segregation protein SMC  28.44 
 
 		 1187 aa  50.8  0.0001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2776  chromosome segregation protein SMC  35.71 
 
 		 1234 aa  50.4  0.0001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.371529  normal  0.187776 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0004  DNA replication and repair protein RecF  46.51 
 
 		 360 aa  50.8  0.0001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4031  SMC domain-containing protein  26.77 
 
 		 810 aa  51.2  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.515725  normal  0.378288 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0004  recombination protein F  34.57 
 
 		 376 aa  51.2  0.0001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.366352  unclonable  0.0000000175389 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0005  Recombinational DNA repair ATPase (RecF pathway)- like protein  42.22 
 
 		 390 aa  50.8  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.518698  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1574  SMC domain-containing protein  27 
 
 		 840 aa  50.4  0.0001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0162335  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0004  recombination protein F  36.9 
 
 		 386 aa  50.8  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.187663 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2356  chromosome segregation SMC protein  33.96 
 
 		 1173 aa  50.1  0.0002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0899656  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0205  exonuclease SbcC  25.14 
 
 		 1172 aa  50.1  0.0002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.305096  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>