More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_2139 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_2139  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 654 aa  1277    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.43176  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0641  TPR repeat-containing protein  46.22 
 
 		 1094 aa  546  1e-154  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.230386  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0637  TPR repeat-containing protein  47.64 
 
 		 4489 aa  540  9.999999999999999e-153  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1840  TPR repeat-containing protein  45.58 
 
 		 3560 aa  528  1e-148  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1841  TPR repeat-containing protein  45.62 
 
 		 3035 aa  512  1e-144  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0441  TPR repeat-containing protein  43.04 
 
 		 1085 aa  466  9.999999999999999e-131  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.239248 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1233  TPR repeat-containing protein  38.8 
 
 		 909 aa  452  1.0000000000000001e-126  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.161918  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0121  TPR repeat-containing protein  37.83 
 
 		 732 aa  451  1e-125  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.261868  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1389  TPR repeat-containing protein  40.58 
 
 		 700 aa  442  1e-123  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.874801 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1232  TPR repeat-containing protein  37 
 
 		 750 aa  438  1e-121  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.967237  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00731  hypothetical protein  36.8 
 
 		 816 aa  433  1e-120  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.456129 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1827  TPR repeat-containing protein  39.45 
 
 		 761 aa  427  1e-118  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0460239  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0702  TPR repeat-containing protein  45.53 
 
 		 667 aa  422  1e-117  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.274193  normal  0.091435 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2288  TPR repeat-containing protein  41.23 
 
 		 740 aa  417  9.999999999999999e-116  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0489  TPR repeat-containing protein  39.04 
 
 		 618 aa  409  1.0000000000000001e-112  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0261011  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1755  TPR repeat-containing protein  39.47 
 
 		 647 aa  390  1e-107  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0455441 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0825  TPR repeat-containing protein  33.55 
 
 		 739 aa  383  1e-105  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.423694  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1104  TPR repeat-containing protein  40.51 
 
 		 616 aa  378  1e-103  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0122  TPR repeat-containing protein  32.66 
 
 		 660 aa  374  1e-102  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.142603  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0772  TPR repeat-containing protein  38.25 
 
 		 611 aa  370  1e-101  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.447572  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1547  hypothetical protein  47.44 
 
 		 459 aa  363  4e-99  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.948596 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0452  TPR repeat-containing protein  46.86 
 
 		 569 aa  358  1.9999999999999998e-97  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.384213  normal  0.0840159 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1891  hypothetical protein  46.07 
 
 		 492 aa  347  4e-94  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.591473 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20301  hypothetical protein  44.78 
 
 		 395 aa  343  4e-93  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.236649 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3091  hypothetical protein  37.12 
 
 		 680 aa  338  1.9999999999999998e-91  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.677352  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1008  TPR repeat-containing protein  38.63 
 
 		 672 aa  336  1e-90  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0451  TPR repeat-containing protein  41.05 
 
 		 574 aa  334  3e-90  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.871153  normal  0.12833 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3361  TPR repeat-containing protein  36.25 
 
 		 750 aa  321  3e-86  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.311751 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0732  TPR repeat-containing protein  34.02 
 
 		 706 aa  320  6e-86  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3428  tetratricopeptide TPR_2  39.8 
 
 		 560 aa  319  1e-85  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0384278  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1202  TPR repeat-containing protein  28.41 
 
 		 632 aa  316  7e-85  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7846  hypothetical protein  44.47 
 
 		 452 aa  315  1.9999999999999998e-84  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.346388 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1086  hypothetical protein  36.3 
 
 		 632 aa  303  9e-81  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1087  TPR repeat-containing protein  32.51 
 
 		 808 aa  300  6e-80  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04549  tetratricopeptide repeat domain protein  39.02 
 
 		 568 aa  285  1.0000000000000001e-75  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0327  hypothetical protein  39.27 
 
 		 657 aa  285  2.0000000000000002e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.322162 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1161  hypothetical protein  43.27 
 
 		 637 aa  280  6e-74  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.143311  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2579  hypothetical protein  35.33 
 
 		 588 aa  278  2e-73  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.385383  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0359  hypothetical protein  38.67 
 
 		 657 aa  273  7e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.224796  normal  0.0716049 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1319  TPR repeat-containing protein  45.04 
 
 		 295 aa  269  1e-70  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.000000490816  hitchhiker  8.5993e-22 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2997  TPR repeat-containing protein  34.17 
 
 		 708 aa  268  2.9999999999999995e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0127987 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1162  hypothetical protein  38.77 
 
 		 633 aa  267  5e-70  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0720  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  36.06 
 
 		 570 aa  261  2e-68  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.597499 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3853  O-linked acetylglucosamine transferase  37.29 
 
 		 590 aa  259  9e-68  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1088  hypothetical protein  40 
 
 		 566 aa  259  9e-68  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2410  hypothetical protein  39.95 
 
 		 624 aa  258  2e-67  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.361804  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4069  TPR repeat-containing protein  37.11 
 
 		 590 aa  258  2e-67  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.00017793  normal  0.44147 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1160  hypothetical protein  38.97 
 
 		 630 aa  253  6e-66  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.795058  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3824  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  34.96 
 
 		 1106 aa  243  6e-63  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.138221 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2601  TPR domain/SecC motif-containing domain protein  34.9 
 
 		 585 aa  240  6.999999999999999e-62  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0346889  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1636  TPR repeat-containing protein  30.16 
 
 		 968 aa  239  1e-61  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.992619 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2411  hypothetical protein  40.26 
 
 		 582 aa  239  2e-61  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.100681  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3741  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 		 1106 aa  238  2e-61  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0166  TPR repeat-containing protein  34.86 
 
 		 754 aa  231  3e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.268335  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4728  TPR repeat-containing protein  29.97 
 
 		 718 aa  231  3e-59  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.346608 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0153  TPR repeat-containing protein  34.7 
 
 		 754 aa  222  1.9999999999999999e-56  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.372833  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3825  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.17 
 
 		 589 aa  217  7e-55  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0624707 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0165  TPR repeat-containing protein  31.94 
 
 		 828 aa  214  2.9999999999999995e-54  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0585605  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0152  TPR repeat-containing protein  31.94 
 
 		 828 aa  213  7e-54  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2993  TPR repeat-containing protein  31.21 
 
 		 789 aa  213  1e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00312978 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1509  TPR domain-containing protein  28.14 
 
 		 699 aa  212  2e-53  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  unclonable  0.000367862  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0148  TPR repeat-containing protein  31.29 
 
 		 619 aa  208  3e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3742  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.92 
 
 		 589 aa  208  3e-52  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0161  TPR repeat-containing protein  31.38 
 
 		 598 aa  205  2e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2809  TPR repeat-containing protein  30.7 
 
 		 717 aa  204  6e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0461  TPR repeat-containing protein  31.84 
 
 		 627 aa  203  8e-51  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.999909  normal  0.380381 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3338  TPR repeat-containing protein  31.47 
 
 		 595 aa  203  9e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.257374 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3339  TPR repeat-containing protein  31.84 
 
 		 732 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.469864 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3037  TPR repeat-containing protein  30.53 
 
 		 717 aa  199  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.657903 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3340  TPR repeat-containing protein  31.52 
 
 		 828 aa  198  3e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.710571 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_863  predicted protein  27.41 
 
 		 708 aa  195  2e-48  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.622244  normal  0.0203568 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2093  TPR repeat-containing protein  28.6 
 
 		 1714 aa  195  3e-48  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3369  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.81 
 
 		 667 aa  194  3e-48  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0774784  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2855  hypothetical protein  30.46 
 
 		 937 aa  192  2e-47  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3331  TPR repeat-containing protein  30.24 
 
 		 633 aa  191  5e-47  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.332967  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2992  TPR repeat-containing protein  28.88 
 
 		 824 aa  190  8e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000746825 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2996  TPR repeat-containing protein  28.15 
 
 		 626 aa  189  2e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.637966  normal  0.0209641 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0164  TPR repeat-containing protein  32.11 
 
 		 833 aa  188  3e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.863115  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3801  TPR repeat-containing protein  29.32 
 
 		 713 aa  187  8e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.386604  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4399  TPR repeat-containing protein  29.93 
 
 		 727 aa  185  2.0000000000000003e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.516213 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0094  TPR domain-containing protein  29.3 
 
 		 821 aa  184  3e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.822931  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0151  TPR repeat-containing protein  32.88 
 
 		 833 aa  184  3e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0256  hypothetical protein  29.64 
 
 		 719 aa  184  6e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0293  TPR repeat-containing protein  28.57 
 
 		 789 aa  184  6e-45  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3873  TPR repeat-containing protein  29.13 
 
 		 776 aa  183  1e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.661818  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5619  SPINDLY family O-linked N-acetylglucosamine transferase  28.21 
 
 		 739 aa  183  1e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.474452 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2876  TPR domain-containing protein  29.3 
 
 		 821 aa  182  2e-44  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3451  TPR domain-containing protein  29.3 
 
 		 776 aa  182  2e-44  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0799942  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3368  Tetratricopeptide domain protein  27.79 
 
 		 596 aa  182  2e-44  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1668  TPR domain-containing protein  29.3 
 
 		 776 aa  182  2e-44  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.329119  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3099  TPR domain-containing protein  29.3 
 
 		 776 aa  182  2e-44  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3955  TPR repeat-containing protein  29.13 
 
 		 776 aa  181  2.9999999999999997e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0220  TPR repeat-containing protein  29.03 
 
 		 779 aa  179  1e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.991207  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5235  hypothetical protein  28.9 
 
 		 797 aa  179  1e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.050699  normal  0.568835 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0785  TPR repeat-containing protein  28.3 
 
 		 796 aa  177  7e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.225465  hitchhiker  0.00421983 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27710  glycosyl transferase,TPR repeat protein  26.92 
 
 		 1221 aa  177  8e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00265  UDP-N-acetylglucosaminyltransferase (AFU_orthologue; AFUA_1G03380)  25.73 
 
 		 1596 aa  176  9.999999999999999e-43  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0115382 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0238  TPR repeat-containing protein  28.27 
 
 		 780 aa  176  9.999999999999999e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2869  tetratricopeptide TPR_2  28.27 
 
 		 780 aa  176  9.999999999999999e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3065  TPR repeat-containing protein  29.1 
 
 		 734 aa  176  9.999999999999999e-43  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.0065343  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>