91 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_0753 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_0753  glycoside hydrolase family protein  100 
 
 		 465 aa  958    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2639  glycoside hydrolase family 43  35.87 
 
 		 472 aa  92.8  1e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.431626  normal  0.0143862 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2392  glycoside hydrolase family 43  32.84 
 
 		 306 aa  91.3  4e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00000000540158  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0650  glycoside hydrolase family 43  30.98 
 
 		 495 aa  86.3  0.000000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0713148  normal  0.104092 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0206  glycoside hydrolase family 43  38.52 
 
 		 304 aa  85.1  0.000000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.306204  normal  0.253285 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6044  glycoside hydrolase family 43  32.14 
 
 		 501 aa  82  0.00000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.845022  normal  0.0554344 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20580  glycoside hydrolase family 43  32.05 
 
 		 315 aa  79.3  0.0000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2723  glycoside hydrolase family protein  33.74 
 
 		 345 aa  75.1  0.000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.469303  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0536  glycoside hydrolase family 43  31.25 
 
 		 393 aa  75.5  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.812392 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1524  glycoside hydrolase family 43  36.28 
 
 		 524 aa  70.5  0.00000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2722  glycoside hydrolase family protein  31.95 
 
 		 310 aa  69.3  0.0000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.123508  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0473  glycoside hydrolase family 43  29.65 
 
 		 829 aa  68.6  0.0000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.658009  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2482  glycoside hydrolase family 43  29.17 
 
 		 384 aa  67.4  0.0000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.24102 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3360  glycoside hydrolase family 43  31.01 
 
 		 522 aa  66.6  0.0000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0779432 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2022  glycoside hydrolase family 43  23.59 
 
 		 334 aa  65.5  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1729  glycoside hydrolase family 43  25.86 
 
 		 472 aa  65.1  0.000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.101805  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4281  glycoside hydrolase family protein  34.19 
 
 		 304 aa  63.2  0.000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.394059  normal  0.201547 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0739  glycoside hydrolase family protein  32.24 
 
 		 348 aa  63.2  0.000000009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2698  glycoside hydrolase family 43  35.71 
 
 		 369 aa  63.2  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.898004  normal  0.338928 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2027  glycoside hydrolase family protein  27.37 
 
 		 325 aa  61.2  0.00000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.808853  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3903  glycoside hydrolase family protein  38.94 
 
 		 340 aa  60.8  0.00000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.969992  normal  0.175565 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3932  glycoside hydrolase family 43  34.23 
 
 		 456 aa  60.5  0.00000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.325517  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6022  glycoside hydrolase family 43  26.79 
 
 		 319 aa  58.9  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4788  Xylan 1,4-beta-xylosidase  29.69 
 
 		 562 aa  58.2  0.0000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.771274  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0628  glycoside hydrolase family 43  31.47 
 
 		 505 aa  57  0.0000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0745  glycoside hydrolase family 43  39.51 
 
 		 327 aa  56.2  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.465475  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0507  glycoside hydrolase family 43  29.76 
 
 		 337 aa  55.5  0.000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.412329 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0737  glycoside hydrolase family protein  29.41 
 
 		 345 aa  55.8  0.000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.612706  normal  0.340405 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0015  alpha-L-arabinofuranosidase B  24.12 
 
 		 707 aa  55.1  0.000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2837  glycoside hydrolase family 43  28.57 
 
 		 348 aa  55.1  0.000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.61366  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3109  glycoside hydrolase family protein  26.63 
 
 		 644 aa  54.7  0.000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2866  glycoside hydrolase family 43  29.81 
 
 		 487 aa  54.7  0.000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.141314  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16970  beta-xylosidase  29.45 
 
 		 313 aa  54.7  0.000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.374085 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4703  glycoside hydrolase family 43  23.24 
 
 		 341 aa  54.3  0.000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.184013  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1235  Carbohydrate binding family 6  26.92 
 
 		 509 aa  54.7  0.000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00440741  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0639  glycoside hydrolase family protein  26.04 
 
 		 475 aa  53.9  0.000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000370471  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0700  glycoside hydrolase family 43  27.78 
 
 		 522 aa  53.9  0.000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1150  glycoside hydrolase family 43  28.18 
 
 		 560 aa  53.9  0.000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4249  glycoside hydrolase family protein  29.46 
 
 		 532 aa  53.5  0.000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.158619  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0789  endo-1,4-beta-xylanase D precursor  27.51 
 
 		 317 aa  53.1  0.000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0130439  normal  0.452031 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1982  glycoside hydrolase family protein  29.09 
 
 		 315 aa  52.8  0.00001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000000010784  normal  0.0338284 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4504  glycoside hydrolase family 43  28.48 
 
 		 510 aa  52.8  0.00001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0875  glycoside hydrolase family protein  24.3 
 
 		 636 aa  52.8  0.00001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000412559  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2069  glycoside hydrolase family protein  28.05 
 
 		 315 aa  52  0.00002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000027007  hitchhiker  0.0000035019 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2449  glycoside hydrolase family 43  32.76 
 
 		 537 aa  52.4  0.00002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.114761  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0501  glycoside hydrolase family 43  30.56 
 
 		 525 aa  52  0.00002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00998877 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2556  glycoside hydrolase family 43  34.12 
 
 		 319 aa  52  0.00002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.149373  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1992  glycoside hydrolase family protein  28.66 
 
 		 315 aa  52.4  0.00002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000493506  unclonable  0.0000204974 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0662  glycoside hydrolase family protein  27.89 
 
 		 471 aa  52  0.00002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000191922  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0182  glycoside hydrolase family 43  29.12 
 
 		 1338 aa  51.2  0.00003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0664  glycoside hydrolase family protein  26.32 
 
 		 476 aa  51.6  0.00003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0193  glycoside hydrolase family 43  28.57 
 
 		 324 aa  51.2  0.00004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00680352  normal  0.581709 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0935  glycoside hydrolase family 43  26.85 
 
 		 522 aa  50.8  0.00005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3403  glycoside hydrolase family 43  28.74 
 
 		 357 aa  50.4  0.00006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.000194853  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3618  glycoside hydrolase family protein  24.14 
 
 		 508 aa  50.4  0.00007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000797588  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0637  glycoside hydrolase family protein  26.84 
 
 		 471 aa  50.4  0.00007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000622549  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5511  glycoside hydrolase family 43  27.27 
 
 		 536 aa  50.1  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0274092 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29240  beta-xylosidase  30.51 
 
 		 527 aa  48.9  0.0002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2384  glycoside hydrolase family 43  27.88 
 
 		 330 aa  48.9  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3042  twin-arginine translocation pathway signal  27.93 
 
 		 537 aa  48.9  0.0002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.351967  normal  0.568346 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1115  family 43 glycoside hydrolase  26 
 
 		 338 aa  48.1  0.0003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4511  glycoside hydrolase family protein  27.54 
 
 		 341 aa  48.1  0.0003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4021  glycoside hydrolase family protein  30.09 
 
 		 537 aa  48.1  0.0003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.701147 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3213  glycoside hydrolase family 43  33.64 
 
 		 464 aa  47.8  0.0004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.331095  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1500  glycoside hydrolase family 43  27.27 
 
 		 551 aa  48.1  0.0004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.36043 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3048  Alpha-N-arabinofuranosidase  27.68 
 
 		 515 aa  47.4  0.0005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0608814  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4846  Xylan 1,4-beta-xylosidase  20.45 
 
 		 367 aa  47  0.0006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0960373  hitchhiker  0.00474985 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1229  Carbohydrate binding family 6  29.84 
 
 		 535 aa  47.4  0.0006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.166566  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3351  glycoside hydrolase family 43  27.78 
 
 		 522 aa  47  0.0007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3011  Alpha-N-arabinofuranosidase  23.64 
 
 		 538 aa  45.8  0.001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2196  carbohydrate-binding family 6 protein  27.5 
 
 		 533 aa  46.6  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2447  putative xylosidase  32.53 
 
 		 468 aa  45.8  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.320135 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0510  glycoside hydrolase family 43  24.26 
 
 		 456 aa  46.2  0.001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0180422  hitchhiker  0.00320544 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6730  glycoside hydrolase family 43  24.84 
 
 		 323 aa  46.6  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.575675  normal  0.920031 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1231  Carbohydrate binding family 6  25.83 
 
 		 524 aa  46.6  0.001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0177163  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3569  glycoside hydrolase family 43  28.57 
 
 		 484 aa  45.1  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.0058203  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1233  Carbohydrate binding family 6  25 
 
 		 746 aa  45.1  0.003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.555313  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0812  hypothetical protein  29.85 
 
 		 430 aa  44.7  0.003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.612634  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2055  Alpha-N-arabinofuranosidase  29.32 
 
 		 369 aa  45.1  0.003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0795  Xylan 1,4-beta-xylosidase  21.16 
 
 		 346 aa  45.1  0.003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0000173963  normal  0.0629112 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3880  glycoside hydrolase family protein  26.11 
 
 		 571 aa  44.7  0.004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0786  arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  21.33 
 
 		 346 aa  44.3  0.004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000000141301  normal  0.447167 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0598  Alpha-L-arabinofuranosidase  23.53 
 
 		 577 aa  43.9  0.005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.628109 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3276  carbohydrate-binding family 6 protein  31.4 
 
 		 401 aa  43.9  0.006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3612  methionine biosynthesis MetW  28.05 
 
 		 1186 aa  43.5  0.007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0161329  hitchhiker  0.00479901 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1435  glycoside hydrolase family 43  30 
 
 		 545 aa  43.5  0.008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3109  glycoside hydrolase family protein  26.95 
 
 		 348 aa  43.5  0.009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.158232 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1271  carbohydrate-binding family 6 protein  26.15 
 
 		 679 aa  43.1  0.01  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1423  Xylan 1,4-beta-xylosidase  23.68 
 
 		 558 aa  43.1  0.01  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.423704 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0822  Alpha-L-arabinofuranosidase  22.98 
 
 		 385 aa  43.1  0.01  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.000000000001862  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2063  glycoside hydrolase family protein  27.98 
 
 		 311 aa  43.1  0.01  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.00000000284349  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>