More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_02686 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010513  Xfasm12_0866  general secretory pathway protein D precursor  69.65 
 
 		 775 aa  1041    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  decreased coverage  0.00112703  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0779  general secretion pathway protein D  69.4 
 
 		 775 aa  1037    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  decreased coverage  0.00261901  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02686  general secretion pathway protein D  100 
 
 		 766 aa  1540    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.91159  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0556  general secretion pathway protein D  67.62 
 
 		 733 aa  939    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.234016  normal  0.128846 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2173  general secretion pathway protein D  36.07 
 
 		 745 aa  451  1e-125  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3307  general secretion pathway protein D  35.85 
 
 		 763 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.335208  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1309  general secretion pathway protein D  33.08 
 
 		 819 aa  342  1e-92  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0418049  normal  0.0430257 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4150  general secretion pathway protein D  32.05 
 
 		 829 aa  308  3e-82  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0456168  hitchhiker  0.0000162446 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0742  type II and III secretion system protein  31.92 
 
 		 773 aa  301  3e-80  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2609  putative general secretion pathway protein D  31.71 
 
 		 780 aa  301  4e-80  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2098  general secretion pathway protein D  31.91 
 
 		 681 aa  300  7e-80  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.103091  normal  0.703642 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1277  general secretion pathway protein D  30.67 
 
 		 751 aa  291  4e-77  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3010  type II and III secretion system protein  31.57 
 
 		 774 aa  275  2.0000000000000002e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.404539 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0678  general secretion pathway protein D  29.75 
 
 		 720 aa  274  4.0000000000000004e-72  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00783707  decreased coverage  0.00018208 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1587  general secretion pathway protein D  29.86 
 
 		 801 aa  270  1e-70  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.089404 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3141  type II and III secretion system protein:NolW-like  44.72 
 
 		 776 aa  267  5e-70  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.529282  normal  0.96586 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3067  general secretion pathway protein D  29.25 
 
 		 803 aa  266  7e-70  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0574712  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1518  general secretion pathway protein D  29.52 
 
 		 772 aa  241  2e-62  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.22323  normal  0.534897 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0885  general secretion pathway protein D  29.36 
 
 		 756 aa  228  3e-58  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.741173  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1123  general secretion pathway protein D  36.54 
 
 		 751 aa  188  4e-46  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2211  general secretion pathway protein D  27.34 
 
 		 793 aa  187  6e-46  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.971398  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1902  type II and III secretion system protein  27.04 
 
 		 789 aa  187  9e-46  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0584402  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0761  general secretion pathway protein D  34 
 
 		 833 aa  178  3e-43  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000306489  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2106  general secretion pathway protein D  37.87 
 
 		 767 aa  178  4e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.832393  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3020  Type II secretory pathway component PulD-like protein  24.03 
 
 		 696 aa  177  9e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000150174  decreased coverage  0.00000000799268 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3175  type II and III secretion system protein  27.5 
 
 		 783 aa  176  9.999999999999999e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.114854  normal  0.0336738 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3392  type II and III secretion system protein  26.61 
 
 		 783 aa  174  3.9999999999999995e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0849213  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2529  general secretion pathway protein D  27.74 
 
 		 728 aa  169  2e-40  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.151487  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0031  general secretion pathway protein D  31.33 
 
 		 794 aa  167  8e-40  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.412275  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3229  type II and III secretion system protein:NolW-like  26.96 
 
 		 804 aa  165  3e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.151962  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3399  general secretion pathway protein D  25.43 
 
 		 807 aa  165  3e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0683  general secretion pathway protein D  24.96 
 
 		 641 aa  164  4.0000000000000004e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00528314  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0909  general secretion pathway protein D  36.52 
 
 		 805 aa  164  4.0000000000000004e-39  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.793401 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16070  general secretion pathway protein D  25.85 
 
 		 752 aa  164  5.0000000000000005e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.14269  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2771  general secretion pathway protein D  32.91 
 
 		 686 aa  162  3e-38  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.662007  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0756  general secretion pathway protein D  25.29 
 
 		 738 aa  161  5e-38  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.2147 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1329  type II and III secretion system protein  24.29 
 
 		 747 aa  159  2e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1954  type II and III secretion system protein  24.57 
 
 		 750 aa  156  1e-36  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0109975  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3658  general secretion pathway protein D  32.31 
 
 		 793 aa  156  1e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3052  general secretion pathway protein D  25.28 
 
 		 803 aa  156  2e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3136  general secretion pathway protein D  25.43 
 
 		 736 aa  154  5e-36  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.81817  hitchhiker  0.003504 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4825  putative type II secretion system protein  26.53 
 
 		 803 aa  147  6e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0565778  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55450  putative type II secretion system protein  26.39 
 
 		 803 aa  147  1e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.0000555876  normal  0.092125 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3236  type II and III secretion system protein  24.29 
 
 		 711 aa  146  2e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.284362  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0667  general secretion pathway protein D  24.83 
 
 		 781 aa  144  6e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.509623 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2591  general secretion pathway protein D  25.18 
 
 		 682 aa  142  3e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3427  general secretion pathway protein D  24.25 
 
 		 753 aa  142  3e-32  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000756806 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4251  general secretion pathway protein D  28.96 
 
 		 660 aa  141  4.999999999999999e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0106048 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0646  general secretion pathway protein D  24.69 
 
 		 781 aa  141  4.999999999999999e-32  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0255398  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7395  general secretion pathway protein D  26.1 
 
 		 717 aa  140  7.999999999999999e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.103776  normal  0.699876 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1299  general secretion pathway protein D  30.49 
 
 		 716 aa  140  1e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0097  general secretion pathway protein D  24.14 
 
 		 662 aa  140  1e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.395857  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3315  general secretion pathway protein D  25.07 
 
 		 696 aa  140  1e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4501  putative general secretory pathway protein D  26.25 
 
 		 814 aa  137  7.000000000000001e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.322148 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1175  general secretion pathway protein D  32.37 
 
 		 797 aa  137  9.999999999999999e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.217594  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2653  type II and III secretion system protein  24.05 
 
 		 748 aa  135  1.9999999999999998e-30  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1041  general secretion pathway protein D  28.45 
 
 		 799 aa  135  3e-30  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0180927  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3269  general secretion pathway protein D  32.17 
 
 		 640 aa  134  3.9999999999999996e-30  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000207036  hitchhiker  0.00000000000000178028 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0953  general secretion pathway protein D  32.17 
 
 		 640 aa  134  3.9999999999999996e-30  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.198389  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2639  type II and III secretion system protein  22.22 
 
 		 733 aa  132  2.0000000000000002e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0449107  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1004  general secretion pathway protein D  31.85 
 
 		 640 aa  132  2.0000000000000002e-29  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1274  type II protein secretion LspD  23.49 
 
 		 791 aa  130  1.0000000000000001e-28  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3364  type II and III secretion system protein:NolW-like  24.28 
 
 		 636 aa  129  2.0000000000000002e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000168391  normal  0.0105147 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1275  type II protein secretion LspD  23.49 
 
 		 791 aa  128  3e-28  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0003  general secretion pathway protein D  29.39 
 
 		 655 aa  129  3e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0438473 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2860  general secretion pathway protein D  30.03 
 
 		 640 aa  125  3e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1412  general secretion pathway protein D  29.32 
 
 		 640 aa  125  3e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0250  type II and III secretion system protein  23.26 
 
 		 703 aa  125  4e-27  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.980463  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3281  type II and III secretion system protein  29.36 
 
 		 915 aa  124  8e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2924  general secretion pathway protein D  23.41 
 
 		 675 aa  123  9.999999999999999e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3114  general secretory pathway D transmembrane protein  27.69 
 
 		 805 aa  121  3.9999999999999996e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.442209  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5697  general secretion pathway protein D  27.98 
 
 		 787 aa  121  6e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0549216 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1791  general secretion pathway protein D  28.25 
 
 		 784 aa  120  7e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4591  general secretion pathway protein D  29.45 
 
 		 697 aa  120  9.999999999999999e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2024  general secretion pathway protein D  26.59 
 
 		 779 aa  120  9.999999999999999e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0993324 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0609  general secretion pathway protein D  27.71 
 
 		 635 aa  119  1.9999999999999998e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.73081e-17 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0231  general secretion pathway protein D  29.86 
 
 		 689 aa  117  7.999999999999999e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1470  general secretion pathway protein D  26.47 
 
 		 714 aa  115  2.0000000000000002e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0388  general secretion pathway protein D  26.1 
 
 		 650 aa  115  3e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0388  general secretion pathway protein D  26.1 
 
 		 654 aa  115  3e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0226374 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03956  general secretion pathway protein D  27.27 
 
 		 681 aa  115  4.0000000000000004e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3519  general secretion pathway protein D  26.15 
 
 		 654 aa  114  6e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0147755  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4734  general secretion pathway protein D  26.78 
 
 		 714 aa  114  7.000000000000001e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00000953864  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00601  general secretion pathway protein D  27.08 
 
 		 658 aa  114  8.000000000000001e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1087  general secretion pathway protein D  28.21 
 
 		 584 aa  114  9e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.57571  normal  0.616621 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0153  general secretion pathway protein D  27.48 
 
 		 705 aa  113  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0109917  normal  0.0543101 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1046  general secretion pathway protein D  27.9 
 
 		 584 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.603917  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4206  general secretion pathway protein D  27.76 
 
 		 705 aa  113  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.016769  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1438  type II and III secretion system protein  31.25 
 
 		 812 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.12402  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4358  general secretion pathway protein D  26.93 
 
 		 724 aa  112  3e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000917218  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001892  general secretion pathway protein D/type II secretion outermembrane pore forming protein (PulD)  26.74 
 
 		 672 aa  112  3e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2134  type IV pilus biogenesis protein PilQ  30.66 
 
 		 874 aa  111  4.0000000000000004e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000140204  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0730  general secretion pathway protein D  21.58 
 
 		 892 aa  110  9.000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.116775  normal  0.828359 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0595  general secretion pathway protein D  27 
 
 		 630 aa  110  1e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.788546  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4180  general secretion pathway protein D  27.08 
 
 		 650 aa  110  1e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.304265  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2370  general secretion pathway protein D  28.01 
 
 		 670 aa  110  1e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3216  type II and III secretion system secretin  30.74 
 
 		 667 aa  110  1e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.141334 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00511  putative type IV pilus biogenesis protein PilQ (cytoplasmic ATPase)  29.84 
 
 		 547 aa  110  1e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.440225  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3619  general secretion pathway protein D  26.5 
 
 		 707 aa  110  1e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0440074  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0144  general secretion pathway protein D  27.92 
 
 		 710 aa  109  2e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>