248 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PG0062 on replicon NC_002950
Organism: Porphyromonas gingivalis W83



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002950  PG0062  TPR domain-containing protein  100 
 
 		 680 aa  1396    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1376  HRDC domain protein  41.18 
 
 		 829 aa  370  1e-101  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0527  AAA ATPase  42.76 
 
 		 517 aa  368  1e-100  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.55626  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0999  AAA ATPase  42.73 
 
 		 759 aa  363  8e-99  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.428029  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4935  5'-3' DNA helicase  41.39 
 
 		 734 aa  357  2.9999999999999997e-97  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0257  AAA ATPase  42.63 
 
 		 747 aa  355  2e-96  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.166241  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3653  helicase-related protein  41.79 
 
 		 738 aa  350  3e-95  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG2047  helicase, putative  43.85 
 
 		 761 aa  343  4e-93  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000160392 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0207  AAA ATPase  40.09 
 
 		 764 aa  337  5e-91  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.195447 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0435  AAA ATPase  40.37 
 
 		 639 aa  323  6e-87  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2564  hypothetical protein  42.82 
 
 		 431 aa  320  5e-86  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.507022  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3066  AAA ATPase  41.49 
 
 		 438 aa  310  4e-83  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1164  hypothetical protein  39.72 
 
 		 445 aa  306  9.000000000000001e-82  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5152  AAA ATPase  40.05 
 
 		 779 aa  296  6e-79  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.430692 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0867  AAA ATPase  41.2 
 
 		 782 aa  291  3e-77  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0861  ATPas  40.96 
 
 		 782 aa  291  4e-77  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0878  AAA ATPase  40.96 
 
 		 782 aa  291  4e-77  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1180  AAA ATPase  41.97 
 
 		 782 aa  285  2.0000000000000002e-75  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.247835  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2072  TPR domain-containing protein  37.33 
 
 		 493 aa  247  4.9999999999999997e-64  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.402208  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0815  ATP-dependent exoDNAse (exonuclease V) alpha subunit - helicase superfamily I member-like protein  32.47 
 
 		 614 aa  185  2.0000000000000003e-45  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0573  TPR domain-containing protein  30.91 
 
 		 435 aa  181  4e-44  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.526626  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1901  ATP-dependent exoDNAse (exonuclease V) subunit alpha  31.99 
 
 		 472 aa  179  1e-43  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1416  hypothetical protein  32.83 
 
 		 442 aa  180  1e-43  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1080  hypothetical protein  30.75 
 
 		 485 aa  175  2.9999999999999996e-42  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0522  conserved hypothetical protein, possible helicase  32.1 
 
 		 420 aa  170  8e-41  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH02480  mitochondrial DNA repair and recombination protein PIF1 precursor, putative  29.89 
 
 		 691 aa  164  6e-39  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.255709  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0941  TPR domain-containing protein  29.12 
 
 		 445 aa  163  8.000000000000001e-39  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.994783  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1560  AAA ATPase  30.28 
 
 		 659 aa  158  2e-37  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000170714  unclonable  0.00000000068929 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1075  hypothetical protein  29.55 
 
 		 439 aa  155  2.9999999999999998e-36  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.000929546  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1843  ATPase  28.72 
 
 		 646 aa  152  1e-35  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.581865 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1856  glycosysltransferase  29.36 
 
 		 438 aa  148  4.0000000000000006e-34  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1023  hypothetical protein  29.69 
 
 		 447 aa  145  2e-33  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.218006  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0969  hypothetical protein  29.69 
 
 		 447 aa  145  2e-33  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1779  ATPase  31.76 
 
 		 422 aa  144  5e-33  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC02830  DNA repair and recombination protein pif1, mitochondrial precursor, putative  32.83 
 
 		 669 aa  136  9.999999999999999e-31  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.577209  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06895  helicase (Eurofung)  27.59 
 
 		 661 aa  117  1.0000000000000001e-24  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.264873 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1611  DNA helicase: AAA ATPase  27.85 
 
 		 653 aa  109  2e-22  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.77045 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0744  hypothetical protein  46.32 
 
 		 130 aa  105  2e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.762104  normal  1 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_15917  predicted protein  33.66 
 
 		 628 aa  78.6  0.0000000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0989  helicase, RecD/TraA family  24.12 
 
 		 738 aa  72  0.00000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0438  helicase, putative  24.55 
 
 		 914 aa  69.3  0.0000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2953  TPR repeat-containing protein  36.89 
 
 		 711 aa  66.2  0.000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0781794 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0213  helicase, RecD/TraA family  23.64 
 
 		 740 aa  64.3  0.000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.629499  normal  0.0445082 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1462  helicase RecD/TraA  23.26 
 
 		 739 aa  62.8  0.00000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0993  helicase, RecD/TraA family  25.59 
 
 		 728 aa  61.2  0.00000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  29.45 
 
 		 927 aa  58.9  0.0000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2919  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  25.62 
 
 		 721 aa  58.9  0.0000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1102  exonuclease V subunit alpha  23.5 
 
 		 872 aa  58.9  0.0000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3841  putative deoxyribonuclease  24.3 
 
 		 365 aa  58.2  0.0000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5077  putative deoxyribonuclease  24.67 
 
 		 365 aa  58.2  0.0000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4249  putative deoxyribonuclease  24.09 
 
 		 365 aa  57.8  0.0000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2849  AAA ATPase  29.74 
 
 		 678 aa  58.2  0.0000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0353435  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4355  TPR repeat-containing protein  25.35 
 
 		 1192 aa  57.8  0.0000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.862224  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2644  helicase, putative  23 
 
 		 902 aa  57.4  0.0000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf852  exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  21.36 
 
 		 732 aa  57  0.000001  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8706  helicase, RecD/TraA family  22.64 
 
 		 740 aa  57  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.671857  normal  0.279794 
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3541  RecD/TraA family helicase  23.44 
 
 		 731 aa  57  0.000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0637  TPR repeat-containing protein  29.49 
 
 		 4489 aa  56.6  0.000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3746  TPR repeat-containing protein  34.94 
 
 		 602 aa  56.6  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.824926  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4247  RecD/TraA family helicase  23.45 
 
 		 736 aa  55.8  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.320311 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4515  exonuclease V subunit alpha  32.03 
 
 		 469 aa  56.6  0.000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3996  tetratricopeptide TPR_2  30.97 
 
 		 1694 aa  56.2  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.271204  normal  0.601264 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1840  TPR repeat-containing protein  34.57 
 
 		 3560 aa  56.2  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2212  TPR repeat-containing protein  35.06 
 
 		 1276 aa  55.5  0.000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.524691  normal  1 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3273  RecD/TraA family helicase  23.21 
 
 		 731 aa  55.5  0.000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2733  helicase, RecD/TraA family  25 
 
 		 762 aa  55.5  0.000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0135188  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1757  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.28 
 
 		 530 aa  54.7  0.000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4756  helicase, RecD/TraA family  22.65 
 
 		 735 aa  55.1  0.000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00416284  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24071  hypothetical protein  28.42 
 
 		 622 aa  54.7  0.000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1733  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  39.08 
 
 		 538 aa  54.7  0.000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.020269 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2487  putative deoxyribonuclease  23.8 
 
 		 365 aa  54.3  0.000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.280682  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1841  TPR repeat-containing protein  28.65 
 
 		 3035 aa  54.3  0.000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0930  TPR repeat-containing protein  28.16 
 
 		 329 aa  54.3  0.000008  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0838  RecD/TraA family helicase  24.47 
 
 		 731 aa  53.9  0.000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0999  helicase, putative  22.78 
 
 		 896 aa  53.9  0.000009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.303006  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6026  helicase, RecD/TraA family  25.5 
 
 		 742 aa  53.9  0.000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.143293  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3229  Exodeoxyribonuclease V  25.07 
 
 		 637 aa  53.9  0.00001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.115754  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0301  TPR repeat-containing protein  25.13 
 
 		 1827 aa  53.5  0.00001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1650  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  23.24 
 
 		 526 aa  53.5  0.00001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011367  Gdia_3571  conjugal transfer relaxase TraA  24.32 
 
 		 1025 aa  53.5  0.00001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1361  TPR repeat-containing protein  37.5 
 
 		 1276 aa  53.9  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3839  helicase, RecD/TraA family  24.47 
 
 		 750 aa  52.4  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0839164  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0818  RecD/TraA family helicase  24.52 
 
 		 688 aa  53.1  0.00002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.662153  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1065  TPR repeat-containing protein  35.53 
 
 		 740 aa  52.8  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.761998  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2482  sulfotransferase TPR domain-containing protein  31.75 
 
 		 530 aa  53.1  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.99645 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24161  hypothetical protein  28.85 
 
 		 661 aa  52.8  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5004  TPR repeat-containing protein  32.93 
 
 		 699 aa  52.8  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0667  helicase, RecD/TraA family  23.23 
 
 		 728 aa  52.4  0.00003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0540027  normal  0.0105669 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3257  TPR repeat-containing protein  27.97 
 
 		 194 aa  52.4  0.00003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.841733  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2673  RecD/TraA family helicase  24.54 
 
 		 736 aa  52  0.00003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24101  hypothetical protein  26.19 
 
 		 725 aa  52.4  0.00003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0763  helicase, putative  23.69 
 
 		 907 aa  52  0.00004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.81938  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2941  hypothetical protein  38.75 
 
 		 560 aa  52  0.00004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000171884  normal  0.0147454 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2853  TPR repeat-containing protein  25.88 
 
 		 3172 aa  52  0.00004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0587  AAA ATPase  24.15 
 
 		 717 aa  51.6  0.00005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2895  O-linked N-acetylglucosamine transferase  36.84 
 
 		 292 aa  51.6  0.00005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0140366 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1260  TPR repeat-containing protein  36.84 
 
 		 573 aa  51.6  0.00005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.439457 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0190  TPR repeat-containing protein  34.94 
 
 		 601 aa  51.6  0.00005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0215  TPR repeat-containing protein  26.92 
 
 		 2262 aa  51.6  0.00005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0297822 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0562  AAA ATPase  24.15 
 
 		 717 aa  51.6  0.00005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>