225 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_4618 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_0556  immunoglobulin I-set domain-containing protein  41.82 
 
 		 1130 aa  695    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.329662  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4618  NHL repeat-containing protein  100 
 
 		 1026 aa  2026    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2265  NHL repeat-containing protein  47.77 
 
 		 963 aa  466  9.999999999999999e-131  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.397951  normal  0.439164 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2854  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  42.64 
 
 		 1292 aa  441  9.999999999999999e-123  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0274394  normal  0.093276 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4617  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  66.76 
 
 		 633 aa  440  9.999999999999999e-123  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4612  immunoglobulin I-set domain-containing protein  61.74 
 
 		 714 aa  429  1e-118  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.830673  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2120  fibronectin type III domain-containing protein  60.8 
 
 		 1178 aa  410  1e-113  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.348152  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0797  immunoglobulin I-set domain-containing protein  59.54 
 
 		 826 aa  395  1e-108  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.431236  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1393  immunoglobulin I-set domain-containing protein  59.18 
 
 		 810 aa  387  1e-106  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2042  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  58.47 
 
 		 805 aa  385  1e-105  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.218324 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1394  immunoglobulin I-set domain-containing protein  54.19 
 
 		 1126 aa  385  1e-105  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1618  immunoglobulin I-set domain-containing protein  55.11 
 
 		 540 aa  375  1e-102  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.490097  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4304  hypothetical protein  52.96 
 
 		 920 aa  374  1e-102  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.126578  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4610  glycoside hydrolase family protein  52.52 
 
 		 721 aa  370  1e-101  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0031  Mannan endo-1,4-beta-mannosidase  59.75 
 
 		 701 aa  368  1e-100  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0166776 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4616  immunoglobulin I-set domain-containing protein  57.57 
 
 		 408 aa  363  9e-99  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1253  peptidase C10 streptopain  54.62 
 
 		 884 aa  354  4e-96  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.662646 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3823  carbohydrate-binding CenC domain-containing protein  55.71 
 
 		 1255 aa  351  4e-95  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0816549  normal  0.385041 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0854  immunoglobulin I-set domain-containing protein  45.42 
 
 		 1607 aa  350  6e-95  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4251  Ig family protein  56.05 
 
 		 2802 aa  345  2e-93  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.676511 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4126  hypothetical protein  53.48 
 
 		 640 aa  345  2e-93  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.657356  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0327  Alpha-N-arabinofuranosidase  52.68 
 
 		 1221 aa  344  5e-93  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.495752  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4248  cell surface receptor IPT/TIG domain-containing protein  53.07 
 
 		 1848 aa  343  1e-92  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.296495 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2514  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  50.44 
 
 		 1383 aa  334  4e-90  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3237  glycoside hydrolase family protein  54.73 
 
 		 1195 aa  332  2e-89  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.414155 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2256  immunoglobulin I-set domain-containing protein  49.13 
 
 		 1183 aa  312  2e-83  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0104124 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0032  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase cyclophilin type  47.59 
 
 		 664 aa  311  4e-83  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.468114  decreased coverage  0.00512066 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0638  PKD domain-containing protein  57.89 
 
 		 1285 aa  300  1e-79  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0313  immunoglobulin I-set domain-containing protein  46.63 
 
 		 887 aa  299  2e-79  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.488254  normal  0.343901 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2184  immunoglobulin I-set domain-containing protein  47.89 
 
 		 1507 aa  286  1.0000000000000001e-75  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3163  beta-lactamase  48.69 
 
 		 862 aa  286  2.0000000000000002e-75  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.111664  normal  0.813914 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0853  hypothetical protein  51.55 
 
 		 1176 aa  283  1e-74  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0561524  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0852  immunoglobulin I-set domain-containing protein  51.86 
 
 		 1176 aa  280  7e-74  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2158  NHL repeat-containing protein  35.1 
 
 		 1750 aa  279  2e-73  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3660  peptidase S41  45.48 
 
 		 791 aa  278  4e-73  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.120532  normal  0.922939 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0651  hypothetical protein  47.29 
 
 		 462 aa  275  4.0000000000000004e-72  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.168362  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0312  hypothetical protein  45.88 
 
 		 3563 aa  268  4e-70  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.61904 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0423  NHL repeat containing protein  30.5 
 
 		 831 aa  265  3e-69  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0378567  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3151  beta-lactamase  48.62 
 
 		 933 aa  255  3e-66  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2779  hypothetical protein  44.16 
 
 		 1051 aa  254  5.000000000000001e-66  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.380242 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2063  NHL repeat containing protein  37.4 
 
 		 652 aa  238  3e-61  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3371  GDSL family lipase  49.63 
 
 		 648 aa  237  7e-61  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.754827  normal  0.777259 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2630  PKD domain containing protein  31.27 
 
 		 930 aa  232  2e-59  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.668358  decreased coverage  0.0001414 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1474  NHL repeat containing protein  28.57 
 
 		 668 aa  229  2e-58  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0914572  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1167  hypothetical protein  29.67 
 
 		 588 aa  229  2e-58  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.233122  normal  0.0121867 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1345  NHL repeat containing protein  31.03 
 
 		 676 aa  228  5.0000000000000005e-58  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.871064 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1359  NHL repeat containing protein  43.94 
 
 		 439 aa  221  5e-56  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.666477 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2981  NHL repeat containing protein  46.11 
 
 		 2296 aa  215  2.9999999999999995e-54  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1358  NHL repeat containing protein  42.86 
 
 		 646 aa  212  3e-53  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.967304 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0346  hypothetical protein  45.91 
 
 		 288 aa  204  8e-51  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4088  serine/threonine protein kinase  39.4 
 
 		 850 aa  187  9e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.527089  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1378  hypothetical protein  35.24 
 
 		 1030 aa  185  4.0000000000000006e-45  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.872311  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2500  leucine-rich repeat-containing protein  36.24 
 
 		 1351 aa  178  6e-43  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7287  serine/threonine protein kinase  37.5 
 
 		 892 aa  172  3e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0443497  normal  0.301808 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4063  NHL repeat-containing protein  37.92 
 
 		 1763 aa  167  6.9999999999999995e-40  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.512891  normal  0.666526 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0408  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  38.05 
 
 		 693 aa  164  1e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.785735  normal  0.15039 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3963  hypothetical protein  46.43 
 
 		 1083 aa  161  6e-38  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2986  PA14 domain-containing protein  29.71 
 
 		 1293 aa  158  4e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3814  NHL repeat containing protein  34.41 
 
 		 359 aa  150  1.0000000000000001e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.0000000186749  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4089  serine/threonine protein kinase  35.13 
 
 		 772 aa  144  8e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.205571  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0044  serine/threonine protein kinase  34.81 
 
 		 863 aa  143  9.999999999999999e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0701705  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2369  NHL repeat containing protein  35.03 
 
 		 579 aa  142  3.9999999999999997e-32  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.547997 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0416  hypothetical protein  34.34 
 
 		 346 aa  139  3.0000000000000003e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0322809  normal  0.695963 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0842  YD repeat-containing protein  31.19 
 
 		 2831 aa  132  3e-29  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1273  NHL repeat containing protein  33.44 
 
 		 387 aa  130  2.0000000000000002e-28  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.349999  normal  0.851657 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2074  NHL repeat containing protein  31.01 
 
 		 522 aa  129  3e-28  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.614793 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1389  periplasmic copper-binding  31.64 
 
 		 709 aa  124  9.999999999999999e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0136597  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1291  hypothetical protein  30.96 
 
 		 510 aa  122  3e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.984868  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0755  Carbohydrate binding family 6  32.28 
 
 		 627 aa  122  3e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.40711 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2631  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  30.77 
 
 		 343 aa  119  1.9999999999999998e-25  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.118189  hitchhiker  0.000564983 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1395  NHL repeat containing protein  31.66 
 
 		 391 aa  119  1.9999999999999998e-25  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.597363 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0355  NHL repeat-containing protein  23.98 
 
 		 1030 aa  119  3e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.64892  normal  0.0641589 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0840  NHL repeat containing protein  30.23 
 
 		 390 aa  118  6e-25  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0361513  normal  0.0920788 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0370  Fibronectin type III domain protein  31.13 
 
 		 841 aa  118  6.9999999999999995e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.800383  normal  0.932394 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0359  NHL repeat-containing protein  28.04 
 
 		 448 aa  116  2.0000000000000002e-24  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.570534 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1156  YD repeat-containing protein  29.9 
 
 		 2961 aa  117  2.0000000000000002e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2818  hypothetical protein  30.03 
 
 		 392 aa  114  7.000000000000001e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.587259  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3620  putative surface layer protein  30.29 
 
 		 752 aa  112  2.0000000000000002e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0027  Fibronectin type III domain protein  34.21 
 
 		 460 aa  111  9.000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1601  NHL repeat-containing protein  31.87 
 
 		 491 aa  110  2e-22  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0447928  normal  0.136115 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7288  serine/threonine protein kinase  32.58 
 
 		 807 aa  110  2e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.134567  normal  0.30608 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2329  NHL repeat containing protein  33.54 
 
 		 404 aa  109  3e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0716797  normal  0.125112 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1718  NHL repeat-containing protein  31.87 
 
 		 487 aa  109  3e-22  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3843  NHL repeat containing protein  31.95 
 
 		 1046 aa  109  3e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0246016 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4185  serine/threonine protein kinase  30.94 
 
 		 719 aa  107  1e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4723  NHL repeat containing protein  32.54 
 
 		 1079 aa  105  3e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.645184  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1421  NHL repeat containing protein  30.27 
 
 		 930 aa  105  4e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.368909  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2917  NHL repeat containing protein  33.01 
 
 		 623 aa  105  5e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.304592  normal  0.453442 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1791  NHL repeat containing protein  28.03 
 
 		 425 aa  104  1e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.326453  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4090  serine/threonine protein kinase  31.85 
 
 		 756 aa  103  2e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.252638  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7086  serine/threonine protein kinase  28.62 
 
 		 732 aa  101  9e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1960  Carbohydrate binding family 6  28.8 
 
 		 786 aa  100  2e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0676284  normal  0.0447838 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1611  Fibronectin type III domain protein  32.04 
 
 		 805 aa  100  2e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  unclonable  0.000457229  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1286  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  30.82 
 
 		 493 aa  98.2  6e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3670  NHL repeat-containing protein  31.67 
 
 		 503 aa  98.2  7e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7126  serine/threonine protein kinase  30.98 
 
 		 770 aa  94.7  7e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1280  NHL repeat-containing protein  30.95 
 
 		 504 aa  93.2  2e-17  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.164299  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3475  NHL repeat protein  30.1 
 
 		 1140 aa  92.4  4e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3618  hypothetical protein  23.82 
 
 		 362 aa  90.9  1e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1325  YD repeat protein  27.79 
 
 		 2350 aa  90.1  2e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>