182 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_1758 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_1758  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 232 aa  468  1.0000000000000001e-131  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000730158  normal  0.179073 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3756  transcriptional regulator, TetR family  58.08 
 
 		 252 aa  230  1e-59  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0538  transcriptional regulator, TetR family  45.07 
 
 		 254 aa  169  4e-41  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3548  transcriptional regulator, TetR family  44.93 
 
 		 224 aa  165  6.9999999999999995e-40  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0228014 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11243  transcriptional regulator  41.09 
 
 		 212 aa  148  8e-35  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0445311  normal  0.0334035 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3673  transcriptional regulator, TetR family  41.59 
 
 		 230 aa  147  1.0000000000000001e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3996  TetR family transcriptional regulator  38.53 
 
 		 228 aa  141  8e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.624951  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4070  TetR family transcriptional regulator  38.53 
 
 		 228 aa  141  8e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.120429  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2198  TetR family transcriptional regulator  40.09 
 
 		 218 aa  141  8e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4010  TetR family transcriptional regulator  37.44 
 
 		 228 aa  135  5e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  hitchhiker  0.00413509  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0144  transcriptional regulator, TetR family  37.05 
 
 		 233 aa  131  9e-30  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4498  TetR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 220 aa  130  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.1303  normal  0.37719 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16540  transcriptional regulator, tetR family  35.41 
 
 		 219 aa  109  3e-23  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.481264  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1396  TetR family transcriptional regulator  34.85 
 
 		 247 aa  99  5e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3200  TetR family transcriptional regulator  34.42 
 
 		 237 aa  85.9  5e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2967  regulatory protein, TetR  33.54 
 
 		 205 aa  85.5  6e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3188  TetR family transcriptional regulator  32.45 
 
 		 211 aa  78.6  0.00000000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00490863 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3159  putative transcriptional regulator, TetR family  47.52 
 
 		 221 aa  77.8  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.251281  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1682  transcriptional regulator, TetR family  41.48 
 
 		 221 aa  75.5  0.0000000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.274254 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5316  transcriptional regulator, TetR family  66.07 
 
 		 215 aa  74.3  0.000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.505659  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2617  transcriptional regulator, TetR family  35.15 
 
 		 214 aa  72  0.000000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000000311719  normal  0.0685304 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1906  transcriptional regulator, TetR family  32.5 
 
 		 193 aa  72  0.000000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.812491 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3567  transcriptional regulator, TetR family  31.93 
 
 		 214 aa  69.7  0.00000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0261  TetR family transcriptional regulator  34.34 
 
 		 266 aa  67  0.0000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0191308 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2758  TetR family transcriptional regulator  31.47 
 
 		 217 aa  63.2  0.000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.524358  hitchhiker  0.00766091 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4630  TetR family transcriptional regulator  34.56 
 
 		 206 aa  59.3  0.00000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.110827  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4073  TetR family transcriptional regulator  43.18 
 
 		 245 aa  55.5  0.0000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0252  transcriptional regulator, TetR family  44.12 
 
 		 194 aa  54.7  0.000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11701  hypothetical protein  26.6 
 
 		 207 aa  54.7  0.000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.107847 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3736  transcriptional regulator, TetR family  32.35 
 
 		 210 aa  53.1  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0336  transcriptional regulator, TetR family  36.84 
 
 		 191 aa  52.8  0.000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.510139 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1714  transcriptional regulator, TetR family  55.56 
 
 		 211 aa  52.8  0.000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.058675  normal  0.0438262 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0894  TetR family transcriptional regulator  48.28 
 
 		 215 aa  52.8  0.000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0749762 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2959  TetR family transcriptional regulator  27 
 
 		 204 aa  51.6  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.878802  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3003  TetR family transcriptional regulator  27 
 
 		 204 aa  51.6  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.384269 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3179  regulatory protein, TetR  31.38 
 
 		 215 aa  51.6  0.00001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.323857 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1398  TetR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 191 aa  50.4  0.00002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2974  TetR family transcriptional regulator  27 
 
 		 204 aa  51.2  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.329725  normal  0.021189 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4404  TetR family transcriptional regulator  29.07 
 
 		 199 aa  50.1  0.00003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0114676  normal  0.191291 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3298  TetR family transcriptional regulator  28.08 
 
 		 206 aa  49.7  0.00004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.436817  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2917  TetR family transcriptional regulator  34.74 
 
 		 218 aa  49.7  0.00004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1512  regulatory protein, TetR  48.08 
 
 		 246 aa  49.3  0.00005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2557  TetR family transcriptional regulator  28.48 
 
 		 250 aa  48.9  0.00007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.705718  normal  0.759568 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0457  TetR family transcriptional regulator  48 
 
 		 189 aa  48.5  0.00008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1087  transcriptional regulator, TetR family  40.62 
 
 		 215 aa  47.8  0.0001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.9461  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2499  TetR family transcriptional regulator  47.46 
 
 		 204 aa  48.1  0.0001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0292579 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2028  transcriptional regulator, TetR family  33.78 
 
 		 194 aa  48.1  0.0001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.937171  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3408  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 205 aa  47.4  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.954504  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1598  TetR family transcriptional regulator  46.67 
 
 		 239 aa  47.4  0.0002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.235097  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000229  transcriptional regulator  27.7 
 
 		 242 aa  47.4  0.0002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1076  transcriptional regulator, TetR family  44.83 
 
 		 220 aa  46.6  0.0003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.66869  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1153  transcriptional regulator, TetR family  42.19 
 
 		 246 aa  47  0.0003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.181492  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1562  putative transcriptional regulator, TetR family  49.12 
 
 		 194 aa  47  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.196181  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2002  TetR family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 191 aa  46.6  0.0004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0595533  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0697  transcriptional regulator, TetR family  46.94 
 
 		 189 aa  46.2  0.0004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0728261  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2872  TetR family transcriptional regulator  33.02 
 
 		 239 aa  46.6  0.0004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2354  regulatory protein, TetR  45.76 
 
 		 202 aa  46.2  0.0004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.291853  normal  0.0619707 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3500  transcriptional regulator, TetR family  34.65 
 
 		 186 aa  46.2  0.0004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.711575  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3459  putative transcriptional regulator  38.24 
 
 		 193 aa  46.2  0.0004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.429515  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1289  transcriptional regulator, TetR family  37.31 
 
 		 192 aa  46.2  0.0004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0416  transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 		 228 aa  45.8  0.0005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1756  transcriptional regulator, TetR family  29.14 
 
 		 205 aa  45.8  0.0005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000229906 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0425  transcriptional regulator, TetR family  38.71 
 
 		 199 aa  45.8  0.0005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.154596 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0212  TetR family transcriptional regulator  40.58 
 
 		 242 aa  45.4  0.0007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.581109  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6912  TetR family transcriptional regulator  37.11 
 
 		 236 aa  45.4  0.0008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.830717  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00763  predicted DNA-binding transcriptional regulator  46 
 
 		 223 aa  45.1  0.0009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.827218  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2846  transcriptional regulator, TetR family  46 
 
 		 223 aa  45.1  0.0009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2515  TetR family transcriptional regulator  47.76 
 
 		 238 aa  45.1  0.0009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.745235  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0944  putative DNA-binding transcriptional regulator  46 
 
 		 223 aa  45.1  0.0009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0850  putative DNA-binding transcriptional regulator  46 
 
 		 223 aa  45.1  0.0009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0861  putative DNA-binding transcriptional regulator  46 
 
 		 223 aa  45.1  0.0009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00780  hypothetical protein  46 
 
 		 223 aa  45.1  0.0009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.978873  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2847  putative DNA-binding transcriptional regulator  46 
 
 		 223 aa  45.1  0.0009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0304787 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28060  transcriptional regulator  32.18 
 
 		 204 aa  44.7  0.001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.633688  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0260  TetR family transcriptional regulator  65.71 
 
 		 234 aa  45.1  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40790  putative transcriptional regulator  38.46 
 
 		 193 aa  44.7  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1758  transcriptional regulator of TetR family protein  36 
 
 		 220 aa  44.7  0.001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.77056  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1746  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 209 aa  44.7  0.001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.227148  normal  0.0202921 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2249  TetR family transcriptional regulator  33.75 
 
 		 227 aa  45.1  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.111246  normal  0.0445772 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0772  transcriptional regulator, TetR family  50.94 
 
 		 223 aa  44.7  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2158  transcriptional regulator, TetR family  35.62 
 
 		 244 aa  44.3  0.001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2630  TetR family transcriptional regulator  36.05 
 
 		 205 aa  45.1  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0697093  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2402  transcriptional regulator, TetR family  55.56 
 
 		 259 aa  44.7  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0404395  hitchhiker  0.00830545 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0819  putative DNA-binding transcriptional regulator  46 
 
 		 223 aa  45.1  0.001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.852921 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3731  TetR family transcriptional regulator  44.9 
 
 		 214 aa  44.3  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0914  putative DNA-binding transcriptional regulator  46 
 
 		 224 aa  43.9  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.198187  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0967  putative DNA-binding transcriptional regulator  46 
 
 		 224 aa  43.9  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0074  TetR/AcrR family transcriptional regulator  41.82 
 
 		 196 aa  43.9  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1191  TetR family transcriptional regulator  27.81 
 
 		 219 aa  43.9  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00105223  normal  0.516093 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0982  TetR family transcriptional regulator  43.86 
 
 		 194 aa  43.9  0.002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9078  putative transcriptional regulator, TetR family  37.88 
 
 		 211 aa  43.9  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1801  transcriptional regulator, TetR family  36.36 
 
 		 216 aa  43.9  0.002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3567  TetR family transcriptional regulator  46.3 
 
 		 217 aa  44.3  0.002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0246266  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0891  transcriptional regulator BetI  44.07 
 
 		 208 aa  44.3  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.21263  normal  0.810171 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0882  putative DNA-binding transcriptional regulator  46 
 
 		 224 aa  43.9  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.808215  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27500  transcriptional regulator  27.71 
 
 		 214 aa  44.3  0.002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9138  putative transcriptional regulator, TetR family  26.8 
 
 		 217 aa  44.3  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0570  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 209 aa  43.9  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0457  TetR family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 206 aa  43.9  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2175  TetR family transcriptional regulator  44.9 
 
 		 214 aa  44.3  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.595394  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>