More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A3535 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A3535  hypothetical protein  100 
 
 		 1123 aa  2284    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.878105 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2526  hypothetical protein  60.08 
 
 		 732 aa  300  1e-79  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0463083 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2917  SEFIR domain protein  28.29 
 
 		 1611 aa  160  1e-37  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.362761  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0166  TPR repeat-containing protein  38.36 
 
 		 454 aa  152  3e-35  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0362369  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3004  TPR repeat-containing protein  27.25 
 
 		 1082 aa  149  4.0000000000000006e-34  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1072  tetratricopeptide TPR_2  27.3 
 
 		 1087 aa  146  3e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1169  TPR repeat-containing protein  37.06 
 
 		 444 aa  143  1.9999999999999998e-32  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2267  TPR repeat-containing protein  34.2 
 
 		 1519 aa  142  4.999999999999999e-32  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3497  peptidase-like  32.6 
 
 		 1328 aa  131  6e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03547  conserved hypothetical protein  31.77 
 
 		 1288 aa  131  9.000000000000001e-29  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.204102  normal  0.74316 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1245  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  34.25 
 
 		 568 aa  129  5e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0199548 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1215  TPR repeat-containing protein  34.25 
 
 		 568 aa  129  5e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1130  TPR domain-containing protein  33.02 
 
 		 665 aa  127  8.000000000000001e-28  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2040  TPR repeat-containing protein  27.99 
 
 		 924 aa  127  9e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.962873  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1366  hypothetical protein  33.02 
 
 		 825 aa  127  1e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0977  TPR repeat-containing protein  33.23 
 
 		 1215 aa  127  1e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.153699  normal  0.773463 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5149  TPR repeat-containing protein  29.43 
 
 		 1105 aa  126  2e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000182587  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1804  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.97 
 
 		 1186 aa  127  2e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4084  TPR repeat-containing protein  34.09 
 
 		 843 aa  127  2e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5265  TPR repeat-containing protein  31.09 
 
 		 284 aa  125  4e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.487256  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2968  kinesin light chain  33.44 
 
 		 493 aa  123  1.9999999999999998e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.220917  normal  0.147814 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3533  hypothetical protein  37.56 
 
 		 338 aa  123  1.9999999999999998e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.674186  normal  0.782695 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0357  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.21 
 
 		 1424 aa  119  3e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00127061 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2400  TPR repeat-containing protein  34.74 
 
 		 649 aa  116  3e-24  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.179753  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2528  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  34.33 
 
 		 991 aa  113  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.122653  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1105  TPR repeat-containing protein  29.17 
 
 		 911 aa  112  3e-23  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4362  tetratricopeptide TPR_2  32.29 
 
 		 725 aa  113  3e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.714509 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1746  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.29 
 
 		 767 aa  112  4.0000000000000004e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08457  Pfs, NB-ARC and TPR domain protein (JCVI)  29.32 
 
 		 1131 aa  111  9.000000000000001e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1453  TPR repeat-containing protein  33.44 
 
 		 639 aa  111  9.000000000000001e-23  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.899031  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2671  tetratricopeptide TPR_2  31.97 
 
 		 828 aa  111  9.000000000000001e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.290452  normal  0.798665 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2523  hypothetical protein  32.42 
 
 		 795 aa  109  3e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.184422  normal  0.460331 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2008  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.32 
 
 		 730 aa  107  1e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.196869  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2765  TPR repeat-containing protein  29.39 
 
 		 751 aa  107  2e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4523  TPR repeat-containing protein  28.21 
 
 		 1119 aa  107  2e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1102  tetratricopeptide TPR_2  29.11 
 
 		 1507 aa  105  5e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1773  NB-ARC domain protein  29.79 
 
 		 672 aa  105  7e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0966  hypothetical protein  25.35 
 
 		 2145 aa  100  1e-19  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.360119 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2380  TPR repeat-containing protein  35.86 
 
 		 785 aa  100  2e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0446  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.48 
 
 		 885 aa  100  2e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1300  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.48 
 
 		 771 aa  99.4  3e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0238  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.81 
 
 		 787 aa  99.4  3e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.463685  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0416  TPR repeat-containing protein  33.93 
 
 		 481 aa  97.4  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.80889 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2597  hypothetical protein  29.02 
 
 		 1238 aa  95.1  7e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0183256  normal  0.576788 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1787  TPR repeat-containing protein  28.61 
 
 		 543 aa  94  2e-17  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.662156  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0963  hypothetical protein  25.14 
 
 		 1550 aa  91.7  7e-17  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.424465 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1712  TPR repeat-containing protein  22.05 
 
 		 817 aa  91.7  7e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.347733  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3708  hypothetical protein  27.27 
 
 		 1039 aa  90.9  1e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3262  tetratricopeptide TPR_2  31.7 
 
 		 919 aa  89.7  3e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.857288  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  26.28 
 
 		 810 aa  89  5e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0320  hypothetical protein  26.01 
 
 		 1068 aa  88.2  8e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1093  TPR repeat-containing protein  28.79 
 
 		 681 aa  87.4  0.000000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.353622  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1912  TPR repeat-containing protein  28.38 
 
 		 578 aa  86.7  0.000000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.855004 
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5289  TPR repeat-containing protein  31.56 
 
 		 857 aa  86.7  0.000000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.752131  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2318  tetratricopeptide protein  26.48 
 
 		 573 aa  85.9  0.000000000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0820  hypothetical protein  28.32 
 
 		 1212 aa  85.1  0.000000000000007  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.826533 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0863  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.3 
 
 		 991 aa  84.7  0.000000000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0494  TPR repeat-containing protein  26.79 
 
 		 1088 aa  84  0.00000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  27.05 
 
 		 878 aa  84.7  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3245  tetratricopeptide TPR_2  31.53 
 
 		 212 aa  83.6  0.00000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5271  TPR repeat-containing protein  24.7 
 
 		 953 aa  82.4  0.00000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.650809  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3866  NB-ARC domain protein  31.98 
 
 		 680 aa  82  0.00000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.641069 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32160  tetratricopeptide repeat protein  24.67 
 
 		 702 aa  82  0.00000000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.277202 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.88 
 
 		 632 aa  81.6  0.00000000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3983  TPR repeat-containing protein  26.52 
 
 		 949 aa  81.6  0.00000000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.808044  normal  0.937608 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1729  TPR repeat-containing protein  25.76 
 
 		 837 aa  80.9  0.0000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3158  TPR repeat-containing protein  27.2 
 
 		 814 aa  80.9  0.0000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.385095  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3640  hypothetical protein  30.45 
 
 		 310 aa  80.9  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.04717  decreased coverage  0.00729391 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3233  serine/threonine protein kinase  27.03 
 
 		 1290 aa  80.1  0.0000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.273331  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3483  TPR repeat-containing protein  23.08 
 
 		 1054 aa  80.5  0.0000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.423026 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18211  hypothetical protein  25.1 
 
 		 603 aa  79.7  0.0000000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.905605 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2652  hypothetical protein  27.83 
 
 		 919 aa  79  0.0000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00496775  normal  0.0664064 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0048  tetratricopeptide domain-containing protein  22.31 
 
 		 897 aa  79  0.0000000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00467809 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1995  TPR repeat-containing protein  28.08 
 
 		 443 aa  78.6  0.0000000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.194004  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1587  NB-ARC  28.83 
 
 		 1044 aa  78.6  0.0000000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.257434  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0657  TPR repeat-containing protein  26.77 
 
 		 811 aa  78.2  0.0000000000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.233938  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1718  tetratricopeptide TPR_4  26.74 
 
 		 799 aa  78.6  0.0000000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0864  TPR repeat-containing protein  27.56 
 
 		 1060 aa  78.2  0.0000000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1094  TPR repeat-containing protein  30 
 
 		 685 aa  77.8  0.000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49558  predicted protein  26.09 
 
 		 1106 aa  77.8  0.000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.022156  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1822  NB-ARC  33.33 
 
 		 977 aa  77.8  0.000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.244157  normal  0.101864 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1262  Tetratricopeptide TPR_4  24.84 
 
 		 1429 aa  76.6  0.000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.803703  normal  0.0826044 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00731  hypothetical protein  25.15 
 
 		 816 aa  76.6  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.456129 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1817  TPR repeat-containing protein  28.57 
 
 		 945 aa  77  0.000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.703136  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3197  O-GlcNAc transferase, p110 subunit  26.35 
 
 		 395 aa  75.5  0.000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.187148  normal  0.017581 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0955  TPR repeat-containing protein  29.57 
 
 		 637 aa  75.1  0.000000000006  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  27.98 
 
 		 927 aa  75.1  0.000000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6784  TPR repeat-containing protein  23.97 
 
 		 1526 aa  75.1  0.000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3996  tetratricopeptide TPR_2  26.42 
 
 		 1694 aa  74.7  0.00000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.271204  normal  0.601264 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1936  TPR repeat-containing protein  23.32 
 
 		 1911 aa  74.3  0.00000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.261102  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0825  TPR repeat-containing protein  24.8 
 
 		 739 aa  73.9  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.423694  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4825  tetratricopeptide TPR_3  24.79 
 
 		 1009 aa  73.6  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.137513 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46573  TPR repeat-contain kinesin light chain  25.48 
 
 		 694 aa  73.6  0.00000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2811  tetratricopeptide TPR_2  21.04 
 
 		 782 aa  73.9  0.00000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0319314  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1683  TPR repeat-containing protein  27.59 
 
 		 362 aa  73.2  0.00000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1249  TPR repeat-containing protein  26.41 
 
 		 702 aa  72.4  0.00000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0879927  normal  0.272595 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23981  hypothetical protein  27.59 
 
 		 587 aa  72.4  0.00000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.167552 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3796  tetratricopeptide TPR_2  25.4 
 
 		 1040 aa  72.4  0.00000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0340  hypothetical protein  28.18 
 
 		 2413 aa  72  0.00000000006  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.259192 
 
 
-
 
NC_011893  Mnod_8810  Tetratricopeptide domain protein  29.82 
 
 		 724 aa  71.2  0.0000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.872699  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>