More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_1858 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013743  Htur_1858  UspA domain protein  100 
 
 
147 aa  287  4e-77  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0432  UspA domain protein  47.86 
 
 
144 aa  137  4.999999999999999e-32  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1862  UspA domain protein  52.48 
 
 
141 aa  136  8.999999999999999e-32  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0496809 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1388  UspA domain protein  43.88 
 
 
145 aa  120  8e-27  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.120958  normal  0.124251 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3773  UspA domain protein  47.68 
 
 
152 aa  118  3e-26  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3096  UspA domain protein  44.68 
 
 
207 aa  107  6e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.286  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2350  hypothetical protein  40.14 
 
 
150 aa  105  2e-22  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000004892  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1706  UspA domain protein  43.57 
 
 
290 aa  105  3e-22  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.873691  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1467  UspA domain protein  43.66 
 
 
180 aa  102  1e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0487  universal stress protein  38.03 
 
 
150 aa  100  7e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1496  UspA domain protein  43.66 
 
 
144 aa  100  7e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.828394 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1308  UspA domain protein  38.57 
 
 
145 aa  100  8e-21  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.437188  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1603  UspA domain protein  40.85 
 
 
208 aa  98.6  3e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0252  UspA domain-containing protein  39.72 
 
 
148 aa  97.4  6e-20  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3147  universal stress protein  38.73 
 
 
150 aa  96.3  1e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00251172  normal  0.0145111 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1309  UspA domain protein  39.87 
 
 
153 aa  95.1  3e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.678787 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0973  UspA domain protein  41.72 
 
 
155 aa  95.1  3e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2014  UspA domain protein  41.38 
 
 
307 aa  93.6  8e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.494901 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1890  UspA domain protein  41.1 
 
 
297 aa  92.8  1e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.108778  normal  0.382663 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0754  UspA domain protein  39.44 
 
 
152 aa  93.2  1e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0606368  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3405  UspA domain protein  41.38 
 
 
150 aa  92  2e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0308  UspA domain-containing protein  35.66 
 
 
145 aa  92.4  2e-18  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1224  UspA domain protein  37.34 
 
 
156 aa  92.4  2e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1606  UspA domain-containing protein  35.42 
 
 
145 aa  92  2e-18  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.198066  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1573  UspA domain protein  42.07 
 
 
149 aa  92.4  2e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3427  UspA domain protein  40.43 
 
 
156 aa  91.7  3e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3733  UspA domain protein  41.38 
 
 
151 aa  90.9  5e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.217159  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3164  UspA domain protein  40.76 
 
 
156 aa  90.9  5e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3089  UspA domain protein  42.86 
 
 
280 aa  90.1  1e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0826  universal stress protein  38.13 
 
 
165 aa  89.4  1e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1457  UspA domain-containing protein  35.21 
 
 
145 aa  89.4  1e-17  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_3017  UspA domain protein  40.58 
 
 
281 aa  89.7  1e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1022  UspA domain-containing protein  34.72 
 
 
145 aa  89.4  1e-17  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.335236  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0015  UspA domain-containing protein  38.89 
 
 
143 aa  89.4  2e-17  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.246066  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1658  UspA domain protein  42.96 
 
 
287 aa  88.6  3e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0825  universal stress protein  35.46 
 
 
164 aa  86.7  1e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3038  hypothetical protein  38.03 
 
 
147 aa  86.3  1e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000975242  normal  0.515565 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4249  UspA domain protein  41.84 
 
 
133 aa  85.9  1e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0480  UspA domain protein  37.86 
 
 
144 aa  86.3  1e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0965  UspA domain protein  36.88 
 
 
152 aa  85.5  2e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4348  UspA domain protein  35.71 
 
 
149 aa  85.9  2e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0947911  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1307  UspA domain protein  36.88 
 
 
153 aa  84.7  4e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.476613  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3681  UspA domain protein  37.59 
 
 
301 aa  84.7  4e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.429907  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2668  UspA domain protein  39.86 
 
 
159 aa  84.3  5e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3831  UspA domain protein  38.03 
 
 
300 aa  84  7e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0656239  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0833  UspA domain protein  36.53 
 
 
169 aa  83.6  8e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.139589  normal  0.670884 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1082  UspA domain protein  38.73 
 
 
158 aa  83.6  9e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.731229  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3813  UspA domain protein  39.57 
 
 
283 aa  82.8  0.000000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0224  UspA domain protein  42.36 
 
 
151 aa  82.8  0.000000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.483112  normal 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3401  UspA domain protein  37.41 
 
 
288 aa  82.8  0.000000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3218  universal stress protein  38.84 
 
 
120 aa  82.8  0.000000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0127245 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0570  UspA domain protein  39.13 
 
 
141 aa  82.4  0.000000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.932953  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2826  UspA domain protein  35.66 
 
 
286 aa  82  0.000000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.232825  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0118  UspA domain-containing protein  37.24 
 
 
144 aa  81.6  0.000000000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.385941 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2851  universal stress protein  30.2 
 
 
157 aa  80.9  0.000000000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.113376  hitchhiker  0.00572798 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0780  UspA domain protein  33.57 
 
 
142 aa  79.3  0.00000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0608906  normal  0.0365188 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3418  UspA domain protein  41.13 
 
 
133 aa  79.3  0.00000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3529  universal stress protein  34.51 
 
 
149 aa  79.7  0.00000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0176065  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2339  UspA domain-containing protein  35.92 
 
 
128 aa  79.7  0.00000000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.0225784 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3403  UspA domain protein  37.76 
 
 
301 aa  78.6  0.00000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3527  universal stress protein  32.64 
 
 
151 aa  77.8  0.00000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3055  UspA domain protein  34.97 
 
 
142 aa  75.9  0.0000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3533  UspA domain protein  34.87 
 
 
305 aa  75.9  0.0000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1589  UspA domain-containing protein  31.21 
 
 
140 aa  75.1  0.0000000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.000251397  normal  0.0131871 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3817  UspA domain protein  35.42 
 
 
415 aa  74.3  0.0000000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.232363  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0228  UspA domain protein  38.62 
 
 
144 aa  74.3  0.0000000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.115538 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2008  UspA domain-containing protein  32.39 
 
 
141 aa  74.3  0.0000000000005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0848  hypothetical protein  35.21 
 
 
142 aa  74.3  0.0000000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.957853  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2767  UspA domain protein  35.14 
 
 
139 aa  73.9  0.0000000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0943  UspA domain protein  30.82 
 
 
151 aa  73.2  0.000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0887098  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1182  UspA domain protein  34.27 
 
 
148 aa  73.2  0.000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.146743 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3827  putative universal stress protein  34.46 
 
 
187 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0704  hypothetical protein  33.56 
 
 
148 aa  72  0.000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2577  UspA domain protein  35.46 
 
 
148 aa  72.4  0.000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.987812  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2171  UspA domain-containing protein  34.93 
 
 
145 aa  72.4  0.000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.198814  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4244  UspA domain protein  38.3 
 
 
283 aa  72.4  0.000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.284447  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0592  UspA domain protein  32.85 
 
 
139 aa  71.6  0.000000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.000217039  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2886  UspA domain-containing protein  33.78 
 
 
148 aa  71.6  0.000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0844522  normal  0.787665 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5263  UspA domain protein  37.32 
 
 
138 aa  71.6  0.000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.179366  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3815  UspA domain-containing protein  33.78 
 
 
167 aa  71.2  0.000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.911542  normal  0.55924 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1466  UspA domain-containing protein  34.23 
 
 
144 aa  71.6  0.000000000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.838968  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1196  UspA domain-containing protein  35.21 
 
 
142 aa  71.2  0.000000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.196709  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3170  UspA domain protein  36.43 
 
 
167 aa  70.9  0.000000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0067  UspA domain protein  37.69 
 
 
126 aa  70.9  0.000000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0416151  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0873  UspA domain protein  32.85 
 
 
150 aa  70.5  0.000000000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00734386  normal  0.0430196 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3459  hypothetical protein  36.73 
 
 
145 aa  70.5  0.000000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.450632  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4616  UspA domain protein  34.27 
 
 
141 aa  70.1  0.000000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4014  UspA domain protein  35.42 
 
 
136 aa  70.1  0.000000000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2164  UspA domain protein  37.06 
 
 
154 aa  70.1  0.000000000009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4283  UspA domain-containing protein  33.78 
 
 
163 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.126296 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2620  UspA domain protein  32.17 
 
 
143 aa  69.3  0.00000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3565  universal stress protein  26.21 
 
 
156 aa  69.3  0.00000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0986618 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2102  UspA domain protein  35.21 
 
 
289 aa  69.3  0.00000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2196  UspA domain-containing protein  32.39 
 
 
143 aa  67.8  0.00000000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0309  hypothetical protein  26.76 
 
 
142 aa  67.8  0.00000000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0959  UspA domain protein  34.69 
 
 
144 aa  67.8  0.00000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.260464  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2586  universal stress protein  29.71 
 
 
141 aa  67.4  0.00000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0483395  normal  0.125899 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1504  hypothetical protein  33.77 
 
 
151 aa  67  0.00000000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1249  hypothetical protein  29.61 
 
 
154 aa  66.6  0.00000000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.17939  normal  0.197708 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1409  UspA domain protein  42.24 
 
 
118 aa  66.2  0.0000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.379594  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>