211 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hore_20580 on replicon NC_011899
Organism: Halothermothrix orenii H 168



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011899  Hore_20580  glycoside hydrolase family 43  100 
 
 
315 aa  649  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0536  glycoside hydrolase family 43  35.77 
 
 
393 aa  206  3e-52  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.812392 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2482  glycoside hydrolase family 43  36.06 
 
 
384 aa  199  5e-50  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.24102 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2556  glycoside hydrolase family 43  36.95 
 
 
319 aa  177  2e-43  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.149373  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2392  glycoside hydrolase family 43  38.49 
 
 
306 aa  172  8e-42  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  5.40158e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2027  glycoside hydrolase family protein  37.29 
 
 
325 aa  166  7e-40  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.808853  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6022  glycoside hydrolase family 43  35.76 
 
 
319 aa  158  1e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3903  glycoside hydrolase family protein  33.84 
 
 
340 aa  154  2e-36  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.969992  normal  0.175565 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0206  glycoside hydrolase family 43  34.69 
 
 
304 aa  145  1e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.306204  normal  0.253285 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2022  glycoside hydrolase family 43  29.75 
 
 
334 aa  140  2e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2722  glycoside hydrolase family protein  32.23 
 
 
310 aa  135  6e-31  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.123508  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2971  glycoside hydrolase family 43  32.56 
 
 
855 aa  130  4e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0529993 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1302  putative beta-xylosidase  31.69 
 
 
713 aa  124  2e-27  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0745  glycoside hydrolase family 43  32.95 
 
 
327 aa  123  4e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.465475  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2723  glycoside hydrolase family protein  32.34 
 
 
345 aa  121  2e-26  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.469303  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0739  glycoside hydrolase family protein  34.41 
 
 
348 aa  120  2e-26  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16970  beta-xylosidase  30.99 
 
 
313 aa  121  2e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.374085 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2866  glycoside hydrolase family 43  30.89 
 
 
487 aa  119  8e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.141314  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1115  family 43 glycoside hydrolase  28.63 
 
 
338 aa  118  1e-25  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2384  glycoside hydrolase family 43  28.86 
 
 
330 aa  105  1e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1524  glycoside hydrolase family 43  31.1 
 
 
524 aa  103  4e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3109  glycoside hydrolase family protein  29.93 
 
 
644 aa  102  7e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0193  glycoside hydrolase family 43  27.85 
 
 
324 aa  102  1e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00680352  normal  0.581709 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2639  glycoside hydrolase family 43  29.68 
 
 
472 aa  100  4e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.431626  normal  0.0143862 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6730  glycoside hydrolase family 43  26.55 
 
 
323 aa  99.4  7e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.575675  normal  0.920031 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0810  carbohydrate-binding family 6 protein  27.81 
 
 
450 aa  97.8  2e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.034958  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0650  glycoside hydrolase family 43  29.21 
 
 
495 aa  97.1  4e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0713148  normal  0.104092 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3213  glycoside hydrolase family 43  27.36 
 
 
464 aa  94.7  2e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.331095  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0628  glycoside hydrolase family 43  29.75 
 
 
505 aa  95.1  2e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0353  Alpha-N-arabinofuranosidase  29.35 
 
 
340 aa  94.4  2e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.478586  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3360  glycoside hydrolase family 43  29.93 
 
 
522 aa  94  3e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0779432 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0455  Carbohydrate binding family 6  27.42 
 
 
618 aa  90.9  2e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2138  glycoside hydrolase family protein  30.1 
 
 
580 aa  90.9  2e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3224  Alpha-N-arabinofuranosidase  28.35 
 
 
444 aa  90.5  3e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.136595  normal  0.135367 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1235  Carbohydrate binding family 6  26.21 
 
 
509 aa  89  9e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00440741  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2447  putative xylosidase  30.25 
 
 
468 aa  89  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.320135 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01870  xylosidase/arabinosidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G04480)  28.97 
 
 
344 aa  87.4  2e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3926  Alpha-N-arabinofuranosidase  26.99 
 
 
353 aa  87  4e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2078  glycoside hydrolase family protein  28.42 
 
 
333 aa  86.7  5e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  1.71617e-06 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1983  Alpha-N-arabinofuranosidase  28.28 
 
 
333 aa  85.5  1e-15  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.131157  hitchhiker  0.000323815 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1991  Alpha-N-arabinofuranosidase  28.28 
 
 
333 aa  85.5  1e-15  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.535361  hitchhiker  0.0025818 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3276  carbohydrate-binding family 6 protein  28.72 
 
 
401 aa  84.7  2e-15  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2318  alpha-N-arabinofuranosidase  25.35 
 
 
512 aa  84.3  2e-15  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.389032  normal  0.249416 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2449  glycoside hydrolase family 43  26.35 
 
 
537 aa  84  3e-15  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.114761  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0375  Alpha-N-arabinofuranosidase  25.87 
 
 
320 aa  84  3e-15  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.194615 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6044  glycoside hydrolase family 43  27.8 
 
 
501 aa  84  3e-15  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.845022  normal  0.0554344 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4281  glycoside hydrolase family protein  28.71 
 
 
304 aa  82.8  7e-15  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.394059  normal  0.201547 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3081  Alpha-N-arabinofuranosidase  27.81 
 
 
347 aa  82.4  8e-15  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.174999 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0737  glycoside hydrolase family protein  29.48 
 
 
345 aa  82.8  8e-15  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.612706  normal  0.340405 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0507  glycoside hydrolase family 43  30.63 
 
 
337 aa  82.4  9e-15  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.412329 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2050  Alpha-N-arabinofuranosidase  27.71 
 
 
628 aa  81.6  1e-14  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.647188  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_10919  hypothetical protein  25.41 
 
 
383 aa  82  1e-14  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0280473  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4015  Alpha-N-arabinofuranosidase  27.86 
 
 
316 aa  81.6  2e-14  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.374265 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4496  glycoside hydrolase family 43  27.68 
 
 
503 aa  80.1  4e-14  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0241272  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0656  Alpha-N-arabinofuranosidase  27.84 
 
 
316 aa  80.1  4e-14  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0753  glycoside hydrolase family protein  32.05 
 
 
465 aa  79.3  7e-14  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20520  beta-xylosidase  26.01 
 
 
542 aa  79.7  7e-14  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.129044  normal  0.254652 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2371  glycoside hydrolase family 43  25.83 
 
 
293 aa  79.3  7e-14  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2614  glycoside hydrolase family 43  26.54 
 
 
326 aa  79  1e-13  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1231  Carbohydrate binding family 6  26.06 
 
 
524 aa  78.6  1e-13  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0177163  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1082  Alpha-N-arabinofuranosidase  25.4 
 
 
517 aa  78.2  2e-13  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.286531 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6193  glycoside hydrolase family 43  26.43 
 
 
502 aa  77.8  2e-13  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1655  translation initiation factor IF-1  29.37 
 
 
566 aa  77.8  2e-13  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0976225  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1366  Alpha-N-arabinofuranosidase  28.96 
 
 
648 aa  78.2  2e-13  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.226192 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2237  glycoside hydrolase family 43  26.15 
 
 
349 aa  78.2  2e-13  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.572744  normal  0.998954 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2157  glycoside hydrolase family 43  27.88 
 
 
627 aa  77.4  3e-13  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  4.34172e-05  hitchhiker  0.0029689 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28680  predicted beta-xylosidase  28.17 
 
 
341 aa  76.6  5e-13  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1982  glycoside hydrolase family protein  27.62 
 
 
315 aa  76.3  7e-13  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  1.0784e-08  normal  0.0338284 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2196  carbohydrate-binding family 6 protein  26.02 
 
 
533 aa  75.9  8e-13  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4504  glycoside hydrolase family 43  26.67 
 
 
510 aa  75.5  1e-12  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3395  glycoside hydrolase family 43  24.6 
 
 
355 aa  75.5  1e-12  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2083  glycoside hydrolase family protein  28.2 
 
 
634 aa  75.5  1e-12  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000179948  decreased coverage  3.21687e-08 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2837  glycoside hydrolase family 43  26.06 
 
 
348 aa  75.5  1e-12  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.61366  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1729  glycoside hydrolase family 43  26.62 
 
 
472 aa  74.7  2e-12  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.101805  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0473  glycoside hydrolase family 43  24.23 
 
 
829 aa  74.7  2e-12  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.658009  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1400  glycoside hydrolase family 43  28.47 
 
 
517 aa  74.3  2e-12  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.587173  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1996  glycoside hydrolase family protein  28.2 
 
 
634 aa  74.7  2e-12  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  7.18487e-06  hitchhiker  3.98389e-05 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1979  glycoside hydrolase family protein  28.2 
 
 
634 aa  74.3  2e-12  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00334232  hitchhiker  0.000434537 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1423  Xylan 1,4-beta-xylosidase  26.52 
 
 
558 aa  74.7  2e-12  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.423704 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1547  putative beta-xylosidase  24.09 
 
 
344 aa  74.3  3e-12  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  unclonable  6.31807e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0165  alpha-N-arabinofuranosidase 2  28.52 
 
 
316 aa  73.6  4e-12  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.124224  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0161  alpha-N-arabinofuranosidase 2  28.52 
 
 
316 aa  73.6  4e-12  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0359  glycoside hydrolase family protein  26.13 
 
 
506 aa  73.2  5e-12  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0212595 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01459  xylosidase; arabinosidase  28.4 
 
 
527 aa  73.6  5e-12  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.928055  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0168  alpha-N-arabinofuranosidase 2  28.52 
 
 
316 aa  73.2  6e-12  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2529  Alpha-N-arabinofuranosidase  25.17 
 
 
355 aa  72.8  7e-12  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0997912 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1992  glycoside hydrolase family protein  27.3 
 
 
315 aa  72.8  7e-12  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  4.93506e-05  unclonable  2.04974e-05 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2025  Alpha-N-arabinofuranosidase  27.85 
 
 
376 aa  72.8  7e-12  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.620669  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2423  glycoside hydrolase family 43  26.06 
 
 
699 aa  72.4  9e-12  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2069  glycoside hydrolase family protein  27.3 
 
 
315 aa  72  1e-11  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  2.7007e-08  hitchhiker  3.5019e-06 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0162  alpha-N-arabinofuranosidase 2  28.18 
 
 
316 aa  72.4  1e-11  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.788898  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3438  glycoside hydrolase family 43  26.67 
 
 
519 aa  71.6  1e-11  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.990127  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0160  alpha-N-arabinofuranosidase 2  28.18 
 
 
316 aa  72.4  1e-11  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3228  glycoside hydrolase family protein  24.52 
 
 
563 aa  72  1e-11  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  decreased coverage  0.00674596  normal  0.0120766 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2143  glycoside hydrolase family 43  27.36 
 
 
311 aa  71.2  2e-11  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.209046  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0946  SecY protein  27.9 
 
 
317 aa  71.6  2e-11  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.409307  hitchhiker  7.24629e-05 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0791  Alpha-L-arabinofuranosidase  23.68 
 
 
607 aa  70.9  3e-11  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.570389  normal  0.122086 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0501  Alpha-N-arabinofuranosidase  28.37 
 
 
426 aa  70.9  3e-11  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.1165  normal  0.486336 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2063  glycoside hydrolase family protein  26.27 
 
 
311 aa  70.5  4e-11  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  2.84349e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2053  Alpha-N-arabinofuranosidase  26.05 
 
 
315 aa  69.7  7e-11  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>