More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_4185 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_4185  signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 494 aa  949    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5177  signal transduction histidine kinase  54.86 
 
 		 492 aa  449  1e-125  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.245991  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30710  signal transduction histidine kinase  50.68 
 
 		 512 aa  447  1.0000000000000001e-124  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.523604  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6290  signal transduction histidine kinase  53.96 
 
 		 492 aa  443  1e-123  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4087  signal transduction histidine kinase  53.77 
 
 		 508 aa  440  9.999999999999999e-123  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0238732  normal  0.0371464 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8307  putative signal transduction histidine kinase  52.46 
 
 		 497 aa  436  1e-121  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.140335  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3706  histidine kinase, dimerisation/phosphoacceptor  52.95 
 
 		 516 aa  434  1e-120  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0555  signal transduction histidine kinase  51.25 
 
 		 521 aa  431  1e-119  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3696  signal transduction histidine kinase  50.39 
 
 		 514 aa  430  1e-119  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.87063 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2909  signal transduction histidine kinase  53.05 
 
 		 487 aa  423  1e-117  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.422924  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3695  signal transduction histidine kinase  51.14 
 
 		 503 aa  421  1e-116  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.316743  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1712  histidine kinase, dimerisation/phosphoacceptor  52.35 
 
 		 491 aa  421  1e-116  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1411  signal transduction histidine kinase  49.8 
 
 		 500 aa  417  9.999999999999999e-116  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.597292  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0970  signal transduction histidine kinase  52.17 
 
 		 520 aa  409  1e-113  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.183244  normal  0.273355 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4686  signal transduction histidine kinase  50.4 
 
 		 496 aa  409  1e-113  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0201363  normal  0.134555 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3760  signal transduction histidine kinase  52.37 
 
 		 511 aa  407  1.0000000000000001e-112  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1382  signal transduction histidine kinase  50.41 
 
 		 496 aa  407  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1400  signal transduction histidine kinase  50.41 
 
 		 496 aa  407  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1416  signal transduction histidine kinase  50.41 
 
 		 496 aa  407  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7712  signal transduction histidine kinase  51.02 
 
 		 509 aa  404  1e-111  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1109  signal transduction histidine kinase  50 
 
 		 501 aa  400  9.999999999999999e-111  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.366346  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1781  signal transduction histidine kinase  49.6 
 
 		 496 aa  401  9.999999999999999e-111  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.525963 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2397  signal transduction histidine kinase  49.48 
 
 		 493 aa  393  1e-108  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.62445  hitchhiker  0.00117344 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0559  signal transduction histidine kinase  52.18 
 
 		 490 aa  394  1e-108  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3522  histidine kinase dimerization/phosphoacceptor  48.5 
 
 		 500 aa  389  1e-107  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2609  signal transduction histidine kinase  48.93 
 
 		 492 aa  386  1e-106  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.107933  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08440  signal transduction histidine kinase  45.79 
 
 		 492 aa  385  1e-105  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.367535  normal  0.378005 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1884  signal transduction histidine kinase  47.23 
 
 		 484 aa  382  1e-105  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.857043 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2829  signal transduction histidine kinase  47.92 
 
 		 517 aa  383  1e-105  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13246  two component sensor kinase  47.98 
 
 		 501 aa  375  1e-102  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.467519 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3796  signal transduction histidine kinase  49.48 
 
 		 500 aa  366  1e-100  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2698  signal transduction histidine kinase  44.13 
 
 		 489 aa  342  8e-93  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.112913  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2429  signal transduction histidine kinase  43.06 
 
 		 490 aa  340  2.9999999999999998e-92  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0180787 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20510  signal transduction histidine kinase  41.16 
 
 		 497 aa  280  4e-74  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.101775  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14630  signal transduction histidine kinase  42.83 
 
 		 502 aa  276  4e-73  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0585  sensor histidine kinase/response regulator  38.59 
 
 		 494 aa  274  3e-72  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.785291 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0765  signal transduction histidine kinase  37.66 
 
 		 495 aa  269  8.999999999999999e-71  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0891628  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08780  signal transduction histidine kinase  43.46 
 
 		 480 aa  247  4e-64  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.102396  normal  0.0847778 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0352  signal transduction histidine kinase  38.96 
 
 		 475 aa  234  2.0000000000000002e-60  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1292  signal transduction histidine kinase  28.32 
 
 		 492 aa  176  9.999999999999999e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1052  signal transduction histidine kinase  26.91 
 
 		 465 aa  165  2.0000000000000002e-39  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1075  signal transduction histidine kinase  26.36 
 
 		 478 aa  154  2.9999999999999998e-36  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0083  signal transduction histidine kinase  26.63 
 
 		 470 aa  145  2e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0889  sensor histidine kinase  29.6 
 
 		 475 aa  140  6e-32  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2710  hypothetical protein  36.84 
 
 		 744 aa  129  2.0000000000000002e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0429  signal transduction histidine kinase  35.81 
 
 		 1093 aa  127  6e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0440  signal transduction histidine kinase  35.81 
 
 		 1093 aa  125  2e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.790224  normal  0.127185 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1527  signal transduction histidine kinase  33.77 
 
 		 1227 aa  125  2e-27  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.823974 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3862  signal transduction histidine kinase  38.97 
 
 		 532 aa  122  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1806  signal transduction histidine kinase  33.18 
 
 		 681 aa  121  3e-26  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.286721 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3899  signal transduction histidine kinase  35.27 
 
 		 613 aa  120  3.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.796516 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0913  multisensor signal transduction histidine kinase  32.14 
 
 		 991 aa  118  3e-25  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.650855  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1419  signal transduction histidine kinase  41.94 
 
 		 551 aa  117  3.9999999999999997e-25  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1535  sensory transduction histidine kinase  31.95 
 
 		 682 aa  116  7.999999999999999e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1666  sensory transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 945 aa  116  1.0000000000000001e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.515191  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3230  signal transduction histidine kinase  38.14 
 
 		 636 aa  116  1.0000000000000001e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00732898  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1972  signal transduction histidine kinase  33.77 
 
 		 815 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000691031  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1812  signal transduction histidine kinase  36.71 
 
 		 1390 aa  115  2.0000000000000002e-24  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.155927 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5298  signal transduction histidine kinase  36.41 
 
 		 732 aa  114  4.0000000000000004e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0815  hypothetical protein  30.84 
 
 		 918 aa  114  5e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3538  hypothetical protein  32.88 
 
 		 754 aa  113  6e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0655709  normal  0.940328 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1496  signal transduction histidine kinase  32.76 
 
 		 1253 aa  113  6e-24  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.172842 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1899  multisensor signal transduction histidine kinase  33.94 
 
 		 462 aa  113  8.000000000000001e-24  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.970297  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0299  two component sensor histidine kinase  28.99 
 
 		 1239 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.669336  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5451  signal transduction histidine kinase  35.98 
 
 		 547 aa  111  3e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.915879  normal  0.94618 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1008  signal transduction histidine kinase  37.98 
 
 		 347 aa  111  3e-23  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.681685  normal  0.906099 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2687  signal transduction histidine kinase  35.26 
 
 		 215 aa  110  8.000000000000001e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.693771  normal  0.196612 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3447  hypothetical protein  30.96 
 
 		 1210 aa  109  1e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00320271  normal  0.0786508 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5678  signal transduction histidine kinase  31.25 
 
 		 747 aa  108  1e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.302282 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2234  signal transduction histidine kinase  33.92 
 
 		 1676 aa  108  2e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.900765 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0404  hypothetical protein  31.15 
 
 		 1182 aa  108  3e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.465468  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2336  signal transduction histidine kinase  31.6 
 
 		 3706 aa  108  3e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0936  signal transduction histidine kinase  33.47 
 
 		 1177 aa  107  6e-22  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.194621  normal  0.0190935 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1370  signal transduction histidine kinase  32.34 
 
 		 1560 aa  107  6e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.71177  normal  0.70667 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3004  Signal transduction histidine kinase  31.63 
 
 		 941 aa  106  9e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2184  hypothetical protein  31.69 
 
 		 676 aa  105  1e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.677561  normal  0.87611 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2636  signal transduction histidine kinase  33.69 
 
 		 1051 aa  106  1e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2118  signal transduction histidine kinase  33.04 
 
 		 572 aa  105  2e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2286  multisensor signal transduction histidine kinase  33.03 
 
 		 834 aa  105  2e-21  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.461732  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2096  signal transduction histidine kinase  36.07 
 
 		 526 aa  105  2e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0713574 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1944  signal-transducing histidine kinase  30.25 
 
 		 1248 aa  104  4e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.318144  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4528  histidine kinase dimerisation/phosphoacceptor  38.43 
 
 		 1668 aa  104  4e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4408  signal transduction histidine kinase  40.56 
 
 		 408 aa  104  4e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.488817 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1359  signal transduction histidine kinase  29.51 
 
 		 631 aa  103  7e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0321472 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2362  hypothetical protein  30.49 
 
 		 449 aa  103  8e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.514155  normal  0.0458949 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1723  signal transduction histidine kinase  31.65 
 
 		 764 aa  103  8e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2876  sensory transduction histidine kinase  30.36 
 
 		 936 aa  102  1e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.558657 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2753  signal transduction histidine kinase  40.69 
 
 		 325 aa  102  1e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2150  signal transduction histidine kinase  35.1 
 
 		 945 aa  102  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0896  signal transduction histidine kinase  35.59 
 
 		 839 aa  102  1e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.335338  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1001  signal transduction histidine kinase  34.97 
 
 		 674 aa  102  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.58641  normal  0.0795268 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1953  signal transduction histidine kinase  39.52 
 
 		 382 aa  103  1e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1002  signal transduction histidine kinase  34.97 
 
 		 932 aa  102  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.353608  normal  0.0662086 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1483  sensory transduction histidine kinase  29.8 
 
 		 704 aa  102  2e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.681498  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1364  signal transduction histidine kinase  34.62 
 
 		 382 aa  102  2e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00521592 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3735  signal transduction histidine kinase  31.25 
 
 		 1183 aa  101  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.709518  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4325  Signal transduction histidine kinase  34.63 
 
 		 1654 aa  102  2e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0454  signal transduction histidine kinase  31 
 
 		 657 aa  102  2e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.263033 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1729  signal transduction histidine kinase  32.21 
 
 		 964 aa  102  2e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0370864  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3010  signal transduction histidine kinase  33.94 
 
 		 488 aa  102  2e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0663481  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>