More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_3600 on replicon NC_013412
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013412  GYMC61_3600  isochorismatase hydrolase  100 
 
 		 208 aa  421  1e-117  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  normal  0.572531  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2747  N-carbamoylsarcosine amidase  45.37 
 
 		 216 aa  197  1.0000000000000001e-49  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4359  isochorismatase hydrolase  45.89 
 
 		 218 aa  183  1.0000000000000001e-45  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0222954  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1694  isochorismatase hydrolase  46.24 
 
 		 209 aa  172  3.9999999999999995e-42  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0173  isochorismatase hydrolase  41.43 
 
 		 209 aa  163  1.0000000000000001e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0048  isochorismatase hydrolase  40.87 
 
 		 210 aa  160  1e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.157221 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3089  N-carbamoylsarcosine amidase  41.35 
 
 		 227 aa  157  9e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.109998  hitchhiker  0.000000410333 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3491  N-carbamoylsarcosine amidase  42.57 
 
 		 214 aa  156  2e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2143  isochorismatase hydrolase  38.86 
 
 		 213 aa  151  7e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.14833 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6045  N-carbamoylsarcosine amidase  38.94 
 
 		 213 aa  150  1e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2308  N-carbamoylsarcosine amidase  39.71 
 
 		 211 aa  150  1e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.48308  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3576  isochorismatase hydrolase  37.82 
 
 		 213 aa  144  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.360022 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3941  isochorismatase superfamily hydrolase  37.82 
 
 		 213 aa  144  1e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0786845 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1896  isochorismatase hydrolase  37.82 
 
 		 213 aa  144  1e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.404618  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1129  putative isochorismatase hydrolase  41.15 
 
 		 242 aa  142  2e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2858  isochorismatase hydrolase  39.71 
 
 		 207 aa  141  8e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6622  isochorismatase hydrolase  42.86 
 
 		 215 aa  139  1.9999999999999998e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.105038  normal  0.886769 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3971  isochorismatase hydrolase  43.24 
 
 		 198 aa  135  3.0000000000000003e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4294  isochorismatase hydrolase  39.41 
 
 		 213 aa  134  9.999999999999999e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3487  isochorismatase hydrolase  35.64 
 
 		 215 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00135303 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1849  isochorismatase hydrolase  39.68 
 
 		 231 aa  133  1.9999999999999998e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4328  isochorismatase hydrolase  35.64 
 
 		 215 aa  132  3e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0839951  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4038  isochorismatase hydrolase  35.64 
 
 		 215 aa  132  3e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0636814  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3931  isochorismatase hydrolase  38.97 
 
 		 224 aa  131  6e-30  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0122322 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4551  isochorismatase hydrolase  36.84 
 
 		 223 aa  127  8.000000000000001e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.28453  normal  0.598116 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2511  isochorismatase hydrolase  37.02 
 
 		 216 aa  127  1.0000000000000001e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.446078  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3789  isochorismatase hydrolase  41.36 
 
 		 208 aa  126  2.0000000000000002e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0217  isochorismatase hydrolase family protein  38.12 
 
 		 211 aa  126  3e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.000000108628  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4677  isochorismatase hydrolase  34.74 
 
 		 210 aa  114  7.999999999999999e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0532887  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7953  isochorismatase hydrolase  32.88 
 
 		 227 aa  112  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.315447  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4354  N-carbamoylsarcosine amidase  29.52 
 
 		 247 aa  100  1e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0856  isochorismatase hydrolase  28.17 
 
 		 236 aa  98.6  6e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.223979  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2732  isochorismatase hydrolase  30.81 
 
 		 219 aa  95.5  4e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.142839  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1059  isochorismatase hydrolase  29.73 
 
 		 251 aa  89.7  3e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0989042  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4343  isochorismatase hydrolase  31.13 
 
 		 252 aa  84.3  0.000000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.202601  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1098  isochorismatase hydrolase  42.71 
 
 		 221 aa  76.6  0.0000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS00897  putative hydrolase protein  28.5 
 
 		 197 aa  70.9  0.00000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0259  isochorismatase hydrolase family protein  30.54 
 
 		 195 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0908  isochorismatase hydrolase  29.61 
 
 		 187 aa  67.4  0.0000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.150668  normal  0.249325 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2274  Isochorismatase  30.16 
 
 		 211 aa  65.5  0.0000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.412367  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0336  isochorismatase hydrolase  28.26 
 
 		 223 aa  65.1  0.0000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.499522  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4231  isochorismatase hydrolase  34.42 
 
 		 194 aa  63.9  0.000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0539738  normal  0.306851 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7125  hydrolase  38.2 
 
 		 229 aa  62.8  0.000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2226  isochorismatase hydrolase  25.79 
 
 		 188 aa  62.8  0.000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1079  isochorismatase hydrolase  25 
 
 		 189 aa  62.8  0.000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2800  isochorismatase hydrolase  23.44 
 
 		 235 aa  62.4  0.000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3660  isochorismatase hydrolase  25.57 
 
 		 213 aa  62  0.000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0150605  normal  0.0962565 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2817  isochorismatase hydrolase  28.21 
 
 		 188 aa  62  0.000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000000369083  hitchhiker  0.00306149 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5815  isochorismatase hydrolase  28.31 
 
 		 187 aa  62  0.000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.28995  hitchhiker  0.00617884 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1015  isochorismatase hydrolase  25.65 
 
 		 203 aa  61.6  0.000000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.174474  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4549  isochorismatase hydrolase  33.33 
 
 		 289 aa  61.2  0.000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.520788  normal  0.388724 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0763  isochorismatase hydrolase  25.65 
 
 		 203 aa  60.8  0.00000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2306  isochorismatase hydrolase  28.26 
 
 		 185 aa  60.8  0.00000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.978441  normal  0.33888 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1287  isochorismatase hydrolase  25.39 
 
 		 184 aa  60.5  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.351322  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4198  isochorismatase hydrolase  32.03 
 
 		 189 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0806995 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1327  isochorismatase hydrolase  25.95 
 
 		 203 aa  60.5  0.00000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.240514 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3668  isochorismatase hydrolase  28.96 
 
 		 243 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.856402 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4611  isochorismatase hydrolase family protein  31.41 
 
 		 186 aa  60.5  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.163759 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0489  isochorismatase hydrolase  28.21 
 
 		 184 aa  60.1  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.428898 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0829  isochorismatase hydrolase  32.65 
 
 		 244 aa  60.1  0.00000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.291924  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1695  isochorismatase hydrolase  33.33 
 
 		 226 aa  59.7  0.00000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.305053  normal  0.0828387 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3421  isochorismatase hydrolase  26.09 
 
 		 217 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5339  isochorismatase hydrolase  26.09 
 
 		 217 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.472338  normal  0.0895037 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0850  isochorismatase hydrolase  25.7 
 
 		 227 aa  59.7  0.00000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.633323  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4947  isochorismatase hydrolase  26.09 
 
 		 217 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000317708 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1111  isochorismatase hydrolase  28.15 
 
 		 239 aa  58.9  0.00000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.77446  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2014  isochorismatase hydrolase  33.33 
 
 		 226 aa  58.9  0.00000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.35213  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3108  isochorismatase hydrolase  27.23 
 
 		 228 aa  58.9  0.00000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.390914 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2024  isochorismatase hydrolase  23.94 
 
 		 239 aa  58.9  0.00000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.166105  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4618  isochorismatase hydrolase  32.03 
 
 		 218 aa  58.9  0.00000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0170  isochorismatase hydrolase  30.17 
 
 		 218 aa  58.9  0.00000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2915  isochorismatase hydrolase  28.02 
 
 		 227 aa  58.5  0.00000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.200288 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3260  isochorismatase hydrolase  30.06 
 
 		 210 aa  58.5  0.00000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0891965  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3075  isochorismatase hydrolase  28.66 
 
 		 212 aa  58.5  0.00000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3214  isochorismatase hydrolase  28.14 
 
 		 197 aa  58.5  0.00000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.176395  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2641  isochorismatase hydrolase  28.16 
 
 		 195 aa  58.2  0.00000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0202  isochorismatase hydrolase  26.34 
 
 		 190 aa  58.2  0.00000009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  decreased coverage  0.00287334  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4464  isochorismatase hydrolase  25 
 
 		 187 aa  58.2  0.00000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0939811  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2928  isochorismatase hydrolase  29.14 
 
 		 204 aa  58.2  0.00000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.820644 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3302  isochorismatase  27.75 
 
 		 190 aa  57.8  0.0000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.154623 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5107  isochorismatase hydrolase  35.42 
 
 		 226 aa  57.8  0.0000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.321359  normal  0.0633461 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4208  isochorismatase hydrolase  30.83 
 
 		 234 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4372  isochorismatase hydrolase  27.84 
 
 		 211 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.010386 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1705  isochorismatase hydrolase  23.94 
 
 		 239 aa  57.8  0.0000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.936948 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2669  isochorismatase hydrolase  25.13 
 
 		 186 aa  57  0.0000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1123  isochorismatase hydrolase  32.48 
 
 		 226 aa  57  0.0000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6682  isochorismatase hydrolase  30.77 
 
 		 212 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2663  isochorismatase hydrolase  27.87 
 
 		 202 aa  57  0.0000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0767391  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0124  isochorismatase hydrolase  30.67 
 
 		 180 aa  57  0.0000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.963178  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0263  isochorismatase hydrolase  28.04 
 
 		 189 aa  57.4  0.0000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1351  isochorismatase hydrolase  34.83 
 
 		 191 aa  57.4  0.0000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2361  aldehyde dehydrogenase  43.55 
 
 		 683 aa  56.6  0.0000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.536746  normal  0.202698 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4889  isochorismatase hydrolase  29.81 
 
 		 211 aa  57  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000690458 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2725  isochorismatase hydrolase  25.13 
 
 		 186 aa  57  0.0000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20850  isochorismate hydrolase  27.92 
 
 		 221 aa  57.4  0.0000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00852514 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2624  isochorismatase hydrolase  28.03 
 
 		 226 aa  56.2  0.0000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.722886  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2058  isochorismatase hydrolase  25.98 
 
 		 225 aa  56.2  0.0000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3976  isochorismatase hydrolase  26 
 
 		 178 aa  56.2  0.0000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0812  isochorismatase hydrolase  24.66 
 
 		 184 aa  56.6  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0745  isochorismatase hydrolase  28.76 
 
 		 211 aa  55.8  0.0000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00955139 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>