287 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_1611 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_1611  integrase family protein  100 
 
 		 375 aa  771    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.115349  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0623  Bbp50  37.26 
 
 		 356 aa  217  2.9999999999999998e-55  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.951969  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0179  hypothetical protein  36.69 
 
 		 401 aa  201  3e-50  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0194  hypothetical protein  36.69 
 
 		 402 aa  200  3.9999999999999996e-50  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2325  phage integrase family protein  34.36 
 
 		 403 aa  186  4e-46  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.633234  hitchhiker  0.0000214757 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1301  integrase family protein  31.13 
 
 		 396 aa  149  6e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0726  phage integrase family protein  29.73 
 
 		 401 aa  144  2e-33  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000125813  decreased coverage  0.0000000856927 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0479  phage integrase  30.26 
 
 		 357 aa  140  4.999999999999999e-32  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.00687154  normal  0.27879 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0961  phage integrase  29.37 
 
 		 414 aa  138  2e-31  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.531442  unclonable  0.0000381875 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01948  integrase  29.12 
 
 		 411 aa  136  6.0000000000000005e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1786  phage integrase family site specific recombinase  26.84 
 
 		 426 aa  135  9.999999999999999e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.942474  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2052  integrase family protein  26.58 
 
 		 431 aa  134  3e-30  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.00969136  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0686  phage integrase family protein  29.03 
 
 		 397 aa  133  6e-30  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0848514  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1074  integrase  27.46 
 
 		 446 aa  132  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000184312 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1042  integrase  27.46 
 
 		 430 aa  131  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000195373 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1107  integrase  27.46 
 
 		 446 aa  131  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.781225 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2851  integrase family protein  28 
 
 		 391 aa  128  2.0000000000000002e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2064  integrase family protein  25.99 
 
 		 398 aa  127  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00115414  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1356  phage integrase  31.84 
 
 		 388 aa  125  1e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.000418117  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2298  integrase family protein  29.25 
 
 		 411 aa  124  3e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000253071  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01322  integrase  29 
 
 		 411 aa  123  6e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01332  hypothetical protein  29 
 
 		 411 aa  123  6e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1324  Phage integrase  27.51 
 
 		 411 aa  122  8e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000225151  hitchhiker  0.00877617 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2022  phage integrase family protein  27.51 
 
 		 407 aa  120  3e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0581728  decreased coverage  0.0000000356379 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2121  Phage integrase  27.55 
 
 		 433 aa  119  9.999999999999999e-26  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2314  phage integrase family protein  25.44 
 
 		 392 aa  118  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0243817  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2356  phage integrase family protein  25.59 
 
 		 392 aa  117  3e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000232607  hitchhiker  0.000274891 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2264  integrase family protein  23.59 
 
 		 428 aa  117  3.9999999999999997e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.12232  hitchhiker  0.00139292 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2897  phage integrase family protein  26.56 
 
 		 386 aa  115  2.0000000000000002e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0371  phage integrase  29.63 
 
 		 471 aa  112  7.000000000000001e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000000794278  normal  0.310006 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3251  Int protein  25.26 
 
 		 428 aa  113  7.000000000000001e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.383765  hitchhiker  0.0000530695 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1143  integrase family protein  29.68 
 
 		 412 aa  111  2.0000000000000002e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00000465357  unclonable  7.38755e-19 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2393  phage integrase family site specific recombinase  25.07 
 
 		 412 aa  110  4.0000000000000004e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.682709  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0288  integrase family protein  26.6 
 
 		 403 aa  110  4.0000000000000004e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2315  integrase family protein  30.83 
 
 		 255 aa  108  1e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0961638  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1996  bacteriophage integrase family protein  38.37 
 
 		 190 aa  106  8e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0601499  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2134  integrase family protein  26.1 
 
 		 407 aa  105  1e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.565858  normal  0.985536 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0253  integrase family protein  27.07 
 
 		 435 aa  105  1e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00000373788  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2000  integrase family protein  27.94 
 
 		 430 aa  103  3e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000276307  normal  0.758982 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1951  phage integrase family protein  27.94 
 
 		 430 aa  103  3e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000646207  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5560  integrase family protein  32.42 
 
 		 273 aa  103  7e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1181  integrase family protein  29.01 
 
 		 417 aa  102  9e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.588038 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06819  integrase  29.83 
 
 		 341 aa  94.7  2e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1995  integrase family protein  27.16 
 
 		 359 aa  93.6  5e-18  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1958  integrase family protein  25.72 
 
 		 431 aa  92.4  1e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00797743  normal  0.0944215 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0846  phage integrase family protein  27.35 
 
 		 368 aa  85.9  0.000000000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2465  putative pore-forming cytotoxin integrase  26.42 
 
 		 381 aa  85.5  0.000000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.472408  normal  0.135007 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0746  phage integrase family protein  25.54 
 
 		 384 aa  84  0.000000000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3092  Phage integrase  26.69 
 
 		 386 aa  83.6  0.000000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000712508  normal  0.602347 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0476  integrase family protein  25.31 
 
 		 371 aa  83.2  0.000000000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0923  integrase family protein  23.99 
 
 		 363 aa  82  0.00000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1796  Phage integrase  24.77 
 
 		 390 aa  82.8  0.00000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1568  integrase family protein  26.82 
 
 		 357 aa  81.3  0.00000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1299  ATP synthase C chain (Lipid-binding protein)(dicyclohexylcarbodiimide-binding protein)  28.26 
 
 		 276 aa  79.7  0.00000000000008  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.138166  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4084  integrase family protein  29 
 
 		 356 aa  79.7  0.00000000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1474  phage integrase family site specific recombinase  27.99 
 
 		 386 aa  79.3  0.00000000000009  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0051357  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0831  integrase family protein  25.98 
 
 		 378 aa  79.3  0.0000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0217  phage integrase family site specific recombinase  28.69 
 
 		 384 aa  77.8  0.0000000000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.35128  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1239  integrase family protein  27.86 
 
 		 390 aa  77.4  0.0000000000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.120865  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2497  integrase family protein  24.29 
 
 		 384 aa  75.1  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.355652 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2937  integrase, putative  41.35 
 
 		 139 aa  74.3  0.000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.456202  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1927  phage integrase  24.84 
 
 		 379 aa  73.9  0.000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0252061  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1112  integrase family protein  25.5 
 
 		 338 aa  73.6  0.000000000006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1592  phage integrase  24.67 
 
 		 377 aa  72.4  0.00000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0012  integrase family protein  25.37 
 
 		 383 aa  72  0.00000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000168789  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2205  DNA integration/recombination/invertion protein  23.65 
 
 		 369 aa  71.2  0.00000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00883749  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1336  integrase family protein  26.29 
 
 		 391 aa  70.9  0.00000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0800  Phage integrase  23.64 
 
 		 369 aa  70.5  0.00000000005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.64955  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2523  Bbp50  63.83 
 
 		 69 aa  70.5  0.00000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02901  hypothetical protein  31.67 
 
 		 354 aa  70.5  0.00000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.338381 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0938  Phage integrase  26 
 
 		 393 aa  70.1  0.00000000006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.992929  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0747  integrase family protein  22.77 
 
 		 325 aa  70.1  0.00000000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.194299  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0959  Phage integrase  25 
 
 		 392 aa  69.3  0.0000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
 
NC_008148  Rxyl_2219  phage integrase  26.49 
 
 		 378 aa  68.6  0.0000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0419  integrase family protein  25.94 
 
 		 414 aa  68.6  0.0000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000230336  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1187  integrase family protein  22.75 
 
 		 370 aa  67.8  0.0000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.474728  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2252  phage integrase  27.63 
 
 		 305 aa  67.8  0.0000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.442177  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15950  site-specific recombinase XerD  26.74 
 
 		 373 aa  67  0.0000000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.182079  hitchhiker  0.000000384619 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2267  phage integrase  22.56 
 
 		 392 aa  66.6  0.0000000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000397895  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0145  integrase family protein  22.49 
 
 		 363 aa  66.6  0.0000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0766756 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6303  integrase family protein  25.08 
 
 		 416 aa  65.9  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.66477  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2734  DNA integration/recombination/invertion protein  22.26 
 
 		 369 aa  65.1  0.000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.117201  hitchhiker  0.0000120563 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4536  integrase family protein  25.98 
 
 		 409 aa  65.5  0.000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5395  integrase family protein  23.56 
 
 		 402 aa  64.7  0.000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2605  integrase family protein  25.79 
 
 		 376 aa  63.9  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0311051  normal  0.282598 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0966  integrase family protein  24.88 
 
 		 346 aa  63.2  0.000000008  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0644  integrase family protein  23.97 
 
 		 406 aa  62.8  0.000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14150  site-specific recombinase XerD  23.51 
 
 		 451 aa  62.8  0.000000009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1144  phage integrase  22.57 
 
 		 422 aa  62.4  0.00000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.132159  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0415  prophage LambdaBa04, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  23.37 
 
 		 374 aa  61.6  0.00000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.611975  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1190  integrase family protein  23.01 
 
 		 463 aa  61.6  0.00000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0427  prophage lambdaba04, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  23.37 
 
 		 374 aa  61.6  0.00000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1462  Phage integrase  29.46 
 
 		 387 aa  62  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1133  phage integrase  24.54 
 
 		 454 aa  61.6  0.00000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00289406  hitchhiker  0.000832848 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03202  phage integrase  27.69 
 
 		 292 aa  62  0.00000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00000402051  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0883  phage integrase family site specific recombinase  25.23 
 
 		 435 aa  61.2  0.00000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0113166  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5518  integrase family protein  24.07 
 
 		 477 aa  61.2  0.00000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0834932  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2455  phage integrase  23.51 
 
 		 370 aa  60.8  0.00000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2589  DNA integration/recombination/invertion protein  21.31 
 
 		 369 aa  60.8  0.00000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5323  integrase family protein  23.14 
 
 		 422 aa  61.2  0.00000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0388032 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>