56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS668_A2523 on replicon NC_009075
Organism: Burkholderia pseudomallei 668



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009075  BURPS668_A2523  Bbp50  100 
 
 
69 aa  147  5e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0623  Bbp50  90.2 
 
 
356 aa  101  3e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.951969  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2937  integrase, putative  53.73 
 
 
139 aa  71.2  0.000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.456202  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1611  integrase family protein  63.83 
 
 
375 aa  70.5  0.000000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.115349  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1301  integrase family protein  63.83 
 
 
396 aa  66.6  0.00000000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0179  hypothetical protein  41.51 
 
 
401 aa  50.4  0.000007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0194  hypothetical protein  41.51 
 
 
402 aa  50.4  0.000008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2064  integrase family protein  42 
 
 
398 aa  48.9  0.00002  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00115414  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1786  phage integrase family site specific recombinase  42 
 
 
426 aa  48.9  0.00002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.942474  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2052  integrase family protein  42 
 
 
431 aa  48.9  0.00002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.00969136  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2749  hypothetical protein  50 
 
 
73 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.737925  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2315  integrase family protein  44.9 
 
 
255 aa  48.5  0.00003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0961638  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2393  phage integrase family site specific recombinase  36.99 
 
 
412 aa  48.1  0.00003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.682709  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2835  hypothetical protein  58.62 
 
 
54 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0848169  normal  0.131444 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01332  hypothetical protein  44.9 
 
 
411 aa  47  0.00008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01322  integrase  44.9 
 
 
411 aa  47  0.00008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2298  integrase family protein  44.9 
 
 
411 aa  47  0.00008  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000253071  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0479  phage integrase  44.68 
 
 
357 aa  46.2  0.0001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.00687154  normal  0.27879 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0512  phage integrase family protein  39.39 
 
 
399 aa  45.4  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5418  phage integrase family protein  39.39 
 
 
399 aa  45.4  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.135045 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5398  phage integrase family protein  39.39 
 
 
399 aa  45.4  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.525123 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1995  integrase family protein  45.1 
 
 
359 aa  44.7  0.0004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014000  Ava_D0049  Phage integrase  43.18 
 
 
368 aa  44.7  0.0004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2121  Phage integrase  42.55 
 
 
433 aa  44.7  0.0004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0344  phage integrase  44 
 
 
293 aa  44.7  0.0005  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0123208  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1074  integrase  44.9 
 
 
446 aa  44.3  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000184312 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1107  integrase  44.9 
 
 
446 aa  44.3  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.781225 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1042  integrase  44.9 
 
 
430 aa  44.3  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000195373 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6841  integrase family protein  45.45 
 
 
492 aa  43.5  0.0009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1996  bacteriophage integrase family protein  39.58 
 
 
190 aa  43.5  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0601499  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1324  Phage integrase  42.55 
 
 
411 aa  43.1  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000225151  hitchhiker  0.00877617 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0897  hypothetical protein  40 
 
 
89 aa  43.5  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03202  phage integrase  42.86 
 
 
292 aa  42.7  0.001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00000402051  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1181  integrase family protein  41.94 
 
 
417 aa  43.5  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.588038 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2022  phage integrase family protein  42.55 
 
 
407 aa  43.1  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0581728  decreased coverage  0.0000000356379 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0371  phage integrase  42.55 
 
 
471 aa  42.7  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000000794278  normal  0.310006 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2325  phage integrase family protein  43.48 
 
 
403 aa  42.7  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.633234  hitchhiker  0.0000214757 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1426  phage integrase family protein  37.5 
 
 
401 aa  42.4  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0253  integrase family protein  40.43 
 
 
435 aa  42.4  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00000373788  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3251  Int protein  35.29 
 
 
428 aa  42.4  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.383765  hitchhiker  0.0000530695 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1143  integrase family protein  39.58 
 
 
412 aa  41.6  0.003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00000465357  unclonable  7.38755e-19 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0959  Phage integrase  40 
 
 
392 aa  41.6  0.003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
 
NC_011663  Sbal223_2134  integrase family protein  42.55 
 
 
407 aa  41.6  0.003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.565858  normal  0.985536 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2264  integrase family protein  36 
 
 
428 aa  41.2  0.004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.12232  hitchhiker  0.00139292 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0136  phage integrase  36.21 
 
 
435 aa  41.6  0.004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.500047 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0565  phage integrase family protein  38.78 
 
 
459 aa  40.8  0.005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5560  integrase family protein  36.92 
 
 
273 aa  41.2  0.005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2961  putative integrase  40 
 
 
66 aa  40.8  0.007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.435315  normal  0.790105 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0961  phage integrase  40.43 
 
 
414 aa  40.8  0.007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.531442  unclonable  0.0000381875 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2082  site-specific recombinase, phage integrase family protein  42.86 
 
 
260 aa  40.4  0.009  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2465  putative pore-forming cytotoxin integrase  34 
 
 
381 aa  40  0.009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.472408  normal  0.135007 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2897  phage integrase family protein  40.43 
 
 
386 aa  40.4  0.009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0505  hypothetical protein  36.17 
 
 
114 aa  40  0.009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0706  site-specific recombinase, phage integrase family protein  42.86 
 
 
297 aa  40  0.01  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0638  lipoprotein  42.86 
 
 
297 aa  40  0.01  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.713246  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8660  hypothetical protein  36.96 
 
 
454 aa  40  0.01  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>