More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccur_03670 on replicon NC_013170
Organism: Cryptobacterium curtum DSM 15641



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013170  Ccur_03670  transcriptional regulator  100 
 
 		 230 aa  477  1e-134  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00912022  hitchhiker  0.0085588 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2316  transcriptional regulator, TetR family  38.89 
 
 		 220 aa  140  9.999999999999999e-33  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.166278  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4628  transcriptional regulator, TetR family  32.18 
 
 		 206 aa  106  3e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000955982  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0337  transcriptional regulator, TetR family  30.62 
 
 		 204 aa  98.2  8e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1939  transcriptional regulator, TetR family  31.16 
 
 		 206 aa  96.7  3e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.640559  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0339  TetR family transcriptional regulator  31.88 
 
 		 205 aa  94.7  1e-18  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1953  TetR family transcriptional regulator  30.48 
 
 		 213 aa  90.5  2e-17  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.957288  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2311  transcriptional regulator, TetR family  31.63 
 
 		 235 aa  87.4  2e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4031  transcriptional regulator, TetR family  30.77 
 
 		 203 aa  83.2  0.000000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0312  transcriptional regulator, TetR family  29.47 
 
 		 203 aa  76.3  0.0000000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.041978  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00750  transcriptional regulator  28.43 
 
 		 197 aa  73.9  0.000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.935342  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24090  transcriptional regulator  30.77 
 
 		 209 aa  72.4  0.000000000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25680  transcriptional regulator  31.15 
 
 		 203 aa  71.2  0.00000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0312  transcriptional regulator, TetR family  27.27 
 
 		 206 aa  70.5  0.00000000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000380117  normal  0.28635 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3241  TetR family transcriptional regulator  33.56 
 
 		 221 aa  67.8  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1606  TetR family transcriptional regulator  23.56 
 
 		 225 aa  67.4  0.0000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.912424  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28270  transcriptional regulator  32.33 
 
 		 205 aa  66.6  0.0000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.188874 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2627  TetR family transcriptional regulator  24.63 
 
 		 202 aa  65.1  0.0000000009  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00000108473  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27950  transcriptional regulator  24.75 
 
 		 207 aa  65.1  0.0000000009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00827834  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23110  transcriptional regulator  21.89 
 
 		 203 aa  62.8  0.000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1489  transcriptional regulator, TetR family  31.21 
 
 		 212 aa  62  0.000000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4604  transcriptional regulator, TetR family  30.08 
 
 		 255 aa  59.3  0.00000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0820  TetR family transcriptional regulator  25.17 
 
 		 219 aa  58.9  0.00000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0110693  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2115  TetR family transcriptional regulator  40.45 
 
 		 213 aa  58.2  0.0000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00202765  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2881  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  53.45 
 
 		 218 aa  57.4  0.0000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.531949 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3206  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  53.45 
 
 		 218 aa  57.4  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3066  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  53.45 
 
 		 218 aa  57.4  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.283852  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0068  transcriptional regulator, TetR family  45.07 
 
 		 185 aa  56.6  0.0000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.139926 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6560  transcriptional regulator, TetR family  46.43 
 
 		 203 aa  55.8  0.0000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1358  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 202 aa  55.1  0.0000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0170  TetR family transcriptional regulator  41.43 
 
 		 192 aa  55.1  0.0000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.652591  normal  0.659974 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1867  transcriptional regulator, TetR family  46.43 
 
 		 201 aa  55.1  0.0000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.129849  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2871  TetR family transcriptional regulator  46.88 
 
 		 213 aa  55.1  0.0000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2005  hypothetical protein  29.57 
 
 		 184 aa  54.7  0.000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0591138  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1613  TetR family transcriptional regulator  49.21 
 
 		 189 aa  54.7  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.066311 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03730  transcriptional regulator, TetR family  42.55 
 
 		 215 aa  53.5  0.000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3645  transcriptional regulator, TetR family  50.98 
 
 		 199 aa  53.9  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.529358  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0541  TetR family transcriptional regulator  34.11 
 
 		 220 aa  54.3  0.000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1098  TetR family transcriptional regulator  41.86 
 
 		 209 aa  53.9  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0976848 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8200  putative transcriptional regulator, TetR family  50.98 
 
 		 237 aa  53.1  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.53611  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30260  transcriptional regulator  37.68 
 
 		 400 aa  53.1  0.000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.473296 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1079  TetR family transcriptional regulator  31.11 
 
 		 215 aa  52.8  0.000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06720  transcriptional regulator, TetR family  41.18 
 
 		 221 aa  53.1  0.000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1071  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  48.28 
 
 		 213 aa  52.4  0.000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0117133  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3096  TetR family transcriptional regulator  47.37 
 
 		 202 aa  52.4  0.000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0203472  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2669  transcriptional regulator, TetR family  46.38 
 
 		 226 aa  52.4  0.000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00411812  normal  0.199475 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1473  TetR family transcriptional regulator  43.1 
 
 		 195 aa  52.4  0.000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4115  transcriptional regulator, TetR family  29.92 
 
 		 194 aa  52  0.000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.1417 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3838  transcriptional regulator TetR family  48.28 
 
 		 230 aa  51.2  0.00001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.606304  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0919  TetR family transcriptional regulator  40.26 
 
 		 215 aa  51.2  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.563199 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3004  transcriptional regulator, TetR family  33.91 
 
 		 186 aa  51.2  0.00001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.519568  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4876  transcriptional regulator, TetR family  31.5 
 
 		 209 aa  51.2  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.217727  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4588  transcriptional regulator, TetR family  38.57 
 
 		 206 aa  51.6  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.112472 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0103  TetR family transcriptional regulator  40.98 
 
 		 190 aa  51.6  0.00001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4630  TetR family transcriptional regulator  48.28 
 
 		 206 aa  51.6  0.00001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.110827  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2109  TetR family transcriptional regulator  41.38 
 
 		 206 aa  51.2  0.00001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.901149 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1128  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  50 
 
 		 227 aa  51.6  0.00001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000181094 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0191  TetR family transcriptional regulator  42.37 
 
 		 210 aa  51.2  0.00001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1944  TetR family transcriptional regulator  38.95 
 
 		 234 aa  51.2  0.00001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.358022  decreased coverage  0.0015067 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3240  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  48.28 
 
 		 213 aa  50.4  0.00002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.501766  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1601  TetR family transcriptional regulator  23.15 
 
 		 215 aa  50.8  0.00002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05020  transcriptional regulator, TetR family  41.67 
 
 		 194 aa  50.8  0.00002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0817  TetR family transcriptional regulator  45.28 
 
 		 332 aa  50.8  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2798  TetR family transcriptional regulator  32.38 
 
 		 251 aa  50.8  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.358212  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3443  TetR family transcriptional regulator  38.64 
 
 		 212 aa  50.8  0.00002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.61751 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0184  TetR family transcriptional regulator  23.36 
 
 		 335 aa  50.8  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000505732  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0130  TetR family transcriptional regulator  30.99 
 
 		 212 aa  50.4  0.00002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0687  TetR family transcriptional regulator  53.45 
 
 		 261 aa  50.1  0.00003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.794796  normal  0.223624 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1204  transcriptional regulator, TetR family  40.91 
 
 		 206 aa  50.1  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.260768  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4306  TetR family transcriptional regulator  43.1 
 
 		 202 aa  50.1  0.00003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.651969  normal  0.688785 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6562  TetR family transcriptional regulator  39.33 
 
 		 210 aa  50.4  0.00003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.67895  normal  0.0476005 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1320  TetR family transcriptional regulator  46.67 
 
 		 199 aa  50.1  0.00003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2495  transcriptional regulator, TetR family  39.53 
 
 		 287 aa  50.4  0.00003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0937177  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0737  transcriptional regulator, TetR family  53.06 
 
 		 209 aa  50.1  0.00003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4225  TetR family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 244 aa  49.7  0.00004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.127157  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1196  TetR family transcriptional regulator  55.32 
 
 		 235 aa  49.3  0.00004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0270816  normal  0.528782 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2034  TetR family transcriptional regulator  48.08 
 
 		 228 aa  49.7  0.00004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.743283  decreased coverage  0.000716409 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5954  transcriptional regulator TetR family  36.9 
 
 		 219 aa  49.7  0.00004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0450  TetR family transcriptional regulator  38.6 
 
 		 201 aa  49.3  0.00005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0440  TetR family transcriptional regulator  33.6 
 
 		 207 aa  49.3  0.00005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2177  transcriptional regulator, TetR family  31.2 
 
 		 210 aa  49.3  0.00005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.480454  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0381  TetR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 212 aa  49.3  0.00005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.336534  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2402  transcriptional regulator, TetR family  31.71 
 
 		 259 aa  49.3  0.00005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0404395  hitchhiker  0.00830545 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0104  TetR family transcriptional regulator  38.98 
 
 		 190 aa  49.3  0.00005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1181  TetR family transcriptional regulator  47.17 
 
 		 199 aa  48.9  0.00006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5419  TetR family transcriptional regulator  44.64 
 
 		 211 aa  48.9  0.00006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.752491  normal  0.799332 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1458  TetR family transcriptional regulator  35.92 
 
 		 209 aa  48.9  0.00006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.121951 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4466  transcriptional regulator, TetR family  41.38 
 
 		 204 aa  48.9  0.00006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.575375  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2856  TetR family transcriptional regulator  41.82 
 
 		 194 aa  48.9  0.00006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.661308  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1709  transcriptional regulator, TetR family  44.64 
 
 		 203 aa  48.9  0.00006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.922562  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2815  TetR family transcriptional regulator  26.4 
 
 		 242 aa  49.3  0.00006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.106176  normal  0.623336 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6768  transcriptional regulator, TetR family  39.33 
 
 		 221 aa  48.9  0.00006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.357314  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4666  TetR family transcriptional regulator  51.72 
 
 		 214 aa  49.3  0.00006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.441468  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0392  transcriptional regulator, TetR family  53.49 
 
 		 201 aa  48.9  0.00007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.022112  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3703  DNA-binding transcriptional regulator EnvR  39.66 
 
 		 215 aa  48.9  0.00007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.83778 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0589  TetR family transcriptional regulator  40.85 
 
 		 191 aa  48.9  0.00007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5720  TetR family transcriptional regulator  34.55 
 
 		 291 aa  48.9  0.00007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.649137  normal  0.760569 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10920  transcriptional regulator  46.3 
 
 		 201 aa  48.9  0.00007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0917166  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1632  transcriptional regulator, TetR family  47.06 
 
 		 239 aa  48.9  0.00007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2000  TetR family transcriptional regulator  51.72 
 
 		 234 aa  48.5  0.00008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.920156  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>