More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_4427 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_4427  translocation protein TolB  100 
 
 		 441 aa  892    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.500534 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2122  beta-propeller repeat-containing to-pal system protein TolB  58.11 
 
 		 446 aa  524  1e-147  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.256883  normal  0.227077 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2627  translocation protein TolB  57.66 
 
 		 436 aa  501  1e-141  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1218  translocation protein TolB  56.21 
 
 		 443 aa  499  1e-140  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.27228  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1697  translocation protein TolB  55.08 
 
 		 443 aa  492  9.999999999999999e-139  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4751  translocation protein TolB  56.64 
 
 		 450 aa  492  9.999999999999999e-139  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1639  translocation protein TolB  55.3 
 
 		 443 aa  492  9.999999999999999e-139  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1094  translocation protein TolB  55.84 
 
 		 443 aa  491  1e-137  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2717  translocation protein TolB  54.82 
 
 		 450 aa  487  1e-136  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.599754  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3512  translocation protein TolB  54.69 
 
 		 450 aa  481  1e-135  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3495  translocation protein TolB  56.07 
 
 		 435 aa  479  1e-134  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.594815  normal  0.174219 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1812  translocation protein TolB  56.14 
 
 		 449 aa  477  1e-133  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.431319  normal  0.360787 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3621  translocation protein TolB  56.24 
 
 		 435 aa  474  1e-133  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.578468  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1311  translocation protein TolB  56.63 
 
 		 444 aa  477  1e-133  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4147  translocation protein TolB  56.14 
 
 		 449 aa  474  1e-132  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6881  translocation protein TolB  55.42 
 
 		 462 aa  473  1e-132  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0464057 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3200  translocation protein TolB  55.61 
 
 		 435 aa  474  1e-132  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3171  translocation protein TolB  54.1 
 
 		 439 aa  470  1.0000000000000001e-131  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0216692  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3056  beta-propeller repeat-containing to-pal system protein TolB  56.23 
 
 		 450 aa  462  1e-129  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0557578  normal  0.412166 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0144  translocation protein TolB  53.18 
 
 		 442 aa  442  1e-123  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1111  translocation protein TolB  53.08 
 
 		 446 aa  440  9.999999999999999e-123  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  decreased coverage  0.00131159  normal  0.386204 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0669  translocation protein TolB  53.62 
 
 		 444 aa  426  1e-118  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.303969  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2322  translocation protein TolB  53.62 
 
 		 444 aa  426  1e-118  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0205331  normal  0.53419 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0975  translocation protein TolB  51.74 
 
 		 445 aa  426  1e-118  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0670772  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0562  translocation protein TolB  53.38 
 
 		 444 aa  426  1e-118  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.271593  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2416  TolB domain-containing protein  48.65 
 
 		 453 aa  426  1e-118  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0270  beta-propeller repeat-containing to-pal system protein TolB  47.99 
 
 		 448 aa  424  1e-117  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.989147  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2365  translocation protein TolB  49.66 
 
 		 441 aa  419  1e-116  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3387  beta-propeller repeat-containing to-pal system protein TolB  49.2 
 
 		 442 aa  402  1e-111  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.413738  normal  0.777637 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4436  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  49.64 
 
 		 442 aa  398  9.999999999999999e-111  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.314306  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5302  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  47.81 
 
 		 446 aa  386  1e-106  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.842711 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2133  translocation protein TolB  47.84 
 
 		 439 aa  379  1e-104  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0686  translocation protein TolB  48.07 
 
 		 461 aa  379  1e-104  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.223253  normal  0.228867 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5227  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  47.82 
 
 		 446 aa  377  1e-103  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.175544  normal  0.115662 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4760  beta-propeller repeat-containing to-pal system protein TolB  47.82 
 
 		 446 aa  377  1e-103  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.577654  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1211  translocation protein TolB  49.14 
 
 		 462 aa  373  1e-102  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.896355  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0744  beta-propeller repeat-containing to-pal system protein TolB  45.9 
 
 		 445 aa  363  3e-99  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.950557  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2899  TolB domain-containing protein  44.32 
 
 		 469 aa  357  1.9999999999999998e-97  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000201302  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0328  translocation protein TolB  47 
 
 		 454 aa  351  2e-95  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0393  translocation protein TolB  45.65 
 
 		 451 aa  339  7e-92  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1017  translocation protein TolB  39.96 
 
 		 461 aa  318  1e-85  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.609487  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0467  TolB domain-containing protein  41.84 
 
 		 450 aa  312  9e-84  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.84052  normal  0.495381 
 
 
-
 
NC_002978  WD0038  translocation protein TolB  37.79 
 
 		 420 aa  300  4e-80  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0823662  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2194  translocation protein TolB  34.22 
 
 		 432 aa  252  1e-65  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.246481  normal  0.294233 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0145  translocation protein TolB  33.65 
 
 		 434 aa  250  3e-65  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2339  TolB-like protein  34.05 
 
 		 415 aa  251  3e-65  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.000000041462  normal  0.0677463 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2050  translocation protein TolB  33.72 
 
 		 429 aa  247  3e-64  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1984  translocation protein TolB  33.88 
 
 		 426 aa  245  9.999999999999999e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.517365  normal  0.378967 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2229  translocation protein TolB  33.25 
 
 		 435 aa  243  3.9999999999999997e-63  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1229  translocation protein TolB  35.75 
 
 		 424 aa  243  7e-63  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.910184  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3119  translocation protein TolB  35.27 
 
 		 439 aa  242  7.999999999999999e-63  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1723  translocation protein TolB  33.89 
 
 		 443 aa  242  1e-62  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0502645 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0242  translocation protein TolB  34.73 
 
 		 428 aa  242  1e-62  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2529  translocation protein TolB  32.94 
 
 		 445 aa  241  2e-62  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000000000320948  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0898  TolB-like  32.14 
 
 		 432 aa  241  2.9999999999999997e-62  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000336659  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3394  translocation protein TolB  34.44 
 
 		 441 aa  239  9e-62  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0076717 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2939  translocation protein TolB  33.87 
 
 		 451 aa  237  4e-61  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00432408  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0949  translocation protein TolB  32.79 
 
 		 474 aa  235  1.0000000000000001e-60  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.400419  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01564  translocation protein TolB  33.87 
 
 		 439 aa  234  2.0000000000000002e-60  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.188797  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1981  translocation protein TolB  33.66 
 
 		 440 aa  234  3e-60  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3323  WD40 domain-containing protein  32.03 
 
 		 435 aa  233  3e-60  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000401957  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1346  translocation protein TolB  33.42 
 
 		 421 aa  234  3e-60  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3972  tolB protein  33.57 
 
 		 433 aa  233  4.0000000000000004e-60  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0956227  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0067  tol-pal system beta propeller repeat protein TolB  34.19 
 
 		 422 aa  233  7.000000000000001e-60  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.518188  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0068  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  34.19 
 
 		 422 aa  233  7.000000000000001e-60  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1068  translocation protein TolB  32.79 
 
 		 439 aa  233  7.000000000000001e-60  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.360403  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1415  translocation protein TolB  33.33 
 
 		 433 aa  232  1e-59  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00100672  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0203  WD40 domain-containing protein  34.68 
 
 		 427 aa  230  4e-59  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000381605  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3406  translocation protein TolB  32.41 
 
 		 438 aa  229  5e-59  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.569267 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2092  translocation protein TolB  32.28 
 
 		 425 aa  229  8e-59  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.626129  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4402  translocation protein TolB  34.71 
 
 		 414 aa  229  9e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.145947  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2206  translocation protein TolB  31.38 
 
 		 427 aa  228  2e-58  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00281817 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02684  translocation protein TolB  31.65 
 
 		 451 aa  226  7e-58  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0273488  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1011  translocation protein TolB  31.22 
 
 		 421 aa  224  2e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0735  translocation protein TolB  34.35 
 
 		 432 aa  224  3e-57  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.9087  normal  0.380909 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0275  translocation protein TolB  31.76 
 
 		 436 aa  224  3e-57  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00839364  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0728  translocation protein TolB  33.17 
 
 		 434 aa  224  4e-57  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00650912  normal  0.160751 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51720  translocation protein TolB  33.74 
 
 		 432 aa  223  4e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000109745  hitchhiker  0.0000339249 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4536  translocation protein TolB  33.74 
 
 		 432 aa  223  6e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2692  translocation protein TolB  32.2 
 
 		 408 aa  223  6e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.319845  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1853  translocation protein TolB  31.18 
 
 		 428 aa  221  1.9999999999999999e-56  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0566  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  32.88 
 
 		 428 aa  220  3.9999999999999997e-56  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.22163  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0755  TolB domain-containing protein  29.7 
 
 		 457 aa  220  3.9999999999999997e-56  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.242927  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1222  translocation protein TolB  31.47 
 
 		 433 aa  220  5e-56  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4196  translocation protein TolB  31.53 
 
 		 423 aa  219  7e-56  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2714  translocation protein TolB  34.42 
 
 		 441 aa  219  7.999999999999999e-56  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0459045  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1251  translocation protein TolB  31.53 
 
 		 423 aa  219  1e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0936092  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1944  translocation protein TolB  31.23 
 
 		 427 aa  218  2e-55  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.526613 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1898  translocation protein TolB  30.6 
 
 		 450 aa  218  2e-55  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2675  translocation protein TolB  33.82 
 
 		 446 aa  218  2e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.202485  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2019  TolB  34.13 
 
 		 440 aa  216  7e-55  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.636869  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0175  TolB protein  34.13 
 
 		 437 aa  216  9e-55  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.313268  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36640  translocation protein TolB  33.33 
 
 		 430 aa  215  9.999999999999999e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.239695  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4053  translocation protein TolB  32.68 
 
 		 437 aa  215  1.9999999999999998e-54  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1699  translocation protein TolB  31.24 
 
 		 442 aa  214  1.9999999999999998e-54  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.182328  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0684  translocation protein TolB  33.65 
 
 		 434 aa  213  3.9999999999999995e-54  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.672983  normal  0.603997 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1394  translocation protein TolB  31.47 
 
 		 442 aa  213  3.9999999999999995e-54  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000203609  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1462  translocation protein TolB  33.41 
 
 		 442 aa  213  3.9999999999999995e-54  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000134108  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0025  tolB protein  31.64 
 
 		 432 aa  213  7.999999999999999e-54  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0382531  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3993  translocation protein TolB  30.59 
 
 		 423 aa  212  9e-54  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.213865  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>