More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_8305 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_8305  putative PAS/PAC sensor protein  100 
 
 
528 aa  1039    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.817018 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4163  putative PAS/PAC sensor protein  38.35 
 
 
1039 aa  200  6e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0226672 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1739  PAS/protein phosphatase 2C-like  33.77 
 
 
817 aa  197  3e-49  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1241  putative PAS/PAC sensor protein  38.36 
 
 
1432 aa  197  3e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00402812 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3501  putative PAS/PAC sensor protein  38.39 
 
 
1225 aa  192  1e-47  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.480314  normal  0.404449 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0743  putative PAS/PAC sensor protein  36.54 
 
 
855 aa  188  2e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.565533 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5311  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  34.49 
 
 
952 aa  187  3e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7300  Serine phosphatase RsbU regulator of sigma subunit-like protein  36.25 
 
 
573 aa  184  2.0000000000000003e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3110  putative PAS/PAC sensor protein  35.14 
 
 
697 aa  184  3e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.63551  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4098  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  36.32 
 
 
1045 aa  181  2.9999999999999997e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.108116 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1752  protein phosphatase 2C-like  35.37 
 
 
591 aa  177  5e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0524  putative PAS/PAC sensor protein  32.41 
 
 
744 aa  176  7e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00695402 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1989  putative PAS/PAC sensor protein  36.57 
 
 
722 aa  173  7.999999999999999e-42  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.965966  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0838  putative PAS/PAC sensor protein  32.05 
 
 
754 aa  169  8e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6003  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  34.86 
 
 
616 aa  168  2.9999999999999998e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.697266  normal  0.4865 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1009  Serine phosphatase RsbU regulator of sigma subunit-like protein  35.7 
 
 
743 aa  167  2.9999999999999998e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6225  putative PAS/PAC sensor protein  35.66 
 
 
713 aa  163  9e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0250  PAS containing protein phosphatase 2C-like  32.19 
 
 
753 aa  162  1e-38  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.337993  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4166  putative PAS/PAC sensor protein  32.91 
 
 
765 aa  162  1e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.299427  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7237  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  36.41 
 
 
579 aa  154  4e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4080  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  33.92 
 
 
738 aa  147  5e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.32388  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2597  putative PAS/PAC sensor protein  41.75 
 
 
594 aa  135  1.9999999999999998e-30  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.158438 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3764  putative PAS/PAC sensor protein  41.75 
 
 
643 aa  135  1.9999999999999998e-30  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.124369  normal  0.415801 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1003  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  34.09 
 
 
549 aa  127  5e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00204881 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0109  putative PAS/PAC sensor protein  32.84 
 
 
776 aa  122  1.9999999999999998e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.310164  normal  0.141702 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3638  protein serine/threonine phosphatase  33.42 
 
 
693 aa  121  3.9999999999999996e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.718947  normal  0.379759 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3140  protein serine/threonine phosphatase  32.84 
 
 
745 aa  120  7.999999999999999e-26  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.444013  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2966  protein serine/threonine phosphatase  32.34 
 
 
716 aa  118  3e-25  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.451872  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1151  serine phosphatase  41.67 
 
 
713 aa  117  3.9999999999999997e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4164  putative PAS/PAC sensor protein  38.81 
 
 
688 aa  117  5e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.412767  normal  0.407902 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2140  PAS/protein phosphatase 2C-like  35.92 
 
 
688 aa  115  2.0000000000000002e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.731032  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3797  putative GAF sensor protein  33.81 
 
 
828 aa  113  7.000000000000001e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.818563 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7089  Serine phosphatase RsbU regulator of sigma subunit-like protein  36.55 
 
 
697 aa  112  1.0000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0288523  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35220  PAS domain S-box  28.01 
 
 
771 aa  110  5e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3954  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.78 
 
 
1370 aa  110  7.000000000000001e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.364846  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4521  putative GAF sensor protein  31.87 
 
 
851 aa  108  2e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4122  Stage II sporulation E family protein  30.41 
 
 
805 aa  107  4e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.530219  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1606  putative PAS/PAC sensor protein  36.11 
 
 
693 aa  106  1e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.132491  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3736  putative PAS/PAC sensor protein  32.51 
 
 
1017 aa  104  3e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34940  fused histidine kinase with GAF domain/SpoIIE-like protein  31.28 
 
 
537 aa  105  3e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.24735  normal  0.897834 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2399  putative PAS/PAC sensor protein  36.01 
 
 
700 aa  104  3e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.249407  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4423  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.84 
 
 
1361 aa  105  3e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.498632 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1931  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.95 
 
 
1385 aa  103  6e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1895  putative PAS/PAC sensor protein  36.11 
 
 
574 aa  103  7e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.757129 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0350  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.59 
 
 
1390 aa  103  1e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0937102  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0360  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.59 
 
 
1390 aa  103  1e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.592677 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0339  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.59 
 
 
1390 aa  102  1e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.726297  normal  0.77171 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0116  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 
1711 aa  102  2e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.257821  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0401  putative PAS/PAC sensor protein  40.08 
 
 
544 aa  100  6e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00113041  normal  0.0129071 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5315  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  39.73 
 
 
750 aa  100  6e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.315721 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3313  putative PAS/PAC sensor protein  36.61 
 
 
692 aa  100  6e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31980  serine phosphatase RsbU, regulator of sigma subunit  33.57 
 
 
453 aa  99.8  1e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0585203  normal  0.149129 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6792  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  38.1 
 
 
585 aa  98.6  2e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2418  protein serine/threonine phosphatase  30.06 
 
 
746 aa  97.4  5e-19  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.724517 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11395  hypothetical protein  30.28 
 
 
653 aa  95.9  2e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3606  protein serine/threonine phosphatase  33.22 
 
 
395 aa  95.9  2e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1588  putative PAS/PAC sensor protein  32.49 
 
 
607 aa  94.7  3e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.127314 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4776  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.45 
 
 
1248 aa  93.6  7e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4019  putative PAS/PAC sensor protein  33.78 
 
 
614 aa  93.6  9e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2453  serine phosphatase  27.08 
 
 
438 aa  93.6  9e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13140  bacteriophytochrome (light-regulated signal transduction histidine kinase)  37.74 
 
 
772 aa  91.3  4e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5165  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  30.39 
 
 
583 aa  90.9  5e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.115407  normal  0.0326575 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4347  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  37.77 
 
 
576 aa  90.9  6e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0230944  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5033  putative PAS/PAC sensor protein  34.57 
 
 
760 aa  89.7  1e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0643  stage II sporulation E family protein  35.62 
 
 
708 aa  89.4  1e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.948489 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1552  PAS:protein phosphatase 2C-like:GAF  36.19 
 
 
618 aa  88.6  2e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3089  putative PAS/PAC sensor protein  31.36 
 
 
676 aa  89  2e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2114  anti-sigma-factor antagonist  36.25 
 
 
618 aa  88.6  3e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.39314  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3709  putative PAS/PAC sensor protein  37.34 
 
 
570 aa  87.4  6e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.551598 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2083  PAS/protein phosphatase 2C-like  32.62 
 
 
672 aa  86.7  9e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2239  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  37.44 
 
 
553 aa  86.7  0.000000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4200  Serine phosphatase RsbU regulator of sigma subunit-like protein  39.76 
 
 
702 aa  86.7  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00190608  normal  0.0466919 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7544  Signal transduction histidine kinase-like protein  31.37 
 
 
1051 aa  86.7  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0617  putative PAS/PAC sensor protein  32.73 
 
 
580 aa  86.7  0.000000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3855  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  34.98 
 
 
560 aa  86.3  0.000000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.574477  normal  0.471316 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1632  putative PAS/PAC sensor protein  34.31 
 
 
583 aa  85.9  0.000000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.30723 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11810  PAS domain S-box  33.77 
 
 
502 aa  85.5  0.000000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.85834  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4988  putative PAS/PAC sensor protein  35.05 
 
 
866 aa  85.1  0.000000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.952168  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2087  putative PAS/PAC sensor protein  29.39 
 
 
666 aa  85.1  0.000000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000976195  normal  0.0252685 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4478  putative PAS/PAC sensor protein  32.03 
 
 
652 aa  84  0.000000000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0359873 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13090  Stage II sporulation protein E (SpoIIE)  30.83 
 
 
576 aa  83.6  0.000000000000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1622  putative PAS/PAC sensor protein  27.81 
 
 
775 aa  83.6  0.000000000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0914545  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4118  ANTAR domain protein with unknown sensor  31.73 
 
 
847 aa  83.2  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2814  putative PAS/PAC sensor protein  35.89 
 
 
709 aa  82  0.00000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0793374  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0750  putative PAS/PAC sensor protein  36.56 
 
 
546 aa  82.4  0.00000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.754604  normal  0.0245877 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3739  response regulator receiver modulated serine phosphatase  30.92 
 
 
523 aa  82.8  0.00000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.433453  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4519  putative GAF sensor protein  33.33 
 
 
755 aa  82.4  0.00000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1271  PAS:protein phosphatase 2C-like:GAF  34.47 
 
 
585 aa  81.6  0.00000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0325345  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4640  putative PAS/PAC sensor protein  33.54 
 
 
427 aa  81.6  0.00000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.74459  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1628  response regulator receiver protein  29.82 
 
 
380 aa  81.3  0.00000000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.311262  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3533  putative PAS/PAC sensor protein  30.7 
 
 
410 aa  81.3  0.00000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0699  protein serine/threonine phosphatase  28.95 
 
 
379 aa  80.9  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0106  PAS protein phosphatase 2C-like  35.78 
 
 
670 aa  79.3  0.0000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2468  stage II sporulation E family protein  34.84 
 
 
455 aa  79.7  0.0000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1571  putative PAS/PAC sensor protein  35.06 
 
 
562 aa  79.3  0.0000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2019  protein serine/threonine phosphatase  34.16 
 
 
308 aa  79  0.0000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1338  serine phosphatase  30.8 
 
 
465 aa  79  0.0000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0060  serine phosphatase  30.84 
 
 
706 aa  79  0.0000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0461367 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3071  protein serine/threonine phosphatase  34.48 
 
 
260 aa  79  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.136695 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0347  putative PAS/PAC sensor protein  36.32 
 
 
723 aa  79.3  0.0000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>