More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmur_2301 on replicon NC_014150
Organism: Brachyspira murdochii DSM 12563



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014150  Bmur_2301  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 197 aa  388  1e-107  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1856  TetR family transcriptional regulator  44.86 
 
 		 185 aa  161  6e-39  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1074  transcriptional regulator, TetR family  37.91 
 
 		 184 aa  108  7.000000000000001e-23  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0127  transcriptional regulator, TetR family  36.67 
 
 		 193 aa  59.7  0.00000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2800  TetR family transcriptional regulator  24.16 
 
 		 201 aa  58.2  0.00000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0949  transcriptional regulator, TetR family  42.62 
 
 		 286 aa  58.2  0.00000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2502  transcriptional regulator, TetR family  43.4 
 
 		 291 aa  56.2  0.0000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0072  TetR family transcriptional regulator  36.23 
 
 		 172 aa  55.8  0.0000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2869  transcriptional regulator, TetR family  20 
 
 		 192 aa  55.5  0.0000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1053  TetR family transcriptional regulator  26.55 
 
 		 200 aa  53.5  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.853566  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8200  putative transcriptional regulator, TetR family  41.18 
 
 		 237 aa  53.1  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.53611  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0880  transcriptional regulator, TetR family  34.94 
 
 		 212 aa  53.5  0.000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.987052  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28060  transcriptional regulator  26.8 
 
 		 204 aa  53.5  0.000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.633688  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0094  TetR family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 172 aa  53.1  0.000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2871  TetR family transcriptional regulator  35.06 
 
 		 213 aa  52.8  0.000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0144  TetR family transcriptional regulator  27.48 
 
 		 181 aa  52.8  0.000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2082  transcriptional regulator, TetR family  24.29 
 
 		 225 aa  53.1  0.000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2136  transcriptional regulator, TetR family  39.22 
 
 		 212 aa  52.4  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.547172  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1100  TetR family transcriptional regulator  32.95 
 
 		 196 aa  52.4  0.000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1394  TetR family transcriptional regulator  27.5 
 
 		 185 aa  52  0.000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.546688  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3645  transcriptional regulator, TetR family  41.18 
 
 		 199 aa  52  0.000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.529358  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4148  TetR family transcriptional regulator  47.83 
 
 		 213 aa  52  0.000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.677229  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4300  transcriptional regulator  45.1 
 
 		 225 aa  52  0.000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0467  TetR family transcriptional regulator  34.41 
 
 		 198 aa  51.6  0.000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0392  transcriptional regulator, TetR family  43.75 
 
 		 201 aa  50.8  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.022112  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04680  transcriptional regulator  38.81 
 
 		 225 aa  50.8  0.00001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1426  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 204 aa  50.8  0.00001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0803354  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2215  TetR family transcriptional regulator  48.08 
 
 		 215 aa  50.8  0.00001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1901  transcriptional regulator, TetR family  30.61 
 
 		 245 aa  51.2  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0306246  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1142  transcriptional regulator, TetR family  24.76 
 
 		 260 aa  50.1  0.00002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2548  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 236 aa  50.1  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000000944763  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05020  transcriptional regulator, TetR family  42.86 
 
 		 194 aa  50.1  0.00002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1025  transcriptional regulator, TetR family  32.53 
 
 		 192 aa  50.4  0.00002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3212  TetR family transcriptional regulator  34.92 
 
 		 223 aa  50.4  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.59703  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2175  TetR family transcriptional regulator  26.52 
 
 		 218 aa  49.7  0.00003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6228  transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 		 194 aa  49.7  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.301912  normal  0.923303 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001979  transcriptional regulator TetR family  42.31 
 
 		 193 aa  49.3  0.00003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.507988  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04380  transcriptional regulator, TetR family  45.1 
 
 		 72 aa  49.7  0.00003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0359  TetR family transcriptional regulator  32.47 
 
 		 203 aa  49.3  0.00004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1798  TetR family transcriptional regulator  33.93 
 
 		 194 aa  49.3  0.00004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3038  transcriptional regulator, TetR family  28.89 
 
 		 209 aa  49.3  0.00004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.051717 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4307  TetR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 214 aa  48.9  0.00005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.188393  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3482  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 191 aa  48.9  0.00005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.342598  normal  0.760921 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3788  transcriptional regulator, TetR family  39.62 
 
 		 208 aa  48.9  0.00005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0414  TetR family transcriptional regulator  44.23 
 
 		 202 aa  48.9  0.00005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1601  TetR family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 194 aa  48.5  0.00006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.105676  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1725  TetR family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 194 aa  48.5  0.00006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1775  transcriptional regulator, TetR family  32.43 
 
 		 194 aa  48.5  0.00006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2625  regulatory protein, TetR  40.38 
 
 		 206 aa  48.5  0.00007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.232365  normal  0.311906 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2580  TetR family transcriptional regulator  28.87 
 
 		 211 aa  48.1  0.00007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.257801 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0881  regulatory protein TetR  43.75 
 
 		 219 aa  48.1  0.00008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1553  TetR family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 194 aa  48.1  0.00008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1473  transcriptional regulator, TetR family  43.14 
 
 		 207 aa  48.1  0.00008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.245471  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6871  TetR family transcriptional regulator  34.55 
 
 		 224 aa  48.1  0.00008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.405099  normal  0.0580493 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3547  regulatory protein, TetR  36.67 
 
 		 187 aa  47.8  0.00009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.473445  normal  0.21056 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0651  TetR family transcriptional regulator  37.7 
 
 		 218 aa  48.1  0.00009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0025795  normal  0.249536 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7736  putative transcriptional regulator, TetR family  31.75 
 
 		 205 aa  48.1  0.00009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.97147  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0770  TetR family transcriptional regulator  42.31 
 
 		 196 aa  47.8  0.0001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1949  hypothetical protein  34.78 
 
 		 186 aa  47.4  0.0001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0408  transcriptional regulator, TetR family  41.82 
 
 		 212 aa  47.8  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.431467 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0803  TetR family transcriptional regulator  42.31 
 
 		 196 aa  47.4  0.0001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1571  TetR family transcriptional regulator  33.75 
 
 		 201 aa  47.4  0.0001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.038411 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1056  TetR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 205 aa  47.4  0.0001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0248365  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1015  transcriptional regulator, TetR family  21.24 
 
 		 201 aa  47.8  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0184  TetR family transcriptional regulator  35.9 
 
 		 197 aa  47.8  0.0001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13607  TetR family transcriptional regulator  39.22 
 
 		 295 aa  47.4  0.0001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.20276 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00482  NADH dehydrogenase  43.48 
 
 		 194 aa  47.4  0.0001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22050  transcriptional regulator  35.09 
 
 		 199 aa  47.8  0.0001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0903673 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4343  regulatory protein TetR  33.33 
 
 		 196 aa  47.8  0.0001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.817011  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1090  transcriptional regulator, TetR family  33.9 
 
 		 204 aa  47.8  0.0001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.141216  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4326  TetR family transcriptional regulator  37.88 
 
 		 202 aa  46.6  0.0002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0061  TetR family transcriptional regulator  30.53 
 
 		 187 aa  47.4  0.0002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05345  transcriptional regulator, tetR family protein  34.48 
 
 		 190 aa  46.6  0.0002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  hitchhiker  0.00749651  n/a   
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6485  regulatory protein, TetR  36.36 
 
 		 278 aa  47  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.521213  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5711  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 245 aa  46.6  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1826  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 250 aa  47  0.0002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0995188  normal  0.24055 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2716  TetR family transcriptional regulator  32.31 
 
 		 212 aa  46.6  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.448471  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1483  TetR family transcriptional regulator  21.97 
 
 		 197 aa  47  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2055  putative transcriptional regulator, TetR family  32.86 
 
 		 229 aa  47  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0410393  normal  0.8778 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2085  transcriptional regulator, TetR family  36.36 
 
 		 210 aa  47  0.0002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4040  TetR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 191 aa  47  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1157  transcriptional regulator, TetR family  27.45 
 
 		 194 aa  47.4  0.0002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0870204  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2554  TetR family transcriptional regulator  34.72 
 
 		 198 aa  46.2  0.0003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000394239  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1775  transcriptional regulator, TetR family  38.46 
 
 		 255 aa  46.2  0.0003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1997  TetR family transcriptional regulator  37.29 
 
 		 250 aa  46.6  0.0003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.354177  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3965  transcriptional regulator, TetR family  35.71 
 
 		 208 aa  46.2  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0960  TetR family transcriptional regulator  33.9 
 
 		 206 aa  46.6  0.0003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.462033  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3984  transcriptional regulator, TetR family  41.18 
 
 		 216 aa  46.2  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.765993  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1242  TetR family transcriptional regulator  32.31 
 
 		 212 aa  46.2  0.0003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000053734  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0378  TetR family transcriptional regulator  32.81 
 
 		 202 aa  46.2  0.0003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6780  TetR family transcriptional regulator  30.85 
 
 		 196 aa  46.2  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.188016 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4713  TetR family transcriptional regulator  23.36 
 
 		 218 aa  46.2  0.0003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0377  transcriptional regulator, TetR family  44.68 
 
 		 224 aa  46.2  0.0003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.294343  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0373  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 188 aa  46.2  0.0003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4111  regulatory protein, TetR  29.58 
 
 		 211 aa  46.2  0.0003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.856223  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4799  TetR family transcriptional regulator  23.36 
 
 		 218 aa  46.2  0.0003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5370  TetR family transcriptional regulator  27.91 
 
 		 187 aa  46.6  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5098  TetR family transcriptional regulator  23.36 
 
 		 218 aa  46.2  0.0003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.11151 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1323  TetR family transcriptional regulator  28.41 
 
 		 207 aa  46.2  0.0003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0832  transcriptional regulator, TetR family  30.59 
 
 		 196 aa  45.8  0.0004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>