More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_B1065 on replicon NC_007511
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007511  Bcep18194_B1065  TPR repeat-containing protein  100 
 
 
740 aa  1464    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.761998  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1066  TPR repeat-containing protein  46.28 
 
 
747 aa  574  1.0000000000000001e-162  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1067  TPR repeat-containing protein  42.31 
 
 
747 aa  435  1e-120  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.905012 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0301  TPR repeat-containing protein  40.26 
 
 
1827 aa  430  1e-119  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2530  TPR repeat-containing protein  44.5 
 
 
608 aa  397  1e-109  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.187337  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7855  TPR domain-containing protein  40.71 
 
 
648 aa  392  1e-107  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.126864 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1825  TPR repeat-containing protein  40.79 
 
 
523 aa  390  1e-107  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.578572  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3120  TPR repeat-containing protein  36.81 
 
 
767 aa  372  1e-101  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3808  TPR repeat-containing protein  40.92 
 
 
578 aa  368  1e-100  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.556982 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1426  TPR repeat-containing protein  41.14 
 
 
574 aa  365  2e-99  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3016  TPR/sulfotransferase domain-containing protein  44.31 
 
 
577 aa  363  6e-99  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3028  TPR repeat-containing protein  35.65 
 
 
620 aa  356  1e-96  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.985806  normal  0.0142271 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3201  TPR repeat-containing protein  34.71 
 
 
955 aa  355  2e-96  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0757905 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0959  hypothetical protein  37.28 
 
 
620 aa  346  1e-93  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.868556 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0722  TPR repeat-containing protein  35.34 
 
 
615 aa  339  9.999999999999999e-92  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.434562 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2369  TPR repeat-containing protein  38.49 
 
 
639 aa  332  2e-89  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.319986  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4648  TPR repeat-containing protein  40.8 
 
 
520 aa  326  8.000000000000001e-88  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.649741  normal  0.91098 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2322  TPR repeat-containing protein  32.4 
 
 
935 aa  323  6e-87  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0205826 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0892  TPR repeat-containing protein  37.91 
 
 
636 aa  323  9.999999999999999e-87  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.647896  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1619  TPR domain-containing protein  37.77 
 
 
626 aa  319  1e-85  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0978258  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0904  TPR repeat-containing protein  37.76 
 
 
612 aa  318  2e-85  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.587904  normal  0.769196 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3015  TPR domain-containing protein  37.6 
 
 
626 aa  316  9.999999999999999e-85  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2906  TPR repeat-containing protein  37.6 
 
 
614 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0475913  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2599  TPR domain-containing protein  37.44 
 
 
614 aa  315  1.9999999999999998e-84  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0734298  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0177  TPR repeat-containing protein  37.44 
 
 
614 aa  315  1.9999999999999998e-84  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0970  TPR domain-containing protein  37.44 
 
 
614 aa  315  1.9999999999999998e-84  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0453  TPR domain-containing protein  37.44 
 
 
626 aa  314  3.9999999999999997e-84  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.311085  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0755  TPR repeat-containing protein  36.05 
 
 
662 aa  307  4.0000000000000004e-82  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.466717  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0911  TPR domain-containing protein  36.13 
 
 
714 aa  307  4.0000000000000004e-82  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.55611 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2967  TPR repeat-containing protein  37.5 
 
 
614 aa  306  8.000000000000001e-82  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4611  TPR domain-containing protein  37.48 
 
 
615 aa  306  1.0000000000000001e-81  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.100536 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0987  TPR repeat-containing protein  37.48 
 
 
611 aa  306  1.0000000000000001e-81  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.384547  normal  0.0740288 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4628  TPR repeat-containing protein  35.96 
 
 
714 aa  305  3.0000000000000004e-81  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.342126 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1028  TPR repeat-containing protein  37.32 
 
 
635 aa  304  3.0000000000000004e-81  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.608823  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0549  TPR repeat-containing protein  37.32 
 
 
635 aa  304  3.0000000000000004e-81  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0308  TPR repeat-containing protein  44.37 
 
 
636 aa  303  1e-80  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00465819 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4141  TPR repeat-containing protein  37.76 
 
 
637 aa  301  4e-80  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.780051  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3748  TPR repeat-containing protein  34.36 
 
 
1450 aa  298  4e-79  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3746  TPR repeat-containing protein  36.24 
 
 
602 aa  293  6e-78  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.824926  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2681  TPR domain protein  37.07 
 
 
653 aa  293  7e-78  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2307  TPR repeat-containing protein  37.07 
 
 
653 aa  293  7e-78  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2491  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.08 
 
 
689 aa  291  2e-77  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0190  TPR repeat-containing protein  36.3 
 
 
601 aa  291  4e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3832  TPR repeat-containing protein  35.07 
 
 
688 aa  289  2e-76  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00173771 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3831  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  37.66 
 
 
1034 aa  284  5.000000000000001e-75  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0133068 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  31.21 
 
 
3145 aa  284  5.000000000000001e-75  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3747  TPR repeat-containing protein  36.91 
 
 
1005 aa  281  2e-74  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7517  hypothetical protein  34.72 
 
 
703 aa  281  3e-74  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.328747  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3330  TPR repeat-containing protein  39.46 
 
 
1038 aa  281  4e-74  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1093  TPR repeat-containing protein  30.64 
 
 
681 aa  278  3e-73  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.353622  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0955  TPR repeat-containing protein  29.95 
 
 
637 aa  277  5e-73  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2985  sulfotransferase  30.75 
 
 
1077 aa  273  9e-72  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0495  TPR repeat-containing protein  34.26 
 
 
592 aa  271  2e-71  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.31548  hitchhiker  0.000811281 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3866  TPR repeat protein  34.18 
 
 
1677 aa  269  1e-70  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3354  TPR repeat-containing protein  41.22 
 
 
1212 aa  265  2e-69  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2412  TPR repeat-containing protein  39.83 
 
 
529 aa  260  8e-68  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0639  TPR repeat-containing protein  36.19 
 
 
542 aa  259  2e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1170  TPR repeat-containing protein  39.95 
 
 
472 aa  258  4e-67  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.126874  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0217  TPR repeat-containing protein  36.35 
 
 
646 aa  256  9e-67  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1547  TPR domain-containing protein  40 
 
 
473 aa  253  7e-66  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.661842  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1398  TPR repeat-containing protein  36.77 
 
 
484 aa  251  2e-65  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2875  TPR repeat-containing protein  35.3 
 
 
649 aa  251  4e-65  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0232  TPR repeat-containing protein  35.3 
 
 
649 aa  251  4e-65  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2537  TPR repeat-containing protein  39.51 
 
 
412 aa  248  3e-64  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.795786  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3833  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  39.32 
 
 
760 aa  244  3.9999999999999997e-63  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00358812 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1361  TPR repeat-containing protein  38.44 
 
 
1276 aa  241  4e-62  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0257  TPR repeat-containing protein  34.66 
 
 
457 aa  240  5.999999999999999e-62  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1219  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.79 
 
 
604 aa  238  4e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0339  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  35.39 
 
 
545 aa  237  5.0000000000000005e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3996  tetratricopeptide TPR_2  34.75 
 
 
1694 aa  237  5.0000000000000005e-61  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.271204  normal  0.601264 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3164  hypothetical protein  39.89 
 
 
387 aa  237  8e-61  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4384  hypothetical protein  36 
 
 
546 aa  236  1.0000000000000001e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2201  TPR repeat-containing protein  37.74 
 
 
556 aa  235  2.0000000000000002e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.805282  normal  0.800144 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0141  TPR repeat-containing protein  32.94 
 
 
438 aa  234  3e-60  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.00386004  normal  0.115434 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18211  hypothetical protein  27.16 
 
 
603 aa  234  3e-60  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.905605 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1512  TPR domain-containing protein  35.19 
 
 
550 aa  233  8.000000000000001e-60  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0206479  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0637  TPR repeat-containing protein  39.23 
 
 
4489 aa  233  8.000000000000001e-60  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1060  TPR repeat-containing protein  37.65 
 
 
558 aa  231  3e-59  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.325724  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0550  TPR repeat-containing protein  35.51 
 
 
595 aa  231  4e-59  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.492764  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6369  TPR repeat-containing protein  31.99 
 
 
607 aa  230  6e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3353  Exostosin family protein  38.36 
 
 
872 aa  229  1e-58  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0479946  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3361  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  36.53 
 
 
454 aa  227  6e-58  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0780323  normal  0.195256 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6068  TPR repeat-containing protein  35.71 
 
 
527 aa  225  2e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.115417 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1719  TPR repeat-containing protein  28.85 
 
 
583 aa  225  2e-57  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3075  TPR repeat-containing protein  31.44 
 
 
780 aa  224  4e-57  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3326  TPR repeat-containing protein  32.33 
 
 
607 aa  222  1.9999999999999999e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.644925 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3825  TPR repeat-containing protein  35.02 
 
 
559 aa  221  3e-56  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0641  TPR repeat-containing protein  41.57 
 
 
1094 aa  221  3e-56  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.230386  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0487  TPR repeat-containing protein  29.98 
 
 
566 aa  221  3.9999999999999997e-56  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.679539 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6628  TPR repeat-containing protein  36.32 
 
 
588 aa  221  5e-56  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00587879 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1712  TPR repeat-containing protein  30.08 
 
 
595 aa  218  2e-55  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.884408 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0599  TPR repeat-containing protein  38.17 
 
 
593 aa  218  2.9999999999999998e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2617  TPR repeat-containing protein  36.73 
 
 
545 aa  218  4e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0066  TPR repeat-containing protein  36.2 
 
 
545 aa  218  4e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.152932  normal 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4266  hypothetical protein  37.22 
 
 
389 aa  217  5e-55  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6027  TPR repeat-containing protein  38.09 
 
 
571 aa  217  5.9999999999999996e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0697264  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4231  TPR repeat-containing protein  36.67 
 
 
536 aa  216  9.999999999999999e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.308845 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2752  TPR repeat-containing protein  36.53 
 
 
545 aa  215  1.9999999999999998e-54  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6627  TPR repeat-containing protein  32.8 
 
 
611 aa  214  3.9999999999999995e-54  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0378674 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2058  TPR repeat-containing protein  33.02 
 
 
1454 aa  213  9e-54  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>