More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_0090 on replicon NC_010551
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006348  BMA2940  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  82.08 
 
 		 385 aa  667    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3371  putative amino acid uptake ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  82.08 
 
 		 473 aa  667    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0194  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  82.34 
 
 		 473 aa  670    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.63329  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3271  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  96.36 
 
 		 385 aa  767    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.262349 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3324  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  83.12 
 
 		 385 aa  674    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1603  putative amino acid uptake ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  82.08 
 
 		 385 aa  667    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3043  extracellular ligand-binding receptor  79.69 
 
 		 386 aa  648    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.865554  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4060  putative amino acid uptake ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  82.34 
 
 		 473 aa  670    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.377113  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3986  putative amino acid uptake ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  82.34 
 
 		 473 aa  669    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2966  extracellular ligand-binding receptor  97.14 
 
 		 385 aa  772    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.106673  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0080  extracellular ligand-binding receptor  98.96 
 
 		 385 aa  781    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.217295  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0106  extracellular ligand-binding receptor  97.14 
 
 		 385 aa  772    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.113472  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0089  extracellular ligand-binding receptor  97.14 
 
 		 385 aa  772    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.332723  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0089  extracellular ligand-binding receptor  95.84 
 
 		 385 aa  734    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0090  extracellular ligand-binding receptor  100 
 
 		 385 aa  789    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.230544 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2999  putative amino acid uptake ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  82.08 
 
 		 473 aa  667    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3909  Extracellular ligand-binding receptor  78.12 
 
 		 386 aa  632  1e-180  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0024  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  78.01 
 
 		 386 aa  624  1e-178  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.471864  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3910  Extracellular ligand-binding receptor  72.06 
 
 		 388 aa  577  1.0000000000000001e-163  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0868538  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0023  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  70.5 
 
 		 388 aa  571  1.0000000000000001e-162  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3364  extracellular ligand-binding receptor  72.78 
 
 		 383 aa  563  1.0000000000000001e-159  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3513  extracellular ligand-binding receptor  73.96 
 
 		 382 aa  563  1.0000000000000001e-159  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0776121 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3199  Extracellular ligand-binding receptor  72.5 
 
 		 382 aa  552  1e-156  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3329  amino-acid-binding periplasmic (PBP) ABC transporter protein  68.41 
 
 		 382 aa  548  1e-155  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.279448  normal  0.702706 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3525  Extracellular ligand-binding receptor  72.22 
 
 		 382 aa  550  1e-155  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00627098 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2401  extracellular ligand-binding receptor  63.52 
 
 		 385 aa  506  9.999999999999999e-143  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.682902 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2943  Extracellular ligand-binding receptor  63.13 
 
 		 382 aa  501  1e-140  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.35469  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0572  extracellular ligand-binding receptor  63.64 
 
 		 383 aa  496  1e-139  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.199084  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1230  Extracellular ligand-binding receptor  66.2 
 
 		 382 aa  492  9.999999999999999e-139  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.520921  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4096  extracellular ligand-binding receptor  63.03 
 
 		 379 aa  481  1e-135  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3951  extracellular ligand-binding receptor  64.17 
 
 		 385 aa  472  1e-132  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.757866  normal  0.707301 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0483  Extracellular ligand-binding receptor  59.16 
 
 		 411 aa  467  9.999999999999999e-131  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0914571 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0197  extracellular ligand-binding receptor  59.84 
 
 		 397 aa  463  1e-129  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4234  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  61.05 
 
 		 410 aa  463  1e-129  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.408833 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2411  extracellular ligand-binding receptor  61.17 
 
 		 381 aa  460  9.999999999999999e-129  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4097  extracellular ligand-binding receptor  57.64 
 
 		 379 aa  455  1e-127  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1517  Extracellular ligand-binding receptor  60.89 
 
 		 382 aa  449  1e-125  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.702531  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5327  Extracellular ligand-binding receptor  60.28 
 
 		 385 aa  443  1e-123  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0968635  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0524  extracellular ligand-binding receptor  56.3 
 
 		 382 aa  429  1e-119  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2820  extracellular ligand-binding receptor  56.28 
 
 		 389 aa  426  1e-118  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0158  Extracellular ligand-binding receptor  56.28 
 
 		 387 aa  422  1e-117  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2428  amino acid-binding periplasmic (PBP) ABC transporter protein  55.62 
 
 		 389 aa  420  1e-116  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2700  extracellular ligand-binding receptor  55.35 
 
 		 390 aa  418  1e-116  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.322471  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0165  Extracellular ligand-binding receptor  56.02 
 
 		 387 aa  420  1e-116  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2232  amino acid-binding periplasmic (PBP) ABC transporter protein  55.06 
 
 		 389 aa  413  1e-114  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2692  putative amino acid-binding periplasmic (PBP) ABC transporter protein  54.21 
 
 		 389 aa  408  1.0000000000000001e-112  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.407877  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2237  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  52.39 
 
 		 395 aa  394  1e-108  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.937762  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2316  Extracellular ligand-binding receptor  52.93 
 
 		 397 aa  385  1e-106  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3666  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  51.55 
 
 		 389 aa  386  1e-106  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.279436  normal  0.958773 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2494  Extracellular ligand-binding receptor  51.17 
 
 		 379 aa  385  1e-106  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.564109  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0968  ABC branched chain amino acid family transporter, periplasmic ligand binding protein  50.54 
 
 		 389 aa  384  1e-105  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1328  Extracellular ligand-binding receptor  53.78 
 
 		 397 aa  379  1e-104  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.125298  normal  0.0640101 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0515  Extracellular ligand-binding receptor  52.08 
 
 		 377 aa  380  1e-104  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.815299  normal  0.447794 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4630  extracellular ligand-binding receptor  46.48 
 
 		 383 aa  379  1e-104  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.511173  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0779  extracellular ligand-binding receptor  47 
 
 		 383 aa  380  1e-104  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0441144  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0502  Extracellular ligand-binding receptor  52.5 
 
 		 377 aa  379  1e-104  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.836386 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3241  extracellular ligand-binding receptor  51.55 
 
 		 381 aa  377  1e-103  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000702514  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1003  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  48.68 
 
 		 382 aa  376  1e-103  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.437001  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5808  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  53.15 
 
 		 385 aa  364  2e-99  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0834641 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0817  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  52.88 
 
 		 385 aa  361  9e-99  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1822  extracellular ligand-binding receptor  47.86 
 
 		 381 aa  360  2e-98  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.56038  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2526  extracellular ligand-binding receptor  51.91 
 
 		 385 aa  359  4e-98  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.779936  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0991  extracellular ligand-binding receptor  45.31 
 
 		 380 aa  358  9.999999999999999e-98  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0800  extracellular ligand-binding receptor  45.17 
 
 		 377 aa  353  2e-96  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.552204  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2394  extracellular ligand-binding receptor  52.39 
 
 		 385 aa  353  4e-96  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1866  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  51.83 
 
 		 394 aa  351  1e-95  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2482  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  51.83 
 
 		 391 aa  351  1e-95  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2477  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  51.83 
 
 		 394 aa  351  1e-95  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.212643  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6271  putative amino-acid ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  45.79 
 
 		 381 aa  350  2e-95  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3892  extracellular ligand-binding receptor  47.8 
 
 		 381 aa  350  3e-95  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0269  extracellular ligand-binding receptor  46.01 
 
 		 377 aa  346  3e-94  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.556277  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1889  extracellular ligand-binding receptor  43.6 
 
 		 385 aa  332  5e-90  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.808445  normal  0.559234 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1991  Extracellular ligand-binding receptor  44.57 
 
 		 385 aa  320  1.9999999999999998e-86  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.179885  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0904  extracellular ligand-binding receptor  45.15 
 
 		 377 aa  319  5e-86  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00289706  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3575  extracellular ligand-binding receptor  44.64 
 
 		 385 aa  317  3e-85  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.807298  normal  0.720427 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7089  putative branched-chain amino acid transport protein  43.77 
 
 		 381 aa  314  1.9999999999999998e-84  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.499249  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1500  Extracellular ligand-binding receptor  46.54 
 
 		 388 aa  310  2e-83  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.145866  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1501  Extracellular ligand-binding receptor  47.22 
 
 		 381 aa  309  5e-83  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.225006  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0900  extracellular ligand-binding receptor  43.33 
 
 		 379 aa  308  1.0000000000000001e-82  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  9.53304e-16  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1504  Extracellular ligand-binding receptor  44.18 
 
 		 387 aa  308  1.0000000000000001e-82  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.235771  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0692  extracellular ligand-binding receptor  43.27 
 
 		 379 aa  304  1.0000000000000001e-81  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2668  extracellular ligand-binding receptor  43.63 
 
 		 388 aa  299  4e-80  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.965129  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2672  extracellular ligand-binding receptor  44.56 
 
 		 384 aa  294  2e-78  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.211064  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3250  putative branched-chain amino acid ABC transporter, substrate-binding protein  42.06 
 
 		 378 aa  289  5.0000000000000004e-77  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.202781  normal  0.281786 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3257  putative branched-chain amino acid transport system substrate-binding protein  39.9 
 
 		 384 aa  288  1e-76  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0668  extracellular ligand-binding receptor  39.5 
 
 		 392 aa  254  2.0000000000000002e-66  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.431771  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3105  Extracellular ligand-binding receptor  36.46 
 
 		 389 aa  244  1.9999999999999999e-63  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2131  extracellular ligand-binding receptor  36.88 
 
 		 379 aa  234  3e-60  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0617424  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1735  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  35.99 
 
 		 378 aa  233  6e-60  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.583415  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3822  Extracellular ligand-binding receptor  33.84 
 
 		 394 aa  227  2e-58  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000102798  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3823  Extracellular ligand-binding receptor  34.24 
 
 		 394 aa  226  4e-58  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00025514  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1681  extracellular ligand-binding receptor  36.29 
 
 		 385 aa  226  4e-58  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.681493  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1860  Extracellular ligand-binding receptor  37.4 
 
 		 382 aa  221  1.9999999999999999e-56  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.153544  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1671  extracellular ligand-binding receptor  33.85 
 
 		 379 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2130  extracellular ligand-binding receptor  34.99 
 
 		 380 aa  213  2.9999999999999995e-54  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.482674  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0995  Extracellular ligand-binding receptor  32.99 
 
 		 379 aa  213  5.999999999999999e-54  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.725983  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1520  extracellular ligand-binding receptor  34.36 
 
 		 381 aa  213  5.999999999999999e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.657552  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2037  Extracellular ligand-binding receptor  36.09 
 
 		 379 aa  212  1e-53  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000596452 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2190  Extracellular ligand-binding receptor  34.1 
 
 		 379 aa  207  4e-52  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1861  Extracellular ligand-binding receptor  34.9 
 
 		 379 aa  205  1e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.571716  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>