More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BLD_0577 on replicon NC_010816
Organism: Bifidobacterium longum DJO10A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010816  BLD_0577  Na+-driven multidrug efflux pump  100 
 
 		 454 aa  899    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.00131825  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1822  MATE efflux family protein  46.76 
 
 		 440 aa  395  1e-109  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.286977  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1053  MATE efflux family protein  33.56 
 
 		 462 aa  272  8.000000000000001e-72  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  1.2115099999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5639  MATE efflux family protein  32.52 
 
 		 450 aa  245  9.999999999999999e-64  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.75001  normal  0.399325 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1497  MATE efflux family protein  32.14 
 
 		 460 aa  232  1e-59  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00584213  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0383  MATE efflux family protein  29.8 
 
 		 451 aa  205  1e-51  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.504119  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0393  MATE efflux family protein  29.8 
 
 		 451 aa  205  1e-51  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.530968  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1081  MATE efflux family protein  25.5 
 
 		 447 aa  192  1e-47  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000165796  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0827  MATE efflux family protein  27.62 
 
 		 452 aa  186  5e-46  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1446  MATE efflux family protein  28.44 
 
 		 439 aa  186  1.0000000000000001e-45  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.484247 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1575  hypothetical protein  26.46 
 
 		 459 aa  179  8e-44  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.195902  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1409  MATE efflux family protein  28.12 
 
 		 460 aa  179  1e-43  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.851568  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0111  MATE efflux family protein  29.08 
 
 		 464 aa  174  1.9999999999999998e-42  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1925  MATE efflux family protein  27.54 
 
 		 455 aa  174  3.9999999999999995e-42  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.16171  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1218  Na+ driven multidrug efflux pump  28.12 
 
 		 464 aa  171  2e-41  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.530621  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0006  MATE efflux family protein  28.57 
 
 		 442 aa  169  7e-41  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0243937 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0877  MATE efflux family protein  28.3 
 
 		 447 aa  167  2.9999999999999998e-40  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.371074  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0835  Na+-driven multidrug efflux pump  30.45 
 
 		 452 aa  166  5.9999999999999996e-40  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.552719  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0012  MATE efflux family protein  28.28 
 
 		 477 aa  165  2.0000000000000002e-39  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00000348389  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2859  MATE efflux family protein  27.95 
 
 		 455 aa  164  2.0000000000000002e-39  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2544  MATE efflux family protein  28.18 
 
 		 455 aa  165  2.0000000000000002e-39  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1652  MATE efflux family protein  28.76 
 
 		 454 aa  165  2.0000000000000002e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000778713  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1726  MATE efflux family protein  26.85 
 
 		 447 aa  164  4.0000000000000004e-39  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1577  MATE efflux family protein  30.23 
 
 		 447 aa  162  1e-38  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.283423  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0185  MATE efflux family protein  28.54 
 
 		 449 aa  160  4e-38  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2080  MATE efflux family protein  29.17 
 
 		 454 aa  159  9e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.634791 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1225  MATE efflux family protein  26.98 
 
 		 452 aa  159  1e-37  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0350  MATE efflux family protein  26.07 
 
 		 455 aa  158  2e-37  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1813  MATE efflux family protein  27.52 
 
 		 461 aa  158  2e-37  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  unclonable  0.000000145997  normal  0.0820418 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1796  MATE efflux family protein  27.21 
 
 		 448 aa  158  2e-37  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  unclonable  0.00000000911844 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1274  Na+ driven multidrug efflux protein  27.51 
 
 		 456 aa  157  3e-37  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.605029  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2656  MATE efflux family protein  26.91 
 
 		 455 aa  156  6e-37  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000320959  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0313  hypothetical protein  26.44 
 
 		 455 aa  155  2e-36  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00088835  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11870  putative efflux protein, MATE family  28.99 
 
 		 485 aa  154  4e-36  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1800  MATE efflux family protein  29.05 
 
 		 455 aa  152  2e-35  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2291  MATE efflux family protein  25.29 
 
 		 460 aa  151  2e-35  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1483  MATE efflux family protein  26.16 
 
 		 456 aa  152  2e-35  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.820235  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2347  MATE efflux family protein  27.64 
 
 		 466 aa  149  9e-35  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000304243  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02070  putative efflux protein, MATE family  24.31 
 
 		 496 aa  148  2.0000000000000003e-34  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1387  MATE efflux family protein  28.54 
 
 		 454 aa  144  3e-33  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00032817  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3395  MATE efflux family protein  27.66 
 
 		 461 aa  142  9e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0091  MATE efflux family protein  26.29 
 
 		 454 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3319  MATE efflux family protein  23.87 
 
 		 460 aa  140  6e-32  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00330578  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1204  MATE efflux family protein  25.54 
 
 		 461 aa  139  7e-32  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0582  MATE efflux family protein  27.48 
 
 		 466 aa  139  1e-31  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2869  MATE efflux family protein  24.37 
 
 		 451 aa  138  2e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000172656  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2651  MATE efflux family protein  27.05 
 
 		 449 aa  137  4e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000524124  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2890  MATE efflux family protein  27.48 
 
 		 466 aa  137  5e-31  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.831923  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04830  MATE efflux family protein  26.52 
 
 		 468 aa  137  5e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000202645  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2060  MATE efflux family protein  26.74 
 
 		 456 aa  136  8e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000022927  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0743  MATE efflux family protein  25.7 
 
 		 454 aa  135  9.999999999999999e-31  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000193663  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2964  MATE efflux family protein  25.69 
 
 		 453 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000632854  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2827  MATE efflux family protein  28.74 
 
 		 451 aa  133  5e-30  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.658448  normal  0.32606 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0400  MATE efflux family protein  25.94 
 
 		 456 aa  132  1.0000000000000001e-29  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.163354 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1448  MATE efflux family protein  25.7 
 
 		 470 aa  132  2.0000000000000002e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3948  MATE efflux family protein  27.57 
 
 		 458 aa  131  3e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0814  MATE efflux family protein subfamily  25.11 
 
 		 451 aa  130  4.0000000000000003e-29  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0013446  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02200  Na+-driven multidrug efflux pump  25.86 
 
 		 466 aa  130  7.000000000000001e-29  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3704  hypothetical protein  26.36 
 
 		 496 aa  129  8.000000000000001e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.546893 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3207  putative transmembrane efflux protein  26.63 
 
 		 467 aa  128  2.0000000000000002e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00227095 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2636  integral membrane protein  27.36 
 
 		 478 aa  127  4.0000000000000003e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.117345 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3000  MATE efflux family protein  29.87 
 
 		 458 aa  127  4.0000000000000003e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.649705  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4033  MATE efflux family protein  27.72 
 
 		 458 aa  127  4.0000000000000003e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000078929 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0404  MATE efflux family protein  27.07 
 
 		 457 aa  125  1e-27  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.294226 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0255  MATE efflux family protein  24.94 
 
 		 448 aa  125  1e-27  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.392054  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1569  MATE efflux family protein  26.63 
 
 		 493 aa  125  2e-27  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.144103 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2888  MATE efflux family protein  25.23 
 
 		 462 aa  123  5e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0238453  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1959  multi antimicrobial extrusion protein MatE  24.16 
 
 		 472 aa  123  8e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.849908  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03665  C-5 cytosine-specific DNA methylase:Multi antimicrobial extrusion (MatE) protein  25.77 
 
 		 455 aa  122  9.999999999999999e-27  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1662  MATE efflux family protein  25.29 
 
 		 453 aa  121  1.9999999999999998e-26  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.226136  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0997  MATE efflux family protein  26.52 
 
 		 437 aa  121  3e-26  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.207525  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2612  MATE efflux family protein  24.62 
 
 		 459 aa  119  9e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2653  MATE efflux family protein  27.07 
 
 		 484 aa  119  9.999999999999999e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1133  MATE efflux family protein  26.26 
 
 		 437 aa  119  9.999999999999999e-26  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3963  MATE efflux family protein  26.65 
 
 		 457 aa  118  1.9999999999999998e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0920263  normal  0.56178 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1654  MATE efflux family protein  29.47 
 
 		 473 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3333  multi anti extrusion protein MatE  28.22 
 
 		 448 aa  118  1.9999999999999998e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0107095  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1368  multi anti extrusion protein MatE  29.15 
 
 		 451 aa  117  5e-25  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1332  multi anti extrusion protein MatE  29.15 
 
 		 451 aa  117  5e-25  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.478618  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1342  multi anti extrusion protein MatE  29.15 
 
 		 451 aa  116  6.9999999999999995e-25  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.934996  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0460  MATE efflux family protein  29.89 
 
 		 451 aa  116  7.999999999999999e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3016  multi antimicrobial extrusion protein MatE  29.15 
 
 		 451 aa  116  7.999999999999999e-25  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.160373  normal  0.416485 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4805  MATE efflux family protein  25.98 
 
 		 868 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.371962  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2307  MATE efflux family protein  25.11 
 
 		 451 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000000873712  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1463  MATE efflux family protein  24.49 
 
 		 440 aa  115  1.0000000000000001e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0174433  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3482  multi anti extrusion protein MatE  28.62 
 
 		 449 aa  115  2.0000000000000002e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.456655  normal  0.0775956 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1754  multi anti extrusion protein MatE  25 
 
 		 452 aa  114  3e-24  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.580282  normal  0.069865 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2775  MATE efflux family protein  27.08 
 
 		 456 aa  114  3e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1922  MATE efflux family protein  22.22 
 
 		 456 aa  114  5e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0784  MATE efflux family protein  23.6 
 
 		 460 aa  113  7.000000000000001e-24  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2445  multi anti extrusion protein MatE  28.12 
 
 		 443 aa  113  7.000000000000001e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0849  MATE efflux family protein  24.28 
 
 		 447 aa  113  7.000000000000001e-24  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0181  multidrug efflux pump VmrA  25.69 
 
 		 446 aa  113  8.000000000000001e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1735  MATE efflux family protein  23.34 
 
 		 442 aa  112  1.0000000000000001e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00244827  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2315  MATE efflux family protein  25.37 
 
 		 470 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.1458  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1166  ABC transporter releated protein  26.2 
 
 		 463 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.403976 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02728  MATE efflux family protein  26.94 
 
 		 460 aa  111  2.0000000000000002e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0324679  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1334  MATE efflux family protein  24.24 
 
 		 478 aa  111  2.0000000000000002e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.402123  normal  0.231405 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1593  MATE efflux family protein  23.85 
 
 		 460 aa  111  2.0000000000000002e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000199125  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1509  MATE efflux family protein  23.6 
 
 		 460 aa  112  2.0000000000000002e-23  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.712333  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>