More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_3763 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_3763  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 154 aa  306  5.9999999999999995e-83  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.311442  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7084  MarR family transcriptional regulator  39.72 
 
 		 170 aa  101  3e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6948  MarR family transcriptional regulator  40.15 
 
 		 159 aa  96.3  1e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.17806  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1996  transcriptional regulator, MarR family  39.44 
 
 		 172 aa  95.5  2e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3570  MarR family transcriptional regulator  41.54 
 
 		 171 aa  95.1  3e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.247728 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1893  regulatory protein, MarR  41.54 
 
 		 172 aa  94  7e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.447554  normal  0.734981 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3429  transcriptional regulator MarR family  36.36 
 
 		 157 aa  90.1  1e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.905636  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2977  transcriptional regulator, MarR family  37.9 
 
 		 158 aa  89  2e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.688657  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1134  MarR family transcriptional regulator  45.37 
 
 		 154 aa  88.2  3e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.168406  hitchhiker  0.0000997239 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3027  MarR family transcriptional regulator  33.1 
 
 		 163 aa  81.6  0.000000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.128021 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0590  putative transcription regulator protein  36.84 
 
 		 178 aa  81.6  0.000000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4899  transcriptional regulator, MarR family  34.4 
 
 		 161 aa  80.9  0.000000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.529551  normal  0.428583 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4809  transcriptional regulator, MarR family  34.4 
 
 		 161 aa  80.9  0.000000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.577759  normal  0.746027 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0284  MarR family transcriptional regulator  35.82 
 
 		 167 aa  79.7  0.00000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1381  MarR family transcriptional regulator  35.94 
 
 		 146 aa  79.3  0.00000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.421757  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0503  transcriptional regulator, MarR family  34.59 
 
 		 171 aa  79.3  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.554707 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3359  hydroxycinnamic acid degradation regulator, putative  32.31 
 
 		 156 aa  78.2  0.00000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0565  MarR family transcriptional regulator  38.76 
 
 		 193 aa  78.2  0.00000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2399  MarR family transcriptional regulator  32.31 
 
 		 156 aa  77.4  0.00000000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0516  transcriptional regulator, MarR family  33.83 
 
 		 171 aa  75.1  0.0000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.398648 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1703  transcriptional regulator MarR family  32.8 
 
 		 172 aa  75.5  0.0000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.135356  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2046  MarR family transcriptional regulator  32.03 
 
 		 156 aa  74.3  0.0000000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2762  MarR family transcriptional regulator  39.81 
 
 		 184 aa  73.6  0.0000000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.351769  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14420  transcriptional regulator, MarR family  34.38 
 
 		 161 aa  73.2  0.000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2729  regulatory protein, MarR  31.43 
 
 		 162 aa  71.6  0.000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0376267  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3044  MarR family transcriptional regulator  31.2 
 
 		 165 aa  70.9  0.000000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2232  transcriptional regulator, MarR family  33.85 
 
 		 151 aa  70.5  0.000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00982992  hitchhiker  0.00000264817 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2197  MarR family transcriptional regulator  35.83 
 
 		 170 aa  69.7  0.00000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0027451  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0603  MarR family transcriptional regulator  33.58 
 
 		 155 aa  69.3  0.00000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.125253  normal  0.477496 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2945  transcriptional regulator, MarR family  31.2 
 
 		 162 aa  67.4  0.00000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.521959  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7499  MarR family transcriptional regulator  30.15 
 
 		 169 aa  67.8  0.00000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.800614 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3155  hypothetical protein  36.64 
 
 		 292 aa  67.4  0.00000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.107679  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5092  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 167 aa  67  0.00000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.636455 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0651  MarR family transcriptional regulator  29.23 
 
 		 172 aa  66.6  0.0000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0223  transcriptional regulator, MarR family  35.51 
 
 		 169 aa  65.5  0.0000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.504687  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0795  MarR family transcriptional regulator  35.34 
 
 		 179 aa  64.3  0.0000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2149  MarR family transcriptional regulator  36.08 
 
 		 142 aa  63.9  0.0000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2195  MarR family transcriptional regulator  36.08 
 
 		 142 aa  63.9  0.0000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0273493 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2136  MarR family transcriptional regulator  36.08 
 
 		 142 aa  63.9  0.0000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00095835 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2271  MarR family transcriptional regulator  31.39 
 
 		 146 aa  63.2  0.000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0738352 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6455  transcriptional regulator, MarR family  29.1 
 
 		 162 aa  63.2  0.000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3119  MarR family transcriptional regulator  30.22 
 
 		 151 aa  63.2  0.000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0332666  normal  0.174429 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1714  transcriptional regulator, MarR family  38.1 
 
 		 157 aa  62.8  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00901457 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0803  MarR family transcriptional regulator  30.65 
 
 		 157 aa  61.6  0.000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0263  MarR family transcriptional regulator  30.4 
 
 		 151 aa  61.2  0.000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1143  MarR family transcriptional regulator  36.13 
 
 		 205 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0934  MarR family transcriptional regulator  27.54 
 
 		 303 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0213342  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0807  MarR family transcriptional regulator  35.04 
 
 		 197 aa  60.5  0.000000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2466  Transcriptional regulators-like protein  36.78 
 
 		 145 aa  58.9  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0564534  normal  0.0878491 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0666  MarR family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 169 aa  58.5  0.00000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.10715  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1612  DNA-binding transcriptional repressor MarR  36.78 
 
 		 144 aa  57.8  0.00000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2144  DNA-binding transcriptional repressor MarR  36.78 
 
 		 144 aa  57.8  0.00000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.517462  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1675  DNA-binding transcriptional repressor MarR  36.78 
 
 		 144 aa  57.8  0.00000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2128  DNA-binding transcriptional repressor MarR  36.78 
 
 		 144 aa  57.8  0.00000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.318768  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1732  DNA-binding transcriptional repressor MarR  36.78 
 
 		 144 aa  57.8  0.00000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1640  DNA-binding transcriptional repressor MarR  36.78 
 
 		 144 aa  57.8  0.00000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01489  DNA-binding transcriptional repressor of multiple antibiotic resistance  36.78 
 
 		 144 aa  57.4  0.00000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0776568  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2116  transcriptional regulator, MarR family  36.78 
 
 		 144 aa  57.4  0.00000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000643944  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2016  MarR family transcriptional regulator  30.95 
 
 		 167 aa  57.8  0.00000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.908198 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3774  regulatory protein, MarR  30.08 
 
 		 177 aa  57.8  0.00000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01500  hypothetical protein  36.78 
 
 		 144 aa  57.4  0.00000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.101748  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3480  MarR family transcriptional regulator  29.69 
 
 		 147 aa  57.8  0.00000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0245944  normal  0.530872 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2632  MarR family transcriptional regulator  29.77 
 
 		 161 aa  57.4  0.00000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.256033  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3696  MarR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 151 aa  57  0.00000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.134225  normal  0.172711 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3234  transcriptional regulator, MarR family  28.03 
 
 		 151 aa  56.2  0.0000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2033  MarR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 303 aa  56.6  0.0000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.368826 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4407  transcriptional regulator, MarR family  35.34 
 
 		 163 aa  56.6  0.0000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.102927  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1634  transcriptional regulator, MarR family  27.48 
 
 		 140 aa  56.6  0.0000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0355019  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0823  transcriptional regulator, MarR family  28.03 
 
 		 150 aa  56.2  0.0000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4315  MarR family transcriptional regulator  32.54 
 
 		 193 aa  56.6  0.0000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2812  MarR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 137 aa  56.2  0.0000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0746607  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3765  MarR family transcriptional regulator  34.74 
 
 		 142 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.81029  normal  0.260835 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4605  MarR family transcriptional regulator  34.74 
 
 		 142 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3758  MarR family transcriptional regulator  34.74 
 
 		 142 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0715353  normal  0.188641 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3454  MarR family transcriptional regulator  29.51 
 
 		 168 aa  56.2  0.0000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.947902  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2856  MarR family transcriptional regulator  29.77 
 
 		 201 aa  55.1  0.0000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.843332 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4392  Transcriptional regulators-like protein  29.5 
 
 		 168 aa  54.7  0.0000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00709871  normal  0.0557169 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3360  transcriptional regulator, MarR family  32.26 
 
 		 151 aa  54.7  0.0000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1353  MarR family transcriptional regulator  30.83 
 
 		 157 aa  54.7  0.0000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4972  MarR family transcriptional regulator  27.34 
 
 		 142 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.229805  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5296  transcriptional regulator MarR family  25.74 
 
 		 149 aa  54.3  0.0000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1828  MarR family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 153 aa  53.9  0.0000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0229599 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4536  MarR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 166 aa  53.9  0.0000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.018511  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1815  DNA-binding transcriptional repressor MarR  32.32 
 
 		 144 aa  53.1  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1633  DNA-binding transcriptional repressor MarR  32.32 
 
 		 144 aa  53.1  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.400135  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0986  MarR family transcriptional regulator  30.95 
 
 		 155 aa  53.5  0.000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1409  MarR family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 184 aa  53.5  0.000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1692  DNA-binding transcriptional repressor MarR  32.32 
 
 		 144 aa  53.1  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1625  DNA-binding transcriptional repressor MarR  32.32 
 
 		 144 aa  53.1  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1650  DNA-binding transcriptional repressor MarR  32.32 
 
 		 144 aa  53.1  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0219827  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3487  MarR family transcriptional regulator  29.92 
 
 		 190 aa  53.1  0.000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.544367  normal  0.213963 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4687  hypothetical protein  33 
 
 		 161 aa  52.4  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00000161275  normal  0.469864 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0324  transcriptional regulator, MarR family  30.95 
 
 		 150 aa  52.4  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.491291  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6607  MarR family transcriptional regulator  29.46 
 
 		 329 aa  52.8  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.542838  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1546  MarR family transcriptional regulator  27.61 
 
 		 161 aa  52.8  0.000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.22368  normal  0.197095 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0825  transcriptional regulator, MarR family  33.96 
 
 		 156 aa  52.4  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1998  DNA-binding transcriptional repressor MarR  33.33 
 
 		 144 aa  52.8  0.000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0715691 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2076  transcriptional regulator, MarR family  27.52 
 
 		 171 aa  52.8  0.000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2019  transcriptional regulator, MarR family  30.83 
 
 		 145 aa  52.8  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0237275 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3320  hypothetical protein  30.4 
 
 		 151 aa  52  0.000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0293206  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>