More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aboo_0100 on replicon NC_013926
Organism: Aciduliprofundum boonei T469



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013926  Aboo_0100  TPR repeat-containing protein  100 
 
 
375 aa  741    Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  35.16 
 
 
810 aa  83.2  0.000000000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  35.16 
 
 
878 aa  82  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2414  TPR repeat-containing protein  28.67 
 
 
589 aa  70.9  0.00000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  35.29 
 
 
632 aa  67.8  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1361  TPR repeat-containing protein  29.93 
 
 
1276 aa  65.5  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00731  hypothetical protein  33.82 
 
 
816 aa  64.3  0.000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.456129 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2941  hypothetical protein  38.95 
 
 
560 aa  63.5  0.000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000171884  normal  0.0147454 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1232  TPR repeat-containing protein  32.19 
 
 
750 aa  63.5  0.000000006  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.967237  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23400  TPR repeat-containing protein  30.08 
 
 
183 aa  63.5  0.000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000457247  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2413  TPR repeat-containing protein  26.57 
 
 
593 aa  63.2  0.000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10800  TPR repeat-containing protein  34.48 
 
 
245 aa  63.2  0.000000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0911  tetratricopeptide TPR_4  32.03 
 
 
875 aa  63.2  0.000000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.379762  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1492  glycosyl transferase family protein  25.5 
 
 
1737 aa  61.6  0.00000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.315595  normal  0.552274 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2419  TPR repeat-containing protein  23.31 
 
 
792 aa  60.8  0.00000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0484292  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2418  TPR repeat-containing protein  26.05 
 
 
827 aa  60.8  0.00000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2477  TPR domain/radical SAM/B12 binding domain-containing protein  32 
 
 
864 aa  60.5  0.00000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1106  TPR repeat-containing protein  29.69 
 
 
605 aa  60.5  0.00000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000356395  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0825  TPR repeat-containing protein  29.73 
 
 
739 aa  60.1  0.00000007  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.423694  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  27.46 
 
 
3145 aa  60.1  0.00000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1233  TPR repeat-containing protein  29.79 
 
 
909 aa  58.9  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.161918  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18201  hypothetical protein  28.37 
 
 
430 aa  59.3  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.48017 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0959  hypothetical protein  26.67 
 
 
620 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.868556 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0200  TPR repeat-containing protein  31.76 
 
 
505 aa  58.2  0.0000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1957  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.81 
 
 
375 aa  58.5  0.0000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2626  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 
587 aa  58.9  0.0000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0661  TPR repeat-containing methyltransferase  25.17 
 
 
561 aa  58.5  0.0000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.25847  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1516  tetratricopeptide repeat family protein  25.17 
 
 
561 aa  58.2  0.0000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3268  TPR repeat-containing protein  28.8 
 
 
441 aa  58.2  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0122  glycosyl transferase, group 1  28.57 
 
 
3301 aa  58.2  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.326818 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2853  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.8 
 
 
441 aa  58.2  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0260503 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19711  hypothetical protein  28.48 
 
 
865 aa  58.2  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.372007  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2853  TPR repeat-containing protein  28.57 
 
 
3172 aa  58.2  0.0000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3023  glycosyl transferase, group 1/2 family protein  28.57 
 
 
2401 aa  57.4  0.0000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2951  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  33 
 
 
784 aa  57.4  0.0000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2855  hypothetical protein  26.7 
 
 
937 aa  57  0.0000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2904  TPR repeat-containing protein  27.88 
 
 
265 aa  57  0.0000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000121078  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0362  TPR repeat-containing protein  29.47 
 
 
804 aa  57  0.0000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.587657  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0213  TPR domain-containing protein  32.14 
 
 
380 aa  56.6  0.0000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.0000000856086  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3028  TPR repeat-containing protein  25.17 
 
 
620 aa  56.6  0.0000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.985806  normal  0.0142271 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0487  TPR repeat-containing protein  27.54 
 
 
566 aa  56.6  0.0000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.679539 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1512  TPR domain-containing protein  29.66 
 
 
550 aa  56.2  0.0000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0206479  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2417  TPR repeat-containing protein  27.21 
 
 
762 aa  56.2  0.0000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2431  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  33 
 
 
818 aa  56.2  0.0000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3866  TPR repeat protein  31.71 
 
 
1677 aa  56.2  0.0000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2266  tetratricopeptide TPR_2  27.66 
 
 
1213 aa  56.2  0.0000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1683  TPR repeat-containing protein  30.34 
 
 
362 aa  55.8  0.000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1987  TPR repeat-containing protein  23.94 
 
 
934 aa  55.5  0.000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0465352  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1451  TPR repeat-containing protein  27.97 
 
 
585 aa  55.8  0.000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2659  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.57 
 
 
565 aa  55.8  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.144865 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2439  TPR repeat-containing protein  32.84 
 
 
448 aa  55.8  0.000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0207467  normal  0.980065 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0720  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.33 
 
 
186 aa  55.8  0.000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4767  sulfotransferase  29.41 
 
 
682 aa  55.8  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.287127 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0702  TPR repeat-containing protein  31.68 
 
 
667 aa  55.5  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.274193  normal  0.091435 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2992  TPR repeat-containing protein  30.39 
 
 
824 aa  55.1  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000746825 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0815  TPR repeat-containing protein  28.08 
 
 
235 aa  55.1  0.000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0605859  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1092  TPR repeat-containing protein  27.59 
 
 
612 aa  54.7  0.000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1094  TPR repeat-containing protein  33.55 
 
 
685 aa  55.1  0.000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  32 
 
 
927 aa  55.1  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3643  TPR domain-containing protein  29.37 
 
 
1979 aa  55.1  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1787  TPR repeat-containing protein  25.27 
 
 
543 aa  55.5  0.000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.662156  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0913  TPR repeat-containing protein  26.67 
 
 
280 aa  55.5  0.000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.249159  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1114  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.33 
 
 
641 aa  55.1  0.000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23981  hypothetical protein  29.22 
 
 
587 aa  54.7  0.000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.167552 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1719  TPR repeat-containing protein  27.08 
 
 
583 aa  54.3  0.000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0788  TPR repeat-containing protein  22.64 
 
 
866 aa  54.7  0.000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.940486  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4265  TPR repeat-containing protein  30.89 
 
 
697 aa  54.3  0.000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2383  TPR repeat-containing protein  25.16 
 
 
1421 aa  54.7  0.000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.823331 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0153  TPR repeat-containing protein  26.63 
 
 
754 aa  53.9  0.000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.372833  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2093  TPR repeat-containing protein  25.19 
 
 
1714 aa  53.9  0.000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2471  TPR repeat-containing protein  26.56 
 
 
643 aa  53.9  0.000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3148  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.41 
 
 
249 aa  53.9  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.00000145051  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24171  hypothetical protein  30.66 
 
 
733 aa  53.9  0.000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2948  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.41 
 
 
249 aa  53.9  0.000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0166  TPR repeat-containing protein  33.94 
 
 
754 aa  53.5  0.000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.268335  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0083  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.87 
 
 
2240 aa  53.5  0.000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24191  hypothetical protein  29.33 
 
 
545 aa  53.5  0.000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18211  hypothetical protein  26.95 
 
 
603 aa  53.1  0.000007  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.905605 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1087  TPR repeat-containing protein  30.6 
 
 
808 aa  53.1  0.000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1093  TPR repeat-containing protein  28.08 
 
 
681 aa  53.1  0.000008  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.353622  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00391  TPR repeat-containing protein  29.05 
 
 
502 aa  53.1  0.000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.264497  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1518  TPR repeat-containing protein  29.41 
 
 
597 aa  53.1  0.000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00971618 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18191  hypothetical protein  26.42 
 
 
425 aa  53.1  0.000008  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.888115 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4282  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 
715 aa  52.8  0.000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2553  TPR repeat-containing protein  27.41 
 
 
547 aa  52.8  0.000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.852958 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3865  TPR repeat protein  28.68 
 
 
503 aa  52.4  0.00001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3267  glycosyl transferase family 2  28.04 
 
 
1252 aa  52.4  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0681  tetratricopeptide TPR_2  28.85 
 
 
562 aa  52.4  0.00001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0911  TPR repeat-containing protein  28.15 
 
 
515 aa  52.4  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.19098  hitchhiker  0.00518464 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0151  TPR repeat-containing protein  29.27 
 
 
833 aa  52.8  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2854  glycosyl transferase family 2  28.04 
 
 
1252 aa  52.8  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.956112  normal  0.0955707 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0152  TPR repeat-containing protein  26.28 
 
 
828 aa  51.6  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0165  TPR repeat-containing protein  26.28 
 
 
828 aa  52  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0585605  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5430  tetratricopeptide TPR_4  26.47 
 
 
595 aa  51.6  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0342  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.91 
 
 
582 aa  52  0.00002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.351016 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1759  TPR repeat-containing protein  31.67 
 
 
207 aa  52  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2630  Sel1 domain protein repeat-containing protein  31.2 
 
 
416 aa  52  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0395405 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1812  TPR repeat-containing protein  30.85 
 
 
189 aa  52  0.00002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2707  glycosyl transferase family protein  27.78 
 
 
1486 aa  52  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.228337 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3239  tetratricopeptide TPR_2  25 
 
 
955 aa  50.8  0.00003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.502177  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>