More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene XfasM23_1738 on replicon NC_010577
Organism: Xylella fastidiosa M23



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010577  XfasM23_1738  ribonuclease BN  100 
 
 
292 aa  582  1.0000000000000001e-165  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.554379  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1806  ribonuclease BN  99.32 
 
 
292 aa  577  1e-164  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04098  ribonuclease BN  78.65 
 
 
320 aa  424  1e-118  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0324  ribonuclease BN  76.28 
 
 
314 aa  394  1e-108  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.290543 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0297  ribonuclease BN  36.11 
 
 
291 aa  178  8e-44  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.421979 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1876  ribonuclease BN  34.84 
 
 
306 aa  177  2e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3408  ribonuclease BN  37.1 
 
 
299 aa  166  5e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0329161  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3921  putative ribonuclease BN  35.55 
 
 
360 aa  155  6e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00855127  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4516  ribonuclease BN  35.02 
 
 
436 aa  154  2e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.783235  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2481  ribonuclease BN  35.47 
 
 
324 aa  154  2e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.541316  normal  0.806631 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3473  ribonuclease BN  31.58 
 
 
324 aa  154  2e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.950669 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4384  ribonuclease BN, putative  35.71 
 
 
314 aa  151  1e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3982  putative ribonuclease BN  35.71 
 
 
314 aa  151  1e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4448  ribonuclease BN  33.45 
 
 
443 aa  150  2e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0111149  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0967  ribonuclease BN  35.69 
 
 
300 aa  151  2e-35  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.89911  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2102  ribonuclease BN  35.05 
 
 
311 aa  150  2e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.316673 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3546  ribonuclease BN  35.36 
 
 
308 aa  150  2e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0229297  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2801  ribonuclease BN  33.96 
 
 
307 aa  150  3e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.128758 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4599  ribonuclease BN  34.18 
 
 
341 aa  149  5e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.150471  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0412  ribonuclease BN  29.69 
 
 
317 aa  149  7e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3877  ribonuclease BN  34.26 
 
 
310 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2469  putative ribonuclease BN  32.18 
 
 
305 aa  148  1.0000000000000001e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.428751  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3375  putative ribonuclease BN  34.26 
 
 
310 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.594125 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1291  ribonuclease BN  32.86 
 
 
311 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.31772 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1591  ribonuclease BN  31.27 
 
 
424 aa  147  2.0000000000000003e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.884253 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4029  ribonuclease BN  34.59 
 
 
316 aa  146  4.0000000000000006e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.394592 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5809  ribonuclease BN, putative  32.73 
 
 
321 aa  145  8.000000000000001e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0703  YihY family protein  34.67 
 
 
325 aa  143  3e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.075214  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6562  ribonuclease BN  34.87 
 
 
347 aa  142  9e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.357212  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0769  ribonuclease BN  35.91 
 
 
411 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2533  ribonuclease BN  35.6 
 
 
311 aa  141  9.999999999999999e-33  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3548  ribonuclease  34.96 
 
 
299 aa  139  3.9999999999999997e-32  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0230388  normal  0.0399226 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2372  ribonuclease BN  33.33 
 
 
321 aa  139  4.999999999999999e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.483691  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2352  ribonuclease BN  33.58 
 
 
305 aa  139  7.999999999999999e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1697  putative ribonuclease BN  34.44 
 
 
307 aa  138  1e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.318237  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2276  putative ribonuclease BN  34.44 
 
 
307 aa  138  1e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1883  putative ribonuclease BN  34.44 
 
 
307 aa  138  1e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.244601  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0744  putative ribonuclease  34.44 
 
 
337 aa  137  2e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2414  putative ribonuclease BN  34.33 
 
 
304 aa  137  2e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1947  ribonuclease BN  34.27 
 
 
299 aa  137  3.0000000000000003e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.594213 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1209  ribonuclease BN  34.62 
 
 
312 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1675  putative ribonuclease BN  33.58 
 
 
307 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.753662  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4408  ribonuclease BN  32.13 
 
 
427 aa  133  3.9999999999999996e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2225  ribonuclease BN  33.33 
 
 
298 aa  132  6e-30  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.681291  decreased coverage  0.00304933 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3922  ribonuclease BN  32.6 
 
 
370 aa  132  6.999999999999999e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.644027  normal  0.211181 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10418  hypothetical protein  29.21 
 
 
323 aa  130  3e-29  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.536635  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6636  ribonuclease BN  30.88 
 
 
322 aa  129  4.0000000000000003e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2153  ribonuclease BN, putative  32.46 
 
 
321 aa  127  2.0000000000000002e-28  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2621  ribonuclease BN  32.22 
 
 
304 aa  124  2e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5335  ribonuclease BN  34.8 
 
 
329 aa  124  3e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3875  ribonuclease BN  31.41 
 
 
329 aa  123  4e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3764  ribonuclease BN  31.41 
 
 
329 aa  123  4e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0316697  normal  0.101597 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1838  ribonuclease BN, putative  32.56 
 
 
301 aa  122  6e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.787321  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02223  putative ribonuclease RNase BN (RBN) transmembrane protein  32.8 
 
 
324 aa  117  1.9999999999999998e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3481  ribonuclease BN family protein  40.87 
 
 
306 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5700  ribonuclease BN  33.09 
 
 
305 aa  116  5e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0471671 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1669  ribonuclease BN, putative  31.76 
 
 
326 aa  112  7.000000000000001e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2157  ribonuclease BN  34.44 
 
 
393 aa  112  9e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2216  ribonuclease BN  34.66 
 
 
303 aa  110  2.0000000000000002e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.987558  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0258  ribonuclease BN  33.33 
 
 
331 aa  108  1e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0221  ribonuclease BN  34.93 
 
 
334 aa  106  4e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2667  ribonuclease BN  28.37 
 
 
302 aa  99.8  5e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0611062  normal  0.153348 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1517  ribonuclease BN  31.5 
 
 
321 aa  97.4  3e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0151  ribonuclease BN  33.71 
 
 
305 aa  95.9  7e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.688141  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0169  ribonuclease BN  33.71 
 
 
305 aa  95.9  8e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0417869  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3201  ribonuclease BN  33.79 
 
 
309 aa  95.1  1e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.248041 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2561  ribonuclease RN  27.13 
 
 
276 aa  94.7  2e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.842929  normal  0.307691 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1406  ribonuclease BN  31.6 
 
 
320 aa  84.3  0.000000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.573356  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3282  ribonuclease BN  23.72 
 
 
306 aa  84  0.000000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.273153 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2314  ribonuclease BN  28.09 
 
 
297 aa  80.1  0.00000000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3407  ribonuclease BN  24.64 
 
 
322 aa  77  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.57313  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2696  ribonuclease BN  24.64 
 
 
322 aa  77  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2769  putative ribonuclease BN  26.67 
 
 
404 aa  75.5  0.0000000000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0433853 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1131  tRNA-processing RNAse BN  29.43 
 
 
447 aa  75.5  0.0000000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0120336  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3909  ribonuclease BN  25.19 
 
 
340 aa  75.1  0.000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1457  ribonuclease BN  26.39 
 
 
484 aa  73.2  0.000000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1250  tRNA-processing RNAse BN  29.55 
 
 
444 aa  72.8  0.000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1830  ribonuclease BN, putative  25.35 
 
 
404 aa  72.8  0.000000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0291213 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2316  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  27.12 
 
 
428 aa  72.8  0.000000000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000260717  hitchhiker  0.000176219 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0042  BrkB-like serum-resistance protein  30.12 
 
 
294 aa  72.4  0.000000000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.363004  normal  0.262588 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4966  ribonuclease BN  27.2 
 
 
448 aa  71.6  0.00000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1575  ribonuclease BN  25.86 
 
 
439 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1559  putative ribonuclease BN transmembrane protein  28.63 
 
 
441 aa  70.5  0.00000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.837363 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2773  ribonuclease BN  29.55 
 
 
437 aa  70.9  0.00000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4618  ribonuclease BN  26.26 
 
 
336 aa  70.5  0.00000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.331921  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4026  ribonuclease BN  24.02 
 
 
302 aa  70.1  0.00000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.194003 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4092  ribonuclease BN  26.69 
 
 
290 aa  70.1  0.00000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0077  ribonuclease BN  24.14 
 
 
307 aa  68.9  0.00000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2776  putative ribonuclease BN  26.46 
 
 
417 aa  68.9  0.00000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0453  YihY family protein  23.83 
 
 
286 aa  68.2  0.0000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1200  putative ribonuclease BN  26.67 
 
 
429 aa  68.6  0.0000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.530131  normal  0.510939 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3482  ribonuclease BN  27.96 
 
 
292 aa  68.6  0.0000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.384798 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1793  ribonuclease BN  30.98 
 
 
442 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2184  putative ribonuclease BN  26.77 
 
 
276 aa  68.2  0.0000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00880085  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4878  ribonuclease BN  26.41 
 
 
296 aa  67.8  0.0000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000922798 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2494  ribonuclease BN  27.37 
 
 
332 aa  68.2  0.0000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.12214  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4186  ribonuclease BN  27.34 
 
 
294 aa  67.8  0.0000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0331  ribonuclease BN  27.31 
 
 
320 aa  67.8  0.0000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.533981  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2618  YihY family protein  28.68 
 
 
437 aa  67  0.0000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1354  ribonuclease BN  28.41 
 
 
436 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.875268  normal  0.303489 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>