More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_1876 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_1876  ribonuclease BN  100 
 
 
306 aa  603  9.999999999999999e-173  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0297  ribonuclease BN  58.22 
 
 
291 aa  346  3e-94  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.421979 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3408  ribonuclease BN  56.76 
 
 
299 aa  332  7.000000000000001e-90  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0329161  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3921  putative ribonuclease BN  50.49 
 
 
360 aa  295  9e-79  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00855127  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4029  ribonuclease BN  47.93 
 
 
316 aa  265  1e-69  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.394592 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1947  ribonuclease BN  51.25 
 
 
299 aa  261  1e-68  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.594213 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2469  putative ribonuclease BN  46.15 
 
 
305 aa  259  4e-68  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.428751  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1591  ribonuclease BN  43.71 
 
 
424 aa  256  5e-67  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.884253 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2153  ribonuclease BN, putative  50.18 
 
 
321 aa  252  5.000000000000001e-66  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6562  ribonuclease BN  44.48 
 
 
347 aa  252  7e-66  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.357212  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0412  ribonuclease BN  44.6 
 
 
317 aa  249  3e-65  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4408  ribonuclease BN  49.51 
 
 
427 aa  249  6e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2372  ribonuclease BN  45.3 
 
 
321 aa  246  3e-64  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.483691  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0967  ribonuclease BN  43.29 
 
 
300 aa  246  4.9999999999999997e-64  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.89911  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2216  ribonuclease BN  52.15 
 
 
303 aa  245  6e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.987558  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6636  ribonuclease BN  43.15 
 
 
322 aa  243  3e-63  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2801  ribonuclease BN  41.67 
 
 
307 aa  236  3e-61  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.128758 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2225  ribonuclease BN  45.3 
 
 
298 aa  235  6e-61  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.681291  decreased coverage  0.00304933 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3922  ribonuclease BN  42.76 
 
 
370 aa  233  4.0000000000000004e-60  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.644027  normal  0.211181 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1209  ribonuclease BN  43.58 
 
 
312 aa  231  1e-59  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10418  hypothetical protein  42.61 
 
 
323 aa  230  3e-59  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.536635  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5809  ribonuclease BN, putative  43.38 
 
 
321 aa  229  3e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1669  ribonuclease BN, putative  46.53 
 
 
326 aa  228  8e-59  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2621  ribonuclease BN  45.8 
 
 
304 aa  226  5.0000000000000005e-58  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2533  ribonuclease BN  41.58 
 
 
311 aa  216  5.9999999999999996e-55  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3473  ribonuclease BN  41.07 
 
 
324 aa  215  8e-55  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.950669 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3875  ribonuclease BN  46.38 
 
 
329 aa  211  2e-53  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3764  ribonuclease BN  46.38 
 
 
329 aa  211  2e-53  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0316697  normal  0.101597 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1838  ribonuclease BN, putative  42.81 
 
 
301 aa  208  8e-53  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.787321  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02223  putative ribonuclease RNase BN (RBN) transmembrane protein  46.95 
 
 
324 aa  207  1e-52  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3548  ribonuclease  41.88 
 
 
299 aa  204  1e-51  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0230388  normal  0.0399226 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3481  ribonuclease BN family protein  43.62 
 
 
306 aa  203  3e-51  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2481  ribonuclease BN  38.33 
 
 
324 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.541316  normal  0.806631 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5335  ribonuclease BN  44.77 
 
 
329 aa  196  4.0000000000000005e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4448  ribonuclease BN  39.49 
 
 
443 aa  191  2e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0111149  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4599  ribonuclease BN  39.33 
 
 
341 aa  190  2e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.150471  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2102  ribonuclease BN  35.99 
 
 
311 aa  189  4e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.316673 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3877  ribonuclease BN  35.49 
 
 
310 aa  188  1e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3375  putative ribonuclease BN  35.49 
 
 
310 aa  187  2e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.594125 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3546  ribonuclease BN  38.13 
 
 
308 aa  185  7e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0229297  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4384  ribonuclease BN, putative  37.74 
 
 
314 aa  185  8e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3982  putative ribonuclease BN  37.74 
 
 
314 aa  185  8e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4516  ribonuclease BN  37.15 
 
 
436 aa  182  5.0000000000000004e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.783235  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2157  ribonuclease BN  40.43 
 
 
393 aa  181  2e-44  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0769  ribonuclease BN  40 
 
 
411 aa  180  2.9999999999999997e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0703  YihY family protein  36.23 
 
 
325 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.075214  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1291  ribonuclease BN  37.76 
 
 
311 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.31772 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1697  putative ribonuclease BN  36.5 
 
 
307 aa  177  1e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.318237  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0744  putative ribonuclease  36.5 
 
 
337 aa  178  1e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2414  putative ribonuclease BN  36.5 
 
 
304 aa  177  1e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1883  putative ribonuclease BN  36.5 
 
 
307 aa  177  1e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.244601  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1675  putative ribonuclease BN  36.5 
 
 
307 aa  177  2e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.753662  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2276  putative ribonuclease BN  36.5 
 
 
307 aa  177  2e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2667  ribonuclease BN  36.39 
 
 
302 aa  174  9.999999999999999e-43  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0611062  normal  0.153348 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1806  ribonuclease BN  36.05 
 
 
292 aa  163  4.0000000000000004e-39  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1738  ribonuclease BN  35.16 
 
 
292 aa  162  7e-39  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.554379  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0042  BrkB-like serum-resistance protein  35.34 
 
 
294 aa  158  1e-37  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.363004  normal  0.262588 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2352  ribonuclease BN  37.74 
 
 
305 aa  154  2e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2561  ribonuclease RN  33.09 
 
 
276 aa  150  3e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.842929  normal  0.307691 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04098  ribonuclease BN  32.81 
 
 
320 aa  147  2.0000000000000003e-34  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0324  ribonuclease BN  32.86 
 
 
314 aa  144  2e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.290543 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5700  ribonuclease BN  37.12 
 
 
305 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0471671 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0221  ribonuclease BN  34.41 
 
 
334 aa  131  1.0000000000000001e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1517  ribonuclease BN  35.19 
 
 
321 aa  129  7.000000000000001e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0258  ribonuclease BN  33.89 
 
 
331 aa  127  2.0000000000000002e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0077  ribonuclease BN  27.57 
 
 
307 aa  124  3e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3282  ribonuclease BN  27.61 
 
 
306 aa  118  9.999999999999999e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.273153 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4026  ribonuclease BN  28.22 
 
 
302 aa  116  3.9999999999999997e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.194003 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3201  ribonuclease BN  31.33 
 
 
309 aa  115  1.0000000000000001e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.248041 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0151  ribonuclease BN  35.29 
 
 
305 aa  114  2.0000000000000002e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.688141  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0169  ribonuclease BN  35.85 
 
 
305 aa  113  3e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0417869  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2802  ribonuclease BN  32.4 
 
 
368 aa  110  2.0000000000000002e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2696  ribonuclease BN  27.52 
 
 
322 aa  107  2e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3407  ribonuclease BN  27.52 
 
 
322 aa  107  2e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.57313  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0559  ribonuclease BN  31.91 
 
 
402 aa  100  3e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0345  putative ribonuclease BN  27.33 
 
 
377 aa  100  3e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1406  ribonuclease BN  27.34 
 
 
320 aa  99.8  5e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.573356  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3965  ribonuclease BN  26.21 
 
 
306 aa  96.3  6e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0548  tRNA-processing RNAse BN  25.81 
 
 
525 aa  91.3  2e-17  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0302  ribonuclease BN  28.57 
 
 
298 aa  90.5  3e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.223678  hitchhiker  0.000000133239 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2523  ribonuclease BN  28.99 
 
 
349 aa  90.9  3e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.861907  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4618  ribonuclease BN  29.77 
 
 
336 aa  89  9e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.331921  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3869  putative ribonuclease BN  28.52 
 
 
401 aa  88.2  1e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.124849 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0536  ribonuclease BN, putative  25.71 
 
 
525 aa  89  1e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.031655 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0425  putative ribonuclease BN  30.63 
 
 
300 aa  88.6  1e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.250516  normal  0.726297 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0418  ribonuclease BN  25.09 
 
 
277 aa  87.8  2e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00636408  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3708  ribonuclease BN  29.01 
 
 
337 aa  86.7  4e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.153225 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0311  ribonuclease BN  29.01 
 
 
337 aa  86.7  5e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.415793 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3448  ribonuclease BN  27.59 
 
 
313 aa  86.3  6e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.016816  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0316  ribonuclease BN  29.01 
 
 
337 aa  85.9  8e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.293845  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4401  ribonuclease BN  28.63 
 
 
295 aa  84.7  0.000000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0034  ribonuclease BN  29.02 
 
 
294 aa  84.7  0.000000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4558  ribonuclease  29.02 
 
 
411 aa  83.6  0.000000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.176119  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4186  ribonuclease BN  28.57 
 
 
294 aa  83.6  0.000000000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0030  ribonuclease BN  28.88 
 
 
294 aa  83.6  0.000000000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0331  ribonuclease BN  29.66 
 
 
320 aa  83.6  0.000000000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.533981  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51960  ribonuclease  29.02 
 
 
411 aa  83.2  0.000000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000384323 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1932  ribonuclease BN  24.73 
 
 
363 aa  82.8  0.000000000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0751  ribonuclease BN, putative  28.07 
 
 
328 aa  82  0.00000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.232287  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3545  ribonuclease BN  30.3 
 
 
285 aa  81.6  0.00000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.109526  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>