More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_2533 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_2533  ribonuclease BN  100 
 
 		 311 aa  616  1e-175  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3921  putative ribonuclease BN  39.64 
 
 		 360 aa  220  3e-56  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00855127  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3408  ribonuclease BN  41.01 
 
 		 299 aa  219  5e-56  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0329161  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0297  ribonuclease BN  39.45 
 
 		 291 aa  219  6e-56  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.421979 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1876  ribonuclease BN  41.58 
 
 		 306 aa  215  5.9999999999999996e-55  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4029  ribonuclease BN  38.66 
 
 		 316 aa  197  2.0000000000000003e-49  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.394592 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3473  ribonuclease BN  37.67 
 
 		 324 aa  194  1e-48  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.950669 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2225  ribonuclease BN  37.63 
 
 		 298 aa  193  3e-48  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.681291  decreased coverage  0.00304933 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5809  ribonuclease BN, putative  35.42 
 
 		 321 aa  191  1e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3875  ribonuclease BN  36.84 
 
 		 329 aa  191  1e-47  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3764  ribonuclease BN  36.84 
 
 		 329 aa  191  1e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0316697  normal  0.101597 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2372  ribonuclease BN  36.75 
 
 		 321 aa  189  5e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.483691  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6562  ribonuclease BN  37.67 
 
 		 347 aa  188  1e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.357212  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0412  ribonuclease BN  35.71 
 
 		 317 aa  186  3e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0967  ribonuclease BN  35.98 
 
 		 300 aa  186  3e-46  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.89911  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02223  putative ribonuclease RNase BN (RBN) transmembrane protein  37.46 
 
 		 324 aa  186  5e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4408  ribonuclease BN  38.64 
 
 		 427 aa  184  2.0000000000000003e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2621  ribonuclease BN  39.23 
 
 		 304 aa  184  2.0000000000000003e-45  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5335  ribonuclease BN  35.31 
 
 		 329 aa  183  3e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1838  ribonuclease BN, putative  39.92 
 
 		 301 aa  181  1e-44  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.787321  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1947  ribonuclease BN  35.61 
 
 		 299 aa  180  2.9999999999999997e-44  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.594213 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2801  ribonuclease BN  36.36 
 
 		 307 aa  179  4.999999999999999e-44  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.128758 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1209  ribonuclease BN  34.33 
 
 		 312 aa  173  2.9999999999999996e-42  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2153  ribonuclease BN, putative  37.2 
 
 		 321 aa  173  3.9999999999999995e-42  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1591  ribonuclease BN  36.11 
 
 		 424 aa  172  6.999999999999999e-42  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.884253 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6636  ribonuclease BN  32.9 
 
 		 322 aa  171  1e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1669  ribonuclease BN, putative  37.88 
 
 		 326 aa  168  1e-40  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0703  YihY family protein  35.27 
 
 		 325 aa  160  2e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.075214  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4448  ribonuclease BN  35.25 
 
 		 443 aa  160  2e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0111149  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3877  ribonuclease BN  35.34 
 
 		 310 aa  160  3e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3375  putative ribonuclease BN  35.34 
 
 		 310 aa  160  3e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.594125 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2102  ribonuclease BN  32.98 
 
 		 311 aa  159  7e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.316673 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1675  putative ribonuclease BN  34.31 
 
 		 307 aa  158  9e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.753662  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2469  putative ribonuclease BN  35.96 
 
 		 305 aa  158  9e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.428751  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0744  putative ribonuclease  34.77 
 
 		 337 aa  157  1e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1697  putative ribonuclease BN  34.31 
 
 		 307 aa  157  2e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.318237  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2276  putative ribonuclease BN  34.77 
 
 		 307 aa  157  2e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2414  putative ribonuclease BN  34.31 
 
 		 304 aa  157  2e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1883  putative ribonuclease BN  34.31 
 
 		 307 aa  157  2e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.244601  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3548  ribonuclease  36.02 
 
 		 299 aa  157  3e-37  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0230388  normal  0.0399226 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4599  ribonuclease BN  34.36 
 
 		 341 aa  156  5.0000000000000005e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.150471  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3922  ribonuclease BN  34.32 
 
 		 370 aa  155  9e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.644027  normal  0.211181 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4516  ribonuclease BN  34.6 
 
 		 436 aa  155  9e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.783235  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2481  ribonuclease BN  32.33 
 
 		 324 aa  155  9e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.541316  normal  0.806631 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4384  ribonuclease BN, putative  34.11 
 
 		 314 aa  154  1e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3546  ribonuclease BN  34.11 
 
 		 308 aa  155  1e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0229297  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3982  putative ribonuclease BN  34.11 
 
 		 314 aa  154  1e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3481  ribonuclease BN family protein  39.43 
 
 		 306 aa  152  8.999999999999999e-36  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2216  ribonuclease BN  36.39 
 
 		 303 aa  150  2e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.987558  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1291  ribonuclease BN  31.73 
 
 		 311 aa  149  4e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.31772 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0769  ribonuclease BN  35.22 
 
 		 411 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10418  hypothetical protein  32.4 
 
 		 323 aa  143  4e-33  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.536635  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2157  ribonuclease BN  30.45 
 
 		 393 aa  142  9e-33  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0221  ribonuclease BN  34.71 
 
 		 334 aa  137  3.0000000000000003e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0258  ribonuclease BN  35.21 
 
 		 331 aa  137  3.0000000000000003e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1806  ribonuclease BN  34.25 
 
 		 292 aa  125  9e-28  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1738  ribonuclease BN  34.25 
 
 		 292 aa  125  1e-27  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.554379  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04098  ribonuclease BN  31.5 
 
 		 320 aa  125  1e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2667  ribonuclease BN  32.25 
 
 		 302 aa  122  9e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0611062  normal  0.153348 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0169  ribonuclease BN  35.48 
 
 		 305 aa  120  1.9999999999999998e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0417869  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0151  ribonuclease BN  36.33 
 
 		 305 aa  120  3e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.688141  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2561  ribonuclease RN  28.46 
 
 		 276 aa  119  6e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.842929  normal  0.307691 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1517  ribonuclease BN  34.98 
 
 		 321 aa  119  6e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2352  ribonuclease BN  30.88 
 
 		 305 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5700  ribonuclease BN  32.55 
 
 		 305 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0471671 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0042  BrkB-like serum-resistance protein  32.01 
 
 		 294 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.363004  normal  0.262588 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3201  ribonuclease BN  32.71 
 
 		 309 aa  114  3e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.248041 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0324  ribonuclease BN  31.71 
 
 		 314 aa  110  4.0000000000000004e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.290543 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2696  ribonuclease BN  27.12 
 
 		 322 aa  102  1e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3407  ribonuclease BN  27.12 
 
 		 322 aa  102  1e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.57313  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3965  ribonuclease BN  26.06 
 
 		 306 aa  93.6  4e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3282  ribonuclease BN  24.32 
 
 		 306 aa  90.5  3e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.273153 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0077  ribonuclease BN  23.17 
 
 		 307 aa  89  9e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1406  ribonuclease BN  24.9 
 
 		 320 aa  82.8  0.000000000000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.573356  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51960  ribonuclease  27.01 
 
 		 411 aa  82  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000384323 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2802  ribonuclease BN  27.5 
 
 		 368 aa  80.9  0.00000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4558  ribonuclease  26.64 
 
 		 411 aa  81.3  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.176119  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1793  ribonuclease BN  27.21 
 
 		 442 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2618  YihY family protein  28.62 
 
 		 437 aa  77.4  0.0000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0331  ribonuclease BN  27.95 
 
 		 320 aa  76.3  0.0000000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.533981  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2988  tRNA-processing RNAse BN  27.34 
 
 		 405 aa  76.3  0.0000000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0115566 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1337  putative ribonuclease BN  27.07 
 
 		 443 aa  75.9  0.0000000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.500166  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1377  ribonuclease BN  27.07 
 
 		 443 aa  75.9  0.0000000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.763301  normal  0.704772 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4026  ribonuclease BN  24.51 
 
 		 302 aa  74.7  0.000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.194003 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4601  ribonuclease BN  26.05 
 
 		 443 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.996518 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2314  ribonuclease BN  28.63 
 
 		 297 aa  74.7  0.000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3909  ribonuclease BN  27.62 
 
 		 340 aa  74.3  0.000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4401  ribonuclease BN  28.92 
 
 		 295 aa  73.9  0.000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1575  ribonuclease BN  26.95 
 
 		 439 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0315  ribonuclease BN  26.52 
 
 		 323 aa  73.6  0.000000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0319  ribonuclease BN  26.52 
 
 		 323 aa  73.6  0.000000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0311  ribonuclease BN  26.01 
 
 		 337 aa  73.6  0.000000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.415793 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0314  ribonuclease BN  26.52 
 
 		 323 aa  73.6  0.000000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.321317  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0320  ribonuclease BN  26.52 
 
 		 323 aa  73.2  0.000000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2773  ribonuclease BN  26.32 
 
 		 437 aa  73.2  0.000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1456  putative ribonuclease BN  26.52 
 
 		 442 aa  73.2  0.000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1434  ribonuclease BN  26.52 
 
 		 442 aa  73.2  0.000000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.50654  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0942  ribonuclease BN  27.51 
 
 		 437 aa  72.8  0.000000000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1862  ribonuclease BN  27.51 
 
 		 437 aa  72.8  0.000000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.618695  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1685  tRNA-processing ribonuclease BN  27.51 
 
 		 437 aa  72.8  0.000000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.417952  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>