118 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_0151 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008782  Ajs_0151  ribonuclease BN  100 
 
 
305 aa  587  1e-166  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.688141  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0169  ribonuclease BN  98.68 
 
 
305 aa  578  1e-164  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0417869  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0221  ribonuclease BN  84.34 
 
 
334 aa  415  9.999999999999999e-116  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0258  ribonuclease BN  67.35 
 
 
331 aa  349  4e-95  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3201  ribonuclease BN  61.68 
 
 
309 aa  297  2e-79  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.248041 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1517  ribonuclease BN  61.35 
 
 
321 aa  295  8e-79  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3408  ribonuclease BN  37.16 
 
 
299 aa  158  1e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0329161  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2533  ribonuclease BN  36.33 
 
 
311 aa  151  1e-35  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4029  ribonuclease BN  37.02 
 
 
316 aa  149  8e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.394592 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0297  ribonuclease BN  34.81 
 
 
291 aa  148  1.0000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.421979 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1876  ribonuclease BN  35.29 
 
 
306 aa  145  1e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2801  ribonuclease BN  33.33 
 
 
307 aa  145  1e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.128758 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0967  ribonuclease BN  37.25 
 
 
300 aa  143  3e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.89911  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3921  putative ribonuclease BN  32.84 
 
 
360 aa  142  5e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00855127  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3877  ribonuclease BN  37.5 
 
 
310 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2481  ribonuclease BN  34.87 
 
 
324 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.541316  normal  0.806631 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3375  putative ribonuclease BN  37.5 
 
 
310 aa  140  3e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.594125 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5809  ribonuclease BN, putative  33.21 
 
 
321 aa  139  7.999999999999999e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2621  ribonuclease BN  34.77 
 
 
304 aa  137  3.0000000000000003e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2372  ribonuclease BN  32.32 
 
 
321 aa  135  6.0000000000000005e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.483691  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0703  YihY family protein  34.14 
 
 
325 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.075214  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2153  ribonuclease BN, putative  35.32 
 
 
321 aa  133  3e-30  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4516  ribonuclease BN  35.67 
 
 
436 aa  133  3e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.783235  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4448  ribonuclease BN  35.23 
 
 
443 aa  132  6.999999999999999e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0111149  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3546  ribonuclease BN  36.86 
 
 
308 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0229297  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0744  putative ribonuclease  35.21 
 
 
337 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4384  ribonuclease BN, putative  36.86 
 
 
314 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3982  putative ribonuclease BN  36.86 
 
 
314 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1591  ribonuclease BN  32 
 
 
424 aa  130  2.0000000000000002e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.884253 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2102  ribonuclease BN  36.47 
 
 
311 aa  129  5.0000000000000004e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.316673 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2469  putative ribonuclease BN  28.47 
 
 
305 aa  129  5.0000000000000004e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.428751  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0412  ribonuclease BN  29.73 
 
 
317 aa  129  5.0000000000000004e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6562  ribonuclease BN  32.05 
 
 
347 aa  129  6e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.357212  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6636  ribonuclease BN  30.88 
 
 
322 aa  129  6e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1697  putative ribonuclease BN  36.03 
 
 
307 aa  127  3e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.318237  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0769  ribonuclease BN  34.85 
 
 
411 aa  127  3e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0042  BrkB-like serum-resistance protein  35.44 
 
 
294 aa  127  3e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.363004  normal  0.262588 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1883  putative ribonuclease BN  36.03 
 
 
307 aa  127  3e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.244601  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2414  putative ribonuclease BN  36.03 
 
 
304 aa  127  3e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2276  putative ribonuclease BN  36.03 
 
 
307 aa  127  3e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1675  putative ribonuclease BN  34 
 
 
307 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.753662  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4599  ribonuclease BN  36.02 
 
 
341 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.150471  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1209  ribonuclease BN  29.69 
 
 
312 aa  125  1e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3548  ribonuclease  32.97 
 
 
299 aa  122  7e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0230388  normal  0.0399226 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1838  ribonuclease BN, putative  33.21 
 
 
301 aa  122  9.999999999999999e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.787321  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3764  ribonuclease BN  34.81 
 
 
329 aa  120  1.9999999999999998e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0316697  normal  0.101597 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3875  ribonuclease BN  34.81 
 
 
329 aa  120  1.9999999999999998e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1669  ribonuclease BN, putative  37.69 
 
 
326 aa  120  3.9999999999999996e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4408  ribonuclease BN  35.69 
 
 
427 aa  119  9e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1291  ribonuclease BN  33.7 
 
 
311 aa  119  9e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.31772 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3481  ribonuclease BN family protein  39.18 
 
 
306 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2216  ribonuclease BN  38.84 
 
 
303 aa  116  3.9999999999999997e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.987558  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02223  putative ribonuclease RNase BN (RBN) transmembrane protein  34.44 
 
 
324 aa  115  7.999999999999999e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5335  ribonuclease BN  31.42 
 
 
329 aa  115  1.0000000000000001e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2225  ribonuclease BN  34.72 
 
 
298 aa  113  4.0000000000000004e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.681291  decreased coverage  0.00304933 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1947  ribonuclease BN  33.88 
 
 
299 aa  112  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.594213 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3282  ribonuclease BN  23.26 
 
 
306 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.273153 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3473  ribonuclease BN  25.18 
 
 
324 aa  109  6e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.950669 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3922  ribonuclease BN  33.73 
 
 
370 aa  108  2e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.644027  normal  0.211181 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10418  hypothetical protein  26.46 
 
 
323 aa  104  2e-21  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.536635  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2667  ribonuclease BN  31.23 
 
 
302 aa  103  4e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0611062  normal  0.153348 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1806  ribonuclease BN  35.81 
 
 
292 aa  100  4e-20  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0324  ribonuclease BN  32.74 
 
 
314 aa  100  4e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.290543 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1738  ribonuclease BN  35.81 
 
 
292 aa  99.8  5e-20  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.554379  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2352  ribonuclease BN  32.61 
 
 
305 aa  96.3  5e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2561  ribonuclease RN  26.3 
 
 
276 aa  95.1  1e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.842929  normal  0.307691 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2157  ribonuclease BN  30.42 
 
 
393 aa  93.6  4e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04098  ribonuclease BN  34.78 
 
 
320 aa  89.7  5e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5700  ribonuclease BN  35.41 
 
 
305 aa  85.9  7e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0471671 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1406  ribonuclease BN  23.35 
 
 
320 aa  75.9  0.0000000000008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.573356  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2802  ribonuclease BN  28.38 
 
 
368 aa  65.1  0.000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4026  ribonuclease BN  25 
 
 
302 aa  65.5  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.194003 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0077  ribonuclease BN  22.68 
 
 
307 aa  60.8  0.00000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1463  serum resistance locus BrkB-like protein  24.46 
 
 
304 aa  58.9  0.00000009  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01651  serum resistance locus BrkB-like protein  24.46 
 
 
304 aa  58.9  0.00000009  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.596268  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4202  ribonuclease BN  26.69 
 
 
341 aa  57.4  0.0000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2696  ribonuclease BN  22.71 
 
 
322 aa  57.4  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3407  ribonuclease BN  22.71 
 
 
322 aa  57.4  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.57313  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0099  serum resistance locus BrkB-like protein  28.29 
 
 
306 aa  55.5  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0625929  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01101  serum resistance locus BrkB-like protein  28.29 
 
 
304 aa  55.1  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2075  ribonuclease BN  27.14 
 
 
328 aa  54.3  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5884  ribonuclease BN  24.4 
 
 
499 aa  52.8  0.000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1831  ribonuclease BN, putative  26.3 
 
 
341 aa  51.6  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.630422  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01071  serum resistance locus BrkB-like protein  24.34 
 
 
314 aa  51.2  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.48623  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01081  serum resistance locus BrkB-like protein  23.91 
 
 
313 aa  51.2  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01111  serum resistance locus BrkB-like protein  28.29 
 
 
304 aa  50.8  0.00003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.970589  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3965  ribonuclease BN  22.18 
 
 
306 aa  50.4  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0106  ribonuclease  25.17 
 
 
366 aa  49.3  0.00008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4056  ribonuclease BN-like family protein  25.17 
 
 
361 aa  48.9  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0363  serum resistance locus BrkB-like  23.24 
 
 
332 aa  48.1  0.0002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2623  putative ribonuclease BN  26.91 
 
 
278 aa  48.1  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.870366 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1198  putative ribonuclease BN  26.24 
 
 
322 aa  47.4  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.405959  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5735  membrane protein-like protein  24.72 
 
 
379 aa  46.6  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.423891  normal  0.171619 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4075  hypothetical protein  25.09 
 
 
357 aa  46.6  0.0005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.90745  normal  0.0226711 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25840  predicted membrane protein  32.14 
 
 
375 aa  46.6  0.0005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.200788  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0418  ribonuclease BN  23.76 
 
 
277 aa  46.2  0.0006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00636408  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1073  ribonuclease BN  24.38 
 
 
328 aa  45.4  0.001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02291  serum resistance locus BrkB-like protein  29.01 
 
 
314 aa  45.4  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4776  ribonuclease BN  25 
 
 
367 aa  45.8  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0858939  normal  0.337427 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0865  ribonuclease BN  28.16 
 
 
342 aa  45.4  0.001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.756909  normal  0.214041 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>