More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B4408 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007348  Reut_B4408  ribonuclease BN  100 
 
 		 427 aa  847    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4029  ribonuclease BN  56.39 
 
 		 316 aa  355  1e-96  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.394592 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2153  ribonuclease BN, putative  59.72 
 
 		 321 aa  313  2.9999999999999996e-84  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2216  ribonuclease BN  60.07 
 
 		 303 aa  305  1.0000000000000001e-81  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.987558  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0967  ribonuclease BN  55.48 
 
 		 300 aa  300  4e-80  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.89911  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1669  ribonuclease BN, putative  55.74 
 
 		 326 aa  283  6.000000000000001e-75  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1876  ribonuclease BN  50.51 
 
 		 306 aa  276  6e-73  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5809  ribonuclease BN, putative  47.39 
 
 		 321 aa  258  2e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3408  ribonuclease BN  47.43 
 
 		 299 aa  253  4.0000000000000004e-66  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0329161  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3921  putative ribonuclease BN  47.27 
 
 		 360 aa  250  3e-65  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00855127  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0297  ribonuclease BN  45.99 
 
 		 291 aa  248  1e-64  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.421979 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3764  ribonuclease BN  48.45 
 
 		 329 aa  237  3e-61  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0316697  normal  0.101597 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3875  ribonuclease BN  48.45 
 
 		 329 aa  237  3e-61  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1209  ribonuclease BN  45.45 
 
 		 312 aa  231  2e-59  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5335  ribonuclease BN  49.26 
 
 		 329 aa  230  3e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02223  putative ribonuclease RNase BN (RBN) transmembrane protein  49.64 
 
 		 324 aa  229  8e-59  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0412  ribonuclease BN  40.26 
 
 		 317 aa  225  1e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6562  ribonuclease BN  40.32 
 
 		 347 aa  219  5e-56  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.357212  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2372  ribonuclease BN  38.44 
 
 		 321 aa  217  2.9999999999999998e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.483691  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1947  ribonuclease BN  42.5 
 
 		 299 aa  211  2e-53  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.594213 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6636  ribonuclease BN  37.73 
 
 		 322 aa  206  5e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2225  ribonuclease BN  40.14 
 
 		 298 aa  206  8e-52  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.681291  decreased coverage  0.00304933 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2533  ribonuclease BN  38.64 
 
 		 311 aa  199  7.999999999999999e-50  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2801  ribonuclease BN  37.91 
 
 		 307 aa  197  3e-49  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.128758 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2469  putative ribonuclease BN  38.95 
 
 		 305 aa  194  4e-48  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.428751  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3473  ribonuclease BN  34.38 
 
 		 324 aa  191  2e-47  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.950669 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1591  ribonuclease BN  38.1 
 
 		 424 aa  190  4e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.884253 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3922  ribonuclease BN  38.8 
 
 		 370 aa  189  9e-47  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.644027  normal  0.211181 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2621  ribonuclease BN  41.33 
 
 		 304 aa  188  1e-46  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4448  ribonuclease BN  39.19 
 
 		 443 aa  189  1e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0111149  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0769  ribonuclease BN  42.63 
 
 		 411 aa  188  2e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2481  ribonuclease BN  35.9 
 
 		 324 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.541316  normal  0.806631 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10418  hypothetical protein  40.65 
 
 		 323 aa  184  2.0000000000000003e-45  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.536635  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0703  YihY family protein  39.24 
 
 		 325 aa  183  5.0000000000000004e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.075214  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1291  ribonuclease BN  42 
 
 		 311 aa  182  1e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.31772 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2157  ribonuclease BN  39.15 
 
 		 393 aa  181  2e-44  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4516  ribonuclease BN  38.55 
 
 		 436 aa  181  2.9999999999999997e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.783235  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3548  ribonuclease  37.06 
 
 		 299 aa  180  4.999999999999999e-44  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0230388  normal  0.0399226 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3375  putative ribonuclease BN  36.61 
 
 		 310 aa  179  9e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.594125 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3877  ribonuclease BN  36.61 
 
 		 310 aa  179  1e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4599  ribonuclease BN  36.27 
 
 		 341 aa  176  9.999999999999999e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.150471  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2667  ribonuclease BN  38.05 
 
 		 302 aa  174  2.9999999999999996e-42  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0611062  normal  0.153348 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0744  putative ribonuclease  37.5 
 
 		 337 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2102  ribonuclease BN  36.82 
 
 		 311 aa  173  3.9999999999999995e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.316673 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1697  putative ribonuclease BN  37.77 
 
 		 307 aa  172  6.999999999999999e-42  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.318237  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1883  putative ribonuclease BN  37.77 
 
 		 307 aa  172  6.999999999999999e-42  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.244601  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2276  putative ribonuclease BN  37.77 
 
 		 307 aa  172  7.999999999999999e-42  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2414  putative ribonuclease BN  38.52 
 
 		 304 aa  172  9e-42  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1675  putative ribonuclease BN  37.41 
 
 		 307 aa  170  4e-41  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.753662  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3546  ribonuclease BN  37.45 
 
 		 308 aa  170  5e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0229297  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4384  ribonuclease BN, putative  37.45 
 
 		 314 aa  170  5e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3982  putative ribonuclease BN  37.45 
 
 		 314 aa  170  5e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1838  ribonuclease BN, putative  37.41 
 
 		 301 aa  164  3e-39  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.787321  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2352  ribonuclease BN  36.03 
 
 		 305 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3481  ribonuclease BN family protein  39.85 
 
 		 306 aa  149  8e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5700  ribonuclease BN  37.32 
 
 		 305 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0471671 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04098  ribonuclease BN  34.28 
 
 		 320 aa  146  6e-34  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1806  ribonuclease BN  33.18 
 
 		 292 aa  137  2e-31  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1738  ribonuclease BN  33.18 
 
 		 292 aa  137  3.0000000000000003e-31  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.554379  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0324  ribonuclease BN  32.53 
 
 		 314 aa  131  2.0000000000000002e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.290543 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2561  ribonuclease RN  27.88 
 
 		 276 aa  129  7.000000000000001e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.842929  normal  0.307691 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3965  ribonuclease BN  30.79 
 
 		 306 aa  130  7.000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0042  BrkB-like serum-resistance protein  32.45 
 
 		 294 aa  125  1e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.363004  normal  0.262588 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3407  ribonuclease BN  29.84 
 
 		 322 aa  122  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.57313  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2696  ribonuclease BN  29.84 
 
 		 322 aa  122  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0258  ribonuclease BN  31.6 
 
 		 331 aa  121  3e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3201  ribonuclease BN  35.25 
 
 		 309 aa  120  4.9999999999999996e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.248041 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1517  ribonuclease BN  32.33 
 
 		 321 aa  117  3.9999999999999997e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0221  ribonuclease BN  32.72 
 
 		 334 aa  114  3e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0151  ribonuclease BN  35.69 
 
 		 305 aa  108  3e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.688141  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0169  ribonuclease BN  35.69 
 
 		 305 aa  107  3e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0417869  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0077  ribonuclease BN  27.8 
 
 		 307 aa  101  2e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3282  ribonuclease BN  25.2 
 
 		 306 aa  98.6  2e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.273153 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2802  ribonuclease BN  27.54 
 
 		 368 aa  90.5  5e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4026  ribonuclease BN  30.71 
 
 		 302 aa  89.4  1e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.194003 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0630  putative ribonuclease BN  27.6 
 
 		 538 aa  87.4  4e-16  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.883121 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51960  ribonuclease  30.86 
 
 		 411 aa  85.9  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000384323 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4558  ribonuclease  30.48 
 
 		 411 aa  84.7  0.000000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.176119  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1406  ribonuclease BN  23.94 
 
 		 320 aa  81.3  0.00000000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.573356  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0302  ribonuclease BN  28.41 
 
 		 298 aa  80.9  0.00000000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.223678  hitchhiker  0.000000133239 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0548  tRNA-processing RNAse BN  24.26 
 
 		 525 aa  75.1  0.000000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4618  ribonuclease BN  28.57 
 
 		 336 aa  75.1  0.000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.331921  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0536  ribonuclease BN, putative  24.26 
 
 		 525 aa  75.1  0.000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.031655 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2988  tRNA-processing RNAse BN  28.57 
 
 		 405 aa  73.9  0.000000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0115566 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3545  ribonuclease BN  29.8 
 
 		 285 aa  73.9  0.000000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.109526  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36810  Ribonuclease BN-like protein  28.78 
 
 		 408 aa  73.6  0.000000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0345  putative ribonuclease BN  22.14 
 
 		 377 aa  73.2  0.000000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1559  putative ribonuclease BN transmembrane protein  26.67 
 
 		 441 aa  73.2  0.000000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.837363 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0704  putative ribonuclease BN  28.52 
 
 		 451 aa  73.2  0.000000000008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.71296  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1434  ribonuclease BN  27.52 
 
 		 442 aa  72.8  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.50654  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0316  ribonuclease BN  26.92 
 
 		 337 aa  72.4  0.00000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.293845  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3708  ribonuclease BN  27.31 
 
 		 337 aa  72.8  0.00000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.153225 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1456  putative ribonuclease BN  27.52 
 
 		 442 aa  72.8  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0311  ribonuclease BN  26.54 
 
 		 337 aa  72.4  0.00000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.415793 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1793  ribonuclease BN  27.17 
 
 		 442 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4601  ribonuclease BN  27.48 
 
 		 443 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.996518 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2618  YihY family protein  25.63 
 
 		 437 aa  72  0.00000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0974  ribonuclease BN, putative  27.52 
 
 		 442 aa  72.4  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.315544  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0315  ribonuclease BN  26.14 
 
 		 323 aa  71.6  0.00000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1377  ribonuclease BN  27.13 
 
 		 443 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.763301  normal  0.704772 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>