More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_5809 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007974  Rmet_5809  ribonuclease BN, putative  100 
 
 		 321 aa  634    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5335  ribonuclease BN  81.54 
 
 		 329 aa  461  9.999999999999999e-129  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3875  ribonuclease BN  70.1 
 
 		 329 aa  350  1e-95  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3764  ribonuclease BN  70.1 
 
 		 329 aa  350  1e-95  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0316697  normal  0.101597 
 
 
-
 
NC_003296  RS02223  putative ribonuclease RNase BN (RBN) transmembrane protein  69.6 
 
 		 324 aa  328  6e-89  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1209  ribonuclease BN  57.86 
 
 		 312 aa  290  3e-77  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4029  ribonuclease BN  50.36 
 
 		 316 aa  257  2e-67  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.394592 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2153  ribonuclease BN, putative  46.92 
 
 		 321 aa  244  9.999999999999999e-64  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0297  ribonuclease BN  45.09 
 
 		 291 aa  239  2.9999999999999997e-62  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.421979 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4408  ribonuclease BN  48.01 
 
 		 427 aa  236  3e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3408  ribonuclease BN  44.69 
 
 		 299 aa  232  7.000000000000001e-60  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0329161  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0967  ribonuclease BN  47.04 
 
 		 300 aa  230  2e-59  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.89911  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1876  ribonuclease BN  43.38 
 
 		 306 aa  229  5e-59  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6562  ribonuclease BN  46.76 
 
 		 347 aa  228  1e-58  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.357212  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2216  ribonuclease BN  50.72 
 
 		 303 aa  225  8e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.987558  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1669  ribonuclease BN, putative  48.25 
 
 		 326 aa  216  2.9999999999999998e-55  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2372  ribonuclease BN  43.75 
 
 		 321 aa  216  2.9999999999999998e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.483691  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2481  ribonuclease BN  38.31 
 
 		 324 aa  213  3.9999999999999995e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.541316  normal  0.806631 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0412  ribonuclease BN  41.16 
 
 		 317 aa  211  2e-53  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3921  putative ribonuclease BN  40.58 
 
 		 360 aa  210  2e-53  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00855127  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2801  ribonuclease BN  42.07 
 
 		 307 aa  206  4e-52  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.128758 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6636  ribonuclease BN  41.33 
 
 		 322 aa  201  9.999999999999999e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2225  ribonuclease BN  39.29 
 
 		 298 aa  201  9.999999999999999e-51  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.681291  decreased coverage  0.00304933 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1591  ribonuclease BN  38.23 
 
 		 424 aa  197  2.0000000000000003e-49  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.884253 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4448  ribonuclease BN  39.34 
 
 		 443 aa  194  2e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0111149  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0703  YihY family protein  39.41 
 
 		 325 aa  193  4e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.075214  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2533  ribonuclease BN  35.42 
 
 		 311 aa  191  1e-47  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10418  hypothetical protein  39.27 
 
 		 323 aa  191  2e-47  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.536635  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3473  ribonuclease BN  36.33 
 
 		 324 aa  189  5e-47  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.950669 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1947  ribonuclease BN  40.91 
 
 		 299 aa  188  1e-46  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.594213 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2667  ribonuclease BN  39.04 
 
 		 302 aa  186  3e-46  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0611062  normal  0.153348 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0744  putative ribonuclease  38.81 
 
 		 337 aa  187  3e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2276  putative ribonuclease BN  38.81 
 
 		 307 aa  186  5e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1697  putative ribonuclease BN  38.81 
 
 		 307 aa  186  5e-46  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.318237  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1883  putative ribonuclease BN  38.81 
 
 		 307 aa  186  5e-46  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.244601  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2414  putative ribonuclease BN  39.25 
 
 		 304 aa  186  6e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1291  ribonuclease BN  40.07 
 
 		 311 aa  186  6e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.31772 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2469  putative ribonuclease BN  39.62 
 
 		 305 aa  186  7e-46  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.428751  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1675  putative ribonuclease BN  38.81 
 
 		 307 aa  185  7e-46  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.753662  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4599  ribonuclease BN  40.16 
 
 		 341 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.150471  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0769  ribonuclease BN  38.64 
 
 		 411 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3877  ribonuclease BN  39.13 
 
 		 310 aa  183  3e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3375  putative ribonuclease BN  39.45 
 
 		 310 aa  183  3e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.594125 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4516  ribonuclease BN  39.34 
 
 		 436 aa  183  4.0000000000000006e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.783235  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3546  ribonuclease BN  40.32 
 
 		 308 aa  181  1e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0229297  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4384  ribonuclease BN, putative  39.92 
 
 		 314 aa  181  2e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3982  putative ribonuclease BN  39.92 
 
 		 314 aa  181  2e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2102  ribonuclease BN  39.92 
 
 		 311 aa  180  2.9999999999999997e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.316673 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2621  ribonuclease BN  40.59 
 
 		 304 aa  176  5e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2157  ribonuclease BN  40.94 
 
 		 393 aa  173  3.9999999999999995e-42  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1838  ribonuclease BN, putative  39.16 
 
 		 301 aa  170  4e-41  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.787321  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2352  ribonuclease BN  36.3 
 
 		 305 aa  166  6.9999999999999995e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3548  ribonuclease  32.39 
 
 		 299 aa  161  1e-38  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0230388  normal  0.0399226 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5700  ribonuclease BN  37.06 
 
 		 305 aa  160  2e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0471671 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3922  ribonuclease BN  33.1 
 
 		 370 aa  159  8e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.644027  normal  0.211181 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3481  ribonuclease BN family protein  38.01 
 
 		 306 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0258  ribonuclease BN  31 
 
 		 331 aa  141  1.9999999999999998e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0042  BrkB-like serum-resistance protein  34.91 
 
 		 294 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.363004  normal  0.262588 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1517  ribonuclease BN  32.55 
 
 		 321 aa  135  7.000000000000001e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3407  ribonuclease BN  30.62 
 
 		 322 aa  128  1.0000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.57313  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2696  ribonuclease BN  30.62 
 
 		 322 aa  128  1.0000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1806  ribonuclease BN  33.97 
 
 		 292 aa  127  3e-28  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1738  ribonuclease BN  33.94 
 
 		 292 aa  126  4.0000000000000003e-28  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.554379  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0221  ribonuclease BN  32.71 
 
 		 334 aa  125  8.000000000000001e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04098  ribonuclease BN  30.72 
 
 		 320 aa  124  2e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0324  ribonuclease BN  33.98 
 
 		 314 aa  124  2e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.290543 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2561  ribonuclease RN  25.55 
 
 		 276 aa  115  8.999999999999998e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.842929  normal  0.307691 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3201  ribonuclease BN  32.6 
 
 		 309 aa  113  5e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.248041 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3965  ribonuclease BN  29.15 
 
 		 306 aa  106  5e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3282  ribonuclease BN  26.51 
 
 		 306 aa  104  2e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.273153 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0151  ribonuclease BN  33.21 
 
 		 305 aa  103  3e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.688141  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0169  ribonuclease BN  33.21 
 
 		 305 aa  103  3e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0417869  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0077  ribonuclease BN  25.5 
 
 		 307 aa  96.3  7e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4026  ribonuclease BN  27.4 
 
 		 302 aa  92.8  8e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.194003 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1406  ribonuclease BN  24.41 
 
 		 320 aa  92  1e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.573356  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2802  ribonuclease BN  28.32 
 
 		 368 aa  79  0.0000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51960  ribonuclease  27.48 
 
 		 411 aa  69.3  0.00000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000384323 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4618  ribonuclease BN  25.57 
 
 		 336 aa  68.9  0.0000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.331921  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4558  ribonuclease  27.1 
 
 		 411 aa  68.2  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.176119  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4092  ribonuclease BN  23.32 
 
 		 290 aa  67.8  0.0000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3708  ribonuclease BN  25.45 
 
 		 337 aa  67.8  0.0000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.153225 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0311  ribonuclease BN  25.45 
 
 		 337 aa  67.8  0.0000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.415793 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1577  ribonuclease BN  37.5 
 
 		 294 aa  67.4  0.0000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.274703  normal  0.013095 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1902  YihY family protein  37.5 
 
 		 262 aa  66.6  0.0000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.567508  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0316  ribonuclease BN  25.09 
 
 		 337 aa  66.2  0.0000000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.293845  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4202  ribonuclease BN  27.46 
 
 		 341 aa  66.2  0.0000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1198  putative ribonuclease BN  27.62 
 
 		 322 aa  65.9  0.0000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.405959  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4305  ribonuclease BN  24.41 
 
 		 290 aa  65.5  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.269266  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4260  ribonuclease BN  24.41 
 
 		 290 aa  65.5  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4416  ribonuclease BN  24.41 
 
 		 290 aa  65.5  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4238  ribonuclease BN  24.41 
 
 		 290 aa  65.5  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.89383  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4351  ribonuclease BN  24.41 
 
 		 290 aa  65.5  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4100  ribonuclease BN  23.3 
 
 		 290 aa  64.3  0.000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4271  ribonuclease BN  23.3 
 
 		 290 aa  64.3  0.000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4132  ribonuclease BN  23.3 
 
 		 290 aa  64.3  0.000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5333  ribonuclease BN  23.3 
 
 		 290 aa  64.3  0.000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.247154 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1932  ribonuclease BN  25.44 
 
 		 363 aa  64.7  0.000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0302  ribonuclease BN  24.91 
 
 		 298 aa  65.1  0.000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.223678  hitchhiker  0.000000133239 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4364  ribonuclease BN  23.3 
 
 		 290 aa  64.3  0.000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4409  ribonuclease BN  23.3 
 
 		 290 aa  64.3  0.000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>