92 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_4026 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_4026  ribonuclease BN  100 
 
 		 302 aa  592  1e-168  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.194003 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3282  ribonuclease BN  48.24 
 
 		 306 aa  268  7e-71  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.273153 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0077  ribonuclease BN  36.45 
 
 		 307 aa  166  4e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2801  ribonuclease BN  32.97 
 
 		 307 aa  145  9e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.128758 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1591  ribonuclease BN  31.23 
 
 		 424 aa  139  3.9999999999999997e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.884253 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3473  ribonuclease BN  30.07 
 
 		 324 aa  138  1e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.950669 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0297  ribonuclease BN  29.31 
 
 		 291 aa  137  2e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.421979 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6636  ribonuclease BN  28.43 
 
 		 322 aa  136  5e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3548  ribonuclease  30.14 
 
 		 299 aa  129  5.0000000000000004e-29  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0230388  normal  0.0399226 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1876  ribonuclease BN  28.32 
 
 		 306 aa  129  8.000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0412  ribonuclease BN  26.42 
 
 		 317 aa  128  1.0000000000000001e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3408  ribonuclease BN  29.12 
 
 		 299 aa  125  7e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0329161  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6562  ribonuclease BN  27.85 
 
 		 347 aa  124  1e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.357212  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2469  putative ribonuclease BN  28.37 
 
 		 305 aa  122  6e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.428751  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2372  ribonuclease BN  25 
 
 		 321 aa  120  1.9999999999999998e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.483691  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3922  ribonuclease BN  28.62 
 
 		 370 aa  119  7e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.644027  normal  0.211181 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3921  putative ribonuclease BN  27.14 
 
 		 360 aa  116  5e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00855127  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10418  hypothetical protein  25.8 
 
 		 323 aa  116  5e-25  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.536635  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1838  ribonuclease BN, putative  30.77 
 
 		 301 aa  106  4e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.787321  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0967  ribonuclease BN  28.57 
 
 		 300 aa  107  4e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.89911  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5809  ribonuclease BN, putative  27.4 
 
 		 321 aa  105  9e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2225  ribonuclease BN  29.29 
 
 		 298 aa  103  2e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.681291  decreased coverage  0.00304933 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5335  ribonuclease BN  31.3 
 
 		 329 aa  103  4e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3875  ribonuclease BN  26.3 
 
 		 329 aa  95.9  8e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3764  ribonuclease BN  26.3 
 
 		 329 aa  95.9  8e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0316697  normal  0.101597 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1209  ribonuclease BN  28.91 
 
 		 312 aa  95.9  8e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2621  ribonuclease BN  28.37 
 
 		 304 aa  92.8  6e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1669  ribonuclease BN, putative  28.47 
 
 		 326 aa  92.8  6e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1947  ribonuclease BN  28.42 
 
 		 299 aa  92.4  7e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.594213 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4599  ribonuclease BN  26.94 
 
 		 341 aa  89.4  6e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.150471  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4516  ribonuclease BN  29.2 
 
 		 436 aa  88.2  1e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.783235  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3481  ribonuclease BN family protein  32.58 
 
 		 306 aa  89  1e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2153  ribonuclease BN, putative  26.85 
 
 		 321 aa  87  3e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02223  putative ribonuclease RNase BN (RBN) transmembrane protein  28.46 
 
 		 324 aa  85.9  8e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2561  ribonuclease RN  25.89 
 
 		 276 aa  85.5  9e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.842929  normal  0.307691 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4408  ribonuclease BN  28.97 
 
 		 427 aa  85.5  0.000000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4384  ribonuclease BN, putative  26.79 
 
 		 314 aa  84  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4029  ribonuclease BN  26.67 
 
 		 316 aa  84  0.000000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.394592 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3982  putative ribonuclease BN  26.79 
 
 		 314 aa  84  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3546  ribonuclease BN  26.79 
 
 		 308 aa  83.6  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0229297  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2533  ribonuclease BN  24.51 
 
 		 311 aa  83.2  0.000000000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3375  putative ribonuclease BN  25.6 
 
 		 310 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.594125 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3877  ribonuclease BN  25.6 
 
 		 310 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4448  ribonuclease BN  29.2 
 
 		 443 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0111149  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2481  ribonuclease BN  25.1 
 
 		 324 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.541316  normal  0.806631 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2102  ribonuclease BN  26.79 
 
 		 311 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.316673 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0769  ribonuclease BN  28.96 
 
 		 411 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1697  putative ribonuclease BN  25.98 
 
 		 307 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.318237  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0703  YihY family protein  26.4 
 
 		 325 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.075214  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1883  putative ribonuclease BN  25.98 
 
 		 307 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.244601  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2276  putative ribonuclease BN  25.98 
 
 		 307 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2414  putative ribonuclease BN  25.98 
 
 		 304 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0744  putative ribonuclease  25.98 
 
 		 337 aa  77.4  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1675  putative ribonuclease BN  25.3 
 
 		 307 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.753662  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2157  ribonuclease BN  29.09 
 
 		 393 aa  74.7  0.000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2667  ribonuclease BN  27.08 
 
 		 302 aa  73.9  0.000000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0611062  normal  0.153348 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1291  ribonuclease BN  28.46 
 
 		 311 aa  72.4  0.000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.31772 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04098  ribonuclease BN  24.89 
 
 		 320 aa  72.4  0.00000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1738  ribonuclease BN  24.02 
 
 		 292 aa  71.2  0.00000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.554379  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2216  ribonuclease BN  28.19 
 
 		 303 aa  71.2  0.00000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.987558  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1806  ribonuclease BN  24.02 
 
 		 292 aa  70.1  0.00000000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0221  ribonuclease BN  25.84 
 
 		 334 aa  69.3  0.00000000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0258  ribonuclease BN  26.04 
 
 		 331 aa  68.6  0.0000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0324  ribonuclease BN  26.22 
 
 		 314 aa  64.3  0.000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.290543 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1517  ribonuclease BN  23.79 
 
 		 321 aa  63.5  0.000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3201  ribonuclease BN  23.26 
 
 		 309 aa  61.2  0.00000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.248041 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2352  ribonuclease BN  25.84 
 
 		 305 aa  59.7  0.00000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5700  ribonuclease BN  25.63 
 
 		 305 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0471671 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2696  ribonuclease BN  24.05 
 
 		 322 aa  57.4  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3407  ribonuclease BN  24.05 
 
 		 322 aa  57.4  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.57313  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0169  ribonuclease BN  25 
 
 		 305 aa  55.1  0.000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0417869  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0151  ribonuclease BN  24.82 
 
 		 305 aa  55.5  0.000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.688141  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2802  ribonuclease BN  33.33 
 
 		 368 aa  51.2  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3965  ribonuclease BN  22.03 
 
 		 306 aa  50.4  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0581  ribonuclease BN  25 
 
 		 446 aa  50.4  0.00004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000420999  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3782  putative ribonuclease BN  25.99 
 
 		 417 aa  50.4  0.00004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.747411  normal  0.886826 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0964  ribonuclease BN  25.29 
 
 		 285 aa  48.5  0.0002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.487515  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0594  ribonuclease BN  23.77 
 
 		 446 aa  47  0.0004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000174757 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4558  ribonuclease  23.44 
 
 		 411 aa  47  0.0004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.176119  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1264  membrane protein-like protein  29.33 
 
 		 311 aa  46.6  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51960  ribonuclease  23.08 
 
 		 411 aa  45.4  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000384323 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1606  putative ribonuclease BN  22.38 
 
 		 311 aa  45.8  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.945482  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3482  ribonuclease BN  24.41 
 
 		 292 aa  45.8  0.001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.384798 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1577  ribonuclease BN  31.76 
 
 		 294 aa  44.7  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.274703  normal  0.013095 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1902  YihY family protein  31.76 
 
 		 262 aa  44.3  0.003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.567508  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0609  ribonuclease BN  22.78 
 
 		 303 aa  43.5  0.004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0138634  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2769  putative ribonuclease BN  27.27 
 
 		 404 aa  43.5  0.004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0433853 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5884  ribonuclease BN  21.71 
 
 		 499 aa  43.5  0.004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0042  BrkB-like serum-resistance protein  23.42 
 
 		 294 aa  43.5  0.004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.363004  normal  0.262588 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0931  putative ribonuclease BN  22.97 
 
 		 459 aa  43.5  0.005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.810596 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2314  ribonuclease BN  22.63 
 
 		 297 aa  42.7  0.008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1406  ribonuclease BN  21.76 
 
 		 320 aa  42.7  0.008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.573356  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>