More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_3473 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013061  Phep_3473  ribonuclease BN  100 
 
 
324 aa  635    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.950669 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6562  ribonuclease BN  54.52 
 
 
347 aa  295  6e-79  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.357212  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2372  ribonuclease BN  53.42 
 
 
321 aa  292  5e-78  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.483691  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0412  ribonuclease BN  51.19 
 
 
317 aa  283  3.0000000000000004e-75  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6636  ribonuclease BN  48.38 
 
 
322 aa  275  1.0000000000000001e-72  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2801  ribonuclease BN  48.61 
 
 
307 aa  263  3e-69  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.128758 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1591  ribonuclease BN  45.33 
 
 
424 aa  254  1.0000000000000001e-66  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.884253 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2469  putative ribonuclease BN  47.54 
 
 
305 aa  240  2e-62  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.428751  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3408  ribonuclease BN  41.18 
 
 
299 aa  224  2e-57  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0329161  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0297  ribonuclease BN  42.45 
 
 
291 aa  219  6e-56  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.421979 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1876  ribonuclease BN  41.07 
 
 
306 aa  215  9e-55  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3921  putative ribonuclease BN  38.52 
 
 
360 aa  204  1e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00855127  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2533  ribonuclease BN  37.67 
 
 
311 aa  194  1e-48  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3922  ribonuclease BN  36.07 
 
 
370 aa  190  2.9999999999999997e-47  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.644027  normal  0.211181 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2225  ribonuclease BN  37 
 
 
298 aa  189  5e-47  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.681291  decreased coverage  0.00304933 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5809  ribonuclease BN, putative  36.33 
 
 
321 aa  189  5e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4029  ribonuclease BN  38.04 
 
 
316 aa  182  6e-45  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.394592 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1209  ribonuclease BN  38.13 
 
 
312 aa  178  1e-43  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3548  ribonuclease  37.41 
 
 
299 aa  176  5e-43  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0230388  normal  0.0399226 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2621  ribonuclease BN  34.21 
 
 
304 aa  172  7.999999999999999e-42  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4408  ribonuclease BN  34.07 
 
 
427 aa  170  4e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10418  hypothetical protein  34.33 
 
 
323 aa  168  1e-40  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.536635  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4599  ribonuclease BN  34.63 
 
 
341 aa  168  1e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.150471  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0967  ribonuclease BN  36.36 
 
 
300 aa  167  2e-40  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.89911  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5335  ribonuclease BN  34.55 
 
 
329 aa  166  4e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3764  ribonuclease BN  35.94 
 
 
329 aa  163  4.0000000000000004e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0316697  normal  0.101597 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3875  ribonuclease BN  35.94 
 
 
329 aa  163  4.0000000000000004e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS02223  putative ribonuclease RNase BN (RBN) transmembrane protein  38.49 
 
 
324 aa  161  1e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1947  ribonuclease BN  37.37 
 
 
299 aa  161  1e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.594213 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3877  ribonuclease BN  33.45 
 
 
310 aa  160  2e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3375  putative ribonuclease BN  33.45 
 
 
310 aa  160  3e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.594125 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1838  ribonuclease BN, putative  33.1 
 
 
301 aa  160  4e-38  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.787321  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4384  ribonuclease BN, putative  33.46 
 
 
314 aa  159  4e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3982  putative ribonuclease BN  33.46 
 
 
314 aa  159  4e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3546  ribonuclease BN  34.46 
 
 
308 aa  159  6e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0229297  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2102  ribonuclease BN  32.75 
 
 
311 aa  159  8e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.316673 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2153  ribonuclease BN, putative  34.31 
 
 
321 aa  159  9e-38  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2481  ribonuclease BN  31.62 
 
 
324 aa  157  2e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.541316  normal  0.806631 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2157  ribonuclease BN  36.03 
 
 
393 aa  156  4e-37  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4448  ribonuclease BN  32.97 
 
 
443 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0111149  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1291  ribonuclease BN  32.45 
 
 
311 aa  153  4e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.31772 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1669  ribonuclease BN, putative  34.73 
 
 
326 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4516  ribonuclease BN  32.63 
 
 
436 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.783235  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3481  ribonuclease BN family protein  32.88 
 
 
306 aa  142  8e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2216  ribonuclease BN  38.89 
 
 
303 aa  142  9.999999999999999e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.987558  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1806  ribonuclease BN  34.23 
 
 
292 aa  141  1.9999999999999998e-32  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1738  ribonuclease BN  34.23 
 
 
292 aa  141  1.9999999999999998e-32  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.554379  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0703  YihY family protein  31.13 
 
 
325 aa  138  1e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.075214  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0769  ribonuclease BN  33.2 
 
 
411 aa  138  1e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1675  putative ribonuclease BN  31.13 
 
 
307 aa  136  4e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.753662  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0744  putative ribonuclease  31.1 
 
 
337 aa  135  7.000000000000001e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2414  putative ribonuclease BN  31.1 
 
 
304 aa  135  9e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1697  putative ribonuclease BN  31.1 
 
 
307 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.318237  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2276  putative ribonuclease BN  31.1 
 
 
307 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1883  putative ribonuclease BN  31.1 
 
 
307 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.244601  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04098  ribonuclease BN  30.57 
 
 
320 aa  134  3e-30  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2352  ribonuclease BN  31.7 
 
 
305 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4026  ribonuclease BN  30.29 
 
 
302 aa  127  3e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.194003 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0324  ribonuclease BN  28.72 
 
 
314 aa  125  7e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.290543 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2667  ribonuclease BN  33.68 
 
 
302 aa  122  8e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0611062  normal  0.153348 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0077  ribonuclease BN  26.56 
 
 
307 aa  121  1.9999999999999998e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5700  ribonuclease BN  31.54 
 
 
305 aa  119  6e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0471671 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3282  ribonuclease BN  26.71 
 
 
306 aa  119  9.999999999999999e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.273153 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2561  ribonuclease RN  28.2 
 
 
276 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.842929  normal  0.307691 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0042  BrkB-like serum-resistance protein  27.24 
 
 
294 aa  112  8.000000000000001e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.363004  normal  0.262588 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3965  ribonuclease BN  30.54 
 
 
306 aa  108  1e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0258  ribonuclease BN  25.18 
 
 
331 aa  103  4e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3201  ribonuclease BN  28.41 
 
 
309 aa  102  8e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.248041 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3407  ribonuclease BN  29.31 
 
 
322 aa  101  1e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.57313  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2696  ribonuclease BN  29.31 
 
 
322 aa  101  1e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0221  ribonuclease BN  25.52 
 
 
334 aa  100  4e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1517  ribonuclease BN  27.24 
 
 
321 aa  100  4e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4558  ribonuclease  27.86 
 
 
411 aa  90.9  2e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.176119  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1406  ribonuclease BN  28.2 
 
 
320 aa  90.9  3e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.573356  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51960  ribonuclease  28.14 
 
 
411 aa  89.7  6e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000384323 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0320  ribonuclease BN  25.43 
 
 
323 aa  84.7  0.000000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2988  tRNA-processing RNAse BN  27.84 
 
 
405 aa  84.3  0.000000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0115566 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0319  ribonuclease BN  25.43 
 
 
323 aa  84  0.000000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0315  ribonuclease BN  25.43 
 
 
323 aa  84  0.000000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0314  ribonuclease BN  25.43 
 
 
323 aa  84.3  0.000000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.321317  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0169  ribonuclease BN  25.18 
 
 
305 aa  84  0.000000000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0417869  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1979  hypothetical protein  26.49 
 
 
479 aa  83.6  0.000000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0151  ribonuclease BN  25.18 
 
 
305 aa  83.2  0.000000000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.688141  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4401  ribonuclease BN  26.88 
 
 
295 aa  82.8  0.000000000000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1377  ribonuclease BN  27.44 
 
 
443 aa  82.4  0.000000000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.763301  normal  0.704772 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3545  ribonuclease BN  27.84 
 
 
285 aa  82.4  0.000000000000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.109526  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1337  putative ribonuclease BN  27.44 
 
 
443 aa  82.4  0.000000000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.500166  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36810  Ribonuclease BN-like protein  26.97 
 
 
408 aa  82  0.00000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2802  ribonuclease BN  28.12 
 
 
368 aa  81.6  0.00000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1793  ribonuclease BN  26.94 
 
 
442 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3448  ribonuclease BN  26.02 
 
 
313 aa  80.9  0.00000000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.016816  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4601  ribonuclease BN  24.91 
 
 
443 aa  80.1  0.00000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.996518 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3708  ribonuclease BN  25.71 
 
 
337 aa  80.5  0.00000000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.153225 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0311  ribonuclease BN  26.84 
 
 
337 aa  80.1  0.00000000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.415793 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0316  ribonuclease BN  25.71 
 
 
337 aa  79.7  0.00000000000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.293845  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0974  ribonuclease BN, putative  25.27 
 
 
442 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.315544  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1685  tRNA-processing ribonuclease BN  24.91 
 
 
437 aa  77.4  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.417952  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0942  ribonuclease BN  24.91 
 
 
437 aa  77.4  0.0000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1475  ribonuclease BN  24.91 
 
 
437 aa  77.4  0.0000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1862  ribonuclease BN  24.91 
 
 
437 aa  77.4  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.618695  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>