More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_2352 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010681  Bphyt_2352  ribonuclease BN  100 
 
 
305 aa  598  1e-170  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2481  ribonuclease BN  60.14 
 
 
324 aa  338  9e-92  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.541316  normal  0.806631 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1291  ribonuclease BN  64.89 
 
 
311 aa  337  9.999999999999999e-92  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.31772 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5700  ribonuclease BN  70.14 
 
 
305 aa  332  6e-90  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0471671 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4516  ribonuclease BN  52.29 
 
 
436 aa  258  1e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.783235  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0703  YihY family protein  52.34 
 
 
325 aa  255  5e-67  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.075214  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2414  putative ribonuclease BN  51.46 
 
 
304 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0744  putative ribonuclease  51.46 
 
 
337 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1697  putative ribonuclease BN  51.46 
 
 
307 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.318237  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1675  putative ribonuclease BN  51.46 
 
 
307 aa  253  2.0000000000000002e-66  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.753662  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1883  putative ribonuclease BN  51.46 
 
 
307 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.244601  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2276  putative ribonuclease BN  51.46 
 
 
307 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4599  ribonuclease BN  52.11 
 
 
341 aa  253  3e-66  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.150471  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3546  ribonuclease BN  51.34 
 
 
308 aa  250  2e-65  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0229297  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4384  ribonuclease BN, putative  51.34 
 
 
314 aa  251  2e-65  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3982  putative ribonuclease BN  51.34 
 
 
314 aa  251  2e-65  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4448  ribonuclease BN  49.82 
 
 
443 aa  247  2e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0111149  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2102  ribonuclease BN  50.57 
 
 
311 aa  246  3e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.316673 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3877  ribonuclease BN  47.69 
 
 
310 aa  241  1e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3375  putative ribonuclease BN  47.69 
 
 
310 aa  241  1e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.594125 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0769  ribonuclease BN  48.26 
 
 
411 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5809  ribonuclease BN, putative  36.3 
 
 
321 aa  183  4.0000000000000006e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1876  ribonuclease BN  37.74 
 
 
306 aa  173  3.9999999999999995e-42  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4029  ribonuclease BN  37.87 
 
 
316 aa  170  3e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.394592 
 
 
-
 
NC_003296  RS02223  putative ribonuclease RNase BN (RBN) transmembrane protein  40.52 
 
 
324 aa  161  1e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5335  ribonuclease BN  37.45 
 
 
329 aa  159  6e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3921  putative ribonuclease BN  31.95 
 
 
360 aa  158  8e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00855127  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0967  ribonuclease BN  37.59 
 
 
300 aa  158  1e-37  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.89911  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3764  ribonuclease BN  37.32 
 
 
329 aa  157  2e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0316697  normal  0.101597 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3875  ribonuclease BN  37.32 
 
 
329 aa  157  2e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2801  ribonuclease BN  33.58 
 
 
307 aa  156  3e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.128758 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0297  ribonuclease BN  33.58 
 
 
291 aa  154  1e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.421979 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4408  ribonuclease BN  36.03 
 
 
427 aa  152  8.999999999999999e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3473  ribonuclease BN  31.7 
 
 
324 aa  150  3e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.950669 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0412  ribonuclease BN  28.89 
 
 
317 aa  149  5e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1591  ribonuclease BN  32.95 
 
 
424 aa  149  5e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.884253 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3408  ribonuclease BN  32.58 
 
 
299 aa  147  2.0000000000000003e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0329161  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2372  ribonuclease BN  34.08 
 
 
321 aa  147  2.0000000000000003e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.483691  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6562  ribonuclease BN  33.82 
 
 
347 aa  146  5e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.357212  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2469  putative ribonuclease BN  31.5 
 
 
305 aa  145  1e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.428751  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6636  ribonuclease BN  30.56 
 
 
322 aa  144  3e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2153  ribonuclease BN, putative  36.09 
 
 
321 aa  142  7e-33  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2533  ribonuclease BN  31.11 
 
 
311 aa  140  3.9999999999999997e-32  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1738  ribonuclease BN  33.58 
 
 
292 aa  139  4.999999999999999e-32  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.554379  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1806  ribonuclease BN  33.58 
 
 
292 aa  138  8.999999999999999e-32  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10418  hypothetical protein  30.42 
 
 
323 aa  137  3.0000000000000003e-31  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.536635  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2225  ribonuclease BN  32.69 
 
 
298 aa  135  6.0000000000000005e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.681291  decreased coverage  0.00304933 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3922  ribonuclease BN  30.53 
 
 
370 aa  132  6.999999999999999e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.644027  normal  0.211181 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04098  ribonuclease BN  35 
 
 
320 aa  131  1.0000000000000001e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2216  ribonuclease BN  37.17 
 
 
303 aa  130  4.0000000000000003e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.987558  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1209  ribonuclease BN  33.08 
 
 
312 aa  129  6e-29  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2667  ribonuclease BN  33.78 
 
 
302 aa  128  1.0000000000000001e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0611062  normal  0.153348 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1947  ribonuclease BN  29.66 
 
 
299 aa  125  6e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.594213 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2157  ribonuclease BN  34.24 
 
 
393 aa  124  2e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1669  ribonuclease BN, putative  33.83 
 
 
326 aa  121  9.999999999999999e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0324  ribonuclease BN  32.2 
 
 
314 aa  116  3.9999999999999997e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.290543 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2621  ribonuclease BN  28.68 
 
 
304 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3548  ribonuclease  25.83 
 
 
299 aa  112  1.0000000000000001e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0230388  normal  0.0399226 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0258  ribonuclease BN  31.32 
 
 
331 aa  109  5e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1838  ribonuclease BN, putative  30.92 
 
 
301 aa  106  5e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.787321  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1517  ribonuclease BN  32.12 
 
 
321 aa  102  9e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3481  ribonuclease BN family protein  31.23 
 
 
306 aa  96.7  4e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0042  BrkB-like serum-resistance protein  30.96 
 
 
294 aa  95.5  1e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.363004  normal  0.262588 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0221  ribonuclease BN  31.27 
 
 
334 aa  94  3e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3282  ribonuclease BN  25.93 
 
 
306 aa  91.3  2e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.273153 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3201  ribonuclease BN  30.45 
 
 
309 aa  87  3e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.248041 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0151  ribonuclease BN  30.6 
 
 
305 aa  83.2  0.000000000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.688141  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0169  ribonuclease BN  30.6 
 
 
305 aa  83.2  0.000000000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0417869  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3482  ribonuclease BN  25.27 
 
 
292 aa  78.2  0.0000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.384798 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1670  ribonuclease BN  25.95 
 
 
403 aa  74.7  0.000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.926786  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0302  ribonuclease BN  25.82 
 
 
298 aa  73.6  0.000000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.223678  hitchhiker  0.000000133239 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4141  putative ribonuclease BN  25.17 
 
 
320 aa  73.2  0.000000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3909  ribonuclease BN  23.4 
 
 
340 aa  71.6  0.00000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4618  ribonuclease BN  25.09 
 
 
336 aa  70.9  0.00000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.331921  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2060  ribonuclease BN, putative  27.86 
 
 
318 aa  71.2  0.00000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.670045  normal  0.582678 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0751  ribonuclease BN, putative  29.14 
 
 
328 aa  70.9  0.00000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.232287  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2561  ribonuclease RN  21.51 
 
 
276 aa  70.1  0.00000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.842929  normal  0.307691 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0389  putative ribonuclease BN  24.13 
 
 
289 aa  69.3  0.00000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001900  ribonuclease BN  25.54 
 
 
314 aa  69.3  0.00000000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.886374  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0523  ribonuclease BN, putative  23.78 
 
 
289 aa  68.6  0.0000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0395  ribonuclease BN  23.78 
 
 
289 aa  68.6  0.0000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0386  ribonuclease BN  23.78 
 
 
289 aa  68.6  0.0000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0383  ribonuclease BN  23.78 
 
 
289 aa  68.6  0.0000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0523  YihY family protein  23.78 
 
 
289 aa  68.6  0.0000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0409  ribonuclease BN  23.78 
 
 
289 aa  68.6  0.0000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2769  putative ribonuclease BN  27.44 
 
 
404 aa  68.6  0.0000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0433853 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2988  tRNA-processing RNAse BN  26.01 
 
 
405 aa  68.2  0.0000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0115566 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0395  putative ribonuclease BN  23.05 
 
 
289 aa  68.2  0.0000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1434  ribonuclease BN  27.17 
 
 
442 aa  67  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.50654  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3448  ribonuclease BN  24.2 
 
 
313 aa  66.6  0.0000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.016816  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3965  ribonuclease BN  23.94 
 
 
306 aa  67  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0974  ribonuclease BN, putative  27.17 
 
 
442 aa  66.6  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.315544  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1456  putative ribonuclease BN  27.17 
 
 
442 aa  67  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1793  ribonuclease BN  25.45 
 
 
442 aa  66.6  0.0000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3545  ribonuclease BN  24.18 
 
 
285 aa  66.6  0.0000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.109526  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2523  ribonuclease BN  23.66 
 
 
349 aa  66.2  0.0000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.861907  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00917  putative ribonuclease protein  22.76 
 
 
317 aa  66.2  0.0000000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1131  tRNA-processing RNAse BN  25.45 
 
 
447 aa  66.2  0.0000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0120336  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0453  YihY family protein  24.13 
 
 
286 aa  65.9  0.0000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0345  putative ribonuclease BN  22.46 
 
 
377 aa  65.1  0.000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>