258 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_5700 on replicon NC_010625
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010625  Bphy_5700  ribonuclease BN  100 
 
 		 305 aa  596  1e-169  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0471671 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2352  ribonuclease BN  71.06 
 
 		 305 aa  349  3e-95  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2481  ribonuclease BN  60.21 
 
 		 324 aa  326  3e-88  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.541316  normal  0.806631 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1291  ribonuclease BN  64.93 
 
 		 311 aa  322  5e-87  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.31772 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4516  ribonuclease BN  54.2 
 
 		 436 aa  265  5.999999999999999e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.783235  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0703  YihY family protein  56.32 
 
 		 325 aa  265  8.999999999999999e-70  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.075214  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3877  ribonuclease BN  53.36 
 
 		 310 aa  264  1e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3375  putative ribonuclease BN  53.36 
 
 		 310 aa  264  1e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.594125 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4599  ribonuclease BN  54.58 
 
 		 341 aa  263  3e-69  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.150471  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4448  ribonuclease BN  54.06 
 
 		 443 aa  262  4.999999999999999e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0111149  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0744  putative ribonuclease  55.77 
 
 		 337 aa  259  3e-68  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2276  putative ribonuclease BN  55.77 
 
 		 307 aa  259  3e-68  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4384  ribonuclease BN, putative  53.05 
 
 		 314 aa  259  3e-68  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3982  putative ribonuclease BN  53.05 
 
 		 314 aa  259  3e-68  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1697  putative ribonuclease BN  55.77 
 
 		 307 aa  259  4e-68  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.318237  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1883  putative ribonuclease BN  55.77 
 
 		 307 aa  259  4e-68  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.244601  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2414  putative ribonuclease BN  55.77 
 
 		 304 aa  259  5.0000000000000005e-68  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1675  putative ribonuclease BN  55.77 
 
 		 307 aa  259  5.0000000000000005e-68  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.753662  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3546  ribonuclease BN  52.49 
 
 		 308 aa  258  1e-67  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0229297  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2102  ribonuclease BN  52.29 
 
 		 311 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.316673 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0769  ribonuclease BN  54.98 
 
 		 411 aa  241  9e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5809  ribonuclease BN, putative  37.06 
 
 		 321 aa  192  6e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1876  ribonuclease BN  37.12 
 
 		 306 aa  172  5e-42  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3764  ribonuclease BN  38.76 
 
 		 329 aa  172  5.999999999999999e-42  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0316697  normal  0.101597 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3875  ribonuclease BN  38.76 
 
 		 329 aa  172  5.999999999999999e-42  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0967  ribonuclease BN  38.43 
 
 		 300 aa  171  9e-42  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.89911  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4029  ribonuclease BN  38.87 
 
 		 316 aa  170  3e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.394592 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5335  ribonuclease BN  39.76 
 
 		 329 aa  166  4e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02223  putative ribonuclease RNase BN (RBN) transmembrane protein  41.54 
 
 		 324 aa  164  2.0000000000000002e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3921  putative ribonuclease BN  31.72 
 
 		 360 aa  160  3e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00855127  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4408  ribonuclease BN  36.84 
 
 		 427 aa  160  4e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0297  ribonuclease BN  31.48 
 
 		 291 aa  158  1e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.421979 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2372  ribonuclease BN  32.54 
 
 		 321 aa  156  4e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.483691  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2801  ribonuclease BN  33.33 
 
 		 307 aa  155  1e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.128758 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6562  ribonuclease BN  33.22 
 
 		 347 aa  152  7e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.357212  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3473  ribonuclease BN  31.54 
 
 		 324 aa  152  7e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.950669 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3408  ribonuclease BN  33.33 
 
 		 299 aa  152  8e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0329161  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2153  ribonuclease BN, putative  34.96 
 
 		 321 aa  149  4e-35  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1591  ribonuclease BN  30 
 
 		 424 aa  149  4e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.884253 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2533  ribonuclease BN  32.55 
 
 		 311 aa  147  2.0000000000000003e-34  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1209  ribonuclease BN  32.44 
 
 		 312 aa  144  2e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3922  ribonuclease BN  31.7 
 
 		 370 aa  140  1.9999999999999998e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.644027  normal  0.211181 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2469  putative ribonuclease BN  28.76 
 
 		 305 aa  139  4.999999999999999e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.428751  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0412  ribonuclease BN  28.97 
 
 		 317 aa  138  1e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2216  ribonuclease BN  39.16 
 
 		 303 aa  137  2e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.987558  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6636  ribonuclease BN  30.86 
 
 		 322 aa  136  5e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1838  ribonuclease BN, putative  34.63 
 
 		 301 aa  135  7.000000000000001e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.787321  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1669  ribonuclease BN, putative  38.03 
 
 		 326 aa  132  5e-30  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1947  ribonuclease BN  30.18 
 
 		 299 aa  130  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.594213 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2621  ribonuclease BN  30.04 
 
 		 304 aa  131  2.0000000000000002e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2225  ribonuclease BN  31.54 
 
 		 298 aa  129  5.0000000000000004e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.681291  decreased coverage  0.00304933 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1806  ribonuclease BN  33.09 
 
 		 292 aa  129  6e-29  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1738  ribonuclease BN  33.09 
 
 		 292 aa  129  7.000000000000001e-29  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.554379  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04098  ribonuclease BN  35.06 
 
 		 320 aa  128  1.0000000000000001e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10418  hypothetical protein  27.17 
 
 		 323 aa  121  9.999999999999999e-27  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.536635  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2667  ribonuclease BN  33.22 
 
 		 302 aa  120  3e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0611062  normal  0.153348 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0324  ribonuclease BN  31.84 
 
 		 314 aa  119  7e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.290543 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3548  ribonuclease  27.24 
 
 		 299 aa  114  2.0000000000000002e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0230388  normal  0.0399226 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2157  ribonuclease BN  32.17 
 
 		 393 aa  108  1e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3481  ribonuclease BN family protein  33.72 
 
 		 306 aa  106  5e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0042  BrkB-like serum-resistance protein  33.46 
 
 		 294 aa  105  1e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.363004  normal  0.262588 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0258  ribonuclease BN  30.53 
 
 		 331 aa  102  1e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1517  ribonuclease BN  31.77 
 
 		 321 aa  97.8  2e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3282  ribonuclease BN  22.11 
 
 		 306 aa  90.1  4e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.273153 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0221  ribonuclease BN  34.18 
 
 		 334 aa  88.6  1e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3201  ribonuclease BN  30.13 
 
 		 309 aa  87.8  2e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.248041 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0151  ribonuclease BN  35.29 
 
 		 305 aa  83.6  0.000000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.688141  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0169  ribonuclease BN  35.29 
 
 		 305 aa  83.2  0.000000000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0417869  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2769  putative ribonuclease BN  30.04 
 
 		 404 aa  76.3  0.0000000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0433853 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1422  putative ribonuclease BN transmembrane protein  28.63 
 
 		 416 aa  75.9  0.0000000000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00924301 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03771  ribonuclease BN  26.44 
 
 		 290 aa  75.9  0.0000000000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.841593  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4100  ribonuclease BN  26.44 
 
 		 290 aa  75.9  0.0000000000009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4271  ribonuclease BN  26.44 
 
 		 290 aa  75.9  0.0000000000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4132  ribonuclease BN  26.44 
 
 		 290 aa  75.9  0.0000000000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4364  ribonuclease BN  26.44 
 
 		 290 aa  75.9  0.0000000000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4111  ribonuclease BN  26.44 
 
 		 290 aa  75.9  0.0000000000009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.235548  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03720  hypothetical protein  26.44 
 
 		 290 aa  75.9  0.0000000000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.664641  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4409  ribonuclease BN  26.44 
 
 		 290 aa  75.9  0.0000000000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5333  ribonuclease BN  26.44 
 
 		 290 aa  75.9  0.0000000000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.247154 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3965  ribonuclease BN  22.3 
 
 		 306 aa  74.3  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4305  ribonuclease BN  25.82 
 
 		 290 aa  72.8  0.000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.269266  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4238  ribonuclease BN  25.82 
 
 		 290 aa  72.8  0.000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.89383  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4260  ribonuclease BN  25.82 
 
 		 290 aa  72.8  0.000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4351  ribonuclease BN  25.82 
 
 		 290 aa  72.8  0.000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4416  ribonuclease BN  25.82 
 
 		 290 aa  72.8  0.000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1670  ribonuclease BN  26.54 
 
 		 403 aa  72  0.00000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.926786  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2561  ribonuclease RN  22.26 
 
 		 276 aa  71.2  0.00000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.842929  normal  0.307691 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3115  ribonuclease BN  27.15 
 
 		 321 aa  70.1  0.00000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.985292  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0077  ribonuclease BN  21.58 
 
 		 307 aa  69.7  0.00000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1131  tRNA-processing RNAse BN  26.6 
 
 		 447 aa  69.7  0.00000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0120336  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1830  ribonuclease BN, putative  27.27 
 
 		 404 aa  67  0.0000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0291213 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0138  putative ribonuclease BN  23.15 
 
 		 371 aa  67  0.0000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.674179  normal  0.0540864 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0964  ribonuclease BN  27.06 
 
 		 285 aa  67  0.0000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.487515  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0395  putative ribonuclease BN  23.93 
 
 		 289 aa  65.5  0.000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0974  ribonuclease BN, putative  26.37 
 
 		 442 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.315544  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0453  YihY family protein  23.4 
 
 		 286 aa  64.3  0.000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3782  putative ribonuclease BN  27.65 
 
 		 417 aa  64.3  0.000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.747411  normal  0.886826 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0523  ribonuclease BN, putative  23.96 
 
 		 289 aa  63.9  0.000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0383  ribonuclease BN  23.96 
 
 		 289 aa  63.9  0.000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4618  ribonuclease BN  24.56 
 
 		 336 aa  63.9  0.000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.331921  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>