More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_6636 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013132  Cpin_6636  ribonuclease BN  100 
 
 
322 aa  642    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2372  ribonuclease BN  60.38 
 
 
321 aa  393  1e-108  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.483691  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6562  ribonuclease BN  58.79 
 
 
347 aa  381  1e-104  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.357212  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0412  ribonuclease BN  52.9 
 
 
317 aa  326  3e-88  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1591  ribonuclease BN  46.89 
 
 
424 aa  300  3e-80  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.884253 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3473  ribonuclease BN  48.38 
 
 
324 aa  290  2e-77  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.950669 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2801  ribonuclease BN  46.98 
 
 
307 aa  290  2e-77  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.128758 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2469  putative ribonuclease BN  48.14 
 
 
305 aa  287  2e-76  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.428751  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1876  ribonuclease BN  43.3 
 
 
306 aa  263  3e-69  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0297  ribonuclease BN  42.96 
 
 
291 aa  240  2.9999999999999997e-62  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.421979 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3921  putative ribonuclease BN  42.24 
 
 
360 aa  238  8e-62  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00855127  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3408  ribonuclease BN  41.69 
 
 
299 aa  238  1e-61  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0329161  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5809  ribonuclease BN, putative  41.33 
 
 
321 aa  222  7e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4029  ribonuclease BN  36.51 
 
 
316 aa  215  8e-55  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.394592 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10418  hypothetical protein  37.19 
 
 
323 aa  214  9.999999999999999e-55  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.536635  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0967  ribonuclease BN  39.15 
 
 
300 aa  214  1.9999999999999998e-54  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.89911  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2621  ribonuclease BN  37 
 
 
304 aa  213  3.9999999999999995e-54  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3548  ribonuclease  39.46 
 
 
299 aa  207  2e-52  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0230388  normal  0.0399226 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4408  ribonuclease BN  37.73 
 
 
427 aa  206  5e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2153  ribonuclease BN, putative  40.07 
 
 
321 aa  204  2e-51  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2225  ribonuclease BN  35.92 
 
 
298 aa  199  5e-50  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.681291  decreased coverage  0.00304933 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3922  ribonuclease BN  35.39 
 
 
370 aa  199  6e-50  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.644027  normal  0.211181 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5335  ribonuclease BN  42.22 
 
 
329 aa  195  9e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1838  ribonuclease BN, putative  37.33 
 
 
301 aa  194  2e-48  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.787321  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3764  ribonuclease BN  38.51 
 
 
329 aa  192  5e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0316697  normal  0.101597 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3875  ribonuclease BN  38.51 
 
 
329 aa  192  5e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS02223  putative ribonuclease RNase BN (RBN) transmembrane protein  39.58 
 
 
324 aa  191  1e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1947  ribonuclease BN  39.64 
 
 
299 aa  191  1e-47  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.594213 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1209  ribonuclease BN  41.95 
 
 
312 aa  190  2e-47  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2533  ribonuclease BN  32.9 
 
 
311 aa  186  5e-46  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2157  ribonuclease BN  35.03 
 
 
393 aa  179  5.999999999999999e-44  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3481  ribonuclease BN family protein  34.2 
 
 
306 aa  176  5e-43  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2216  ribonuclease BN  39.78 
 
 
303 aa  174  9.999999999999999e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.987558  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1669  ribonuclease BN, putative  31.35 
 
 
326 aa  172  6.999999999999999e-42  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2481  ribonuclease BN  30.1 
 
 
324 aa  170  3e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.541316  normal  0.806631 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4599  ribonuclease BN  32.09 
 
 
341 aa  167  2e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.150471  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0703  YihY family protein  33.98 
 
 
325 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.075214  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4448  ribonuclease BN  31.48 
 
 
443 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0111149  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2102  ribonuclease BN  30.14 
 
 
311 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.316673 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3546  ribonuclease BN  31.32 
 
 
308 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0229297  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3877  ribonuclease BN  31.16 
 
 
310 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3375  putative ribonuclease BN  32.12 
 
 
310 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.594125 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1883  putative ribonuclease BN  33.6 
 
 
307 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.244601  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1697  putative ribonuclease BN  33.6 
 
 
307 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.318237  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2276  putative ribonuclease BN  33.6 
 
 
307 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2414  putative ribonuclease BN  33.6 
 
 
304 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0744  putative ribonuclease  33.6 
 
 
337 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4384  ribonuclease BN, putative  30.94 
 
 
314 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3982  putative ribonuclease BN  30.94 
 
 
314 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1675  putative ribonuclease BN  33.6 
 
 
307 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.753662  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2667  ribonuclease BN  33.56 
 
 
302 aa  160  4e-38  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0611062  normal  0.153348 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1291  ribonuclease BN  32.08 
 
 
311 aa  154  2e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.31772 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4516  ribonuclease BN  29.89 
 
 
436 aa  151  1e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.783235  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0769  ribonuclease BN  32.17 
 
 
411 aa  150  3e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3282  ribonuclease BN  28.42 
 
 
306 aa  145  8.000000000000001e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.273153 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2561  ribonuclease RN  32.43 
 
 
276 aa  144  2e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.842929  normal  0.307691 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2352  ribonuclease BN  30.56 
 
 
305 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4026  ribonuclease BN  28.43 
 
 
302 aa  136  4e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.194003 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04098  ribonuclease BN  29.27 
 
 
320 aa  132  1.0000000000000001e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1738  ribonuclease BN  30.88 
 
 
292 aa  130  3e-29  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.554379  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1806  ribonuclease BN  30.88 
 
 
292 aa  130  3e-29  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0077  ribonuclease BN  27.72 
 
 
307 aa  129  8.000000000000001e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0221  ribonuclease BN  29.93 
 
 
334 aa  127  3e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0258  ribonuclease BN  29.89 
 
 
331 aa  122  7e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1517  ribonuclease BN  30.17 
 
 
321 aa  122  7e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5700  ribonuclease BN  30.86 
 
 
305 aa  119  6e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0471671 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0042  BrkB-like serum-resistance protein  26.22 
 
 
294 aa  118  9.999999999999999e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.363004  normal  0.262588 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0324  ribonuclease BN  28.72 
 
 
314 aa  114  3e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.290543 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3201  ribonuclease BN  30.18 
 
 
309 aa  113  4.0000000000000004e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.248041 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0151  ribonuclease BN  30.88 
 
 
305 aa  111  2.0000000000000002e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.688141  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0169  ribonuclease BN  30.88 
 
 
305 aa  110  3e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0417869  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2802  ribonuclease BN  28.97 
 
 
368 aa  104  2e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2696  ribonuclease BN  28.42 
 
 
322 aa  102  1e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3965  ribonuclease BN  30.04 
 
 
306 aa  102  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1406  ribonuclease BN  29.24 
 
 
320 aa  102  1e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.573356  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3407  ribonuclease BN  28.42 
 
 
322 aa  102  1e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.57313  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1577  ribonuclease BN  26.82 
 
 
294 aa  89.7  5e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.274703  normal  0.013095 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1902  YihY family protein  28.36 
 
 
262 aa  88.6  1e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.567508  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0345  putative ribonuclease BN  24.55 
 
 
377 aa  83.6  0.000000000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4350  ribonuclease BN  25.29 
 
 
316 aa  82.4  0.00000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4678  ribonuclease BN  24.41 
 
 
347 aa  78.2  0.0000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0366951  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2075  ribonuclease BN  20.98 
 
 
328 aa  75.1  0.000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2988  tRNA-processing RNAse BN  24.49 
 
 
405 aa  75.1  0.000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0115566 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1932  ribonuclease BN  22.78 
 
 
363 aa  75.1  0.000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0559  ribonuclease BN  26.55 
 
 
402 aa  73.6  0.000000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0311  ribonuclease BN  22.43 
 
 
337 aa  72.8  0.000000000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.415793 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3545  ribonuclease BN  22.45 
 
 
285 aa  72.8  0.000000000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.109526  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1073  ribonuclease BN  26.25 
 
 
328 aa  72.4  0.000000000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3708  ribonuclease BN  22.43 
 
 
337 aa  72.4  0.000000000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.153225 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4558  ribonuclease  25.36 
 
 
411 aa  72  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.176119  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1377  ribonuclease BN  24.22 
 
 
443 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.763301  normal  0.704772 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1793  ribonuclease BN  24.36 
 
 
442 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51960  ribonuclease  25.36 
 
 
411 aa  71.2  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000384323 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2523  ribonuclease BN  21.48 
 
 
349 aa  70.9  0.00000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.861907  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4401  ribonuclease BN  22.81 
 
 
295 aa  70.9  0.00000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0302  ribonuclease BN  23.69 
 
 
298 aa  70.9  0.00000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.223678  hitchhiker  0.000000133239 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2314  ribonuclease BN  23.94 
 
 
297 aa  70.9  0.00000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0316  ribonuclease BN  22.05 
 
 
337 aa  70.5  0.00000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.293845  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1337  putative ribonuclease BN  24.22 
 
 
443 aa  70.9  0.00000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.500166  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1597  ribonuclease BN, putative  26.74 
 
 
323 aa  70.5  0.00000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.294731  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>