More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_3408 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007413  Ava_3408  ribonuclease BN  100 
 
 
299 aa  591  1e-168  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0329161  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0297  ribonuclease BN  65.98 
 
 
291 aa  399  9.999999999999999e-111  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.421979 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1876  ribonuclease BN  56.76 
 
 
306 aa  342  5e-93  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3921  putative ribonuclease BN  55.56 
 
 
360 aa  312  2.9999999999999996e-84  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00855127  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4029  ribonuclease BN  48.66 
 
 
316 aa  283  2.0000000000000002e-75  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.394592 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1947  ribonuclease BN  52.14 
 
 
299 aa  268  1e-70  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.594213 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0967  ribonuclease BN  46.43 
 
 
300 aa  263  2e-69  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.89911  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0412  ribonuclease BN  44.67 
 
 
317 aa  260  2e-68  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6562  ribonuclease BN  45.67 
 
 
347 aa  258  8e-68  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.357212  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2469  putative ribonuclease BN  45.7 
 
 
305 aa  254  2.0000000000000002e-66  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.428751  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2372  ribonuclease BN  44.98 
 
 
321 aa  252  6e-66  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.483691  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2153  ribonuclease BN, putative  47.18 
 
 
321 aa  245  4.9999999999999997e-64  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2801  ribonuclease BN  42.36 
 
 
307 aa  243  3.9999999999999997e-63  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.128758 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5809  ribonuclease BN, putative  44.69 
 
 
321 aa  243  3.9999999999999997e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1669  ribonuclease BN, putative  50.52 
 
 
326 aa  241  1e-62  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4408  ribonuclease BN  47.43 
 
 
427 aa  238  1e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2216  ribonuclease BN  49.82 
 
 
303 aa  237  2e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.987558  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1591  ribonuclease BN  41.58 
 
 
424 aa  236  3e-61  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.884253 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1209  ribonuclease BN  44.15 
 
 
312 aa  236  3e-61  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3473  ribonuclease BN  41.18 
 
 
324 aa  231  9e-60  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.950669 
 
 
-
 
NC_003296  RS02223  putative ribonuclease RNase BN (RBN) transmembrane protein  45.71 
 
 
324 aa  231  1e-59  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2533  ribonuclease BN  41.01 
 
 
311 aa  229  3e-59  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3875  ribonuclease BN  47.23 
 
 
329 aa  229  5e-59  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3764  ribonuclease BN  47.23 
 
 
329 aa  229  5e-59  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0316697  normal  0.101597 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6636  ribonuclease BN  41.69 
 
 
322 aa  228  9e-59  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2225  ribonuclease BN  44.69 
 
 
298 aa  227  2e-58  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.681291  decreased coverage  0.00304933 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1838  ribonuclease BN, putative  45.05 
 
 
301 aa  221  9.999999999999999e-57  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.787321  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5335  ribonuclease BN  44.84 
 
 
329 aa  213  1.9999999999999998e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2621  ribonuclease BN  41.99 
 
 
304 aa  210  2e-53  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3548  ribonuclease  43.12 
 
 
299 aa  210  2e-53  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0230388  normal  0.0399226 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3922  ribonuclease BN  39.32 
 
 
370 aa  209  3e-53  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.644027  normal  0.211181 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10418  hypothetical protein  40.07 
 
 
323 aa  206  4e-52  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.536635  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4599  ribonuclease BN  40.36 
 
 
341 aa  205  9e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.150471  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2102  ribonuclease BN  40.07 
 
 
311 aa  204  2e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.316673 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3877  ribonuclease BN  38.18 
 
 
310 aa  202  4e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4384  ribonuclease BN, putative  40.82 
 
 
314 aa  202  7e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3546  ribonuclease BN  40.82 
 
 
308 aa  202  7e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0229297  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3982  putative ribonuclease BN  40.82 
 
 
314 aa  202  7e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3375  putative ribonuclease BN  37.84 
 
 
310 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.594125 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0703  YihY family protein  39.08 
 
 
325 aa  194  2e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.075214  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4448  ribonuclease BN  37.55 
 
 
443 aa  191  1e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0111149  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1883  putative ribonuclease BN  39.15 
 
 
307 aa  191  2e-47  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.244601  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1697  putative ribonuclease BN  39.15 
 
 
307 aa  191  2e-47  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.318237  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0744  putative ribonuclease  39.15 
 
 
337 aa  191  2e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2276  putative ribonuclease BN  39.15 
 
 
307 aa  191  2e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2414  putative ribonuclease BN  39.15 
 
 
304 aa  190  2e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1675  putative ribonuclease BN  39.15 
 
 
307 aa  190  2e-47  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.753662  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4516  ribonuclease BN  36.33 
 
 
436 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.783235  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0769  ribonuclease BN  39.3 
 
 
411 aa  188  8e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2481  ribonuclease BN  35 
 
 
324 aa  186  3e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.541316  normal  0.806631 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3481  ribonuclease BN family protein  43.73 
 
 
306 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2157  ribonuclease BN  39.01 
 
 
393 aa  174  1.9999999999999998e-42  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2667  ribonuclease BN  34.8 
 
 
302 aa  173  2.9999999999999996e-42  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0611062  normal  0.153348 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1291  ribonuclease BN  35.77 
 
 
311 aa  171  1e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.31772 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1806  ribonuclease BN  37.34 
 
 
292 aa  162  8.000000000000001e-39  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1738  ribonuclease BN  38.07 
 
 
292 aa  160  3e-38  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.554379  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0042  BrkB-like serum-resistance protein  35.66 
 
 
294 aa  155  9e-37  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.363004  normal  0.262588 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04098  ribonuclease BN  36.41 
 
 
320 aa  152  5.9999999999999996e-36  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0258  ribonuclease BN  33.88 
 
 
331 aa  151  1e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0221  ribonuclease BN  34.89 
 
 
334 aa  148  1.0000000000000001e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2802  ribonuclease BN  36.51 
 
 
368 aa  147  1.0000000000000001e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0324  ribonuclease BN  32.6 
 
 
314 aa  147  3e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.290543 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1517  ribonuclease BN  33.57 
 
 
321 aa  143  4e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2561  ribonuclease RN  29.71 
 
 
276 aa  139  3.9999999999999997e-32  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.842929  normal  0.307691 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3201  ribonuclease BN  34.05 
 
 
309 aa  139  4.999999999999999e-32  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.248041 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2352  ribonuclease BN  33.83 
 
 
305 aa  137  2e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0151  ribonuclease BN  37.16 
 
 
305 aa  133  5e-30  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.688141  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0169  ribonuclease BN  37.16 
 
 
305 aa  132  5e-30  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0417869  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5700  ribonuclease BN  33.33 
 
 
305 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0471671 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3282  ribonuclease BN  27.96 
 
 
306 aa  122  6e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.273153 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0077  ribonuclease BN  27.89 
 
 
307 aa  122  6e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4026  ribonuclease BN  29.12 
 
 
302 aa  120  3e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.194003 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3965  ribonuclease BN  30.32 
 
 
306 aa  118  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2696  ribonuclease BN  29.55 
 
 
322 aa  114  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3407  ribonuclease BN  29.55 
 
 
322 aa  114  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.57313  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1932  ribonuclease BN  25.66 
 
 
363 aa  95.1  1e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1406  ribonuclease BN  22.81 
 
 
320 aa  91.7  1e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.573356  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4558  ribonuclease  28.06 
 
 
411 aa  87.4  3e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.176119  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51960  ribonuclease  28.06 
 
 
411 aa  87.4  3e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000384323 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2988  tRNA-processing RNAse BN  28.01 
 
 
405 aa  85.1  0.000000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0115566 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1131  tRNA-processing RNAse BN  26.57 
 
 
447 aa  84.3  0.000000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0120336  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1831  ribonuclease BN, putative  25.99 
 
 
341 aa  84.7  0.000000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.630422  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0704  putative ribonuclease BN  26.34 
 
 
451 aa  82  0.00000000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.71296  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0281  YihY family protein  24.91 
 
 
283 aa  81.6  0.00000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0425  putative ribonuclease BN  27.59 
 
 
300 aa  81.3  0.00000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.250516  normal  0.726297 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2523  ribonuclease BN  24.27 
 
 
349 aa  80.5  0.00000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.861907  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0272  YihY family protein  24.54 
 
 
283 aa  79.3  0.00000000000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.975594  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4092  ribonuclease BN  28.68 
 
 
290 aa  79.3  0.00000000000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4618  ribonuclease BN  25.52 
 
 
336 aa  79  0.00000000000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.331921  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3482  ribonuclease BN  28.16 
 
 
292 aa  78.6  0.0000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.384798 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4601  ribonuclease BN  26.35 
 
 
443 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.996518 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1337  putative ribonuclease BN  25.99 
 
 
443 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.500166  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1377  ribonuclease BN  25.99 
 
 
443 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.763301  normal  0.704772 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0974  ribonuclease BN, putative  27.44 
 
 
442 aa  76.6  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.315544  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0389  putative ribonuclease BN  22.53 
 
 
289 aa  76.6  0.0000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1434  ribonuclease BN  27.08 
 
 
442 aa  75.9  0.0000000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.50654  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0302  ribonuclease BN  26.62 
 
 
298 aa  75.9  0.0000000000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.223678  hitchhiker  0.000000133239 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1421  ribonuclease BN, putative  24.91 
 
 
392 aa  75.9  0.0000000000008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1456  putative ribonuclease BN  27.08 
 
 
442 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1862  ribonuclease BN  26.12 
 
 
437 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.618695  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>