More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_B2102 on replicon NC_007511
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007511  Bcep18194_B2102  ribonuclease BN  100 
 
 
311 aa  606  9.999999999999999e-173  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.316673 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3546  ribonuclease BN  92.6 
 
 
308 aa  544  1e-154  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0229297  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4384  ribonuclease BN, putative  93.63 
 
 
314 aa  545  1e-154  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3982  putative ribonuclease BN  93.63 
 
 
314 aa  545  1e-154  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3877  ribonuclease BN  86.82 
 
 
310 aa  520  1e-146  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3375  putative ribonuclease BN  86.5 
 
 
310 aa  517  1.0000000000000001e-145  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.594125 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4599  ribonuclease BN  81.54 
 
 
341 aa  509  1e-143  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.150471  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0703  YihY family protein  77.54 
 
 
325 aa  414  1e-114  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.075214  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1697  putative ribonuclease BN  76 
 
 
307 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.318237  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0744  putative ribonuclease  76 
 
 
337 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1883  putative ribonuclease BN  76 
 
 
307 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.244601  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2276  putative ribonuclease BN  76 
 
 
307 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1675  putative ribonuclease BN  76 
 
 
307 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.753662  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2414  putative ribonuclease BN  76.1 
 
 
304 aa  403  1e-111  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4516  ribonuclease BN  69.29 
 
 
436 aa  375  1e-103  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.783235  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4448  ribonuclease BN  68.68 
 
 
443 aa  372  1e-102  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0111149  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0769  ribonuclease BN  70.82 
 
 
411 aa  340  2e-92  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2481  ribonuclease BN  56.14 
 
 
324 aa  291  1e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.541316  normal  0.806631 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1291  ribonuclease BN  54.39 
 
 
311 aa  260  2e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.31772 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2352  ribonuclease BN  50.57 
 
 
305 aa  216  5e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5700  ribonuclease BN  52.29 
 
 
305 aa  207  3e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0471671 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0967  ribonuclease BN  43.94 
 
 
300 aa  195  8.000000000000001e-49  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.89911  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3921  putative ribonuclease BN  39.25 
 
 
360 aa  191  1e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00855127  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3408  ribonuclease BN  40.07 
 
 
299 aa  191  2e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0329161  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0297  ribonuclease BN  38.27 
 
 
291 aa  188  1e-46  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.421979 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1876  ribonuclease BN  36.3 
 
 
306 aa  185  9e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4029  ribonuclease BN  38.6 
 
 
316 aa  181  2e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.394592 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5809  ribonuclease BN, putative  39.92 
 
 
321 aa  180  2.9999999999999997e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2372  ribonuclease BN  35.96 
 
 
321 aa  178  1e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.483691  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6562  ribonuclease BN  36.21 
 
 
347 aa  177  2e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.357212  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5335  ribonuclease BN  42.02 
 
 
329 aa  164  1.0000000000000001e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2153  ribonuclease BN, putative  37.28 
 
 
321 aa  165  1.0000000000000001e-39  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2533  ribonuclease BN  32.98 
 
 
311 aa  159  7e-38  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3473  ribonuclease BN  32.75 
 
 
324 aa  159  8e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.950669 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0412  ribonuclease BN  30.8 
 
 
317 aa  157  2e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2801  ribonuclease BN  33.57 
 
 
307 aa  156  4e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.128758 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4408  ribonuclease BN  36.82 
 
 
427 aa  155  8e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1591  ribonuclease BN  31.73 
 
 
424 aa  153  2.9999999999999998e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.884253 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1209  ribonuclease BN  37.79 
 
 
312 aa  152  5e-36  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2225  ribonuclease BN  33.56 
 
 
298 aa  152  8e-36  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.681291  decreased coverage  0.00304933 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3875  ribonuclease BN  38.31 
 
 
329 aa  151  1e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2469  putative ribonuclease BN  30.72 
 
 
305 aa  152  1e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.428751  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3764  ribonuclease BN  38.31 
 
 
329 aa  151  1e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0316697  normal  0.101597 
 
 
-
 
NC_003296  RS02223  putative ribonuclease RNase BN (RBN) transmembrane protein  36.43 
 
 
324 aa  149  7e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1947  ribonuclease BN  37.13 
 
 
299 aa  148  1.0000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.594213 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1669  ribonuclease BN, putative  41.52 
 
 
326 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2621  ribonuclease BN  36.06 
 
 
304 aa  146  3e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6636  ribonuclease BN  30.14 
 
 
322 aa  146  5e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2216  ribonuclease BN  36.68 
 
 
303 aa  143  4e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.987558  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3548  ribonuclease  29.45 
 
 
299 aa  142  7e-33  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0230388  normal  0.0399226 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10418  hypothetical protein  31.54 
 
 
323 aa  142  8e-33  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.536635  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3922  ribonuclease BN  31.8 
 
 
370 aa  141  9.999999999999999e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.644027  normal  0.211181 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1838  ribonuclease BN, putative  37.41 
 
 
301 aa  137  2e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.787321  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1806  ribonuclease BN  35.15 
 
 
292 aa  135  6.0000000000000005e-31  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1738  ribonuclease BN  35.84 
 
 
292 aa  134  9.999999999999999e-31  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.554379  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04098  ribonuclease BN  33.55 
 
 
320 aa  132  1.0000000000000001e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0042  BrkB-like serum-resistance protein  34.44 
 
 
294 aa  123  5e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.363004  normal  0.262588 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2157  ribonuclease BN  33.97 
 
 
393 aa  121  9.999999999999999e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3481  ribonuclease BN family protein  37.54 
 
 
306 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0258  ribonuclease BN  34.73 
 
 
331 aa  116  3.9999999999999997e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0324  ribonuclease BN  32.44 
 
 
314 aa  116  5e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.290543 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2667  ribonuclease BN  31.1 
 
 
302 aa  114  2.0000000000000002e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0611062  normal  0.153348 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3282  ribonuclease BN  26.04 
 
 
306 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.273153 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0221  ribonuclease BN  37.36 
 
 
334 aa  107  2e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1517  ribonuclease BN  33.94 
 
 
321 aa  102  6e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3201  ribonuclease BN  34.73 
 
 
309 aa  101  2e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.248041 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0302  ribonuclease BN  31.18 
 
 
298 aa  94.4  2e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.223678  hitchhiker  0.000000133239 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1131  tRNA-processing RNAse BN  30.42 
 
 
447 aa  92.4  9e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0120336  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0151  ribonuclease BN  36.47 
 
 
305 aa  91.7  1e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.688141  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0169  ribonuclease BN  36.47 
 
 
305 aa  91.7  2e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0417869  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3965  ribonuclease BN  26.25 
 
 
306 aa  88.6  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3545  ribonuclease BN  30.42 
 
 
285 aa  87.4  3e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.109526  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0316  ribonuclease BN  30.8 
 
 
337 aa  86.7  5e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.293845  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3407  ribonuclease BN  25.16 
 
 
322 aa  86.3  6e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.57313  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2696  ribonuclease BN  25.16 
 
 
322 aa  86.3  6e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4618  ribonuclease BN  28.96 
 
 
336 aa  85.9  8e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.331921  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3708  ribonuclease BN  30.8 
 
 
337 aa  85.1  0.000000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.153225 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0311  ribonuclease BN  30.8 
 
 
337 aa  85.1  0.000000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.415793 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0314  ribonuclease BN  30.04 
 
 
323 aa  83.6  0.000000000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.321317  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0315  ribonuclease BN  30.04 
 
 
323 aa  83.6  0.000000000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0319  ribonuclease BN  30.04 
 
 
323 aa  83.6  0.000000000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3909  ribonuclease BN  26.8 
 
 
340 aa  83.2  0.000000000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0536  ribonuclease BN, putative  27.48 
 
 
525 aa  82.8  0.000000000000007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.031655 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0548  tRNA-processing RNAse BN  26.92 
 
 
525 aa  82.8  0.000000000000008  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0320  ribonuclease BN  29.66 
 
 
323 aa  82.4  0.000000000000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4401  ribonuclease BN  30.42 
 
 
295 aa  82.4  0.00000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4141  putative ribonuclease BN  28.04 
 
 
320 aa  81.3  0.00000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0331  ribonuclease BN  27.36 
 
 
320 aa  81.3  0.00000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.533981  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1250  tRNA-processing RNAse BN  28.72 
 
 
444 aa  80.9  0.00000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0974  ribonuclease BN, putative  29.96 
 
 
442 aa  80.9  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.315544  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1456  putative ribonuclease BN  29.96 
 
 
442 aa  80.9  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1434  ribonuclease BN  29.96 
 
 
442 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.50654  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1354  ribonuclease BN  28.73 
 
 
436 aa  79.3  0.00000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.875268  normal  0.303489 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1559  putative ribonuclease BN transmembrane protein  30.53 
 
 
441 aa  78.6  0.0000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.837363 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4601  ribonuclease BN  28.1 
 
 
443 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.996518 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1337  putative ribonuclease BN  28.1 
 
 
443 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.500166  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1377  ribonuclease BN  28.1 
 
 
443 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.763301  normal  0.704772 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3912  ribonuclease BN, putative  27.43 
 
 
386 aa  77.8  0.0000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.561181  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2773  ribonuclease BN  27.64 
 
 
437 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0077  ribonuclease BN  25.09 
 
 
307 aa  76.3  0.0000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>