194 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A3481 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008825  Mpe_A3481  ribonuclease BN family protein  100 
 
 		 306 aa  583  1.0000000000000001e-165  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2621  ribonuclease BN  62.96 
 
 		 304 aa  355  3.9999999999999996e-97  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1838  ribonuclease BN, putative  59.43 
 
 		 301 aa  299  3e-80  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.787321  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1876  ribonuclease BN  43.84 
 
 		 306 aa  236  3e-61  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0297  ribonuclease BN  40.14 
 
 		 291 aa  219  3.9999999999999997e-56  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.421979 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3408  ribonuclease BN  43.73 
 
 		 299 aa  215  8e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0329161  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3921  putative ribonuclease BN  40.58 
 
 		 360 aa  210  3e-53  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00855127  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4029  ribonuclease BN  40.4 
 
 		 316 aa  199  5e-50  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.394592 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2372  ribonuclease BN  39.46 
 
 		 321 aa  198  7.999999999999999e-50  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.483691  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6636  ribonuclease BN  34.2 
 
 		 322 aa  197  3e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0967  ribonuclease BN  40.07 
 
 		 300 aa  196  5.000000000000001e-49  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.89911  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6562  ribonuclease BN  38.81 
 
 		 347 aa  195  8.000000000000001e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.357212  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2801  ribonuclease BN  35.31 
 
 		 307 aa  192  4e-48  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.128758 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2469  putative ribonuclease BN  33.22 
 
 		 305 aa  190  2.9999999999999997e-47  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.428751  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0412  ribonuclease BN  34.33 
 
 		 317 aa  187  2e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1209  ribonuclease BN  40.53 
 
 		 312 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3922  ribonuclease BN  36.7 
 
 		 370 aa  182  5.0000000000000004e-45  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.644027  normal  0.211181 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2533  ribonuclease BN  40 
 
 		 311 aa  182  6e-45  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5809  ribonuclease BN, putative  38.01 
 
 		 321 aa  181  1e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1591  ribonuclease BN  30.23 
 
 		 424 aa  178  1e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.884253 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10418  hypothetical protein  34.62 
 
 		 323 aa  178  1e-43  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.536635  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2225  ribonuclease BN  39.39 
 
 		 298 aa  175  9.999999999999999e-43  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.681291  decreased coverage  0.00304933 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1669  ribonuclease BN, putative  44 
 
 		 326 aa  173  3.9999999999999995e-42  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3473  ribonuclease BN  32.88 
 
 		 324 aa  172  5e-42  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.950669 
 
 
-
 
NC_003296  RS02223  putative ribonuclease RNase BN (RBN) transmembrane protein  41.04 
 
 		 324 aa  167  2e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3875  ribonuclease BN  38.19 
 
 		 329 aa  166  4e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3764  ribonuclease BN  38.19 
 
 		 329 aa  166  4e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0316697  normal  0.101597 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4408  ribonuclease BN  39.85 
 
 		 427 aa  166  5.9999999999999996e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2153  ribonuclease BN, putative  38.79 
 
 		 321 aa  165  1.0000000000000001e-39  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2216  ribonuclease BN  43.21 
 
 		 303 aa  163  3e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.987558  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5335  ribonuclease BN  39.16 
 
 		 329 aa  159  5e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4516  ribonuclease BN  37.91 
 
 		 436 aa  158  1e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.783235  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4599  ribonuclease BN  40.15 
 
 		 341 aa  157  2e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.150471  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4384  ribonuclease BN, putative  39.62 
 
 		 314 aa  157  2e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3982  putative ribonuclease BN  39.62 
 
 		 314 aa  157  2e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3548  ribonuclease  34.93 
 
 		 299 aa  157  3e-37  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0230388  normal  0.0399226 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2102  ribonuclease BN  37.41 
 
 		 311 aa  156  5.0000000000000005e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.316673 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3546  ribonuclease BN  39.84 
 
 		 308 aa  156  5.0000000000000005e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0229297  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1947  ribonuclease BN  35.97 
 
 		 299 aa  155  1e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.594213 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3877  ribonuclease BN  38.75 
 
 		 310 aa  154  2e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3375  putative ribonuclease BN  38.89 
 
 		 310 aa  153  4e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.594125 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2481  ribonuclease BN  35.04 
 
 		 324 aa  150  2e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.541316  normal  0.806631 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2667  ribonuclease BN  34.72 
 
 		 302 aa  150  2e-35  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0611062  normal  0.153348 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0769  ribonuclease BN  35.69 
 
 		 411 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4448  ribonuclease BN  34.35 
 
 		 443 aa  146  3e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0111149  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2157  ribonuclease BN  35.83 
 
 		 393 aa  145  7.0000000000000006e-34  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0703  YihY family protein  36.99 
 
 		 325 aa  144  2e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.075214  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0744  putative ribonuclease  37.3 
 
 		 337 aa  142  7e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2414  putative ribonuclease BN  37.3 
 
 		 304 aa  142  9e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1697  putative ribonuclease BN  37.3 
 
 		 307 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.318237  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1883  putative ribonuclease BN  37.3 
 
 		 307 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.244601  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2276  putative ribonuclease BN  37.3 
 
 		 307 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1675  putative ribonuclease BN  36.89 
 
 		 307 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.753662  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0221  ribonuclease BN  37.5 
 
 		 334 aa  137  3.0000000000000003e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1806  ribonuclease BN  40.93 
 
 		 292 aa  136  5e-31  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1738  ribonuclease BN  41.63 
 
 		 292 aa  135  9.999999999999999e-31  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.554379  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1517  ribonuclease BN  35.29 
 
 		 321 aa  134  1.9999999999999998e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0258  ribonuclease BN  36.26 
 
 		 331 aa  133  3e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1291  ribonuclease BN  34.73 
 
 		 311 aa  132  7.999999999999999e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.31772 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0169  ribonuclease BN  39.05 
 
 		 305 aa  131  1.0000000000000001e-29  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0417869  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0151  ribonuclease BN  39.18 
 
 		 305 aa  130  3e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.688141  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04098  ribonuclease BN  36.1 
 
 		 320 aa  127  3e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0042  BrkB-like serum-resistance protein  35.11 
 
 		 294 aa  124  2e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.363004  normal  0.262588 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3201  ribonuclease BN  35.98 
 
 		 309 aa  118  9.999999999999999e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.248041 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0324  ribonuclease BN  33.33 
 
 		 314 aa  117  1.9999999999999998e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.290543 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3282  ribonuclease BN  26.41 
 
 		 306 aa  115  7.999999999999999e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.273153 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2561  ribonuclease RN  27.01 
 
 		 276 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.842929  normal  0.307691 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2352  ribonuclease BN  31.23 
 
 		 305 aa  103  3e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5700  ribonuclease BN  33.72 
 
 		 305 aa  103  3e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0471671 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4026  ribonuclease BN  32.58 
 
 		 302 aa  102  8e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.194003 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0077  ribonuclease BN  28.89 
 
 		 307 aa  97.8  2e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2696  ribonuclease BN  24.19 
 
 		 322 aa  92.8  6e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3407  ribonuclease BN  24.19 
 
 		 322 aa  92.8  6e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.57313  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3965  ribonuclease BN  23.02 
 
 		 306 aa  77  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2802  ribonuclease BN  25.08 
 
 		 368 aa  68.2  0.0000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1406  ribonuclease BN  23.33 
 
 		 320 aa  66.6  0.0000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.573356  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4558  ribonuclease  26.52 
 
 		 411 aa  64.3  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.176119  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51960  ribonuclease  26.52 
 
 		 411 aa  63.9  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000384323 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1831  ribonuclease BN, putative  25.35 
 
 		 341 aa  62.4  0.00000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.630422  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2988  tRNA-processing RNAse BN  28.11 
 
 		 405 aa  60.8  0.00000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0115566 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4870  putative ribonuclease  23.3 
 
 		 346 aa  59.7  0.00000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0433032  normal  0.0967189 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4618  ribonuclease BN  25.42 
 
 		 336 aa  60.1  0.00000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.331921  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0535  putative ribonuclease BN  25.28 
 
 		 329 aa  59.7  0.00000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6469  ribonuclease  29.96 
 
 		 339 aa  58.9  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1830  ribonuclease BN, putative  26.95 
 
 		 404 aa  57.8  0.0000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0291213 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1131  tRNA-processing RNAse BN  27.96 
 
 		 447 aa  58.2  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0120336  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1213  hypothetical protein  24.92 
 
 		 339 aa  56.2  0.0000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.158916  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1230  putative ribonuclease  24.92 
 
 		 339 aa  56.2  0.0000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3782  putative ribonuclease BN  28.91 
 
 		 417 aa  56.2  0.0000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.747411  normal  0.886826 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2446  ribonuclease BN  25.86 
 
 		 263 aa  56.2  0.0000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.805614  hitchhiker  0.00565169 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1250  tRNA-processing RNAse BN  26.62 
 
 		 444 aa  55.5  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4776  ribonuclease BN  26.71 
 
 		 367 aa  54.7  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0858939  normal  0.337427 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0302  ribonuclease BN  26.47 
 
 		 298 aa  55.1  0.000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.223678  hitchhiker  0.000000133239 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3482  ribonuclease BN  26.95 
 
 		 292 aa  55.1  0.000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.384798 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1577  ribonuclease BN  25.28 
 
 		 294 aa  54.7  0.000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.274703  normal  0.013095 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3448  ribonuclease BN  25.24 
 
 		 313 aa  53.5  0.000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.016816  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0865  ribonuclease BN  27.16 
 
 		 342 aa  53.5  0.000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.756909  normal  0.214041 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03526  ribonuclease BN  24.73 
 
 		 294 aa  53.5  0.000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0234008  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3545  ribonuclease BN  25.54 
 
 		 285 aa  53.1  0.000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.109526  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0425  putative ribonuclease BN  26.43 
 
 		 300 aa  53.1  0.000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.250516  normal  0.726297 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>