More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen_4384 on replicon NC_008061
Organism: Burkholderia cenocepacia AU 1054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008061  Bcen_4384  ribonuclease BN, putative  100 
 
 		 314 aa  613  9.999999999999999e-175  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3982  putative ribonuclease BN  100 
 
 		 314 aa  613  9.999999999999999e-175  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2102  ribonuclease BN  93.63 
 
 		 311 aa  563  1.0000000000000001e-159  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.316673 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3546  ribonuclease BN  95.86 
 
 		 308 aa  555  1e-157  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0229297  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3877  ribonuclease BN  87.26 
 
 		 310 aa  524  1e-147  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3375  putative ribonuclease BN  86.39 
 
 		 310 aa  520  1e-146  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.594125 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4599  ribonuclease BN  82.87 
 
 		 341 aa  514  1.0000000000000001e-145  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.150471  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1697  putative ribonuclease BN  74.76 
 
 		 307 aa  418  1e-116  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.318237  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1883  putative ribonuclease BN  74.76 
 
 		 307 aa  418  1e-116  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.244601  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1675  putative ribonuclease BN  74.76 
 
 		 307 aa  419  1e-116  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.753662  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2414  putative ribonuclease BN  74.84 
 
 		 304 aa  414  9.999999999999999e-116  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0744  putative ribonuclease  76.08 
 
 		 337 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2276  putative ribonuclease BN  76.08 
 
 		 307 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0703  YihY family protein  77.9 
 
 		 325 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.075214  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4516  ribonuclease BN  70.86 
 
 		 436 aa  381  1e-105  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.783235  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4448  ribonuclease BN  70.97 
 
 		 443 aa  382  1e-105  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0111149  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0769  ribonuclease BN  72.94 
 
 		 411 aa  349  4e-95  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2481  ribonuclease BN  54.03 
 
 		 324 aa  296  4e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.541316  normal  0.806631 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1291  ribonuclease BN  57.53 
 
 		 311 aa  263  3e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.31772 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2352  ribonuclease BN  48.94 
 
 		 305 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5700  ribonuclease BN  52.59 
 
 		 305 aa  213  4.9999999999999996e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0471671 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0967  ribonuclease BN  43.32 
 
 		 300 aa  201  1.9999999999999998e-50  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.89911  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3408  ribonuclease BN  40.42 
 
 		 299 aa  195  8.000000000000001e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0329161  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3921  putative ribonuclease BN  38.69 
 
 		 360 aa  194  2e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00855127  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0297  ribonuclease BN  39.35 
 
 		 291 aa  192  6e-48  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.421979 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1876  ribonuclease BN  37.09 
 
 		 306 aa  191  2e-47  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5809  ribonuclease BN, putative  39.19 
 
 		 321 aa  183  3e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4029  ribonuclease BN  38.97 
 
 		 316 aa  182  8.000000000000001e-45  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.394592 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2372  ribonuclease BN  36.27 
 
 		 321 aa  179  7e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.483691  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6562  ribonuclease BN  36.82 
 
 		 347 aa  176  5e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.357212  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2153  ribonuclease BN, putative  35.41 
 
 		 321 aa  167  2.9999999999999998e-40  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5335  ribonuclease BN  42.19 
 
 		 329 aa  165  8e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0412  ribonuclease BN  31.96 
 
 		 317 aa  163  3e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2225  ribonuclease BN  37.02 
 
 		 298 aa  162  5.0000000000000005e-39  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.681291  decreased coverage  0.00304933 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3473  ribonuclease BN  33.22 
 
 		 324 aa  162  9e-39  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.950669 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1591  ribonuclease BN  31.67 
 
 		 424 aa  162  1e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.884253 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2801  ribonuclease BN  33.92 
 
 		 307 aa  157  2e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.128758 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2533  ribonuclease BN  33.98 
 
 		 311 aa  155  1e-36  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2469  putative ribonuclease BN  32.5 
 
 		 305 aa  154  2e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.428751  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4408  ribonuclease BN  36.49 
 
 		 427 aa  152  5.9999999999999996e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1209  ribonuclease BN  37.79 
 
 		 312 aa  152  7e-36  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3764  ribonuclease BN  36.9 
 
 		 329 aa  152  7e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0316697  normal  0.101597 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3875  ribonuclease BN  36.9 
 
 		 329 aa  152  7e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02223  putative ribonuclease RNase BN (RBN) transmembrane protein  35.12 
 
 		 324 aa  150  2e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6636  ribonuclease BN  29.73 
 
 		 322 aa  151  2e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2621  ribonuclease BN  35.02 
 
 		 304 aa  150  2e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1669  ribonuclease BN, putative  45.06 
 
 		 326 aa  148  1.0000000000000001e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10418  hypothetical protein  30.6 
 
 		 323 aa  147  3e-34  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.536635  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3548  ribonuclease  31.25 
 
 		 299 aa  145  7.0000000000000006e-34  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0230388  normal  0.0399226 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1947  ribonuclease BN  35.04 
 
 		 299 aa  145  1e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.594213 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2216  ribonuclease BN  36.21 
 
 		 303 aa  144  1e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.987558  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1838  ribonuclease BN, putative  37.83 
 
 		 301 aa  143  3e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.787321  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3922  ribonuclease BN  31.8 
 
 		 370 aa  143  4e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.644027  normal  0.211181 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1806  ribonuclease BN  34.92 
 
 		 292 aa  137  2e-31  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1738  ribonuclease BN  34.92 
 
 		 292 aa  136  4e-31  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.554379  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04098  ribonuclease BN  32.91 
 
 		 320 aa  135  6.0000000000000005e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0258  ribonuclease BN  35.21 
 
 		 331 aa  126  4.0000000000000003e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2157  ribonuclease BN  34.35 
 
 		 393 aa  125  1e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3481  ribonuclease BN family protein  39.92 
 
 		 306 aa  124  3e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0324  ribonuclease BN  31.86 
 
 		 314 aa  122  8e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.290543 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0042  BrkB-like serum-resistance protein  33.33 
 
 		 294 aa  121  9.999999999999999e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.363004  normal  0.262588 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2667  ribonuclease BN  31.1 
 
 		 302 aa  115  7.999999999999999e-25  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0611062  normal  0.153348 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3282  ribonuclease BN  24.91 
 
 		 306 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.273153 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0221  ribonuclease BN  36.68 
 
 		 334 aa  111  2.0000000000000002e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1517  ribonuclease BN  32.96 
 
 		 321 aa  106  4e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3201  ribonuclease BN  35.43 
 
 		 309 aa  104  2e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.248041 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0151  ribonuclease BN  36.23 
 
 		 305 aa  96.3  7e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.688141  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0169  ribonuclease BN  36.86 
 
 		 305 aa  94.4  3e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0417869  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0302  ribonuclease BN  30.8 
 
 		 298 aa  92  1e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.223678  hitchhiker  0.000000133239 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1131  tRNA-processing RNAse BN  29.37 
 
 		 447 aa  87.8  2e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0120336  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2696  ribonuclease BN  25.72 
 
 		 322 aa  86.3  6e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3407  ribonuclease BN  25.72 
 
 		 322 aa  86.3  6e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.57313  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3965  ribonuclease BN  23.95 
 
 		 306 aa  85.1  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4141  putative ribonuclease BN  28.28 
 
 		 320 aa  84  0.000000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3545  ribonuclease BN  30.04 
 
 		 285 aa  84.3  0.000000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.109526  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0316  ribonuclease BN  30.42 
 
 		 337 aa  83.6  0.000000000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.293845  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4618  ribonuclease BN  28.57 
 
 		 336 aa  82.8  0.000000000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.331921  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1354  ribonuclease BN  28.99 
 
 		 436 aa  82.4  0.000000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.875268  normal  0.303489 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3708  ribonuclease BN  30.04 
 
 		 337 aa  82.4  0.000000000000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.153225 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0311  ribonuclease BN  30.04 
 
 		 337 aa  82  0.00000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.415793 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0548  tRNA-processing RNAse BN  26.54 
 
 		 525 aa  81.6  0.00000000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2773  ribonuclease BN  28.21 
 
 		 437 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0536  ribonuclease BN, putative  27.1 
 
 		 525 aa  81.3  0.00000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.031655 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1575  ribonuclease BN  28.52 
 
 		 439 aa  80.5  0.00000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3912  ribonuclease BN, putative  27.27 
 
 		 386 aa  79.3  0.00000000000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.561181  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1250  tRNA-processing RNAse BN  28.37 
 
 		 444 aa  79.3  0.00000000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4401  ribonuclease BN  28.9 
 
 		 295 aa  79  0.0000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0314  ribonuclease BN  29.28 
 
 		 323 aa  78.6  0.0000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.321317  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1434  ribonuclease BN  29.71 
 
 		 442 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.50654  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1830  ribonuclease BN, putative  29.08 
 
 		 404 aa  79  0.0000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0291213 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0974  ribonuclease BN, putative  29.71 
 
 		 442 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.315544  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1456  putative ribonuclease BN  29.71 
 
 		 442 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4100  ribonuclease BN  25.63 
 
 		 290 aa  77.8  0.0000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03720  hypothetical protein  25.63 
 
 		 290 aa  77.8  0.0000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.664641  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4364  ribonuclease BN  25.63 
 
 		 290 aa  77.8  0.0000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4271  ribonuclease BN  25.63 
 
 		 290 aa  77.8  0.0000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0331  ribonuclease BN  28.52 
 
 		 320 aa  78.2  0.0000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.533981  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0315  ribonuclease BN  28.42 
 
 		 323 aa  78.2  0.0000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4111  ribonuclease BN  25.63 
 
 		 290 aa  77.8  0.0000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.235548  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5333  ribonuclease BN  25.63 
 
 		 290 aa  77.8  0.0000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.247154 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>