More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_0297 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011729  PCC7424_0297  ribonuclease BN  100 
 
 
291 aa  572  1.0000000000000001e-162  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.421979 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3408  ribonuclease BN  65.98 
 
 
299 aa  382  1e-105  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0329161  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1876  ribonuclease BN  58.22 
 
 
306 aa  346  3e-94  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3921  putative ribonuclease BN  55.4 
 
 
360 aa  310  1e-83  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00855127  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1947  ribonuclease BN  56.79 
 
 
299 aa  288  6e-77  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.594213 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6562  ribonuclease BN  51.6 
 
 
347 aa  269  4e-71  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.357212  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2469  putative ribonuclease BN  48.99 
 
 
305 aa  260  2e-68  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.428751  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0967  ribonuclease BN  46.79 
 
 
300 aa  257  1e-67  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.89911  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4029  ribonuclease BN  48.53 
 
 
316 aa  258  1e-67  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.394592 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0412  ribonuclease BN  43.34 
 
 
317 aa  248  9e-65  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2801  ribonuclease BN  43.79 
 
 
307 aa  245  4.9999999999999997e-64  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.128758 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2372  ribonuclease BN  46.26 
 
 
321 aa  244  1.9999999999999999e-63  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.483691  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2225  ribonuclease BN  44.96 
 
 
298 aa  239  2.9999999999999997e-62  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.681291  decreased coverage  0.00304933 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5809  ribonuclease BN, putative  45.09 
 
 
321 aa  239  2.9999999999999997e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1591  ribonuclease BN  41.58 
 
 
424 aa  236  3e-61  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.884253 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1669  ribonuclease BN, putative  49.48 
 
 
326 aa  233  2.0000000000000002e-60  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1209  ribonuclease BN  46.34 
 
 
312 aa  231  8.000000000000001e-60  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3922  ribonuclease BN  43.45 
 
 
370 aa  230  3e-59  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.644027  normal  0.211181 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4408  ribonuclease BN  45.99 
 
 
427 aa  226  3e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2153  ribonuclease BN, putative  46.8 
 
 
321 aa  226  3e-58  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2216  ribonuclease BN  49.64 
 
 
303 aa  223  2e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.987558  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1838  ribonuclease BN, putative  44.57 
 
 
301 aa  222  4.9999999999999996e-57  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.787321  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3473  ribonuclease BN  42.45 
 
 
324 aa  219  5e-56  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.950669 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2533  ribonuclease BN  39.45 
 
 
311 aa  219  6e-56  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6636  ribonuclease BN  42.96 
 
 
322 aa  218  8.999999999999998e-56  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10418  hypothetical protein  41.81 
 
 
323 aa  211  1e-53  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.536635  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02223  putative ribonuclease RNase BN (RBN) transmembrane protein  44.53 
 
 
324 aa  211  1e-53  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3875  ribonuclease BN  44.2 
 
 
329 aa  211  1e-53  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3764  ribonuclease BN  44.2 
 
 
329 aa  211  1e-53  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0316697  normal  0.101597 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5335  ribonuclease BN  45.13 
 
 
329 aa  209  5e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3548  ribonuclease  43.54 
 
 
299 aa  208  9e-53  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0230388  normal  0.0399226 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2621  ribonuclease BN  38.03 
 
 
304 aa  200  3e-50  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4599  ribonuclease BN  40 
 
 
341 aa  192  7e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.150471  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2102  ribonuclease BN  38.27 
 
 
311 aa  188  9e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.316673 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4384  ribonuclease BN, putative  40.08 
 
 
314 aa  186  3e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3982  putative ribonuclease BN  40.08 
 
 
314 aa  186  3e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3546  ribonuclease BN  40.08 
 
 
308 aa  186  4e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0229297  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3877  ribonuclease BN  39.77 
 
 
310 aa  185  8e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3375  putative ribonuclease BN  39.77 
 
 
310 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.594125 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3481  ribonuclease BN family protein  40.14 
 
 
306 aa  180  2.9999999999999997e-44  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0703  YihY family protein  38.28 
 
 
325 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.075214  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4448  ribonuclease BN  37.31 
 
 
443 aa  179  5.999999999999999e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0111149  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0744  putative ribonuclease  38.04 
 
 
337 aa  175  6e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1697  putative ribonuclease BN  38.04 
 
 
307 aa  175  7e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.318237  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1883  putative ribonuclease BN  38.04 
 
 
307 aa  175  7e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.244601  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2276  putative ribonuclease BN  38.04 
 
 
307 aa  175  7e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2414  putative ribonuclease BN  38.34 
 
 
304 aa  175  8e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1675  putative ribonuclease BN  38.04 
 
 
307 aa  175  9e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.753662  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2481  ribonuclease BN  35.4 
 
 
324 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.541316  normal  0.806631 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2667  ribonuclease BN  33.9 
 
 
302 aa  172  6.999999999999999e-42  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0611062  normal  0.153348 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4516  ribonuclease BN  35.56 
 
 
436 aa  172  9e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.783235  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0769  ribonuclease BN  38.52 
 
 
411 aa  171  2e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2157  ribonuclease BN  36.62 
 
 
393 aa  162  5.0000000000000005e-39  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1806  ribonuclease BN  35.74 
 
 
292 aa  160  3e-38  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1738  ribonuclease BN  36.11 
 
 
292 aa  159  6e-38  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.554379  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1291  ribonuclease BN  33.1 
 
 
311 aa  157  3e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.31772 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04098  ribonuclease BN  36.72 
 
 
320 aa  157  3e-37  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0042  BrkB-like serum-resistance protein  33.21 
 
 
294 aa  154  1e-36  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.363004  normal  0.262588 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0324  ribonuclease BN  32.28 
 
 
314 aa  152  5.9999999999999996e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.290543 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1517  ribonuclease BN  37.68 
 
 
321 aa  145  9e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2561  ribonuclease RN  32.01 
 
 
276 aa  143  3e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.842929  normal  0.307691 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2352  ribonuclease BN  33.58 
 
 
305 aa  138  1e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3201  ribonuclease BN  34.47 
 
 
309 aa  138  1e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.248041 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2802  ribonuclease BN  35.37 
 
 
368 aa  136  4e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0258  ribonuclease BN  33.56 
 
 
331 aa  135  7.000000000000001e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0221  ribonuclease BN  33.33 
 
 
334 aa  134  3e-30  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5700  ribonuclease BN  31.48 
 
 
305 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0471671 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0077  ribonuclease BN  27.85 
 
 
307 aa  126  5e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4026  ribonuclease BN  29.31 
 
 
302 aa  125  7e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.194003 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3965  ribonuclease BN  30.74 
 
 
306 aa  125  1e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3282  ribonuclease BN  26.83 
 
 
306 aa  123  4e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.273153 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3407  ribonuclease BN  27.57 
 
 
322 aa  116  3.9999999999999997e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.57313  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2696  ribonuclease BN  27.57 
 
 
322 aa  116  3.9999999999999997e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0169  ribonuclease BN  33.57 
 
 
305 aa  114  2.0000000000000002e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0417869  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0151  ribonuclease BN  34.81 
 
 
305 aa  112  5e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.688141  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1406  ribonuclease BN  25.94 
 
 
320 aa  91.3  2e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.573356  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1932  ribonuclease BN  25.36 
 
 
363 aa  90.5  3e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0389  putative ribonuclease BN  24.72 
 
 
289 aa  87.4  2e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0395  putative ribonuclease BN  24.81 
 
 
289 aa  85.5  9e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0425  putative ribonuclease BN  26.95 
 
 
300 aa  85.5  9e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.250516  normal  0.726297 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4850  YihY family protein  24.72 
 
 
288 aa  85.1  0.000000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0474  YihY family protein  24.72 
 
 
288 aa  85.1  0.000000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0453  YihY family protein  23.94 
 
 
286 aa  84.7  0.000000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0523  ribonuclease BN, putative  23.97 
 
 
289 aa  83.2  0.000000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0395  ribonuclease BN  23.97 
 
 
289 aa  83.2  0.000000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0386  ribonuclease BN  23.97 
 
 
289 aa  83.2  0.000000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0383  ribonuclease BN  23.97 
 
 
289 aa  83.2  0.000000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0523  YihY family protein  23.97 
 
 
289 aa  83.2  0.000000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0409  ribonuclease BN  23.97 
 
 
289 aa  83.2  0.000000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1577  ribonuclease BN  27.64 
 
 
294 aa  83.2  0.000000000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.274703  normal  0.013095 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0630  putative ribonuclease BN  29.12 
 
 
538 aa  83.2  0.000000000000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.883121 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4238  ribonuclease BN  30 
 
 
290 aa  81.6  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.89383  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4351  ribonuclease BN  30 
 
 
290 aa  81.6  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1902  YihY family protein  28.04 
 
 
262 aa  82  0.00000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.567508  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4305  ribonuclease BN  30 
 
 
290 aa  81.6  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.269266  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4092  ribonuclease BN  29.7 
 
 
290 aa  81.6  0.00000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4416  ribonuclease BN  30 
 
 
290 aa  81.6  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3782  putative ribonuclease BN  27.8 
 
 
417 aa  81.6  0.00000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.747411  normal  0.886826 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4260  ribonuclease BN  30 
 
 
290 aa  81.6  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03720  hypothetical protein  29.5 
 
 
290 aa  78.2  0.0000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.664641  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>