More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_1947 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011729  PCC7424_1947  ribonuclease BN  100 
 
 
299 aa  590  1e-168  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.594213 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0297  ribonuclease BN  56.79 
 
 
291 aa  317  2e-85  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.421979 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1876  ribonuclease BN  51.25 
 
 
306 aa  286  2.9999999999999996e-76  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3408  ribonuclease BN  52.52 
 
 
299 aa  281  8.000000000000001e-75  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0329161  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3921  putative ribonuclease BN  48.39 
 
 
360 aa  249  6e-65  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00855127  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2153  ribonuclease BN, putative  44.33 
 
 
321 aa  230  2e-59  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4029  ribonuclease BN  39.18 
 
 
316 aa  226  3e-58  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.394592 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0967  ribonuclease BN  40.36 
 
 
300 aa  220  1.9999999999999999e-56  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.89911  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6562  ribonuclease BN  41.61 
 
 
347 aa  219  5e-56  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.357212  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4408  ribonuclease BN  42.5 
 
 
427 aa  216  2.9999999999999998e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1209  ribonuclease BN  42.07 
 
 
312 aa  212  5.999999999999999e-54  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2372  ribonuclease BN  41.07 
 
 
321 aa  210  2e-53  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.483691  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5809  ribonuclease BN, putative  40.91 
 
 
321 aa  210  2e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2225  ribonuclease BN  41.28 
 
 
298 aa  209  7e-53  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.681291  decreased coverage  0.00304933 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0412  ribonuclease BN  38.33 
 
 
317 aa  207  1e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1669  ribonuclease BN, putative  40.47 
 
 
326 aa  206  4e-52  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2469  putative ribonuclease BN  41.58 
 
 
305 aa  203  2e-51  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.428751  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2801  ribonuclease BN  38.94 
 
 
307 aa  203  3e-51  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.128758 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2533  ribonuclease BN  35.61 
 
 
311 aa  203  3e-51  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6636  ribonuclease BN  39.64 
 
 
322 aa  199  3.9999999999999996e-50  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1591  ribonuclease BN  38.13 
 
 
424 aa  199  5e-50  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.884253 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2216  ribonuclease BN  43.4 
 
 
303 aa  198  7.999999999999999e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.987558  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3875  ribonuclease BN  39.93 
 
 
329 aa  192  6e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3764  ribonuclease BN  39.93 
 
 
329 aa  192  6e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0316697  normal  0.101597 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3922  ribonuclease BN  37.75 
 
 
370 aa  191  1e-47  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.644027  normal  0.211181 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3548  ribonuclease  39.45 
 
 
299 aa  191  2e-47  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0230388  normal  0.0399226 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3473  ribonuclease BN  37.37 
 
 
324 aa  185  7e-46  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.950669 
 
 
-
 
NC_003296  RS02223  putative ribonuclease RNase BN (RBN) transmembrane protein  38.21 
 
 
324 aa  183  3e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5335  ribonuclease BN  40.88 
 
 
329 aa  182  7e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2621  ribonuclease BN  34.6 
 
 
304 aa  172  7.999999999999999e-42  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1838  ribonuclease BN, putative  36.92 
 
 
301 aa  171  1e-41  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.787321  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10418  hypothetical protein  34.14 
 
 
323 aa  171  1e-41  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.536635  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3375  putative ribonuclease BN  36.26 
 
 
310 aa  169  3e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.594125 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4599  ribonuclease BN  38.29 
 
 
341 aa  169  4e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.150471  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2102  ribonuclease BN  37.27 
 
 
311 aa  169  4e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.316673 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3877  ribonuclease BN  36.26 
 
 
310 aa  169  4e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2157  ribonuclease BN  37.68 
 
 
393 aa  169  5e-41  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4448  ribonuclease BN  34.53 
 
 
443 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0111149  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4384  ribonuclease BN, putative  36.4 
 
 
314 aa  166  4e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3982  putative ribonuclease BN  36.4 
 
 
314 aa  166  4e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3546  ribonuclease BN  37.36 
 
 
308 aa  166  5.9999999999999996e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0229297  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0703  YihY family protein  35.41 
 
 
325 aa  160  2e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.075214  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4516  ribonuclease BN  35.29 
 
 
436 aa  159  4e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.783235  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2481  ribonuclease BN  31.34 
 
 
324 aa  159  4e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.541316  normal  0.806631 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1675  putative ribonuclease BN  35.91 
 
 
307 aa  156  4e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.753662  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1697  putative ribonuclease BN  35.91 
 
 
307 aa  155  5.0000000000000005e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.318237  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0744  putative ribonuclease  35.91 
 
 
337 aa  155  5.0000000000000005e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1883  putative ribonuclease BN  35.91 
 
 
307 aa  155  5.0000000000000005e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.244601  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2414  putative ribonuclease BN  35.91 
 
 
304 aa  155  6e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2276  putative ribonuclease BN  35.91 
 
 
307 aa  155  6e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0769  ribonuclease BN  35.18 
 
 
411 aa  149  5e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1291  ribonuclease BN  32.06 
 
 
311 aa  148  9e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.31772 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2667  ribonuclease BN  30.69 
 
 
302 aa  141  9.999999999999999e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0611062  normal  0.153348 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3481  ribonuclease BN family protein  35.97 
 
 
306 aa  141  9.999999999999999e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04098  ribonuclease BN  34.05 
 
 
320 aa  139  4.999999999999999e-32  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0324  ribonuclease BN  33.46 
 
 
314 aa  138  1e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.290543 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1806  ribonuclease BN  34.53 
 
 
292 aa  137  2e-31  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1738  ribonuclease BN  34.53 
 
 
292 aa  137  2e-31  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.554379  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1517  ribonuclease BN  31.4 
 
 
321 aa  135  9.999999999999999e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2802  ribonuclease BN  36.36 
 
 
368 aa  134  1.9999999999999998e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2561  ribonuclease RN  31.37 
 
 
276 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.842929  normal  0.307691 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2352  ribonuclease BN  29.81 
 
 
305 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0042  BrkB-like serum-resistance protein  32.56 
 
 
294 aa  125  9e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.363004  normal  0.262588 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0221  ribonuclease BN  33.21 
 
 
334 aa  120  1.9999999999999998e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3201  ribonuclease BN  31.54 
 
 
309 aa  120  3e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.248041 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3282  ribonuclease BN  29.6 
 
 
306 aa  119  4.9999999999999996e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.273153 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5700  ribonuclease BN  30.18 
 
 
305 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0471671 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0258  ribonuclease BN  32.95 
 
 
331 aa  117  3e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3407  ribonuclease BN  28.77 
 
 
322 aa  115  7.999999999999999e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.57313  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2696  ribonuclease BN  28.77 
 
 
322 aa  115  7.999999999999999e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3965  ribonuclease BN  26.28 
 
 
306 aa  110  3e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1406  ribonuclease BN  25.76 
 
 
320 aa  106  4e-22  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.573356  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0151  ribonuclease BN  33.2 
 
 
305 aa  102  9e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.688141  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0169  ribonuclease BN  33.2 
 
 
305 aa  101  1e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0417869  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1932  ribonuclease BN  26.06 
 
 
363 aa  100  3e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4026  ribonuclease BN  28.42 
 
 
302 aa  96.7  4e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.194003 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0077  ribonuclease BN  25.18 
 
 
307 aa  92.8  6e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00917  putative ribonuclease protein  27.96 
 
 
317 aa  92.4  8e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3782  putative ribonuclease BN  28.27 
 
 
417 aa  90.5  3e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.747411  normal  0.886826 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03526  ribonuclease BN  27.34 
 
 
294 aa  85.9  7e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0234008  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0389  putative ribonuclease BN  26.47 
 
 
289 aa  85.1  0.000000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1577  ribonuclease BN  26.97 
 
 
294 aa  84  0.000000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.274703  normal  0.013095 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0234  ribonuclease BN  26.56 
 
 
319 aa  84  0.000000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0302  ribonuclease BN  26.33 
 
 
298 aa  82.8  0.000000000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.223678  hitchhiker  0.000000133239 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0395  putative ribonuclease BN  25 
 
 
289 aa  82.8  0.000000000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0474  YihY family protein  26.02 
 
 
288 aa  82.4  0.000000000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4850  YihY family protein  26.02 
 
 
288 aa  82.4  0.000000000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0942  ribonuclease BN  28.52 
 
 
437 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1862  ribonuclease BN  28.52 
 
 
437 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.618695  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1685  tRNA-processing ribonuclease BN  28.52 
 
 
437 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.417952  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1475  ribonuclease BN  28.52 
 
 
437 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1902  YihY family protein  26.89 
 
 
262 aa  81.3  0.00000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.567508  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1707  tRNA-processing ribonuclease BN  28.52 
 
 
437 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0630  putative ribonuclease BN  27.54 
 
 
538 aa  80.5  0.00000000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.883121 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2618  YihY family protein  27.51 
 
 
437 aa  80.1  0.00000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2773  ribonuclease BN  27.05 
 
 
437 aa  80.1  0.00000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0345  putative ribonuclease BN  26.04 
 
 
377 aa  80.1  0.00000000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0395  ribonuclease BN  25.1 
 
 
289 aa  79.7  0.00000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0386  ribonuclease BN  25.1 
 
 
289 aa  79.7  0.00000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0383  ribonuclease BN  25.1 
 
 
289 aa  79.7  0.00000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>